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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8156#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1020 fasta sequence
[AAACGATCTCGTCCTTCATTTCTTTTGATTGCATCTTGTGCTTTAGAAATTTGATTATGTAATCGATTAATTTGTTCATGTGTATGAAATAGTTTACGTTTTAAAATACTTTCATTACAATTTGTAAGAGAAATTTGAGATGTTACGGTATTCTTTGTATTATTATCAGTGTTATTATTATTATTATTAGGATGTGTTGGATTTTGATCATTTCTACTGG-ACGTCGATAATAATGCCATATTAATTAGATTAAAAACGCTTCCACTATGAGAAGTAACATGGCTTTGTGGTGTTTTACTTGACTTTTCTACTGCTTTATCACGACATGCAATGTTTTTTATACGTTTTCGAGATAACACAACATTGTCTAGAGAAGGTCGATGATTCCATTTGACATTATGCACTTGATACTTTTCAAGATTAGTGCATACAGGAGATTGACGACCTTGGTGACAGCGACCAAGTCCACCGTAACCTGGATAACCCATGCTTGCTAATAAACGAGAGCCTATTCCTCGAGTGTGTGCTTCCCAGTCACCAATGGAACTCTGTTTGTCTTCTTTATTAACATTGGGATATTCCTTATCGGTATTTAAATTTGGTGGTTGGTCTGGTAAAAGCGTATTACCGAAGACAAACTGAACCCGTAAACGACGTTTATCATACTGCGAACATGACTGCGATTTAGTCGTCTGTCCACTATTGATCAGTTCGGTGGAAGGTCGAGCATACGAAGTAGTAGAATCCAAATAATCATTAGAATCTCCTGAATCAGTAGTTGATGATGAGATATCACTATCTACAGAAATATCAGAGTCAATATCATCATCATTTACTAATATATGAATACACTCTAGTGGCAAACTAGTTACTTTATCCTCCAAATTT-CGTACGATTGACGCTTCACTGAAATTC-TTCCAGGTTGACTTTTAACATGACCCCATTTCATAACACAAGTGCCTGATACAAAATCTGTTTGAAGAACCCTTGCCTATTGCC-TAAAGAATTGTGATCACTGTT]
[-] EMBL CD139419 [AAACGATCTCGTCCTTCATTTCTTTTGATTGCATCTTGTGCTTTAGAAATTTGATTATGTAATCGATTAATTTGTTTATGTGTATGAAATAGTTTACGTTTTAAAATACTTTCATTACAATTTGTAAGAGAAATTTGAGATGTTACGGTATTCTTTGTATTATTATCAGTGTTATTATTATTATTATTAGGATGTGTTGGATTTTGATCATTTCTACTGG ACGTCGATAATAATGCCATATTAATTAGATTAAAAACGCTTCCACTATGAGAAGTAACATGGCTTTGTGGTGTTTTACTTGACTCTTCGACTGCTCTATCACGACATGCAATGTTTGTTATACGTTTTCGAGATAACACAACATTGTCTAGAGAAGGTCGATGATTCCATTAGACATAATGCACTTGATACTTTTCAAGATTAGTGCATACAGGAGATTGACGACCTTGGT ]
[+] EMBL CD151922 [ GATTATGT ATCGATTAATTTGTTCATGTGTATGAAATAGTTTACGTTTTAAAATACTTTCATTACAATTTGTAAGAGAAATTTGAGATGTTACGGTATTCTTTGTATTATTATCAGTG TTATTATTATTATTAGGATGTGTTGGATTTTGATCATTTCTACTGG ACGTCGATAATAATGCCATATTAATTAGATTAAAAACGCTTCCACTATGAGAAGTAACATGGCTTTGTGGTGTTTTACTTGACTTTTCTACTGCTTTATCACGACATGCAATGTTTTTTATACGTTTTCGAGATAACACAACATTGTCTAGAGAAGGTCGATGATTCC ]
