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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8148#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1492 fasta sequence
[AGAGATTCACAGGTGATCGACATGAAGCTAAATTGTTTCTCAAAAGTCAGAAGCCGAGGAGAAATGTGAAACGATCATCCTAGGTTTCTTTATTCACTACATCTCTATAGTCTCTGGACTACAATATATTGAAGATACAGTCTTCAATAGAAAAAAACCGAGGTCAGTCTATAATGACTTGGGTTCTCCTGTGGTTCTTATGCTCATTTGTTCAATGCGATGACGAAAAATTAAATACCCATTTCATTGGAGTTCATCGTAATCCCGAATCTATCCTTCCAGAAATGCATTTTGAGGATCGGCTTCATGTGTATTTCAAAAAAATTGACACTAATAACAATGGATTCATTGAAGATGATGAATTAGCATCATGGATCTTAAAGACTTATGAATCTTTAGACCGTGAGCATGCTGAAAAACAACTTACAAGATTTGATGTGAATAAAGACGGAAAGGTTTCGTTCGAAGAGTATATAAGTCAAACATATGAGACTTCTGAAGAGGAACTAAGACATTCGAAGGACGANCAATCATCGAAATTTATTTTAGAATTATTAANAGATGAACGATTACGTTTCAGCTTTGCTGATAAAGATAATGATGGTTTATTATCCCTAGAAGAATTCACTTTATTCTTACGACCTGAAAATTATGAGGATATGGCAAATTATGAAATGCAAAAAAGTTTTTCCAGTTTTGATCAAAATGGTGATGGTATGATTACAAAAGATGAGTTTACAAATTTCTCTTATCGAGGTGTATCACAGGAGAATTATTTACATGAACAATTCACTAGTCTTGACGTTGATAAAAATGGCATACTCACTTTGGATGAATTACGACCATGGTTATTGCCCTCTTTAAAAGCAGCCGCGAAATCAGAAGCCACACGATTAATGAATCTCACAGATTCTAATCGTGATGGCAAACTTACATTGGAAGAAATCTTGGCTAAATCACATTCATGGAAAGATAGCCAAGTTGTTAAGCATGCGCGATCATTATGGGATGAATTGTAGAGGTAAATGAGCACAACGTATCTTCTACTATTATCTCTGTAACTCAATTGTGTCCAGTTATATGTTATGGTCGTTGTGTGTAGTAGTTTATCATTCCATATCTTTCAAAGTTGATAATAAAACATTGAATTTCTCTTTGTGGCATTCACTGAACATTTTGTCTGTGGATTTTCCTCCTTTCTCATCCTTTTTCTTAATCTCTTGCTACAAATTCATTTTTTATTTGTTCTCACTAAAAACCATAAACGCAGTTGTATATTTTGTTTCTTCTCCCTATATTTGTTGTGGTTACTTTCGCTATTTGTTCTCATCGATTCTATCAGTTATCTTCAGCCGAATATTTTGTAAAAATGTCTTCTGTTGTTATATAGACACATTGTAAGATTATTCTCTTCATCGTTTGACTAACCATACCACTCACGGGAACAATGTTAAGATAGTTGAATAAATTAGACATTAACAACAGAAAACTA]
[+] EMBL CD078525 [AGAGATTCACAGGTGATCGACATGAAGCTAAATTGTTTCTCAAAAGTCAGAAGCCGAGGAGAAATGTGAAACGATCATCCTAGGTTTCTTTATTCACTACATCTCTATAGTCTCTGGACTACAATATATTGAAGATACAGTCTTCAATAGAAAAAAACCGAGGTCAGTCTATAATGACTTGGGTTCTCCTGTGGTTCTTATGCTCATTTGTTCAATGCGATGACGAAAAATTAAATACCCATTTCATTGGAGTTCATCGTAATCCCGAATCTATCCTTCCAGAAATGCATTTTGAGGATCGGCTTCATGTGTATTTCAAAAAAATTGACACTAATAACAATGGATTCATTGAAGATGATGAATTAGCATCATGGATCTTAAAGACTTATGAATCTTTAGACCGTGAGCATGCTGAAAAACAACTTACAAGATTTGATGTGAATAAAGACGGAAAGGTTTCGTTCGAAGAGTATATAAGTCAAACATATGAGACTTCTGAAGAGGAACTAAGACATTCGAAGGACGANCAATCATCGAAATTTATTTTAGAATTATTAANAGATGAACGATTACGTTTCAGCTTTGCTGATAAAGA ]
