These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8188#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 923 fasta sequence [AGTAGATCCAAATATTATCGGAACTTCTAGTATCGATACTACATGCACTATCTGGGCCCTTGAAACGGAGCAGGTGATCGGCCATGCAAATGTCGTAAGTGGACGCGTAGAATCTCAGTTAATAGCCCATGACAAAGAAGTATATGACATAGCTTTCAGTCGTGCTGGAGGCGGAAGAGATGTTTTCGCTAGTGTTGGCGCAGATGGTTCTGTACGTATGTTTGATCTTCGGCATTTGGAGCATTCTAATATTGTGTATGAGGATTCAAATCATTCCCCACTTTTACGCTTAGCTTGGAATAAACAAGATGCAAATTATCTAGCGACATTTGCAATGGACTCCGTAGAAATAATTATTTTAGATTTACGCGTACCATGCACTCCAGTAGCTCGTTTAAACAATCATAGAGCATTTGTAAATGGATTAGCATGGGCACCACATTCAAGTTGTCATTTATGTACTGCATCTGAAGATTGTCAAGCTCTTATCTGGGATATTCAGTCAATGCCAAGAGCAATAGAAGATCCTATTCTAGCATATACAGCTGCC-GGTGAAATTAATCAAATCCAATGGTCGTCAACACAACCAGATTGGATAGCTATTTGTTATAATAATTCGTTAGAAATTTTACGAGTATAATGTTTACTGTTTATTTCTTATTTTATCAACTGATTTAAAGGTATCCTATAATTATGATCAAATGTTATTTCTTCCTTTATGCTTACTAATTATCGTATGTTATTTTCATGCGTTTCATTATTATTCTTTTCTAAATATTCTGGATAATTTAACTGAGTACTATTATCGAGATACATGTGTTGGTTCTAGTAAAAGTAAGTCTTGACTACATATGAATCAATTTCAAATGTTTTGTATATTTACTTAAAAAAATATTTGTGTTTGTCTAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL CD079085 [AGTAGATCCAAATATTATCGGAACTTCTAGTATCGATACTACATGCACTATCTGGGCCCTTGAAACGGAGCAGGTGATCGGCCATGCAAATGTCGTAAGTGGACGCGTAGAATCTCAGTTAATAGCCCATGACAAAGAAGTATATGACATAGCTTTCAGTCGTGCTGGAGGCGGAAGAGATGTTTTCGCTAGTGTTGGCGCAGATGGTTCTGTACGTATGTTTGATCTTCGGCATTTGGAGCATTCTAATATTGTGTATGAGGATTCAAATCATTCCCCACTTTTACGCTTAGCTTGGAATAAACAAGATGCAAATTATCTAGCGACATTTGCAATGGACTCCGTAGAAATAATTATTTTAGATTTACGCGTACCATGCACTCCAGTAGCTCGTTTAAACAATCATAGAGCATTTGTAAATGGATTAGCATGGGCACCACATTCAAGTTGTCATTTATGTACTGCATCTGAAGATTGTCAAGCTCTTATCTGGGATATTCAGTCAATGCCAAGAGCAATAGAAGATCCTATTCTAGCATATACAGCTGCC GGTGAAATTAATCANATCCAATGGTCGTCAACACAACCAGATTGGATAGCTATTTGNTATAATAAT ] [+] EMBL CD079075 [AGTAGATCCAAATATTATCGGAACTTCTAGTATCGATACTACATGCACTATCTGGGCCCTTGAAACGGAGCAGGTGATCGGCCATGCAAATGTCGTAAGTGGACGCGTAGAATCTCAGTTAATAGCCCATGACAAAGAAGTATATGACATAGCTTTCAGTCGTGCTGGAGGCGGAAGAGATGTTTTCGCTAGTGTTGGCGCAGATGGTTCTGTACGTATGTTTGATCTTCGGCATTTGGAGCATTCTAATATTGTGTATGAGGATTCAAATCATTCCCCACTTTTACGCTTAGCTTGGAATAAACAAGATGCAAATTATCTAGCGACATTTGCAATGGACTCCGTAGAAATAATTATTTTAGATTTACGCGTACCATGCACTCCAGTAGCTCGTTTAAACAATCATAGAGCATTTGTAAATGGATTAGCATGGGCACCACATTCAAGTTGTCATTTATGTACTGCATCTGAAGATTGTCAAGCTCTTATCTGGGATATTCAGTCAATGCCAAGAGCAATAGAAGATCCTATTCTAGCATATACAGCTGCC