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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8150#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 748 fasta sequence
[GAATCGATTCATATTTAACAGTATGATAAATATGATCTGACTCTATTTACATTTTATTAAGTATATTTGAGGAAAGATATGGACGAGTCAATTACTCTAGAAACCACTGTCTATAAATTGTGGGTAAGGTCACAACAA-TAATTGAAGTAAATGGAAAAATTTTTCTTCGAGGCTTATTGGAATTCACCTTTGGTCAATTTTATTTTTCTGCGTTTCGATAACCTTTTACAAAAATCTACTCAAACACATAATATTGTTCAATTCAAAGATGTAAACGTTTATCATTCTTAACAAAAAGAAACTAAGTAACGACAATAGTTGAAGTGATGAAAAGATTAGAGACAAAGAACACTTAGAAATGTCAGTAACATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAACCTCAATT-AAATCTTTTTCCTAATATGTGATTTTAAAGGAAAGAGCTTTATTGAAAATGAGCTCTTGGAAAATAACAAACAATTAAAAATATTCGTTAATAATTTAGTTAAAAATAAGCATATATATATAACAGATCATTTTCTTACCAATGGAGTAAACATAAACGTGTTTTATTTATTTATTTAAACACATAAATATTGGTACAAGGAAGCACCAAATACATATGCGCCACACAAATCTCATTTGATTTGTGTGAGGACTGTGATACTGCCCAGGTGCTCAGAATGAAGCAGGTGGTTTTCCTA-GGGGGCCACACCCGAAGCCTTCGACCTAGA]
[+] EMBL CD112160 [GAATCGATTCATATTTAACAGTATGATAAATATGATCTGACTCTATTTACATTTTATTAAGTATATTTGAGGAAAGATATGGACGAGTCAATTACTCTAGAAACCACTGTCTATAAATTGTGGGTAAGGTCACAACAA TAATTGAAGTAAATGGAAAAATTTTTCTTCGAGGCTTATTGAAATTCACCTTTGGTCAATTTTATTTTTCTGCGTTTCGATAACCTTTTACAAAAATCTACTCAAACACATAATATTGTTCAATTCAAAGATGTAAACGTTTATCATTCTTAACAAAAAGAAACTAAGTAACGACAATAGTTGAAGTGATGAAAAGATTAGAGACAAAGAACACTTAGAAATGTCAGTAACATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAACCTCAATT AAATCTTTTTCCTAATATGTGATTTTAAAGGAAAGAGCTTTATTGAAAATGAGCTCTTGGAAAATAACAAACAATTAAAAATATTCGTTAATAATTT ]
[+] EMBL CD112181 [ AACAGTATGATAAATATGATCTGACTCTATTTACATTTTATTAAGTATATTTGAGGAAAGATATGGACGAGTCAATTACTCTAGAAACCACTGTCTATAAATTGTGGGTAAGGTCACAACAA TAATTGAAGTAAATGGAAAAATTTTTCTTCGAGGCTTATTGGAATTCACCTTTGGTCAATTTTATTTTTCTGCGTTTCGATAACCTTTTACAAAAATCAACTCAAACACATAATATTGTTCAATTCAAAGATGTAAACGTTTATCATTCTTAACAAAAAGAAACTAAGTAACGACAATAGTTGAAGTGATGAAAAGATTAGAGACAAAGAACACTTAGAAATGTCAGTAACATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAACCTCAATT AAATCTTTTTCCTAAT ]
[+] EMBL CD112381 [ ACAACAA TAATTGAAGTAAATGGAAAAATTTTTCTTCGAGGCTTATTGGAATTCACCTTTGGTCAATTTTATTTTTCTGCGTTTCGATAACCTTTTACAAAAATCTACTCAAACACATAATATTGTTCAATTCAAAGATGTAAACGTTTATCATTCTTAACAAAAAGAAACTAAGTAACGACAATAGTTGAAGTGATGAAAAGATTAGAGACAAAGAACACTTAGAAATGTCAGTAACATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAACCTCAATT AAATCTTTTTCCTAATATGTGATTTTAAAGGAAAGAGCTTTATTGAAAATGAGCTCTTGGAAAATAACAAACAATTAAAAATATTCGTTAATAATTTAGTTAAAAATAAGCATATATATATAACAGATCATTTTCTTACCAGTGGAGTNAACATAAACGTG ]
[+] EMBL CD112607 [ ACAACAAGTAATTGAAGTAAATGGAAAAATTTTTCTTCGAGGCTTATTGGAATTCACCTTTGGTCAATTTTATTTTTCTGCGTTTCGATAACCTTTTACAAAAATCTACTCAAACACATAATATTGTTCAATTCAAAGATGTAAACGTTTATCATTCTTAACAAAAAGAAACTAAGTAACGACAATAGTTGAAGTGATGAAAAGATTAGAGACAAAGAACACTTAGAAATGCCAGTAACATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAACCTCAATT AAATCTTTTTCCTAATATGTGATTTTAAAGGAAAGAGCTTTATTGAAAATGAGCTCTTGGAAAATAACAAACAATTAAAAATATTCGTTAATAATTTAGTTAAAAATAAGCATATATATATAACAGATCATTTTCTTACCAAT ]
[-] EMBL CD112395 [ CAATTCAAAGATGTAAACGTTTATCATTCTTAACAAAAAGAAACTAAGTAACGACAATAGTTGAAGTGATGAAAAGATTAGAGACAAAGAACACTTAGAAATGTCAGTAACATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAACCTCAATT AAATCTTTTTCCTAATATGTGATTTTAAAGGAAAGAGCTTTATTGAAAATGAGCTCTTGGAAAATAACAAACAATTAAAAATATTCGTTAATAATTTAGTTAAAAATAAGCATATATATATAACAGATCATTTTCTTACCAATGGAGTAAACATAAACGTGTTTTATTTATTTATTTAAACACATAAATATTGGTACAAGGAAGCACCAAATACATATGCGCCACACAAATCTCATTTGATTTGTGTGAGGACTGTGATACTGCCCAGGTGCTCAGAATGAAGCAGGTGGTTTTCCTA GGGGGCCACACCCGAAGCCTTCGACCTAGA]
[-] EMBL CD112487 [ CATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAGCCTCAATTGAAATCTTTTTCCTAATATGTGATTTTAAAGGAAAGAGCTTTATTGAAAATGAGCTCTTGGAAAATAACAAACAATTAAAAATATTCGTTAATAATTTAGTTAAAAATAAGCATATATATATAACAGATCATTTTCTTACCAATGGAGTAAACATAAACGTGTTTTATTTATTTATTTAAACACATAAATATTGGTACAAGGAAGCACCAAATACATATGCGCCACACAAATCTCATTTGATTTGTGTGAGGACTGTGATACTGCCCAGGTGCTCAGAATGAAGCAGGTGGTTTTCCTATGGGGGCCACACCCGAAGCCTTCGACCTAaa]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||