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Schistosoma mansoni
cluster # 8142 cluster # 8142       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8142#0 length = 697 sequences # 6  

consensusID : consensus_8142#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 697
fasta sequence
                              [GGTTTAGCTATACATTTACTTGGTACATTAGCATTACTTTATTATGCAGTAACAAGAAAGAATCCATTTGTATTCTACAAGGGTTTATTTCAAGCTTGGATTACAGCACTTGGTACTGCATCCAGTGCAGCTACTCTACCAATCACATTTCG-TTGTTTAGAACAAAATCTAGGCATTGATAAACGTGTAACACGTTTTGTTTTACCTATTGGTGCAACAATCAATATGGATGGTACTGCATTATATGAAGCTGTGGCATCCATTTTTATTGCACAAATTAATGGAAAATATTTGACCATTATTGAAGTATTCATTGTAAGCTTAACGGCAACGTTGGCAGCAATAGGTGCAGCTAGTGTTCCAAGTGCTGGTTTAGTCACTATGATGTTAGTGCTTACATCTGTTGGACTGCCTACAAAAGATATTTCTTTAATTTTAGCTGTTGATTGGTTACTTGATCGTATTCGTACATCAATCAATGTAATGGGTGATGCAGTTGGTGCTGGTATAGTGAATCATTTATGTTCTAAAGAATTAGCACAAAAAGATGCTGAAATTGATAAAGAAATTGATGAAGTTGTAGAAGAATATACACGTGAATTATCTAATACAACATCTATGATTGATCGTGAAAAACGTAACTCGTCTAGTTTAAATCGTCATCATAAAAAACGTATGAGTTTAGCTGCTGCTATAC]

