cluster # 8185

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8185 cluster # 8185 Sequences # 6 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8185#0 length = 657 sequences # 6
consensusID : consensus_8185#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 657
fasta sequence
                              [CACGATTACTTCCTGTTAAGGAGAACTATTTATGTAGACCAATTTTTAAGAATGCTTCAAAAATTACATCAGCTGATATTGATCGAGCATTTTCACTTTATGATTTAGATGCAAATGGTACAATAGAAGATGAAGAATTATCAGGATTTCTTAAAGATTTGTTAGAATTAGCACAAGAAGATTATGATGAAGATGATTTAGAATTTTTTAAAAAAGTTATCCTTAATCAATGGGATGTAAATAATGATGGTAAAATTAATCGTGATGAATTAAAAATGATGCTTATGCAACAATCACGTTTATTAAGTGATAAAATTTAGAAAAATTTGATTGAATTACTTATTCGTTACTATTATTATTCTTGAG-TAGTTATGTTATCGATTTTCNNNCGAAAANTAAGAGAAGAANATANGAAAAGAANAGAAAAAAGAAANCCAGTTGAAGAGGACAATNGTNACGACGAAAGCGAATTTCTACCTCGATAATAACTTCTCTCTATAAGTTTCTTTTCTTTTTTCACTAAATAACACTGTCATACCCTTCATTCTTTTTTCTTTTCTTCTTTTTCTTCTCTATCTACCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCATTCTTTCTCTATAGTTTATTCCATTGAATATATATATCTATATATCC]

