Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8171 cluster # 8171       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8171#0 length = 1563 sequences # 6  

consensusID : consensus_8171#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1563
fasta sequence
                              [TTGTGTTGTTGACCGATACGTCAAGTGTGTAGTCGAGCGCTTCTATGCTTATCATCATCTTGATGAACTGTGTTCAATGCTCAAGAAATCAAATAGTAATAGTTTGAGCAGTAAAAGACATGATTCATCAGCTCAGTCGATCAATAGAGATAAAATATTGGATTCAAGCGAATTAGGATCGGATCGCGTATTAGTCATTGAGCCTATAATTGTTGAAACGCTCCAGATCATTACTTGTTCAGAACTTTATTTGAGATTTATACAGAGGCGAATTTCTGCTGATATTAAACAGTGCAATCTCGCAGAAGATGATTTTAAAAAGAAAAGCAATAAGGTCTCCAAATTTTTTGAAAATTCTCAACTTGTTTGTCAAGTACAAGATTTACTCAGC-AAATATCTTAATTTAGAACAATATTATCTCCGTGT-AACAATTATGAAGGCATTAAGTTCAGATGAAGTCGACAAATCTGGTAATGTATGGTGTTTTATTGACGATGTATTTTTCATCACCAAAAAAAGTCTTATTCGATCTCTTTCATCTGGTAATGTGGATACTATTTGTGCTATGGTGAATCATAGTTGTTCAATACTAATTGATCTTATGGTAAATGATTTTCTGGGCAACATTATTCGTACAGGGTTTCCTTCAGGTTGGGTGCAAGATGCATACAGTTATGTTCAGAATAGTGTTGCTGTGGCTGGTTCACTTAGTTCTTCTTCATCCATTGTCAATGTTCCAACAGTATCATCATTCAATATGATTGGACCTAATTCACTTGCAAGATATCATTTTCTAGTTACTCTTAATAGTATTGAAGCATCTCAGAAGAATTTACTGTCTCTTGTTAATCATCTTGAAAGTGAATTAAATTTACTTTATCAAAATCAAGAAATCAATTCACAGAAACTTGATATGTGTATCACGGAATTAAAAGTTTCTATCTCAGATCAACTTCAAGCATTACTTGATTCTGCCTTCGAGCATCTTTCAACTAGTGTTATTCAAAGTCAAGTAAAAACATTGTTAAATGTTTTCAAGTCATTGAAATATGATTTACTTGAGGAGGATTTAGATGTTTTCGCTGCTAATGATAGATGGATTGAATCATGTATAGCTCATACAGAGGATTTTCTCAGACCATTTAGGTCTGTCTTATCAACTGAGAATAACGATCGATTTGTATTGATTCTCATAAACGAAATTTTGCATCAACTTGATCAATTTATTCAAAGGAAATCATTCAGTAGATTTGGAGCTATTCAACTAGAGAAAGAATATCATAATTTGTTTGCCTATTTAACATCGATATCTTACAGTTCTTTGCGTGATTATTTCACGCGTAGTTTACAGATCTGTAGACTNTTAAATTGGNATCGAGTTGAAAGAAGTCATTATTTTTGGATAGTTCTAATTGGCGTCTACTGCACACAGGTCAGAGTATCTTCTCTAGACGTGATTCGCGTCAGAAAATCAGCCTTAACTACATGACTCATCTATCAGTATCTTTCTTCTTTTATNTCTGAATGAATGAACAAATGGGTTTTGTTTTTCTATTTACATAA]

[+] EMBL CD196685             [TTGTGTTGTTGACCGATACGTCAAGTGTGTAGTCGAGCGCTTCTATGCTTATCATCATCTTGATGAACTGTGTTCAATGCTCAAGAAATCAAATAGTAATAGTTTGAGCAGTAAAAGACATGATTCATCAGCTCAGTCGATCAATAGAGATAAAATATTGGATTCAAGCGAATTAGGATCGGATCGCGTATTAGTCATTGAGCCTATAATTGTTGAAACGCTCCAGATCATTACTTGTTCAGAACTTTATTTGAGATTTATACAGAGGCGAATTTCTGCTGATATTAAACAGTGCAATCTCGCAGAAGATGATTTTAAAAAGAAAAGCAATAAGGTCTCCAAATTTTTTGAAAATTCTCAACTTGTTTGTCAAGTACAAGATTTACCCAGC