These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8148#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1492 fasta sequence [AGAGATTCACAGGTGATCGACATGAAGCTAAATTGTTTCTCAAAAGTCAGAAGCCGAGGAGAAATGTGAAACGATCATCCTAGGTTTCTTTATTCACTACATCTCTATAGTCTCTGGACTACAATATATTGAAGATACAGTCTTCAATAGAAAAAAACCGAGGTCAGTCTATAATGACTTGGGTTCTCCTGTGGTTCTTATGCTCATTTGTTCAATGCGATGACGAAAAATTAAATACCCATTTCATTGGAGTTCATCGTAATCCCGAATCTATCCTTCCAGAAATGCATTTTGAGGATCGGCTTCATGTGTATTTCAAAAAAATTGACACTAATAACAATGGATTCATTGAAGATGATGAATTAGCATCATGGATCTTAAAGACTTATGAATCTTTAGACCGTGAGCATGCTGAAAAACAACTTACAAGATTTGATGTGAATAAAGACGGAAAGGTTTCGTTCGAAGAGTATATAAGTCAAACATATGAGACTTCTGAAGAGGAACTAAGACATTCGAAGGACGANCAATCATCGAAATTTATTTTAGAATTATTAANAGATGAACGATTACGTTTCAGCTTTGCTGATAAAGATAATGATGGTTTATTATCCCTAGAAGAATTCACTTTATTCTTACGACCTGAAAATTATGAGGATATGGCAAATTATGAAATGCAAAAAAGTTTTTCCAGTTTTGATCAAAATGGTGATGGTATGATTACAAAAGATGAGTTTACAAATTTCTCTTATCGAGGTGTATCACAGGAGAATTATTTACATGAACAATTCACTAGTCTTGACGTTGATAAAAATGGCATACTCACTTTGGATGAATTACGACCATGGTTATTGCCCTCTTTAAAAGCAGCCGCGAAATCAGAAGCCACACGATTAATGAATCTCACAGATTCTAATCGTGATGGCAAACTTACATTGGAAGAAATCTTGGCTAAATCACATTCATGGAAAGATAGCCAAGTTGTTAAGCATGCGCGATCATTATGGGATGAATTGTAGAGGTAAATGAGCACAACGTATCTTCTACTATTATCTCTGTAACTCAATTGTGTCCAGTTATATGTTATGGTCGTTGTGTGTAGTAGTTTATCATTCCATATCTTTCAAAGTTGATAATAAAACATTGAATTTCTCTTTGTGGCATTCACTGAACATTTTGTCTGTGGATTTTCCTCCTTTCTCATCCTTTTTCTTAATCTCTTGCTACAAATTCATTTTTTATTTGTTCTCACTAAAAACCATAAACGCAGTTGTATATTTTGTTTCTTCTCCCTATATTTGTTGTGGTTACTTTCGCTATTTGTTCTCATCGATTCTATCAGTTATCTTCAGCCGAATATTTTGTAAAAATGTCTTCTGTTGTTATATAGACACATTGTAAGATTATTCTCTTCATCGTTTGACTAACCATACCACTCACGGGAACAATGTTAAGATAGTTGAATAAATTAGACATTAACAACAGAAAACTA] [+] EMBL CD078525 [AGAGATTCACAGGTGATCGACATGAAGCTAAATTGTTTCTCAAAAGTCAGAAGCCGAGGAGAAATGTGAAACGATCATCCTAGGTTTCTTTATTCACTACATCTCTATAGTCTCTGGACTACAATATATTGAAGATACAGTCTTCAATAGAAAAAAACCGAGGTCAGTCTATAATGACTTGGGTTCTCCTGTGGTTCTTATGCTCATTTGTTCAATGCGATGACGAAAAATTAAATACCCATTTCATTGGAGTTCATCGTAATCCCGAATCTATCCTTCCAGAAATGCATTTTGAGGATCGGCTTCATGTGTATTTCAAAAAAATTGACACTAATAACAATGGATTCATTGAAGATGATGAATTAGCATCATGGATCTTAAAGACTTATGAATCTTTAGACCGTGAGCATGCTGAAAAACAACTTACAAGATTTGATGTGAATAAAGACGGAAAGGTTTCGTTCGAAGAGTATATAAGTCAAACATATGAGACTTCTGAAGAGGAACTAAGACATTCGAAGGACGANCAATCATCGAAATTTATTTTAGAATTATTAANAGATGAACGATTACGTTTCAGCTTTGCTGATAAAGA ] [+] EMBL CD082316 [ agacTGATGTGAATAAAGACGGAAAGGTTTCGTTTTAAGAGTATATAAGTCACACATATGAGACTTCTGAAGAGGAACTAAGACATTCGAAGGACGACAAATCATCGAAATTTATTTTAGAATTATTAAAAGATGAACGATTACGTTTCAGCTTTGCTGATAAAGATAATGATGGTTTATTATCCCTAGAAGAATTCACTTTATTCTTACGACCTGAAAATTATGAGGATATGGCAAATTATGAAATGCAAAAAAGTTTTTCCAGTTTTGATCAAAATGGTGATGGTATGATTACAAAAGATGAGTTTACAAATTTCTCTTATCGAGGTGTATCACAGGAGAATTATTTACATGAACAATTCACTAGTCTTGACGTTGATAAAAATGGCATACTCACTTTGGATGAATTACGACCATGGTTATTGCCCTCTTTAAAAGCAGCCGCGAAATCAGAAGCCACACGATTAATGAATCTCACAGATTCTAATCGTGATGGCAAACTTACATTGGAAGAAATCTTGGCTAAATCACATTCATGGAAAGATAGCCAAGTTGTTAAGCATGCGCGATCATTATGGGATGAATTGTAGAGGTAAATGAGCACAACGTATCTTCTACTATTATCTCTGTAA ] [-] EMBL CD075918 [ AGGAGAATTATTTACATGAACAATTCACTAGTCTTGACGTTGATAAAAATGGCATACTCACTTTGGATGAATTACGACCATGGTTATTGCCCTCTTTAAAAGCAGCCGCGAAATCAGAAGCCACACGATTAATGAATCTCACAGATTCTAATCGTGATGGCAAACTTACATTGGAAGAAATCTTGGCTAAATCACATTCATGGAAAGATAGCCAAGTTGTTAAGCATGCGCGATCATTATGGGATGAATTGTAGAGGTAAATGAGCACAACGTATCTTCTACTATTATCTCTGTAACTCAATTGTGTCCAGTTATATGTTATGGTCGTTGTGTGTAGTAGTTTATCATTCCATATCTTTCAAAGTTGATAATAAAACATTGAATTTCTCTTTGTGGCATTCACTGAACATTTTGTCTGTGGATTTTCCTCCTTTCTCATCCTTTTTCTTAATCTCTTGCTACAAATTCATTTTTTATTTGTTCTCACTAAAAACCATAAACGCAGTTGTATATTTTGTTTCTTCTCCCTATATTTGTTGTGGTTACTTTCGCTATTTGTTCTCATCGATTCTATCAGTTATCTTCAGCCGA ] [-] EMBL CD072994 [ CACACGATTAATGAATCTTACAGATTCTAATCGTGATGGCAAACTTACATTGGAAGAAATCTTGGCTAAATCACATTCATGGAAAGATAGCCAAGTTGTTAAGCATGCGCGATCATTATGGGATGAATTGTAGAGGTAAATGAGCACAACGTATCTTCTACTATTATCTCTGTAACTCAATTGTGTCCAGTTATATGTTATGGTCGTTGTGTGTAGTAGTTTATCATTCCATATCTTTCAAAGTTGATAATAAAACATTGAATTTCTCTTTGTGGCATTCACTGAACATTTTGTCTGTGGATTTTCCTCCTTTCTCATCCTTTTTCTTAATCTCTTGCTACAAATTCATTTTTTATTTGTTCTCACTAAAAACCATAAACGCAGTTGTATATTTTGTTTCTTCTCCCTATATTTGTTGTGGTTACTTTCGCTATTTGTTCTCATCGATTCTATCAGTTATCTTCAGCCGAATATTTTGTAAAAATGTCTTCTGTTGTTATATAGACACAT ] [-] EMBL CD088330 [ AGCACAACGTATCTTCTACTATTATCTCTGTAACTCAATTGTGTCCAGTTATATGTTATGGTCGTTGTGTGTAGTAGTTTATCATTCCATATCTTTCAAAGTTGATAATAAAACATTGAATTTCTCTTTGTGGCATTCACTGAACATTTTGTCTGTGGATTTTCCTCCTTTCTCATCCTTTTTCTTAATCTCTTGCTACAAATTCATTTTTTATTTGTTCTCACTAAAAACCATAAACGCAGTTGTATATTTTGTTTCTTCTCCCTATATTTGTTGTGGTTACTTTCGCTATTTGTTCTCATCGATTCTATCAGTTATCTTCAGCCGAATATTTTGTAAAAATGTCTTCTGTTGTTATATAGACACATTGTAAGATTATTCTCTTCATCGTTTGACTAACCATACCACTCACGGGAACAATGTTAAGATAGTTGAATAAATTAGACATTAACAACAGAAAACTA] [-] EMBL CD076789 [ TCCCTATATTTGTTGTGGTTACTTTCGCTATTTGTTCTCATCGATTCTATCAGTTATCTTCAGCCGAATATTTTGTAAAAATGTCTTCTGTTGTTATATAGACACAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||