These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8145#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 618 fasta sequence [CATCAAGTCGATAACGCGTTGAATGCCAACTATTCGATCATCTGGGTGTGCTTCACTAAGTATTGAATAGATTAGCCAACTGCGAAAACGATTTGAAAATGACTTTGATTTATTCAAATTAGGTACAGCATTACCAGTACGATCACGACTTTCAACTTCCC-AAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAATATTATTTAAGGTTATACGATTAACAAAATTTCTTAATTGATTTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGTTTCCATAGTCCTTATTGTTGTTGTCGTCATTGCTTCAGGATATTGTGTTGAAATTGGAGGATTTTGTAAATAATGTTTAATACGTTCAACCGATGAAATTAAATGTCTAGCTTGTATACTCGATAAAAAATCTAACAGTTTCTGACGTAATCGAGGATTAGGAGCAAAATCATTCTGATAATAGCGTGCATTACGAACCCAACGGGATAGGAACATTATCACTCTGGATTGAATACGCTTTTTATATCCTGAGCGAAATCTTTTCAACAT] [+] EMBL CD163506 [CATCAAGTCGATAACGCGTTGAATGCCAACTATTCGATCATCTGGGTGTGCTTCACTAAGTATTGAATAGATTAGCCAACTGCGAAAACGATTTGAAAATGACTTTGATTTATTCAAATTAGGTACAGCATTACCAGTACGATCACGACTTTCAACTTCCC AAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAATATTATTTAAGGTTATACGATTAACAAAATTTCTTAATTGATTTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGTTTCCATAGTCCTTATTGTTGTTGTCGTCATTGCATCAGG ] [+] EMBL CD094946 [ TGAAAATGACTTTGATTTATTCAAATTAGGTACAGCATTACCAGTACGATCACGACTTTCAACTTCCC AAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAGTATTATTTAAGGTTATACGATTAACAAAATTTCTTAATTGATTTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGTTTCCATAATCCTTATTGTTGTTGTCGTCATTGCTTCAGGATATTGTGTTGAAATTGGAGGATTTTGTAAATAATGTTTAATACGTTCAACCGATGAAATTAAATGTCTAGCTTGTATACTCGATAAAAAATCTAACAGTTTCTGACGTAATCGAGGATTAGGAGCAAAATCATTCTGATAATAGCGTGCATTACGAACCCAACGGGATAGGAACATTATCACTCTGGATTGAATACGCTTTTTATATCCTGAGCGAAATCTTTTCAACA ] [+] EMBL CD095213 [ TGAAAATGACTTTGATTTATTCAAATTAGGTACAGCATTACCAGTACGATCACGACTTTCAACTTCCC AAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAATATTATTTAAGGTTATACGATTAACAAAATTTCTTAATTGATTTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGCTTCCATAGTCCTTATTGTTGTTGTCGTCATTGCTTCAGGATATTGTGTTGAAATTGGAGGATTTTGTAAATAATGTTTAATACGTTCAACCGATGAAATTAAATGTCTAGCTTGTATACTCGATAAAAAATCTAACAGTTTCTGACGTAATCGAGGATTAGGAGCAAAATCATTCTGATAATAGCGTGCATTACGAACCCAACGGGATAGGAACATTATCACTCTGGATTGAATACGCTTTTTATATCCTGAGCGAAATCTTTTCAACA ] [+] EMBL CD094777 [ TGAAAATGACTTTGATTTATTCAAATTAGGTACAGCATTACCAGCACGATCACGACTTTCAACTTCCC AAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAATATTATTTAAGGTTATACGATTAACAAAATTTCTTAATTGATTTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGTTTCCATAGTCCTTATTGTTGTTGTCGTCATTGCTTCAGGATATTGTGTTGAAATTGGAGGATTTTGTAAATGATGTTTAATACGTTCAACCGATGAAATTAAATGTCTAGCTTGTATACTCGATAAAAAATCTAACAGTTTCTGACGTAATCGAGGATTAGGAGCAAAATCATTCTGATAATAGCGTGCATTACGAACCCAACGGGATAGGAACATTATCACTCTGGATTGAATACGCTNTTTATATCCTGAGCGAAATCTTTTCAACA ] [+] EMBL CD095239 [ TGAAAATGACTTTGATTTGTTCAAATTAGGTACAGCATTACCAGTACGATCACGACTTTCAACTTCCC AAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAATATTATTTAAGGTTATACGATTAACAGAATTTCTTAATTGATCTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGTTTCCATAGTCCTTATTGTAGTTGTCGTCATTGCTTCAGGATATTGTGTTGAAATTGGAGGATTTTGTAAATAATGTTTAATACGTTCAACCGATGAAATTAAATGTCTAGCTTGTATACTCGATAAAAAATCCAACAGTTTCTGACGTAATCGAGGATTAGGAGCAAAATCATTCTGATAATAGCGTGCATTACGAACCCAACGGGATAGGAACA ] [-] EMBL CD095232 [ CAGTACGATCACGACTTTCAACTTCCCAAAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAATATTATTTAAGGTTATACGATTAACAAAATTTCTTAATTGATTTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGTTTCCATAGTCCTTATTGTTGTTGTCGTCATTGCTTCAGGATATTGTGTTGAAATTGGAGGATTTTGTAAATAATGTTTAATACGTTCAACCGATGAAATTAAATGTCTAGCTTGTATACTCGATAAAAAATCTAACAGTTTCTGACGTAATCGAGGATTAGGAGCAAAATCATTCTGATAATAGCGTGCATTACGAACCCAACGGGATAGGAACATTATCACTCTGGATTGAATACGCTTTTTATATCCTGAGCGAAATCTTTTCAACAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||