AAATATCTTAATTTAGAACAATATTATCTCCGTGT AACAATTATGAAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD184890             [                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGCTGATATCAAACAGTGCAATCTCGCAGAAGATGATTTTAAAAAGAAAAGCAATGAGATCTCCAAATTTTTTGAAAGTTCTCAACTTGTTTGTCAAGTACAAGATTTACTCAGT AAATACCTTAATTTAGAACAATATTATCTCCGTGT AACAATTATGAAGGCATTAAGTTCAGATGAAGTCGACAAATCTGGTAATGTATGGTGTTTTATTGACGATGTATTTTTCATCACCAAAAAAAGTCTTATTCGATCTCTTTCATCTGGTAATGTGGATACTATTTGTGCTATGGTGAATCATAGTTGTTCAATACTAATTGATCTTATGGTAAATGATTTTCTGGGCAACATTcgt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD071327             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aTTACTCAGCAAAATATCTTAATTTAGAACAATA TATCTCCGTGTNAACAATTATGAAGGCATTAAGTTCAGATGAAGTTGACAAATCTAATAATGTATGGTGTTTTATTGACGATGTATTTTTCATCACCAAAAAAAGTCTTATTCGATCTCTTCCATCTGGTAATGTGGATACTATTTGTGCTATGGTGAATCATAGTTGTTCAATACTAATTGATCTTATGGTAAATGATTTTCTGGGCAACATTATTCGTACAGGGTTTCCTTCAGGTTGGGTGCAAGATGCATACAGTTATGTTCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD140734             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATACTAATTGATCTTATGGTAAATGATTTTCTGGGCAACATTATTCGTACAGGGTTTCCTTCAGGTTGGGTGCAAGATGCATACAGTTATGTTCAGAATAGTGTTGCTGTGGCTGGTTCACTTAGTTCTTCTTCATCCATTGTCAATGTTCCAACAGTATCATCATTCAATATGATTGGACCTAATTCACTTGCAAGATATCATTTTCTAGTTACTCTTAATAGTATTGAAGCATCTCAGAAGAATTTACTGTCTCTTGTTAATCATCTTGAAAGTGAATTAAATTTACTTTATCAAAATCAAGAAATCAATTCACAGAAACTTGATATGTGTATCACGGAATTAAAAGTTTCTATCTCAGATCAACTTCAAGCATTACTTGATTCTGCCTTCGAGCATCTTTCAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD082444             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTTATGTTCAGAATAGTGTTGCTGTGGCTGGTTCACTTAGTTCTTCTTCATCCATTGTCAATGTTCCAACAGTATCATCATTCAATATGATTGGACCTAATTCACTTGCAAGATATCATTTTCTAGTTACTCTTAATAGTATTGAAGCATCTCAGAAGAATTTACTGTCTCTTGTTAATCATCTTGAAAGTGAATTAAATTTACTTTATCAAAATCAAGAAATCAATTCACAGAAACTTGATATGTGTATCACGGAATTAAAAGTTTCTATCTCAGATCAACTTCAAGCATTACTTGATTCTGCCTTCGAGCATCTTTCAACTAGTGTTATTCAAAGTCAAGTAAAAACATTGTTAAATGTTTTCAAGTCATTGAAATATGATTTACTTGAGGAGGATTTAGATGTTTTCGCTGCTAATGATAGATGGATTGAATCATGTATAGCTCATACAGAGGATTTTCTCAGACCATTTAGGTCTGTCTTATCAACTGAGAATAACGATCGATTTGTATTGATTCTCATAAACGAAATTTTGCATCAACTTGATCAATTTATTCAAAGGAAATCATTCAGTAGATTTGGAGCTATTCAACTAGAGAAAGAATATCATAATTTGTTTGCCTATTTAACATCGATATCTTACAGTTCTTTGCGTGATTATTTCACGCGTAGTTTACAGATCTGTAGACTNTTAAATTGGNATCGAGTTGAAAGAAGTCATTATTTTTGGATAGTTCTAATTGGCGTCTACTGCACACAGGTCAGAGTATCTTCTCTAGACGTGATTCGCGTCAGAAAATCAGCCTTAACTACATGACTCATCTATCAGTATCTTTCTTCTTTTATNTCTGAATGAATGAACAAATGGGTTTTGTTTTTCTATTTACATAA]
