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Schistosoma mansoni
cluster # 8148 cluster # 8148       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8148#0 length = 1492 sequences # 6  

consensusID : consensus_8148#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1492
fasta sequence
                              [AGAGATTCACAGGTGATCGACATGAAGCTAAATTGTTTCTCAAAAGTCAGAAGCCGAGGAGAAATGTGAAACGATCATCCTAGGTTTCTTTATTCACTACATCTCTATAGTCTCTGGACTACAATATATTGAAGATACAGTCTTCAATAGAAAAAAACCGAGGTCAGTCTATAATGACTTGGGTTCTCCTGTGGTTCTTATGCTCATTTGTTCAATGCGATGACGAAAAATTAAATACCCATTTCATTGGAGTTCATCGTAATCCCGAATCTATCCTTCCAGAAATGCATTTTGAGGATCGGCTTCATGTGTATTTCAAAAAAATTGACACTAATAACAATGGATTCATTGAAGATGATGAATTAGCATCATGGATCTTAAAGACTTATGAATCTTTAGACCGTGAGCATGCTGAAAAACAACTTACAAGATTTGATGTGAATAAAGACGGAAAGGTTTCGTTCGAAGAGTATATAAGTCAAACATATGAGACTTCTGAAGAGGAACTAAGACATTCGAAGGACGANCAATCATCGAAATTTATTTTAGAATTATTAANAGATGAACGATTACGTTTCAGCTTTGCTGATAAAGATAATGATGGTTTATTATCCCTAGAAGAATTCACTTTATTCTTACGACCTGAAAATTATGAGGATATGGCAAATTATGAAATGCAAAAAAGTTTTTCCAGTTTTGATCAAAATGGTGATGGTATGATTACAAAAGATGAGTTTACAAATTTCTCTTATCGAGGTGTATCACAGGAGAATTATTTACATGAACAATTCACTAGTCTTGACGTTGATAAAAATGGCATACTCACTTTGGATGAATTACGACCATGGTTATTGCCCTCTTTAAAAGCAGCCGCGAAATCAGAAGCCACACGATTAATGAATCTCACAGATTCTAATCGTGATGGCAAACTTACATTGGAAGAAATCTTGGCTAAATCACATTCATGGAAAGATAGCCAAGTTGTTAAGCATGCGCGATCATTATGGGATGAATTGTAGAGGTAAATGAGCACAACGTATCTTCTACTATTATCTCTGTAACTCAATTGTGTCCAGTTATATGTTATGGTCGTTGTGTGTAGTAGTTTATCATTCCATATCTTTCAAAGTTGATAATAAAACATTGAATTTCTCTTTGTGGCATTCACTGAACATTTTGTCTGTGGATTTTCCTCCTTTCTCATCCTTTTTCTTAATCTCTTGCTACAAATTCATTTTTTATTTGTTCTCACTAAAAACCATAAACGCAGTTGTATATTTTGTTTCTTCTCCCTATATTTGTTGTGGTTACTTTCGCTATTTGTTCTCATCGATTCTATCAGTTATCTTCAGCCGAATATTTTGTAAAAATGTCTTCTGTTGTTATATAGACACATTGTAAGATTATTCTCTTCATCGTTTGACTAACCATACCACTCACGGGAACAATGTTAAGATAGTTGAATAAATTAGACATTAACAACAGAAAACTA]

[+] EMBL CD078525             [AGAGATTCACAGGTGATCGACATGAAGCTAAATTGTTTCTCAAAAGTCAGAAGCCGAGGAGAAATGTGAAACGATCATCCTAGGTTTCTTTATTCACTACATCTCTATAGTCTCTGGACTACAATATATTGAAGATACAGTCTTCAATAGAAAAAAACCGAGGTCAGTCTATAATGACTTGGGTTCTCCTGTGGTTCTTATGCTCATTTGTTCAATGCGATGACGAAAAATTAAATACCCATTTCATTGGAGTTCATCGTAATCCCGAATCTATCCTTCCAGAAATGCATTTTGAGGATCGGCTTCATGTGTATTTCAAAAAAATTGACACTAATAACAATGGATTCATTGAAGATGATGAATTAGCATCATGGATCTTAAAGACTTATGAATCTTTAGACCGTGAGCATGCTGAAAAACAACTTACAAGATTTGATGTGAATAAAGACGGAAAGGTTTCGTTCGAAGAGTATATAAGTCAAACATATGAGACTTCTGAAGAGGAACTAAGACATTCGAAGGACGANCAATCATCGAAATTTATTTTAGAATTATTAANAGATGAACGATTACGTTTCAGCTTTGCTGATAAAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD082316             