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Schistosoma mansoni
cluster # 8156 cluster # 8156       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8156#0 length = 1020 sequences # 6  

consensusID : consensus_8156#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1020
fasta sequence
                              [AAACGATCTCGTCCTTCATTTCTTTTGATTGCATCTTGTGCTTTAGAAATTTGATTATGTAATCGATTAATTTGTTCATGTGTATGAAATAGTTTACGTTTTAAAATACTTTCATTACAATTTGTAAGAGAAATTTGAGATGTTACGGTATTCTTTGTATTATTATCAGTGTTATTATTATTATTATTAGGATGTGTTGGATTTTGATCATTTCTACTGG-ACGTCGATAATAATGCCATATTAATTAGATTAAAAACGCTTCCACTATGAGAAGTAACATGGCTTTGTGGTGTTTTACTTGACTTTTCTACTGCTTTATCACGACATGCAATGTTTTTTATACGTTTTCGAGATAACACAACATTGTCTAGAGAAGGTCGATGATTCCATTTGACATTATGCACTTGATACTTTTCAAGATTAGTGCATACAGGAGATTGACGACCTTGGTGACAGCGACCAAGTCCACCGTAACCTGGATAACCCATGCTTGCTAATAAACGAGAGCCTATTCCTCGAGTGTGTGCTTCCCAGTCACCAATGGAACTCTGTTTGTCTTCTTTATTAACATTGGGATATTCCTTATCGGTATTTAAATTTGGTGGTTGGTCTGGTAAAAGCGTATTACCGAAGACAAACTGAACCCGTAAACGACGTTTATCATACTGCGAACATGACTGCGATTTAGTCGTCTGTCCACTATTGATCAGTTCGGTGGAAGGTCGAGCATACGAAGTAGTAGAATCCAAATAATCATTAGAATCTCCTGAATCAGTAGTTGATGATGAGATATCACTATCTACAGAAATATCAGAGTCAATATCATCATCATTTACTAATATATGAATACACTCTAGTGGCAAACTAGTTACTTTATCCTCCAAATTT-CGTACGATTGACGCTTCACTGAAATTC-TTCCAGGTTGACTTTTAACATGACCCCATTTCATAACACAAGTGCCTGATACAAAATCTGTTTGAAGAACCCTTGCCTATTGCC-TAAAGAATTGTGATCACTGTT]