[+] EMBL CD200270             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATCAATTCACAGAAACTTGATATGTGTATCACGGAATTAAAAGTTTCTATCTCAGATCAACTTCAAGCATTACTTGATTCTGCCTTCGAGCATCTTTCAACTAGTGTTATTCAAAGTCAAGTAAAAACATTGTTAAATGTTCTCAAGTCATTGAAATATGATTTACTTGAGGAGGATTTAGATGTTTTCGCTGCTAATGATAGATGGATTGAATCATGTATAGCTCATACAGAGGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]


>consensus_8171#0 TTGTGTTGTTGACCGATACGTCAAGTGTGTAGTCGAGCGCTTCTATGCTTATCATCATCT TGATGAACTGTGTTCAATGCTCAAGAAATCAAATAGTAATAGTTTGAGCAGTAAAAGACA TGATTCATCAGCTCAGTCGATCAATAGAGATAAAATATTGGATTCAAGCGAATTAGGATC GGATCGCGTATTAGTCATTGAGCCTATAATTGTTGAAACGCTCCAGATCATTACTTGTTC AGAACTTTATTTGAGATTTATACAGAGGCGAATTTCTGCTGATATTAAACAGTGCAATCT CGCAGAAGATGATTTTAAAAAGAAAAGCAATAAGGTCTCCAAATTTTTTGAAAATTCTCA ACTTGTTTGTCAAGTACAAGATTTACTCAGCAAATATCTTAATTTAGAACAATATTATCT CCGTGTAACAATTATGAAGGCATTAAGTTCAGATGAAGTCGACAAATCTGGTAATGTATG GTGTTTTATTGACGATGTATTTTTCATCACCAAAAAAAGTCTTATTCGATCTCTTTCATC TGGTAATGTGGATACTATTTGTGCTATGGTGAATCATAGTTGTTCAATACTAATTGATCT TATGGTAAATGATTTTCTGGGCAACATTATTCGTACAGGGTTTCCTTCAGGTTGGGTGCA AGATGCATACAGTTATGTTCAGAATAGTGTTGCTGTGGCTGGTTCACTTAGTTCTTCTTC ATCCATTGTCAATGTTCCAACAGTATCATCATTCAATATGATTGGACCTAATTCACTTGC AAGATATCATTTTCTAGTTACTCTTAATAGTATTGAAGCATCTCAGAAGAATTTACTGTC TCTTGTTAATCATCTTGAAAGTGAATTAAATTTACTTTATCAAAATCAAGAAATCAATTC ACAGAAACTTGATATGTGTATCACGGAATTAAAAGTTTCTATCTCAGATCAACTTCAAGC ATTACTTGATTCTGCCTTCGAGCATCTTTCAACTAGTGTTATTCAAAGTCAAGTAAAAAC ATTGTTAAATGTTTTCAAGTCATTGAAATATGATTTACTTGAGGAGGATTTAGATGTTTT CGCTGCTAATGATAGATGGATTGAATCATGTATAGCTCATACAGAGGATTTTCTCAGACC ATTTAGGTCTGTCTTATCAACTGAGAATAACGATCGATTTGTATTGATTCTCATAAACGA AATTTTGCATCAACTTGATCAATTTATTCAAAGGAAATCATTCAGTAGATTTGGAGCTAT TCAACTAGAGAAAGAATATCATAATTTGTTTGCCTATTTAACATCGATATCTTACAGTTC TTTGCGTGATTATTTCACGCGTAGTTTACAGATCTGTAGACTNTTAAATTGGNATCGAGT TGAAAGAAGTCATTATTTTTGGATAGTTCTAATTGGCGTCTACTGCACACAGGTCAGAGT ATCTTCTCTAGACGTGATTCGCGTCAGAAAATCAGCCTTAACTACATGACTCATCTATCA GTATCTTTCTTCTTTTATNTCTGAATGAATGAACAAATGGGTTTTGTTTTTCTATTTACA TAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)