[+] EMBL AI110979             [CACGATTACTTCCTGTTAAGGAGAACTATTTATGTAGACCAATTTTTAAGAATGCTTCAAAAATTACATCAGCTGATATTGATCGAGCATTTTCACTTTATGATTTAGATGCAAATGGTACAATAGAAGATGAAGAATTATCAGGATTTCTTAAAGATTTGTTAGAATTAGCACAAGAAGATTATGATGAAGATGATTTAGAATTTTTTAAAAAAGTTATCCTTAATCAATGGGATGTAAATAATGATGGTAAAATTAATCGTGATGAATTAAAAATGATGCTTATGCAACAATCACNTTTATTAAGTGATAAAATTTAGAAAAATTTGATTGAATTNCTTATTCGTTACTATTATTATTCTTGAG TAGTTATGTTATCGATTTTCNNNCGAAAANTAAGAGAAGAANATANGAAAAGAANAGAAAAAAGAAANCCAGTTGAAGAGGACAATNGTNACGACGAAAGCGAATTTCTACCTCGATAATAACTTCTCTCTATAAGTTTCTTTTCTTTTTTCACTAAATAACACTGTCATACCCTTCATTCTTTTTTCTTTTCTTCTTTTTCTTCTCTATCTACCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCATTCTTTCTCTATAGTTTATTCCATTGAATATATATATCTATATATCC]
[+] EMBL AI111118             [CACGATTACTTCCTGTTAAGGAGAACTATTTATGTAGACCAATTTTTAAGAATGCTTCAAAAATTACNTCAGCTGATATTGATCGAGCATTTTCACTTTATGATTTAGATGCAAATGGTACAATAGAAGATGAAGAATTATCAGGATTTCTTAAAGATTTGTTAGAATTAGCNCAAGAAGATTATGATGAAGATGATTTAGAATTTTTTAAAAAAGTTATCCTTAATCAATGGGATGTAAATAATGATGGTAAAATTAATCGTGATGAATTAAAAATGATGCTTATGCAACAATCACGTTTATTAAGTGATAAAATTTAGAAAAATTTGATTGAATTACTTATTCGTTACTATTATTATTCTTGAG TAGTTATGTTATCGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AI111072             [CACGATTACTTCCTGTTAAGGAGAACTATTTATGTNGACCAATTTTTAAGAATGCTTCAAAAATTACATCAGCTGATATTGATCGAGCATTTTCACTTTATGATTTAGATGCNAATGGTACAATAGAAGATGAAGAATTATCAGGATTTCTTAAAGATTTGTTAGAATTAGCNCNAGAAGATTATGATGAAGATGATTTAGAATTTTTTAAAAAAGTTATCCTTAATCAATGGGATGTNAATAATGATGGTAAAATTAATCGTGATGAATTAAAAATGATGCTTATGCAACNATCACGTTTATTAAGTGATAAAATTTAGAAAAATTTGATTGAATTACTTATTCGTTACTATTATTA TCTTGAG TTGTTATGTTATCGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AI111046             [CACGATTACTTCCTGTTAAGGAGAACTATTTATGTAGACCAATTTTTAAGAATGCTTCAAAAATTACATCAGCTGATATTGATCGAGCATTTTCACTTTATGATTTAGATGCAAATGGTACAATAGAAGATGAAGAATTATCAGGATTTCTTAAAGATTTGTTAGAATTAGCACAAGAAGATTATGATGAAGATGATTTAGAATTTTTTAAAAAAGTTATCCTTAATCAATGGGATGTAAATAATGATGGTAAAATTAATCGTGATGAATTAAAAATGATGCTTATGCAACAATCACGTTTATTAAGTGATAAAATTTAGAAAAATTTGATTGAATTACTTATTCGTTACTATTATTATTCTTGAGTTAGTTATGTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AI111137             [CACGATTACTTCCTGTTAAGGAGAACTATTTATGTAGACCAATTTTTAAGAATGCTTCAAAAATTACATCAGCTGATATTGATCGAGCATTTTCACTTTATGATTTAGATGCNAATGGTNCAATAGAAGATGAAGAATTATCNGGATTTCTTAAAGATTTGTTNGAATTAGCACAAGAAGATTATGATGAAGATGATTTAGAATTTTTTAAAAAAGTTATCCTTAATCAATGGGATGTAAATAATGATGGTAAAATTAATCGTGATGAATTAAAAATGATGCTTATGCAACAATCACGTTTATTAAGTGATAAAATTTAGAAAAATTTGATTGAATTACTTATTCGTTACTATTATTATTCTTGAG TAGTTATGTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AI111100             [CACGATTACTTCCTGTTAAGGAGAACTATTTATGTAGACCAATTTTTAAGAATGCTTCAAAAATTACATCAGCTGATATTGATCGAGCATTTTCACTTTATGATTTAGATGCNAATGGTACAATANAAGATGAAGAATTATCAGGATTTCTTAAAGATTTGTTAGAATTANCACAAGAAGATTATGATGAANATNATTTNNAATTTTTTAAAAAAGTTATCCTTAATCAATGGGATGTAAATAATGATGGTAAAATTANTCGTGATGANTTAAAAATGATGCTTATGC ACAATCACGTTTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]




>consensus_8185#0
CACGATTACTTCCTGTTAAGGAGAACTATTTATGTAGACCAATTTTTAAGAATGCTTCAA
AAATTACATCAGCTGATATTGATCGAGCATTTTCACTTTATGATTTAGATGCAAATGGTA
CAATAGAAGATGAAGAATTATCAGGATTTCTTAAAGATTTGTTAGAATTAGCACAAGAAG
ATTATGATGAAGATGATTTAGAATTTTTTAAAAAAGTTATCCTTAATCAATGGGATGTAA
ATAATGATGGTAAAATTAATCGTGATGAATTAAAAATGATGCTTATGCAACAATCACGTT
TATTAAGTGATAAAATTTAGAAAAATTTGATTGAATTACTTATTCGTTACTATTATTATT
CTTGAGTAGTTATGTTATCGATTTTCNNNCGAAAANTAAGAGAAGAANATANGAAAAGAA
NAGAAAAAAGAAANCCAGTTGAAGAGGACAATNGTNACGACGAAAGCGAATTTCTACCTC
GATAATAACTTCTCTCTATAAGTTTCTTTTCTTTTTTCACTAAATAACACTGTCATACCC
TTCATTCTTTTTTCTTTTCTTCTTTTTCTTCTCTATCTACCTATCTATCTATCTATCTAT
CTATCTATCATTCTTTCTCTATAGTTTATTCCATTGAATATATATATCTATATATCC
clustalw multiple alignements is not computed in this case