GGTGAAATTAATCANATCCAATGG ] [+] EMBL CD201105 [ GATACTACATGCACTATCTGGGCCCTTGAAACGGAGCAGGTGGTCGGCCATGCAAATGTCGTAAGTGGACGCGTAGAATCTCAGTTAATAGCCCATAACAAAGAAGTATATGACATAGCTTTCAGTCGTGCTGGAGGCGGAAGAGATGTTTTCGCTAGTGTTGGCGCAGATGGTTCTGTACGTATGTTTGATCTTCGGCATTTGGAGCATTCTAATATTGTGTATGAGGATTCAAATCATTCCCCACTTTTACGCTTAGCTTGGAATAAACAAGATGCAAATTATCTAGCGACATTTGCAATGGACTCCGTAGAAATAATTATTTTAGATTTACGCGTACCATGCGCTCCAGTAGCTCGTTTAAACAATCATAGAGCATTTGTAAATGGATTAGCATGGGCACC ] [-] EMBL CD073538 [ TCCGTAGAAATAATTATTTTAGATTTACGCGTACCATGCACTCCAGTAGCTCGTTTAAACAATCATAGAGCATTTGTAAATGGATTAGCATGGGCACCACATTCAAGTTGTCATTTATGTACTGCATCTGAAGATTGTCAAGCTCTTATCTGGGATATTCAGTCAATGCCAAGAGCAATAGAAGATCCTATTCTAGCATATACAGCTGCC GGTGAAATTAATCAAATCCAATGGTCGTCAACACAACCAGATTGGATAGCTATTTGTTATAATAATTCGTTAGAAATTTTACGAGTATAATGTTTACTGTTTATTTCTTATTTTATCAACTGATTTAAAGGTATCCTATAATTATGATCAAATGTTATTTCTTCCTTTATGCTTACTAATTATCGTATGTTATTTTCATGCGTTTCATTATTATTCTTTTCTAAATATTCTGGATAATTTAACTGAGTACTATTATCGAGATACATGTGTTGGTTCTAGTAAAAGTAAGTCTTGACTACATATGAATCAATTTCAAATGTTTTGTATATTTACTTAAAAAAATATTTG ] [-] EMBL CD073530 [ TTATTTTAGATTTACGCGTACCATGCACTCCAGTAGCTCGTTTAAACAATCATAGAGCATTTGTAAATGGATTAGCATGGGCACCACATTCAAGTTGTCATTTATGTACTGCATCTGAAGATTGTCAAGCTCTTATCTGGGATATTCAGTCAATGCCAAGAGCAATAGAAGATCCTATTCTAGCATATACAGCTGCC GGTGAAATTAATCAAATCCAATGGTCGTCAACACAACCAGATTGGATAGCTATTTGTTATAATAATTCGTTAGAAATTTTACGAGTATAATGTTTACTGTTTATTTCTTATTTTATCAACTGATTTAAAGGTATCCTATAATTATGATCAAATGTTATTTCTTCCTTTATGCTTACTAATTATCGTATGTTATTTTCATGCGTTTCATTATTATTCTTTTCTAAATATTCTGGATAATTTAACTGAGTACTATTATCGAGATACATGTGTTGGTTCTAGTAAAAGTAAGTCTTGACTACATATGAATCAATTTCAAATGTTTTGTATATTTACTTAAAAAAATATTTG ] [-] EMBL AI395506 [ TCCTATTCTAGCATATACAGCTGCCGGGTGAAATTAATCAAATCCAATGGTCGTCAACACAACCAGATTGGATAGCTATTTGTTATAATAATTCGTTAGAAATTTTACGAGTATAATGTTTACTGTTTATTTCTTATTTTATCAACTGATTTAAAGGTATCCTATAATTATGATCAAATGTTATTTCTTCCTTTATGCTTACTAATTATCGTATGTTATTTTCATGCGTTTCATTATTATTCTTTTCTAAATATTCTGGATAATTTAACTGAGTACTATTATCGAGATACATGTGTTGGTTCTAGTAAAAGTAAGTCTTGACTACATATGAATCAATTTCAAATGTTTTGTATATTTACTT AAAAATATTTGTGTTTGTCTAAAAAAAAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||