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agacTGATGTGAATAAAGACGGAAAGGTTTCGTTTTAAGAGTATATAAGTCACACATATGAGACTTCTGAAGAGGAACTAAGACATTCGAAGGACGACAAATCATCGAAATTTATTTTAGAATTATTAAAAGATGAACGATTACGTTTCAGCTTTGCTGATAAAGATAATGATGGTTTATTATCCCTAGAAGAATTCACTTTATTCTTACGACCTGAAAATTATGAGGATATGGCAAATTATGAAATGCAAAAAAGTTTTTCCAGTTTTGATCAAAATGGTGATGGTATGATTACAAAAGATGAGTTTACAAATTTCTCTTATCGAGGTGTATCACAGGAGAATTATTTACATGAACAATTCACTAGTCTTGACGTTGATAAAAATGGCATACTCACTTTGGATGAATTACGACCATGGTTATTGCCCTCTTTAAAAGCAGCCGCGAAATCAGAAGCCACACGATTAATGAATCTCACAGATTCTAATCGTGATGGCAAACTTACATTGGAAGAAATCTTGGCTAAATCACATTCATGGAAAGATAGCCAAGTTGTTAAGCATGCGCGATCATTATGGGATGAATTGTAGAGGTAAATGAGCACAACGTATCTTCTACTATTATCTCTGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD075918             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AGGAGAATTATTTACATGAACAATTCACTAGTCTTGACGTTGATAAAAATGGCATACTCACTTTGGATGAATTACGACCATGGTTATTGCCCTCTTTAAAAGCAGCCGCGAAATCAGAAGCCACACGATTAATGAATCTCACAGATTCTAATCGTGATGGCAAACTTACATTGGAAGAAATCTTGGCTAAATCACATTCATGGAAAGATAGCCAAGTTGTTAAGCATGCGCGATCATTATGGGATGAATTGTAGAGGTAAATGAGCACAACGTATCTTCTACTATTATCTCTGTAACTCAATTGTGTCCAGTTATATGTTATGGTCGTTGTGTGTAGTAGTTTATCATTCCATATCTTTCAAAGTTGATAATAAAACATTGAATTTCTCTTTGTGGCATTCACTGAACATTTTGTCTGTGGATTTTCCTCCTTTCTCATCCTTTTTCTTAATCTCTTGCTACAAATTCATTTTTTATTTGTTCTCACTAAAAACCATAAACGCAGTTGTATATTTTGTTTCTTCTCCCTATATTTGTTGTGGTTACTTTCGCTATTTGTTCTCATCGATTCTATCAGTTATCTTCAGCCGA                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD072994             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CACACGATTAATGAATCTTACAGATTCTAATCGTGATGGCAAACTTACATTGGAAGAAATCTTGGCTAAATCACATTCATGGAAAGATAGCCAAGTTGTTAAGCATGCGCGATCATTATGGGATGAATTGTAGAGGTAAATGAGCACAACGTATCTTCTACTATTATCTCTGTAACTCAATTGTGTCCAGTTATATGTTATGGTCGTTGTGTGTAGTAGTTTATCATTCCATATCTTTCAAAGTTGATAATAAAACATTGAATTTCTCTTTGTGGCATTCACTGAACATTTTGTCTGTGGATTTTCCTCCTTTCTCATCCTTTTTCTTAATCTCTTGCTACAAATTCATTTTTTATTTGTTCTCACTAAAAACCATAAACGCAGTTGTATATTTTGTTTCTTCTCCCTATATTTGTTGTGGTTACTTTCGCTATTTGTTCTCATCGATTCTATCAGTTATCTTCAGCCGAATATTTTGTAAAAATGTCTTCTGTTGTTATATAGACACAT                                                                                                ]
