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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8149#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 908 fasta sequence
[AATCTGTAGTGCCGCCCAATATTCCTGCTATCAAAGCATGAAACAAGAAGTACTTCAGTATTTGCTGTATGATGAGATGAATACGGAAGGCCAGTTATTCAGGATTAAAAAAAATGATGTGGTTCATTTCGTTTTGGATGTATCTCTGATTGGTTGCAATATCCGGTTTTTTATTAATTATCCCGATTCTGGCGTTCCATTTCAGCGGTTGCAATATCGGGAGCTGCCTTTGAATAACCCAACTCTTACTGGCAAACAATCGGATTGTTTTGATAGTTTTTTCGAGTTAAAAAAAATAAGTGTCTGCGGATCTTTTCACTTTTATTTTTCAAAAGACGGATCTTCTCCTAGCCCTCCATCAACCGCAACATGTATGAAAGAAAATATAGCTGGTTCGGGATATATTATCGTTGATCCAGATTTCACTGGTAAACAAGTTGTCACGGAGTCCTCAGGAAATATCCGTGGAAAAAATTGGGATTTAAGTGGCGTGGTTCTTCAGTCTTATTTGTCTAAAAATCTTGGAATATTCCCTGAATGGGAGTCAAGACTTCATACAGTCAGGAATGGTAGTTATAATATGATTCACTTTACTCCTCTTCAAGAACTTGGGTATTCTCGTTCTGCTTATTCTCTCAAAGATCAACTCACGGTCAATCCTAGCTTTACCCCACCTGGAGCAACGAAGAAGGTAGACTGGACGGATATTGAATGCTTTGTCAAACATTTGGAAAATAATTGGGCAGTACTTAGTATGACGGACTTAGTTTTTAATCATACATCAAATGATAGCCCCTGGGTTCACGAACATCCTGAATGTGCTTACAACGTTGTTAATTCTCCTCATCTAGCTCCAGCGTATATCCTGGATCATATTGTCTGGCGTTTAACTATAGAAGCCAGTACTG]
[+] EMBL CD097896 [AATCTGTAGTGCCGCCCAATATTCCTGCTATCAAAGCATGAAACAAGAAGTACTTCAGTATTTGCTGTATGATGAGATGAATACGGAAGGCCAGTTATTCAGGATTAAAAAAAATGATGTGGTTCATTTCGTTTTGGATGTATCTCTGATTGGTTGCAATATCCGGTTTTTTATTAATTATCCCGATTCTGACGTTCCATTTCAGCGGTTGCAATATCGGGAGCTGCCTTTGAATAACCCAACTCTTACTGGCAAACAATCGGATTGTTTTGATAGTTTTTTCGAGTTAAAAAAAATAAGTGTCTGCGGATCTTTTCACTTTTATTTTTCAAAAGACGGATCTTCTCCTAGCCCTCCATCAACCGCAACATGTATGAAAGAAAATATAGCTGGTTCGGGATATATTATCGTTGATCCAGATTTCACTGGTAAACAAGTTGTCACGGAGTCCTCAGGAAATATCCG ]
[+] EMBL CD097796 [AATCTGTAGTGCCGCCCAATATTCCTGCTATCAAAGCATGAAACAAGAAGTACTTCAGTATTTGCTGTATGATGAGATGAATACGGAAGGCCAGTTATTCAGGATTAAAAAAAATGATGTGGTTCATTACGTTTTGGATGTATCTCTGATTGGTTGCAATATCCGGTTTTTTATTAATTATCCCGATTCTGGCGTTCCATTTCAGCGGTTGCAATATCGGGAGCTGCCTTTGAATAACCCAACTCTTACTGGCAAACAATCGGATTGTTTTGATAGTTTTTTCGAGTTAAAAAAAATAAGTGTCTGCGGATCTTTTCACTTTTATTTTTCAAAAGACGGATCTTCTCCTAGCCCTCCATCAANCGCAACATGTATGTAAGAGAATATAGCT ]
[-] EMBL CD098151 [ TGATTGGTTGCAATATCCGGTTTTTTATTAATTATCCCGATTCTGGCGTTCCATTTCAGCGGTTGCAATATCGGGAGCTGCCTTTGAATAACCCAACTCTTACTGGCAAACAATCGGATTGTTTTGATAGTTTTTTCGAGTTAAAAAAAATAAGTGTCTGCGGATCTTTTCACTTTTATTTTTCAAAAGACGGATCTTCTCCTAGCCCTCCATCAACCGCAACATGTATGAAAGAAAATATAGCTGGTTCGGGATATATTATCGTTGATCCAGATTTCACTGGTAAACAAGTTGTCACGGAGTCCTCAGGAAATATCCGTGGAAAAAATTGGGATTTAAGTGGCGTGGTTCTTCAGTCTTATTTGTCTAAAAATCTTGGAATATTCCCTGAATGGGAGTCAA ]
[+] EMBL CD161671 [ ATAGCTGGTTCGGGATATATTATCGTTGATCCAGATTTCACTGGTAAACAAGTTGTCACGGAGTCCTCAGGAAATATCCGTGGAAAAAATTGGGATTTAAGTGGCGTGGTTCTTCAGTCTTATTTGTCTAAAAATCTTGGAATATTCCCTGAATGGGAGTCAAGACTTCATACAGTCAGGAATGGTAGTTATAATATGATTCACTTTACTCCTCTTCAAGAACTTGGGTATTCTCGTTCTGCTTATTCTCTCAAAGATCAACTCACGGTCAATCCTAGCTTTACCCCACCTGGAGCAACGAAGAAGGTAGACTGGACGGATATTGAATGCTTTGTCAAACATTTGGAAAATAATTGGGCA ]
[+] EMBL CD161685 [ TAGCTGGTTCGGGATATATTATCGTTGATCCAGATTTCACTGGTAAGCAAGTTGTCACGGAGTCCTCAGGAAATATCCGTGGAAAAAATTGGGTTTTAAGTGGCGTGGTTCTTCAGTCTTATTTGTCTAAAAATCTTGGAATATTCCCTGAATGGGAGTCAAGACTTCATACAGTCAGGAATGGTAGTTATAATATGATTCACTTTACTCCTCTTCAAGAACTTGGGTATTCTCGTTCTGCTTATTCTCTCAAAGATCAACTCACGGTCAATCCTAGCTTTACCCCACCTGGAGCAACGAAGAAGGTAGACTGGACGGATATTGAATGCTTTGTCAAACATTTGGAAAATAATTGGGCA ]
[-] EMBL CD189752 [ CAGTCTTATTTGTCTAAAAATCTTGGAATATTCCCTGAATGGGAGTCAAGACTTCATACAGTCAGGAATGGTAGTTATAATATGATTCACTTTACTCCTCTTCAAGAACTTGGGTATTCTCGTTCTGCTTATTCTCTCAAAGATCAACTCACGGTCAATCCTAGCTTTACCCCACCTGGAGCAACGAAGAAGGTAGACTGGACGGATATTGAATGCTTTGTCAAACATTTGGAAAATAATTGGGCAGTACTTAGTATGACGGACTTAGTTTTTAATCATACATCAAATGATAGCCCCTGGGTTCACGAACATCCTGAATGTGCTTACAACGTTGTTAATTCTCCTCATCTAGCTCCAGCGTATATCCTGGATCATATTGTCTGGCGTTTAACTATAGAAGCCAGTACTG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||