[-] EMBL CD151921 [ ATTATGTAATCGATTAATTTGTTCATGTGTATGAAATAGTTTACGTTTTAAAATACTTTCATTACAATTTGTAAGAGAAATTTGAGATGTTACGGTATTCTTTGTATTATTATCAGTGTTATTATTATTATTATTAGGATGTGTTGGATTTTGATCATTTCTACTGG ACGTCGATAATAATGCCATATTAATTAGATTAAAAACGCTTCCACTATGAGAAGTAACATGGCTTTGTGGTGTTTTACTTGACTTTTCTACTGCTTTATCACGACATGCAATG TTTTTATACGTTTTCGAGATATCACAACATTGTCTAGAGAAGGTCGATGATTCC ]
[+] EMBL CD115436 [ ACTGGCACGTTGATAATAATGCCATATTAATTAGATTAAAAACGCTTCCACTATGAGAAGTAACATGGCTTTGTGGTGTTTTACTTGACTTTTCTACTGCTTTATCACGACATGCAATGTTTTTTATACGTTTTCGAGATAACACAACATTGTCTAGAGAAGGTCGATGATTCCATTTGACATTATGCACTTGATACTTTTCAAGATTAGTGCATACAGGAGATTGACGACCTTGGTGACAGCGACCAAGTCCACCGTAACCTGGATAACCCATGCTTGCTAATAAACGAGAGCCTATTCCTCGAGTGTGTGCTTCCCAGTCACCAATGGAACTCTGTTTGTCTTCTTTATTAACATTGGGATATTCCTTATCGGTATTTAAATTTGGTGGTTGGTCTGGTAAAAGCGTATTACCGAAGACAAACTGAACCCGTAAACGACGTTTATCATACTGCGAACATGACTGCGATTTAGTCGTCTGTCCACTATTGATCAGTTCGGTGGAAGGTCGAGCATACGAAGTAGTAGAATCCAAATAATCATTAGAATCTCCTGAATCAGTAGTTGATGATGAGATATCACTATCTACAGAAATATCAGAGTCAATATCATCATCATTTACTAATATATGAATACACTCTAGTGGCAAACTAGTTACTTTATCCTCCAAATTT CGTACGATTGACGCTTCACTGAAATTC TTCCAGGTTGACTTTTAACATGACCCCATTTCATAACACAAGTGCCTGATACAAAATCTGTTTGAAGAACCCTTGCCTATTGCC TAAAGAATTGTGATCACTGT ]
[-] EMBL CD097841 [ CACGACATGCAATGTTTTTTATACGTTTTCGAGATAACACAACATTGTCTAGAGAAGGTCGATGATTCCATTTGACATTATGCACTTGATACTTTTCAAGATTAGTGCATACAGGAGATTGACGACCTTGGTGACAGCGACCAAGTCCACCGTAACCTGGATAACCCATGCTTGCTAATAAACGAGAGCCTATTCCTCGAGTGTGTGCCTCCCAGTCACCAATGGAACTCTGTTTGTCTTCTTTATTAACATTGGGATATTCCTTATCGGTATCTAAATTTGGTGGTTGGTCTGGTAAAAGCGTATTACCGAAGACAAACTGAACCCGTAAACGACGTTTATCATACTGCGAACATGACTGCGATTTAGTCGTCTGTCC ]
[-] EMBL CD115785 [ TGCGAACATGACTGCGATTTAGTCGTCTGTCCACTATTGATCAGTTCGGTGGAAGGTCGAGCATACGAAGTAGTAGAATCCAAATAATCATTAGAATCTCCTGAATCAGTAGTTGATGATGAGATATCACTATCTACAGAAATATCAGAGTCAATATCATCATCATTTTCTAATATATGAATACACTCTAGTGGCAAACTAGTTACTTTATCCTCCAAATTTCCGTACGATTGACGCTTCACTG AATTCTTTCCAGGTTGACTTTTAACATGACCCCATTCAATAACACAAGTGCCTGATTCAAAATCTGTTTGAAGAAGCCTTGCATAATGCCATAAAGAATTGTGATCACTGTT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||