Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8165 cluster # 8165       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8165#0 length = 748 sequences # 6  

consensusID : consensus_8165#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 748
fasta sequence
                              [TCAAAGAGTACAAGATAATTGGGCTTTCTTGTTCGCTCAACGCTTAGCATTGAAATTTAAAGTCCCACTACACGTTTGTTTCTGTTTGGTTCCGAAATTTCAAGCCGAAACGTTACGACATTATACCTTTATGGTTGAAGGATTGAAAGAAGTAGAGAAAGAATGTCGTGAACTTTGTATACCATTTCATATTACATCAGCTATCACTAACAGCTCATCGAACAATCAGCCAGTCAAAACGGGCGTTAAGCGTAAATTACCGGAATCGGTGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTTTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTTGGCTGAACTGCTACCAGAAAATATTCCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAATGTTGTTCCTGTTTGGCATGCATCAGATCACTTAGAATATGCGGCTCGTACAATTAGACCTAAATTACATCAAAAAGCAAACAACTTAATGACTGAGTTCCCGCCGTTGATTAGACATCCCTACTGCCATCAATCAAGTTTATCACCAATAGATTGGAATTATTGGATATCAAAATTTTCGGGAGATTTATCAGTTAAACCAGTTGATTGGGCAATTCCAGGAACCAGTGGGGGTCTCACAACGTTACACACATTCATTTATGAAAGACTGCCTAAATACGCTGATTGTCGTAACGACCCC]

[+] EMBL CD120736             [TCAAAGAGTACAAGATAATTGGGCTTTCTTGTTCGCTCAACGCTTAGCATTGAAATTTAAAGTCCCACTACACGTTTGTTTCTGTTTGGTTCCGAAATTTCAAGCCGAAACGTTACGACATTATACCTTTATGGTTGAAGGATTGAAAGAAGTAGAGAAAGAATGTCGTGAACTTTGTATACCATTTCATATTACATCAGCTATCACTAACAGCTCATCGAACAATCAGCCAGTCAAAACGGGCGTTAAGCGTAAATTACCGGAATCGGTGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTTTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTTGGCTGAACTGCTACCAGAAAATATTCCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAATGTTGTTCCTGTTTGGCATGCATCAGATCACTTAGAATATGCGGCTC                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD130400             [                                                                                                                                                                                                                           GAACAATCAGCCAGTCAAAACGGGCGTTAAGCGTAAATTACCGGAGTCGGTGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTTTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTT GCTGAACTGCTACCAGAAAATATTCCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAATGTTGTTCCTGTTTGGCATGC                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD130306             [                                                                                                                                                                                                                            AACAATCAGCCAGTCAAAACGGGCGTTAAGCGTAAATTACCGGAATCGGTGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTTTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTTGGCTGAACTGCTACCAGAAAATATTCCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAATGTTGTTCCTGTTTGGCATGCATCAGATC CCTAGAATATGCGG                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD079042             [                                                                                                                                                                                                                                     CCAGTCAAAACGGGCGTTAAGCGTAAATTACCGGAATCGGTGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTTTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTTGGCTGAACTGCTACCAGAAAATATTCCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAATGTTGTTCCTGTTTGGCATGCATCAGATCACTTAGAATATGCGGCTCGTACAATTAGACCTAAATTACATCAAAAAGCAAACAACTTAATGACTGAGTTCCCGCCGTTGATTAGACATCCCTACTGCCATCAATCAAGTTTATCACCAATAGATTGGAATTATTGGATATCAAAATTTTCGGGAGATTTATCAGTTAAACCAGTTGATTGGGCAATTCCAGGAACCAGTGGGGGTCTCACAACGTTACACACATTCATTTATGAAAGACTGCCTAAATACGCTGATTGTCGTAACGACCC ]
[-] EMBL CD073495             [                                                                                                                                                                                                                                      CAGTCAAAACGGGCGTTAAGCGTAAATTACCGGAATCGGTGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTTTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTTGGCTGAACTGCTACCAGAAAATATTCCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAATGTTGTTCCTGTTTGGCATGCATCAGATCACTTAGAATATGCGGCTCGTACAATTAGACCTAAATTACATCAAAAAGCAAACAACTTAATGACTGAGTTCCCGCCGTTGATTAGACATCCCTACTGCCATCAATCAAGTTTATCACCAATAGATTGGAATTATTGGATATCAAAATTTTCGGGAGATTTATCAGTTAAACCAGTTGATTGGGCAATTCCAGGAACCAGTGGGGGTCTCACAACGTTACACACATTCATTTATGAAAGACTGCCTAAATACGCTGATTGTCGTAACGACCCC]
[-] EMBL CD130379             [                                                                                                                                                                                                                                                                             TGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTCTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTTGGCTGAACTGCTACCAGAAAATATTTCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAACGTTGTTCCTGTTTGGCATGCATCAGATCAC TAGAATATGCGG                                                                                                                                                                                                                                                                 ]


>consensus_8165#0 TCAAAGAGTACAAGATAATTGGGCTTTCTTGTTCGCTCAACGCTTAGCATTGAAATTTAA AGTCCCACTACACGTTTGTTTCTGTTTGGTTCCGAAATTTCAAGCCGAAACGTTACGACA TTATACCTTTATGGTTGAAGGATTGAAAGAAGTAGAGAAAGAATGTCGTGAACTTTGTAT ACCATTTCATATTACATCAGCTATCACTAACAGCTCATCGAACAATCAGCCAGTCAAAAC GGGCGTTAAGCGTAAATTACCGGAATCGGTGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGC TCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTT TCCTTTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTTGGCTGAACTGCTACCAGAAAATAT TCCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAATGTTGTTCCTGTTTGGCATGCATCAGATCACTT AGAATATGCGGCTCGTACAATTAGACCTAAATTACATCAAAAAGCAAACAACTTAATGAC TGAGTTCCCGCCGTTGATTAGACATCCCTACTGCCATCAATCAAGTTTATCACCAATAGA TTGGAATTATTGGATATCAAAATTTTCGGGAGATTTATCAGTTAAACCAGTTGATTGGGC AATTCCAGGAACCAGTGGGGGTCTCACAACGTTACACACATTCATTTATGAAAGACTGCC TAAATACGCTGATTGTCGTAACGACCCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)