[+] EMBL CD080077             [GGTTTAGCTATACATTTACTTGGTACATTAGCATTACTTTATTATGCAGTAACAAGAAAGAATCCATTTGTATTCTACAAGGGTTTATTTCAAGCTTGGATTACAGCACTTGGTACTGCATCCAGTGCAGCTACTCTACCAATCACATTTCG TTGTTTAGAACAAAATCTAGGCATTGATAAACGTGTAACACGTTTTGTTTTACCTATTGGTGCAACAATCAATATGGATGGTACTGCATTATATGAAGCTGTGGCATCCATTTTTATTGCACAAATTAATGGAAAATATTTGACCATTATTGAAGTATTCATTGTAAGCTTAACGGCAACGTTGGCAGCAATAGGTGCAGCTAGTGTTCCAAGTGCTGGTTTAGTCACTATGATGTTAGTGCTTACATCTGTTGGACTGCCTACAAAAGATATTTCTTTAATTTTAGCTGTTGATTGGTTACTTGATCGTATTCGTACATCAATCAATGTAATGGGTGATGCAGTTGGTGCTGGTATAGTGAATCATTTATGTTCTAAAGAATTAGCACAAAAAGATGCTGAAATTGATAAAGAAATTGATGAAGTTGTAGAAGAATATACACGTGAATTATCTAATACAACATCTATGATTGATCGTGAAAAACGTAACTCGTCTAGTTTAAATCGTCATCATAAAAAACGTATGAGTTTAGCTGCTGCTATAC]
[-] EMBL CD070317             [                                                                                                                GTACTGCATCCAGTGCAGCTACTCTACCAATCACA TTCGTTTGTTTAGAACAAAATCTAGGCATTGATAAACGTGTAACACGTTTTGTTTTACCTATTGGTGCAACAATCAATATGGATGGTACTGCATTATATGAAGCTGTGGCATCCATTTTTATTGCACAAATTAATGGAAAATATTTGACCATTATTGAAGTATTCATTGTAAGCTTAACGGCAACGTTGGCAGCAATAGGTGCAGCTAGTGTTCCAAGTGCTGGTTTAGTCACTATGATGTTAGTGCTTACATCTGTTGGACTGCCTACAAAAGATATTTCTTTAATTTTAGCTGTTGATTGGTTACTTGACCGTATTCGTACATCAATCAATGTAATGGGTGATGCA                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD070203             [                                                                                                                                    ACTCTACCAATCACATTTCG TGTTTTAGAACAAAATCTAGGCATTGATAAACGTGTAACACGTTTTGTTTTACCTATTGGTGCAACAATCAATATGGATGGTACTGCATTATATGAAGCTGTGGCATCCATTTTTATTGCACAAATTAATGGAAAATATTTGACCATTATTGAAGTATTCATTGTAAGCTTAACGGCAACGTTGGCAGCAATAGGTGCAGCTAGTGTTCCAAGTGCTGGTTTAGTCACTATGATGTTAGTGCTTACATCTGTCGGACTGCCTACAAGAGATATTTCTTTAATTTTAGCTGTTGATTGGTTACTTGATCGTATTCGTACATCAATCAATGTAATGGGTGAT                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD070357             [                                                                                                                                                ACATTTCG TTGTTTAGAACAAAGTCTAGGCATTGATAAACGTGTAACACGTTTTGTNTTACCTATTGGTGCAACAATCAATATGGATGGTACTGCATTATATGAAGCTGTGGCATCCATTTTTATTGCACAAATTAATGGAAAATATTTGACCATTATTGAAGTATTCATTGTAAGCTTAACGGCAACGTTGGCAGTAATAGGTGCAGCTAGTGTTCCAAGTGCTGGTTTAGTCACTATGATGTTAGTGCTTACATCTGTTGGACTGCCTACAAAAGATATTTCTTTAATTTTAGCTGTTGATTGGTTACTTGATCGTATTCGTACATCAATCAATGTAATGGGTGAT                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD070283             [                                                                                                                                                 CATTTCG TTG TTAGAACAAAATCTAGGCATTGATAAACGTGTAACACGTTTTGTTTTACCTATTGGTGCAACAATCAATATGGATGGTACTGCATTATATGAAGCTGTGGCATCCATTTTTATTGCACAAATTAATGGAAAATATTTGACCATTATTGAAGTATTCATTGTAAGCTTAACGGCAACGTTGGCAGCAATAGGTGCAGCTAGTGTTCCAAGTGCTGGTTTAGTCACTATGATGTTAGTGCTTACATCTGTTGGACTGCCTACAAAAGATATTTCTTTAATTTTAGCTGTTGATTGGTTACTTGATCGTATTCGTACATCAATCAATGTAATGGGTGAT                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD070385             [                                                                                                                                                                   CAAAATCTAGGCATTGATAAACGTGTAACACG TTTGTTTTACCTATTGGTGCAACAATCAATATGGATGGTACTGCATTATATGAAGCTGTGGCATCCATTTNTATTGCACAAATTAATGGAAAGTATTTGACCATCATTGAAGTATTCATTGTAAGCTTAACGGCAACGTTGGCAGCAATAGGTGCAGCTGGTGTTCCAAGTGCTGGTTTAGTCACTATGATGTTAGTGCTTACATCTGTTGGACTGCCTACAAAAGATATTTCTTTAATTTTAGCTGTTGATTGGTTACTTGATCGTATTCGTACATCAATCAATGTAATGGGTGAT                                                                                                                                                                                                             ]


>consensus_8142#0 GGTTTAGCTATACATTTACTTGGTACATTAGCATTACTTTATTATGCAGTAACAAGAAAG AATCCATTTGTATTCTACAAGGGTTTATTTCAAGCTTGGATTACAGCACTTGGTACTGCA TCCAGTGCAGCTACTCTACCAATCACATTTCGTTGTTTAGAACAAAATCTAGGCATTGAT AAACGTGTAACACGTTTTGTTTTACCTATTGGTGCAACAATCAATATGGATGGTACTGCA TTATATGAAGCTGTGGCATCCATTTTTATTGCACAAATTAATGGAAAATATTTGACCATT ATTGAAGTATTCATTGTAAGCTTAACGGCAACGTTGGCAGCAATAGGTGCAGCTAGTGTT CCAAGTGCTGGTTTAGTCACTATGATGTTAGTGCTTACATCTGTTGGACTGCCTACAAAA GATATTTCTTTAATTTTAGCTGTTGATTGGTTACTTGATCGTATTCGTACATCAATCAAT GTAATGGGTGATGCAGTTGGTGCTGGTATAGTGAATCATTTATGTTCTAAAGAATTAGCA CAAAAAGATGCTGAAATTGATAAAGAAATTGATGAAGTTGTAGAAGAATATACACGTGAA TTATCTAATACAACATCTATGATTGATCGTGAAAAACGTAACTCGTCTAGTTTAAATCGT CATCATAAAAAACGTATGAGTTTAGCTGCTGCTATAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)