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Schistosoma mansoni
cluster # 8150 cluster # 8150       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8150#0 length = 748 sequences # 6  

consensusID : consensus_8150#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 748
fasta sequence
                              [GAATCGATTCATATTTAACAGTATGATAAATATGATCTGACTCTATTTACATTTTATTAAGTATATTTGAGGAAAGATATGGACGAGTCAATTACTCTAGAAACCACTGTCTATAAATTGTGGGTAAGGTCACAACAA-TAATTGAAGTAAATGGAAAAATTTTTCTTCGAGGCTTATTGGAATTCACCTTTGGTCAATTTTATTTTTCTGCGTTTCGATAACCTTTTACAAAAATCTACTCAAACACATAATATTGTTCAATTCAAAGATGTAAACGTTTATCATTCTTAACAAAAAGAAACTAAGTAACGACAATAGTTGAAGTGATGAAAAGATTAGAGACAAAGAACACTTAGAAATGTCAGTAACATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAACCTCAATT-AAATCTTTTTCCTAATATGTGATTTTAAAGGAAAGAGCTTTATTGAAAATGAGCTCTTGGAAAATAACAAACAATTAAAAATATTCGTTAATAATTTAGTTAAAAATAAGCATATATATATAACAGATCATTTTCTTACCAATGGAGTAAACATAAACGTGTTTTATTTATTTATTTAAACACATAAATATTGGTACAAGGAAGCACCAAATACATATGCGCCACACAAATCTCATTTGATTTGTGTGAGGACTGTGATACTGCCCAGGTGCTCAGAATGAAGCAGGTGGTTTTCCTA-GGGGGCCACACCCGAAGCCTTCGACCTAGA]

