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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8145#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 618 fasta sequence
[CATCAAGTCGATAACGCGTTGAATGCCAACTATTCGATCATCTGGGTGTGCTTCACTAAGTATTGAATAGATTAGCCAACTGCGAAAACGATTTGAAAATGACTTTGATTTATTCAAATTAGGTACAGCATTACCAGTACGATCACGACTTTCAACTTCCC-AAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAATATTATTTAAGGTTATACGATTAACAAAATTTCTTAATTGATTTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGTTTCCATAGTCCTTATTGTTGTTGTCGTCATTGCTTCAGGATATTGTGTTGAAATTGGAGGATTTTGTAAATAATGTTTAATACGTTCAACCGATGAAATTAAATGTCTAGCTTGTATACTCGATAAAAAATCTAACAGTTTCTGACGTAATCGAGGATTAGGAGCAAAATCATTCTGATAATAGCGTGCATTACGAACCCAACGGGATAGGAACATTATCACTCTGGATTGAATACGCTTTTTATATCCTGAGCGAAATCTTTTCAACAT]
[+] EMBL CD163506 [CATCAAGTCGATAACGCGTTGAATGCCAACTATTCGATCATCTGGGTGTGCTTCACTAAGTATTGAATAGATTAGCCAACTGCGAAAACGATTTGAAAATGACTTTGATTTATTCAAATTAGGTACAGCATTACCAGTACGATCACGACTTTCAACTTCCC AAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAATATTATTTAAGGTTATACGATTAACAAAATTTCTTAATTGATTTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGTTTCCATAGTCCTTATTGTTGTTGTCGTCATTGCATCAGG ]
[+] EMBL CD094946 [ TGAAAATGACTTTGATTTATTCAAATTAGGTACAGCATTACCAGTACGATCACGACTTTCAACTTCCC AAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAGTATTATTTAAGGTTATACGATTAACAAAATTTCTTAATTGATTTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGTTTCCATAATCCTTATTGTTGTTGTCGTCATTGCTTCAGGATATTGTGTTGAAATTGGAGGATTTTGTAAATAATGTTTAATACGTTCAACCGATGAAATTAAATGTCTAGCTTGTATACTCGATAAAAAATCTAACAGTTTCTGACGTAATCGAGGATTAGGAGCAAAATCATTCTGATAATAGCGTGCATTACGAACCCAACGGGATAGGAACATTATCACTCTGGATTGAATACGCTTTTTATATCCTGAGCGAAATCTTTTCAACA ]
[+] EMBL CD095213 [ TGAAAATGACTTTGATTTATTCAAATTAGGTACAGCATTACCAGTACGATCACGACTTTCAACTTCCC AAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAATATTATTTAAGGTTATACGATTAACAAAATTTCTTAATTGATTTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGCTTCCATAGTCCTTATTGTTGTTGTCGTCATTGCTTCAGGATATTGTGTTGAAATTGGAGGATTTTGTAAATAATGTTTAATACGTTCAACCGATGAAATTAAATGTCTAGCTTGTATACTCGATAAAAAATCTAACAGTTTCTGACGTAATCGAGGATTAGGAGCAAAATCATTCTGATAATAGCGTGCATTACGAACCCAACGGGATAGGAACATTATCACTCTGGATTGAATACGCTTTTTATATCCTGAGCGAAATCTTTTCAACA ]
[+] EMBL CD094777 [ TGAAAATGACTTTGATTTATTCAAATTAGGTACAGCATTACCAGCACGATCACGACTTTCAACTTCCC AAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAATATTATTTAAGGTTATACGATTAACAAAATTTCTTAATTGATTTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGTTTCCATAGTCCTTATTGTTGTTGTCGTCATTGCTTCAGGATATTGTGTTGAAATTGGAGGATTTTGTAAATGATGTTTAATACGTTCAACCGATGAAATTAAATGTCTAGCTTGTATACTCGATAAAAAATCTAACAGTTTCTGACGTAATCGAGGATTAGGAGCAAAATCATTCTGATAATAGCGTGCATTACGAACCCAACGGGATAGGAACATTATCACTCTGGATTGAATACGCTNTTTATATCCTGAGCGAAATCTTTTCAACA ]
[+] EMBL CD095239 [ TGAAAATGACTTTGATTTGTTCAAATTAGGTACAGCATTACCAGTACGATCACGACTTTCAACTTCCC AAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAATATTATTTAAGGTTATACGATTAACAGAATTTCTTAATTGATCTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGTTTCCATAGTCCTTATTGTAGTTGTCGTCATTGCTTCAGGATATTGTGTTGAAATTGGAGGATTTTGTAAATAATGTTTAATACGTTCAACCGATGAAATTAAATGTCTAGCTTGTATACTCGATAAAAAATCCAACAGTTTCTGACGTAATCGAGGATTAGGAGCAAAATCATTCTGATAATAGCGTGCATTACGAACCCAACGGGATAGGAACA ]
[-] EMBL CD095232 [ CAGTACGATCACGACTTTCAACTTCCCAAAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAATATTATTTAAGGTTATACGATTAACAAAATTTCTTAATTGATTTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGTTTCCATAGTCCTTATTGTTGTTGTCGTCATTGCTTCAGGATATTGTGTTGAAATTGGAGGATTTTGTAAATAATGTTTAATACGTTCAACCGATGAAATTAAATGTCTAGCTTGTATACTCGATAAAAAATCTAACAGTTTCTGACGTAATCGAGGATTAGGAGCAAAATCATTCTGATAATAGCGTGCATTACGAACCCAACGGGATAGGAACATTATCACTCTGGATTGAATACGCTTTTTATATCCTGAGCGAAATCTTTTCAACAT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||