[-] EMBL CD088330             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGCACAACGTATCTTCTACTATTATCTCTGTAACTCAATTGTGTCCAGTTATATGTTATGGTCGTTGTGTGTAGTAGTTTATCATTCCATATCTTTCAAAGTTGATAATAAAACATTGAATTTCTCTTTGTGGCATTCACTGAACATTTTGTCTGTGGATTTTCCTCCTTTCTCATCCTTTTTCTTAATCTCTTGCTACAAATTCATTTTTTATTTGTTCTCACTAAAAACCATAAACGCAGTTGTATATTTTGTTTCTTCTCCCTATATTTGTTGTGGTTACTTTCGCTATTTGTTCTCATCGATTCTATCAGTTATCTTCAGCCGAATATTTTGTAAAAATGTCTTCTGTTGTTATATAGACACATTGTAAGATTATTCTCTTCATCGTTTGACTAACCATACCACTCACGGGAACAATGTTAAGATAGTTGAATAAATTAGACATTAACAACAGAAAACTA]
[-] EMBL CD076789             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCCCTATATTTGTTGTGGTTACTTTCGCTATTTGTTCTCATCGATTCTATCAGTTATCTTCAGCCGAATATTTTGTAAAAATGTCTTCTGTTGTTATATAGACACAT                                                                                                ]


>consensus_8148#0 AGAGATTCACAGGTGATCGACATGAAGCTAAATTGTTTCTCAAAAGTCAGAAGCCGAGGA GAAATGTGAAACGATCATCCTAGGTTTCTTTATTCACTACATCTCTATAGTCTCTGGACT ACAATATATTGAAGATACAGTCTTCAATAGAAAAAAACCGAGGTCAGTCTATAATGACTT GGGTTCTCCTGTGGTTCTTATGCTCATTTGTTCAATGCGATGACGAAAAATTAAATACCC ATTTCATTGGAGTTCATCGTAATCCCGAATCTATCCTTCCAGAAATGCATTTTGAGGATC GGCTTCATGTGTATTTCAAAAAAATTGACACTAATAACAATGGATTCATTGAAGATGATG AATTAGCATCATGGATCTTAAAGACTTATGAATCTTTAGACCGTGAGCATGCTGAAAAAC AACTTACAAGATTTGATGTGAATAAAGACGGAAAGGTTTCGTTCGAAGAGTATATAAGTC AAACATATGAGACTTCTGAAGAGGAACTAAGACATTCGAAGGACGANCAATCATCGAAAT TTATTTTAGAATTATTAANAGATGAACGATTACGTTTCAGCTTTGCTGATAAAGATAATG ATGGTTTATTATCCCTAGAAGAATTCACTTTATTCTTACGACCTGAAAATTATGAGGATA TGGCAAATTATGAAATGCAAAAAAGTTTTTCCAGTTTTGATCAAAATGGTGATGGTATGA TTACAAAAGATGAGTTTACAAATTTCTCTTATCGAGGTGTATCACAGGAGAATTATTTAC ATGAACAATTCACTAGTCTTGACGTTGATAAAAATGGCATACTCACTTTGGATGAATTAC GACCATGGTTATTGCCCTCTTTAAAAGCAGCCGCGAAATCAGAAGCCACACGATTAATGA ATCTCACAGATTCTAATCGTGATGGCAAACTTACATTGGAAGAAATCTTGGCTAAATCAC ATTCATGGAAAGATAGCCAAGTTGTTAAGCATGCGCGATCATTATGGGATGAATTGTAGA GGTAAATGAGCACAACGTATCTTCTACTATTATCTCTGTAACTCAATTGTGTCCAGTTAT ATGTTATGGTCGTTGTGTGTAGTAGTTTATCATTCCATATCTTTCAAAGTTGATAATAAA ACATTGAATTTCTCTTTGTGGCATTCACTGAACATTTTGTCTGTGGATTTTCCTCCTTTC TCATCCTTTTTCTTAATCTCTTGCTACAAATTCATTTTTTATTTGTTCTCACTAAAAACC ATAAACGCAGTTGTATATTTTGTTTCTTCTCCCTATATTTGTTGTGGTTACTTTCGCTAT TTGTTCTCATCGATTCTATCAGTTATCTTCAGCCGAATATTTTGTAAAAATGTCTTCTGT TGTTATATAGACACATTGTAAGATTATTCTCTTCATCGTTTGACTAACCATACCACTCAC GGGAACAATGTTAAGATAGTTGAATAAATTAGACATTAACAACAGAAAACTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)