These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8150#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 748 fasta sequence [GAATCGATTCATATTTAACAGTATGATAAATATGATCTGACTCTATTTACATTTTATTAAGTATATTTGAGGAAAGATATGGACGAGTCAATTACTCTAGAAACCACTGTCTATAAATTGTGGGTAAGGTCACAACAA-TAATTGAAGTAAATGGAAAAATTTTTCTTCGAGGCTTATTGGAATTCACCTTTGGTCAATTTTATTTTTCTGCGTTTCGATAACCTTTTACAAAAATCTACTCAAACACATAATATTGTTCAATTCAAAGATGTAAACGTTTATCATTCTTAACAAAAAGAAACTAAGTAACGACAATAGTTGAAGTGATGAAAAGATTAGAGACAAAGAACACTTAGAAATGTCAGTAACATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAACCTCAATT-AAATCTTTTTCCTAATATGTGATTTTAAAGGAAAGAGCTTTATTGAAAATGAGCTCTTGGAAAATAACAAACAATTAAAAATATTCGTTAATAATTTAGTTAAAAATAAGCATATATATATAACAGATCATTTTCTTACCAATGGAGTAAACATAAACGTGTTTTATTTATTTATTTAAACACATAAATATTGGTACAAGGAAGCACCAAATACATATGCGCCACACAAATCTCATTTGATTTGTGTGAGGACTGTGATACTGCCCAGGTGCTCAGAATGAAGCAGGTGGTTTTCCTA-GGGGGCCACACCCGAAGCCTTCGACCTAGA] [+] EMBL CD112160 [GAATCGATTCATATTTAACAGTATGATAAATATGATCTGACTCTATTTACATTTTATTAAGTATATTTGAGGAAAGATATGGACGAGTCAATTACTCTAGAAACCACTGTCTATAAATTGTGGGTAAGGTCACAACAA TAATTGAAGTAAATGGAAAAATTTTTCTTCGAGGCTTATTGAAATTCACCTTTGGTCAATTTTATTTTTCTGCGTTTCGATAACCTTTTACAAAAATCTACTCAAACACATAATATTGTTCAATTCAAAGATGTAAACGTTTATCATTCTTAACAAAAAGAAACTAAGTAACGACAATAGTTGAAGTGATGAAAAGATTAGAGACAAAGAACACTTAGAAATGTCAGTAACATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAACCTCAATT AAATCTTTTTCCTAATATGTGATTTTAAAGGAAAGAGCTTTATTGAAAATGAGCTCTTGGAAAATAACAAACAATTAAAAATATTCGTTAATAATTT ] [+] EMBL CD112181 [ AACAGTATGATAAATATGATCTGACTCTATTTACATTTTATTAAGTATATTTGAGGAAAGATATGGACGAGTCAATTACTCTAGAAACCACTGTCTATAAATTGTGGGTAAGGTCACAACAA TAATTGAAGTAAATGGAAAAATTTTTCTTCGAGGCTTATTGGAATTCACCTTTGGTCAATTTTATTTTTCTGCGTTTCGATAACCTTTTACAAAAATCAACTCAAACACATAATATTGTTCAATTCAAAGATGTAAACGTTTATCATTCTTAACAAAAAGAAACTAAGTAACGACAATAGTTGAAGTGATGAAAAGATTAGAGACAAAGAACACTTAGAAATGTCAGTAACATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAACCTCAATT AAATCTTTTTCCTAAT ] [+] EMBL CD112381 [ ACAACAA TAATTGAAGTAAATGGAAAAATTTTTCTTCGAGGCTTATTGGAATTCACCTTTGGTCAATTTTATTTTTCTGCGTTTCGATAACCTTTTACAAAAATCTACTCAAACACATAATATTGTTCAATTCAAAGATGTAAACGTTTATCATTCTTAACAAAAAGAAACTAAGTAACGACAATAGTTGAAGTGATGAAAAGATTAGAGACAAAGAACACTTAGAAATGTCAGTAACATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAACCTCAATT AAATCTTTTTCCTAATATGTGATTTTAAAGGAAAGAGCTTTATTGAAAATGAGCTCTTGGAAAATAACAAACAATTAAAAATATTCGTTAATAATTTAGTTAAAAATAAGCATATATATATAACAGATCATTTTCTTACCAGTGGAGTNAACATAAACGTG ] [+] EMBL CD112607 [ ACAACAAGTAATTGAAGTAAATGGAAAAATTTTTCTTCGAGGCTTATTGGAATTCACCTTTGGTCAATTTTATTTTTCTGCGTTTCGATAACCTTTTACAAAAATCTACTCAAACACATAATATTGTTCAATTCAAAGATGTAAACGTTTATCATTCTTAACAAAAAGAAACTAAGTAACGACAATAGTTGAAGTGATGAAAAGATTAGAGACAAAGAACACTTAGAAATGCCAGTAACATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAACCTCAATT AAATCTTTTTCCTAATATGTGATTTTAAAGGAAAGAGCTTTATTGAAAATGAGCTCTTGGAAAATAACAAACAATTAAAAATATTCGTTAATAATTTAGTTAAAAATAAGCATATATATATAACAGATCATTTTCTTACCAAT ] [-] EMBL CD112395 [ CAATTCAAAGATGTAAACGTTTATCATTCTTAACAAAAAGAAACTAAGTAACGACAATAGTTGAAGTGATGAAAAGATTAGAGACAAAGAACACTTAGAAATGTCAGTAACATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAACCTCAATT AAATCTTTTTCCTAATATGTGATTTTAAAGGAAAGAGCTTTATTGAAAATGAGCTCTTGGAAAATAACAAACAATTAAAAATATTCGTTAATAATTTAGTTAAAAATAAGCATATATATATAACAGATCATTTTCTTACCAATGGAGTAAACATAAACGTGTTTTATTTATTTATTTAAACACATAAATATTGGTACAAGGAAGCACCAAATACATATGCGCCACACAAATCTCATTTGATTTGTGTGAGGACTGTGATACTGCCCAGGTGCTCAGAATGAAGCAGGTGGTTTTCCTA GGGGGCCACACCCGAAGCCTTCGACCTAGA] [-] EMBL CD112487 [ CATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAGCCTCAATTGAAATCTTTTTCCTAATATGTGATTTTAAAGGAAAGAGCTTTATTGAAAATGAGCTCTTGGAAAATAACAAACAATTAAAAATATTCGTTAATAATTTAGTTAAAAATAAGCATATATATATAACAGATCATTTTCTTACCAATGGAGTAAACATAAACGTGTTTTATTTATTTATTTAAACACATAAATATTGGTACAAGGAAGCACCAAATACATATGCGCCACACAAATCTCATTTGATTTGTGTGAGGACTGTGATACTGCCCAGGTGCTCAGAATGAAGCAGGTGGTTTTCCTATGGGGGCCACACCCGAAGCCTTCGACCTAaa] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||