[+] EMBL CD112160             [GAATCGATTCATATTTAACAGTATGATAAATATGATCTGACTCTATTTACATTTTATTAAGTATATTTGAGGAAAGATATGGACGAGTCAATTACTCTAGAAACCACTGTCTATAAATTGTGGGTAAGGTCACAACAA TAATTGAAGTAAATGGAAAAATTTTTCTTCGAGGCTTATTGAAATTCACCTTTGGTCAATTTTATTTTTCTGCGTTTCGATAACCTTTTACAAAAATCTACTCAAACACATAATATTGTTCAATTCAAAGATGTAAACGTTTATCATTCTTAACAAAAAGAAACTAAGTAACGACAATAGTTGAAGTGATGAAAAGATTAGAGACAAAGAACACTTAGAAATGTCAGTAACATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAACCTCAATT AAATCTTTTTCCTAATATGTGATTTTAAAGGAAAGAGCTTTATTGAAAATGAGCTCTTGGAAAATAACAAACAATTAAAAATATTCGTTAATAATTT                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD112181             [                AACAGTATGATAAATATGATCTGACTCTATTTACATTTTATTAAGTATATTTGAGGAAAGATATGGACGAGTCAATTACTCTAGAAACCACTGTCTATAAATTGTGGGTAAGGTCACAACAA TAATTGAAGTAAATGGAAAAATTTTTCTTCGAGGCTTATTGGAATTCACCTTTGGTCAATTTTATTTTTCTGCGTTTCGATAACCTTTTACAAAAATCAACTCAAACACATAATATTGTTCAATTCAAAGATGTAAACGTTTATCATTCTTAACAAAAAGAAACTAAGTAACGACAATAGTTGAAGTGATGAAAAGATTAGAGACAAAGAACACTTAGAAATGTCAGTAACATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAACCTCAATT AAATCTTTTTCCTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD112381             [                                                                                                                                   ACAACAA TAATTGAAGTAAATGGAAAAATTTTTCTTCGAGGCTTATTGGAATTCACCTTTGGTCAATTTTATTTTTCTGCGTTTCGATAACCTTTTACAAAAATCTACTCAAACACATAATATTGTTCAATTCAAAGATGTAAACGTTTATCATTCTTAACAAAAAGAAACTAAGTAACGACAATAGTTGAAGTGATGAAAAGATTAGAGACAAAGAACACTTAGAAATGTCAGTAACATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAACCTCAATT AAATCTTTTTCCTAATATGTGATTTTAAAGGAAAGAGCTTTATTGAAAATGAGCTCTTGGAAAATAACAAACAATTAAAAATATTCGTTAATAATTTAGTTAAAAATAAGCATATATATATAACAGATCATTTTCTTACCAGTGGAGTNAACATAAACGTG                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD112607             [                                                                                                                                   ACAACAAGTAATTGAAGTAAATGGAAAAATTTTTCTTCGAGGCTTATTGGAATTCACCTTTGGTCAATTTTATTTTTCTGCGTTTCGATAACCTTTTACAAAAATCTACTCAAACACATAATATTGTTCAATTCAAAGATGTAAACGTTTATCATTCTTAACAAAAAGAAACTAAGTAACGACAATAGTTGAAGTGATGAAAAGATTAGAGACAAAGAACACTTAGAAATGCCAGTAACATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAACCTCAATT AAATCTTTTTCCTAATATGTGATTTTAAAGGAAAGAGCTTTATTGAAAATGAGCTCTTGGAAAATAACAAACAATTAAAAATATTCGTTAATAATTTAGTTAAAAATAAGCATATATATATAACAGATCATTTTCTTACCAAT                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD112395             [                                                                                                                                                                                                                                                                   CAATTCAAAGATGTAAACGTTTATCATTCTTAACAAAAAGAAACTAAGTAACGACAATAGTTGAAGTGATGAAAAGATTAGAGACAAAGAACACTTAGAAATGTCAGTAACATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAACCTCAATT AAATCTTTTTCCTAATATGTGATTTTAAAGGAAAGAGCTTTATTGAAAATGAGCTCTTGGAAAATAACAAACAATTAAAAATATTCGTTAATAATTTAGTTAAAAATAAGCATATATATATAACAGATCATTTTCTTACCAATGGAGTAAACATAAACGTGTTTTATTTATTTATTTAAACACATAAATATTGGTACAAGGAAGCACCAAATACATATGCGCCACACAAATCTCATTTGATTTGTGTGAGGACTGTGATACTGCCCAGGTGCTCAGAATGAAGCAGGTGGTTTTCCTA GGGGGCCACACCCGAAGCCTTCGACCTAGA]
[-] EMBL CD112487             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAGCCTCAATTGAAATCTTTTTCCTAATATGTGATTTTAAAGGAAAGAGCTTTATTGAAAATGAGCTCTTGGAAAATAACAAACAATTAAAAATATTCGTTAATAATTTAGTTAAAAATAAGCATATATATATAACAGATCATTTTCTTACCAATGGAGTAAACATAAACGTGTTTTATTTATTTATTTAAACACATAAATATTGGTACAAGGAAGCACCAAATACATATGCGCCACACAAATCTCATTTGATTTGTGTGAGGACTGTGATACTGCCCAGGTGCTCAGAATGAAGCAGGTGGTTTTCCTATGGGGGCCACACCCGAAGCCTTCGACCTAaa]


>consensus_8150#0 GAATCGATTCATATTTAACAGTATGATAAATATGATCTGACTCTATTTACATTTTATTAA GTATATTTGAGGAAAGATATGGACGAGTCAATTACTCTAGAAACCACTGTCTATAAATTG TGGGTAAGGTCACAACAATAATTGAAGTAAATGGAAAAATTTTTCTTCGAGGCTTATTGG AATTCACCTTTGGTCAATTTTATTTTTCTGCGTTTCGATAACCTTTTACAAAAATCTACT CAAACACATAATATTGTTCAATTCAAAGATGTAAACGTTTATCATTCTTAACAAAAAGAA ACTAAGTAACGACAATAGTTGAAGTGATGAAAAGATTAGAGACAAAGAACACTTAGAAAT GTCAGTAACATACAAGCGTATATATAAGCAATAAAGGAATTATTTTCAAAAACCTCAATT AAATCTTTTTCCTAATATGTGATTTTAAAGGAAAGAGCTTTATTGAAAATGAGCTCTTGG AAAATAACAAACAATTAAAAATATTCGTTAATAATTTAGTTAAAAATAAGCATATATATA TAACAGATCATTTTCTTACCAATGGAGTAAACATAAACGTGTTTTATTTATTTATTTAAA CACATAAATATTGGTACAAGGAAGCACCAAATACATATGCGCCACACAAATCTCATTTGA TTTGTGTGAGGACTGTGATACTGCCCAGGTGCTCAGAATGAAGCAGGTGGTTTTCCTAGG GGGCCACACCCGAAGCCTTCGACCTAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)