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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8160#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1239 fasta sequence
[GCCAANATTTCGGCACGAGGCGGAAATGATAGATGTCTACGTAGAGTGAATATGATATCTGAAGAGATGAGATGTATTGGTGTAACGTTTTACAAATTAAACCAACATGAATTAATTAATTGTCCCGAAAAAATGCAAAATATTTGGCAGGAATTGAGAAAATTACCAGAGTTTCAAAGTAGACAGACGAAAATAGCAAACTGTGATAACAATGACTCAATAAGTGATTCCAGAAATTACAAGGTATATCCATTCACTACAGAAAATCAATTCGAGGATGGAAAAACTTTGCCAAATGTTAGTTCAGAAGTTCCGCAAATTGAAGAGTTAAAAAAATCTTTGGTGAAAGTAACTATTCAATACAAAATAGATTCTTCTATCTTTGACATTTTTATAGAAGAGATGAAAAATGTGAAAATTTTAAAAAATGAAACTGAAATGATGTTTCAAGCATTATTCTGCCTTGGTAATACAACCTTATCCGTTGTACGATGCAAACCGATTCGCCTTGATAAAACAAAACCATCTGATGAAGAGAAAAGCACTGATCAAAATGACTTATTCCGCATTTACAATCATATTTCACTTCCTGATGACGAACATGTTTCAGTAAATGTTGATGTGAATCGATTATTAAACTAT-AATAATATTGGAATAATTNTACAAATATTTACACGAACAGATACATCGAATCACTTAAGACGTGTGGCAAATATTTCAATTGGTGTGACTAAATTAACCGATAACTTAGCATCAATTCAGTGGAACGCTTTAATTAAAGAGTTAAAACAATTGAAAAGTAATAACCAATTATTTGGATCAACAAAAAAATTCACTTATTGGCATTTAATAGAATCATCCTGATTAGGGCTCTTTTCTCTCACTTTTTTTCAACTCGTTAAATCAAATATAATTGAAATGAAATAAACATTTAAACAAATGAACAGTTGACATGTTATAAAAATATATTGTGTTTATAAGTTCATAGAGAAAATGTATGAACGCATCCATGCATACATACGTACACGCATGGATATATACATACATATATACATAGAAAAGTAAATTCATATAATTGAATATACCCCGTGACTTAGATATTTGCTATTGTTTATTTGTTTGAGTAGATGAGTTAACTTTTTTTCTGCATATTACAATATTTA-AACTATTTGATAACGCTGTCTTACTTACATTTTTTATCGGATATACATAAAATATATTGTATACCTATTCAAAGGA]
[+] EMBL CD083287 [GCCAANATTTCGGCACGAGGCGGAAATGATAGATGTCTACGTAGAGTGAATATGATATCTGAAGAGATGAGATGTATTGGTGTAACGTTTTACAAATTAAACCAACATGAATTAATTAATTGTCCCGAAAAAATGCAAAATATTTGGCAGGAATTGAGAAAATTACCAGAGTTTCAAAGTAGACAGACGAAAATAGCAAACTGTGATAACAATGACTCAATAAGTGATTCCAGAAATTACAAGGTATATCCATTCACTACAGAAAATCAATTCGAGGATGGAAAAACTTTGCCAAATGTTAGTTCAGAAGTTCCGCAAATTGAAGAGTTAAAAAAATCTTTGGTGAAAGTAACTATTCAATACAAAATAGATTCTTCTATCTTTGACATTTTTATAGAAGAGATGAAAAATGTGAAAATTTTAAAAAATGAAACTGAAATGATGTTTCAAGCATTATTCTGCCTTGGTAATACAACCTTATCCGTTGTACGATGCAAACCGATTCGCCTTGATAAAACAAAACCATCTGATGAAGAGAAAAGCACTGATCAAAATGACTTATTCCGCATTTACAATCATATTTCACTTCCTGATGACGAACATGTTTCAGTAAATGTTGATGTGAATCGATTATTAAACTATNNAT ATATTGGAAATATTNnta ]
