These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8156#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1020 fasta sequence [AAACGATCTCGTCCTTCATTTCTTTTGATTGCATCTTGTGCTTTAGAAATTTGATTATGTAATCGATTAATTTGTTCATGTGTATGAAATAGTTTACGTTTTAAAATACTTTCATTACAATTTGTAAGAGAAATTTGAGATGTTACGGTATTCTTTGTATTATTATCAGTGTTATTATTATTATTATTAGGATGTGTTGGATTTTGATCATTTCTACTGG-ACGTCGATAATAATGCCATATTAATTAGATTAAAAACGCTTCCACTATGAGAAGTAACATGGCTTTGTGGTGTTTTACTTGACTTTTCTACTGCTTTATCACGACATGCAATGTTTTTTATACGTTTTCGAGATAACACAACATTGTCTAGAGAAGGTCGATGATTCCATTTGACATTATGCACTTGATACTTTTCAAGATTAGTGCATACAGGAGATTGACGACCTTGGTGACAGCGACCAAGTCCACCGTAACCTGGATAACCCATGCTTGCTAATAAACGAGAGCCTATTCCTCGAGTGTGTGCTTCCCAGTCACCAATGGAACTCTGTTTGTCTTCTTTATTAACATTGGGATATTCCTTATCGGTATTTAAATTTGGTGGTTGGTCTGGTAAAAGCGTATTACCGAAGACAAACTGAACCCGTAAACGACGTTTATCATACTGCGAACATGACTGCGATTTAGTCGTCTGTCCACTATTGATCAGTTCGGTGGAAGGTCGAGCATACGAAGTAGTAGAATCCAAATAATCATTAGAATCTCCTGAATCAGTAGTTGATGATGAGATATCACTATCTACAGAAATATCAGAGTCAATATCATCATCATTTACTAATATATGAATACACTCTAGTGGCAAACTAGTTACTTTATCCTCCAAATTT-CGTACGATTGACGCTTCACTGAAATTC-TTCCAGGTTGACTTTTAACATGACCCCATTTCATAACACAAGTGCCTGATACAAAATCTGTTTGAAGAACCCTTGCCTATTGCC-TAAAGAATTGTGATCACTGTT] [-] EMBL CD139419 [AAACGATCTCGTCCTTCATTTCTTTTGATTGCATCTTGTGCTTTAGAAATTTGATTATGTAATCGATTAATTTGTTTATGTGTATGAAATAGTTTACGTTTTAAAATACTTTCATTACAATTTGTAAGAGAAATTTGAGATGTTACGGTATTCTTTGTATTATTATCAGTGTTATTATTATTATTATTAGGATGTGTTGGATTTTGATCATTTCTACTGG ACGTCGATAATAATGCCATATTAATTAGATTAAAAACGCTTCCACTATGAGAAGTAACATGGCTTTGTGGTGTTTTACTTGACTCTTCGACTGCTCTATCACGACATGCAATGTTTGTTATACGTTTTCGAGATAACACAACATTGTCTAGAGAAGGTCGATGATTCCATTAGACATAATGCACTTGATACTTTTCAAGATTAGTGCATACAGGAGATTGACGACCTTGGT ] [+] EMBL CD151922 [ GATTATGT ATCGATTAATTTGTTCATGTGTATGAAATAGTTTACGTTTTAAAATACTTTCATTACAATTTGTAAGAGAAATTTGAGATGTTACGGTATTCTTTGTATTATTATCAGTG TTATTATTATTATTAGGATGTGTTGGATTTTGATCATTTCTACTGG ACGTCGATAATAATGCCATATTAATTAGATTAAAAACGCTTCCACTATGAGAAGTAACATGGCTTTGTGGTGTTTTACTTGACTTTTCTACTGCTTTATCACGACATGCAATGTTTTTTATACGTTTTCGAGATAACACAACATTGTCTAGAGAAGGTCGATGATTCC ] [-] EMBL CD151921 [ ATTATGTAATCGATTAATTTGTTCATGTGTATGAAATAGTTTACGTTTTAAAATACTTTCATTACAATTTGTAAGAGAAATTTGAGATGTTACGGTATTCTTTGTATTATTATCAGTGTTATTATTATTATTATTAGGATGTGTTGGATTTTGATCATTTCTACTGG ACGTCGATAATAATGCCATATTAATTAGATTAAAAACGCTTCCACTATGAGAAGTAACATGGCTTTGTGGTGTTTTACTTGACTTTTCTACTGCTTTATCACGACATGCAATG TTTTTATACGTTTTCGAGATATCACAACATTGTCTAGAGAAGGTCGATGATTCC ] [+] EMBL CD115436 [ ACTGGCACGTTGATAATAATGCCATATTAATTAGATTAAAAACGCTTCCACTATGAGAAGTAACATGGCTTTGTGGTGTTTTACTTGACTTTTCTACTGCTTTATCACGACATGCAATGTTTTTTATACGTTTTCGAGATAACACAACATTGTCTAGAGAAGGTCGATGATTCCATTTGACATTATGCACTTGATACTTTTCAAGATTAGTGCATACAGGAGATTGACGACCTTGGTGACAGCGACCAAGTCCACCGTAACCTGGATAACCCATGCTTGCTAATAAACGAGAGCCTATTCCTCGAGTGTGTGCTTCCCAGTCACCAATGGAACTCTGTTTGTCTTCTTTATTAACATTGGGATATTCCTTATCGGTATTTAAATTTGGTGGTTGGTCTGGTAAAAGCGTATTACCGAAGACAAACTGAACCCGTAAACGACGTTTATCATACTGCGAACATGACTGCGATTTAGTCGTCTGTCCACTATTGATCAGTTCGGTGGAAGGTCGAGCATACGAAGTAGTAGAATCCAAATAATCATTAGAATCTCCTGAATCAGTAGTTGATGATGAGATATCACTATCTACAGAAATATCAGAGTCAATATCATCATCATTTACTAATATATGAATACACTCTAGTGGCAAACTAGTTACTTTATCCTCCAAATTT CGTACGATTGACGCTTCACTGAAATTC TTCCAGGTTGACTTTTAACATGACCCCATTTCATAACACAAGTGCCTGATACAAAATCTGTTTGAAGAACCCTTGCCTATTGCC TAAAGAATTGTGATCACTGT ] [-] EMBL CD097841 [ CACGACATGCAATGTTTTTTATACGTTTTCGAGATAACACAACATTGTCTAGAGAAGGTCGATGATTCCATTTGACATTATGCACTTGATACTTTTCAAGATTAGTGCATACAGGAGATTGACGACCTTGGTGACAGCGACCAAGTCCACCGTAACCTGGATAACCCATGCTTGCTAATAAACGAGAGCCTATTCCTCGAGTGTGTGCCTCCCAGTCACCAATGGAACTCTGTTTGTCTTCTTTATTAACATTGGGATATTCCTTATCGGTATCTAAATTTGGTGGTTGGTCTGGTAAAAGCGTATTACCGAAGACAAACTGAACCCGTAAACGACGTTTATCATACTGCGAACATGACTGCGATTTAGTCGTCTGTCC ] [-] EMBL CD115785 [ TGCGAACATGACTGCGATTTAGTCGTCTGTCCACTATTGATCAGTTCGGTGGAAGGTCGAGCATACGAAGTAGTAGAATCCAAATAATCATTAGAATCTCCTGAATCAGTAGTTGATGATGAGATATCACTATCTACAGAAATATCAGAGTCAATATCATCATCATTTTCTAATATATGAATACACTCTAGTGGCAAACTAGTTACTTTATCCTCCAAATTTCCGTACGATTGACGCTTCACTG AATTCTTTCCAGGTTGACTTTTAACATGACCCCATTCAATAACACAAGTGCCTGATTCAAAATCTGTTTGAAGAAGCCTTGCATAATGCCATAAAGAATTGTGATCACTGTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||