[+] EMBL CD082316 [ agacTGATGTGAATAAAGACGGAAAGGTTTCGTTTTAAGAGTATATAAGTCACACATATGAGACTTCTGAAGAGGAACTAAGACATTCGAAGGACGACAAATCATCGAAATTTATTTTAGAATTATTAAAAGATGAACGATTACGTTTCAGCTTTGCTGATAAAGATAATGATGGTTTATTATCCCTAGAAGAATTCACTTTATTCTTACGACCTGAAAATTATGAGGATATGGCAAATTATGAAATGCAAAAAAGTTTTTCCAGTTTTGATCAAAATGGTGATGGTATGATTACAAAAGATGAGTTTACAAATTTCTCTTATCGAGGTGTATCACAGGAGAATTATTTACATGAACAATTCACTAGTCTTGACGTTGATAAAAATGGCATACTCACTTTGGATGAATTACGACCATGGTTATTGCCCTCTTTAAAAGCAGCCGCGAAATCAGAAGCCACACGATTAATGAATCTCACAGATTCTAATCGTGATGGCAAACTTACATTGGAAGAAATCTTGGCTAAATCACATTCATGGAAAGATAGCCAAGTTGTTAAGCATGCGCGATCATTATGGGATGAATTGTAGAGGTAAATGAGCACAACGTATCTTCTACTATTATCTCTGTAA ]
[-] EMBL CD075918 [ AGGAGAATTATTTACATGAACAATTCACTAGTCTTGACGTTGATAAAAATGGCATACTCACTTTGGATGAATTACGACCATGGTTATTGCCCTCTTTAAAAGCAGCCGCGAAATCAGAAGCCACACGATTAATGAATCTCACAGATTCTAATCGTGATGGCAAACTTACATTGGAAGAAATCTTGGCTAAATCACATTCATGGAAAGATAGCCAAGTTGTTAAGCATGCGCGATCATTATGGGATGAATTGTAGAGGTAAATGAGCACAACGTATCTTCTACTATTATCTCTGTAACTCAATTGTGTCCAGTTATATGTTATGGTCGTTGTGTGTAGTAGTTTATCATTCCATATCTTTCAAAGTTGATAATAAAACATTGAATTTCTCTTTGTGGCATTCACTGAACATTTTGTCTGTGGATTTTCCTCCTTTCTCATCCTTTTTCTTAATCTCTTGCTACAAATTCATTTTTTATTTGTTCTCACTAAAAACCATAAACGCAGTTGTATATTTTGTTTCTTCTCCCTATATTTGTTGTGGTTACTTTCGCTATTTGTTCTCATCGATTCTATCAGTTATCTTCAGCCGA ]
[-] EMBL CD072994 [ CACACGATTAATGAATCTTACAGATTCTAATCGTGATGGCAAACTTACATTGGAAGAAATCTTGGCTAAATCACATTCATGGAAAGATAGCCAAGTTGTTAAGCATGCGCGATCATTATGGGATGAATTGTAGAGGTAAATGAGCACAACGTATCTTCTACTATTATCTCTGTAACTCAATTGTGTCCAGTTATATGTTATGGTCGTTGTGTGTAGTAGTTTATCATTCCATATCTTTCAAAGTTGATAATAAAACATTGAATTTCTCTTTGTGGCATTCACTGAACATTTTGTCTGTGGATTTTCCTCCTTTCTCATCCTTTTTCTTAATCTCTTGCTACAAATTCATTTTTTATTTGTTCTCACTAAAAACCATAAACGCAGTTGTATATTTTGTTTCTTCTCCCTATATTTGTTGTGGTTACTTTCGCTATTTGTTCTCATCGATTCTATCAGTTATCTTCAGCCGAATATTTTGTAAAAATGTCTTCTGTTGTTATATAGACACAT ]
[-] EMBL CD088330 [ AGCACAACGTATCTTCTACTATTATCTCTGTAACTCAATTGTGTCCAGTTATATGTTATGGTCGTTGTGTGTAGTAGTTTATCATTCCATATCTTTCAAAGTTGATAATAAAACATTGAATTTCTCTTTGTGGCATTCACTGAACATTTTGTCTGTGGATTTTCCTCCTTTCTCATCCTTTTTCTTAATCTCTTGCTACAAATTCATTTTTTATTTGTTCTCACTAAAAACCATAAACGCAGTTGTATATTTTGTTTCTTCTCCCTATATTTGTTGTGGTTACTTTCGCTATTTGTTCTCATCGATTCTATCAGTTATCTTCAGCCGAATATTTTGTAAAAATGTCTTCTGTTGTTATATAGACACATTGTAAGATTATTCTCTTCATCGTTTGACTAACCATACCACTCACGGGAACAATGTTAAGATAGTTGAATAAATTAGACATTAACAACAGAAAACTA]
[-] EMBL CD076789 [ TCCCTATATTTGTTGTGGTTACTTTCGCTATTTGTTCTCATCGATTCTATCAGTTATCTTCAGCCGAATATTTTGTAAAAATGTCTTCTGTTGTTATATAGACACAT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||