[+] EMBL CD082838 [ TTGGCAGGAATTGAGAAAA TACCAGAGTTTCAAAGTAGACAGACGAAAATAGCAAACTGTGATAACAATGACTCAATAAGTGATTCCAGAAATTACAAGGTATATCCATTCACTACAGAAAATCAATTCGAGGATGGAAAAACTTTGCCAAATGTTAGTTCAGAAGTTCCGCAAATTGAAGAGTTAAAAAAATCTTTGGTGAAAGTAACTATTCAATACAAAATAGATTCTTCTATCTTTGACATTTTTATAGAAGAGATGAAAAATGTGAAAATTTTAAAAAATGAAACTGAAATGATGTTTCAAGCATTATTCTGCCTTGGTAATACAACCTTATCCGTTGTACGATGCAAACCGATTCGCCTTGATAAAACAAAACCATCTGATGAAGAGAAAAGCACTGATCAAAATGACTTATTCCGCATTTACAATCATATTTCACTTCCTGATGACGAACATGTTTCAGTAAATGTTGATGTGAATCGATTATTAAACTAT AATAATATTGGAATAATTNTACAAATATTTACACGAACAGATACATCGAATCACTTAAGACGTGTGGCANATATTTCAATTGGTGTGACTAAATTAACCGATNACTTAGCATC ]
[-] EMBL CD139705 [ TGATGTTTCAAGCATTATTCTGCCTTGGTAATACAACCTTATACGTTGTACGATGCGAACCGATTCGCCTTGATAAAACAAAACCATCTGATGAAGAGAAAAGCACTGATCAAAATGACTTATTCCGCATTTACAATCATATTTCACTTCCTGATGACGAACATGTTTCAGTAAATGTTGATGTGAATCGATTATTAAACT ]
[-] EMBL CD076425 [ nAATGACTTATTCCGCATTTACAATCATATTTCACTTCCTGATGACGAACATGTTTCAGTAAATGTTGATGTGAATCGATTATTAAACTAT AATAATATTGGAATAATTTTACAAATATTTACACGAACAGATACATCGAATCACTTAAGACGTGTGGCAAATATTTCAATTGGTGTGACTAAATTAACCGATAACTTAGCATCAATTCAGTGGAACGCTTTAATTAAAGAGTTAAAACAATTGAAAAGTAATAACCAATTATTTGGATCAACAAAAAAATTCACTTATTGGCATTTAATAGAATCATCCTGATTAGGGCTCTTTTCTCTCACTTTTTTTCAACTCGTTAAATCAAATATAATTGAAATGAAATAAACATTTAAACAAATGAACAGTTGACATGTTATAAAAATATATTGTGTTTATAAGTTCATAGAGAAAATGTATGAACGCATCCATGCATACATACGTACACGCATGGATATATACATACATATATACATAGAAAAGTAAATTCATATAATTGAATATACCCCGTGACTTAGATATTTGCTATTGTTTATTTGTTTGAGTAGATGAGTTAACTTTTTTTCTGCATATTACAATATTAT AACTAT ]
[-] EMBL CD076858 [ ACATCGAATCACTTAAGACGTGTGGCAAATATTTCAATTGGTGTGACTAAATTAACCGATAACTTAGCATCAATTCAGTGGAACGCTTTAATTAAAGAGTTAAAACAATTGAAAAGTAATAACCCATTATTTGGATCAACAAAAAAATTCACTTATTGGCATTTAATAGAATCATCCTGATTAGGGCTTTTTTTTTTCACTTTTTTTCAACTCGTTAAATCAAATATAATTGAAATGAAATAAACATTTTAACAAATGAACAGTTGACATGTTATAAAAATATATTGTGTTTATAAGTTCATAGAGAAAATGTATGAACGCATCCATGCATACATACGTACACGCATGGATATATACATACATATATACATAGAAAAGTAAATTCATATAATTGAATATACCCCGTGACTTAGATATTTGCTATTGTTTATTTGTTTGAGTAGATGAGTTAACTTTTTTTTTGCATATTACAATATTTA ]
[-] EMBL CD195760 [ AGTAGAAGAGTTAACTTTTTTTCTGCATATTACAATATTTATAACTA TTGATAACGCTGTCTTACTTACATTTTTTATCGGATATACATAAAATATATTGTATACCTATTCAAAGGA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||