[-] EMBL CD139419             [AAACGATCTCGTCCTTCATTTCTTTTGATTGCATCTTGTGCTTTAGAAATTTGATTATGTAATCGATTAATTTGTTTATGTGTATGAAATAGTTTACGTTTTAAAATACTTTCATTACAATTTGTAAGAGAAATTTGAGATGTTACGGTATTCTTTGTATTATTATCAGTGTTATTATTATTATTATTAGGATGTGTTGGATTTTGATCATTTCTACTGG ACGTCGATAATAATGCCATATTAATTAGATTAAAAACGCTTCCACTATGAGAAGTAACATGGCTTTGTGGTGTTTTACTTGACTCTTCGACTGCTCTATCACGACATGCAATGTTTGTTATACGTTTTCGAGATAACACAACATTGTCTAGAGAAGGTCGATGATTCCATTAGACATAATGCACTTGATACTTTTCAAGATTAGTGCATACAGGAGATTGACGACCTTGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD151922             [                                                    GATTATGT ATCGATTAATTTGTTCATGTGTATGAAATAGTTTACGTTTTAAAATACTTTCATTACAATTTGTAAGAGAAATTTGAGATGTTACGGTATTCTTTGTATTATTATCAGTG   TTATTATTATTATTAGGATGTGTTGGATTTTGATCATTTCTACTGG ACGTCGATAATAATGCCATATTAATTAGATTAAAAACGCTTCCACTATGAGAAGTAACATGGCTTTGTGGTGTTTTACTTGACTTTTCTACTGCTTTATCACGACATGCAATGTTTTTTATACGTTTTCGAGATAACACAACATTGTCTAGAGAAGGTCGATGATTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD151921             [                                                     ATTATGTAATCGATTAATTTGTTCATGTGTATGAAATAGTTTACGTTTTAAAATACTTTCATTACAATTTGTAAGAGAAATTTGAGATGTTACGGTATTCTTTGTATTATTATCAGTGTTATTATTATTATTATTAGGATGTGTTGGATTTTGATCATTTCTACTGG ACGTCGATAATAATGCCATATTAATTAGATTAAAAACGCTTCCACTATGAGAAGTAACATGGCTTTGTGGTGTTTTACTTGACTTTTCTACTGCTTTATCACGACATGCAATG TTTTTATACGTTTTCGAGATATCACAACATTGTCTAGAGAAGGTCGATGATTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD115436             [                                                                                                                                                                                                                       ACTGGCACGTTGATAATAATGCCATATTAATTAGATTAAAAACGCTTCCACTATGAGAAGTAACATGGCTTTGTGGTGTTTTACTTGACTTTTCTACTGCTTTATCACGACATGCAATGTTTTTTATACGTTTTCGAGATAACACAACATTGTCTAGAGAAGGTCGATGATTCCATTTGACATTATGCACTTGATACTTTTCAAGATTAGTGCATACAGGAGATTGACGACCTTGGTGACAGCGACCAAGTCCACCGTAACCTGGATAACCCATGCTTGCTAATAAACGAGAGCCTATTCCTCGAGTGTGTGCTTCCCAGTCACCAATGGAACTCTGTTTGTCTTCTTTATTAACATTGGGATATTCCTTATCGGTATTTAAATTTGGTGGTTGGTCTGGTAAAAGCGTATTACCGAAGACAAACTGAACCCGTAAACGACGTTTATCATACTGCGAACATGACTGCGATTTAGTCGTCTGTCCACTATTGATCAGTTCGGTGGAAGGTCGAGCATACGAAGTAGTAGAATCCAAATAATCATTAGAATCTCCTGAATCAGTAGTTGATGATGAGATATCACTATCTACAGAAATATCAGAGTCAATATCATCATCATTTACTAATATATGAATACACTCTAGTGGCAAACTAGTTACTTTATCCTCCAAATTT CGTACGATTGACGCTTCACTGAAATTC TTCCAGGTTGACTTTTAACATGACCCCATTTCATAACACAAGTGCCTGATACAAAATCTGTTTGAAGAACCCTTGCCTATTGCC TAAAGAATTGTGATCACTGT ]
[-] EMBL CD097841             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CACGACATGCAATGTTTTTTATACGTTTTCGAGATAACACAACATTGTCTAGAGAAGGTCGATGATTCCATTTGACATTATGCACTTGATACTTTTCAAGATTAGTGCATACAGGAGATTGACGACCTTGGTGACAGCGACCAAGTCCACCGTAACCTGGATAACCCATGCTTGCTAATAAACGAGAGCCTATTCCTCGAGTGTGTGCCTCCCAGTCACCAATGGAACTCTGTTTGTCTTCTTTATTAACATTGGGATATTCCTTATCGGTATCTAAATTTGGTGGTTGGTCTGGTAAAAGCGTATTACCGAAGACAAACTGAACCCGTAAACGACGTTTATCATACTGCGAACATGACTGCGATTTAGTCGTCTGTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD115785             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGCGAACATGACTGCGATTTAGTCGTCTGTCCACTATTGATCAGTTCGGTGGAAGGTCGAGCATACGAAGTAGTAGAATCCAAATAATCATTAGAATCTCCTGAATCAGTAGTTGATGATGAGATATCACTATCTACAGAAATATCAGAGTCAATATCATCATCATTTTCTAATATATGAATACACTCTAGTGGCAAACTAGTTACTTTATCCTCCAAATTTCCGTACGATTGACGCTTCACTG AATTCTTTCCAGGTTGACTTTTAACATGACCCCATTCAATAACACAAGTGCCTGATTCAAAATCTGTTTGAAGAAGCCTTGCATAATGCCATAAAGAATTGTGATCACTGTT]


>consensus_8156#0 AAACGATCTCGTCCTTCATTTCTTTTGATTGCATCTTGTGCTTTAGAAATTTGATTATGT AATCGATTAATTTGTTCATGTGTATGAAATAGTTTACGTTTTAAAATACTTTCATTACAA TTTGTAAGAGAAATTTGAGATGTTACGGTATTCTTTGTATTATTATCAGTGTTATTATTA TTATTATTAGGATGTGTTGGATTTTGATCATTTCTACTGGACGTCGATAATAATGCCATA TTAATTAGATTAAAAACGCTTCCACTATGAGAAGTAACATGGCTTTGTGGTGTTTTACTT GACTTTTCTACTGCTTTATCACGACATGCAATGTTTTTTATACGTTTTCGAGATAACACA ACATTGTCTAGAGAAGGTCGATGATTCCATTTGACATTATGCACTTGATACTTTTCAAGA TTAGTGCATACAGGAGATTGACGACCTTGGTGACAGCGACCAAGTCCACCGTAACCTGGA TAACCCATGCTTGCTAATAAACGAGAGCCTATTCCTCGAGTGTGTGCTTCCCAGTCACCA ATGGAACTCTGTTTGTCTTCTTTATTAACATTGGGATATTCCTTATCGGTATTTAAATTT GGTGGTTGGTCTGGTAAAAGCGTATTACCGAAGACAAACTGAACCCGTAAACGACGTTTA TCATACTGCGAACATGACTGCGATTTAGTCGTCTGTCCACTATTGATCAGTTCGGTGGAA GGTCGAGCATACGAAGTAGTAGAATCCAAATAATCATTAGAATCTCCTGAATCAGTAGTT GATGATGAGATATCACTATCTACAGAAATATCAGAGTCAATATCATCATCATTTACTAAT ATATGAATACACTCTAGTGGCAAACTAGTTACTTTATCCTCCAAATTTCGTACGATTGAC GCTTCACTGAAATTCTTCCAGGTTGACTTTTAACATGACCCCATTTCATAACACAAGTGC CTGATACAAAATCTGTTTGAAGAACCCTTGCCTATTGCCTAAAGAATTGTGATCACTGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)