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Schistosoma mansoni
cluster # 8207 cluster # 8207       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8207#0 length = 885 sequences # 6  

consensusID : consensus_8207#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 885
fasta sequence
                              [CTTCATCGTCTGCACGAGCGATGGGATTATCATCCGCACCTGTTAGATTGTTGTTAGATGCAG-CACCAGAACAAGA-ATGCA-CACTCGACTGTAGTTCTCATGGTGTATGTGAATATATGGATGGTTATGATCAGCCTGTATGCCGATGCTTTTCTGGTTGGACAGGTTCCGATTGTAATACAAAACGATGCGATACTCGTTGTTTTATAAATGGATATTGTACTAATGGTACATGTATTTGCAAAGTCGGTTGGAATGGAAAGTACTGTACATTAGATGGTTGCCCAGATCATTGTAATGGACACGGTCAATGCACCATGTATCCATTGTCTAGTTCTTATTATTGTCAATGTTCTCCTGGTTGGTCAGGTAGTGCGTGTCAACGACAAATCGAAACAATATGTGATGATGGAATAGATAATGATCATGATGGTCTTGTTGATTGTTTAGATCCCGATTGCTGTACATCGACACATTGTGATCGACTCATTAAACTTGGTCCAAATGCTGGTGGCGTAGCTGCTGATAACGCTCAACAAAGTTGTGCACACAGTGAATCATTTGATTGTTATTTATTAATTACACCGATTGCACCATTGGACAGTGCATTTTATGTCAATTAGAATTCCTTCTAAGACGTGAACGTATTGTTGTAGAGAACTTCGATCCCAGACGTATTTCCGTTGTTCGTGGTGTAATTCGTCAATGGGACGGAACTGTATTTTGGGGTTGTCGTGTATCCGATAGAGCTAATATGCAAAATGGATATACACTAACTGATAAAAGTGGAAGATTTGACCTACCAGTTGATGGGGGAACAATTGTTCAGTTAGAATTCCTACGGTATCCTACTGATCAATTTTCAGCCGTACATAATTTATATGT]

[+] EMBL CD152516             [CTTCATCGTCTGCACGAGCGATGGGATTATCATCCGCACCTGTTATATTGTTGTTAGATGCAGCCACCAGAACAAGACATGCACCACTCGACTGTAGTTCTCATGGGGTATGTGAATATATGGATGGTTATAATCAGCCTGTATGCCGATGCTTTTCTGGTTGGACAGGTTCCGATTGTAATACAAAACGATGCGATACTCGTTGTTTTATAAATGGATATTGTACTAATGGTACATGTATTTGCAAAGTCGGTTGGAATGGAAAGTACTGTACATTAGATGGCTGCCCATATCATTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD163026             [                        GATTATCATCCGCACCTGTTAGATTGTTGTTAGATGCAG CACCAGAACAAGA ATGCA CACTCGACTGTAGTTCTCATGGTGTATGTGAATATATGGATGGTTATGATCAGCCTGTATGCCGATGCTTTTCTGGTTGGACAGGTTCCGATTGTAATACAAAACGATGCGATACTCGTTGTTTTATAAATGGATATTGTACTAATGGTACATGTATTTGCAAAGTCGGTTGGAATGGAAAGTACTGTACATTAGATGGTTGCCCAGATCATTGTAATGGACACGGTCAATGCACCATGTATCCATTGTCTAGTTCTTATTATTGTCAATGTTCTCCTGGTTGGTCAGGTAGTGCGTGTCAACGACAAATCGAAACAATATGTGATGATGGAATAGATAATGATCATGATGGTCTTGTTGATTGTTTAAATCCCGATTGCTGTACATCGACACATTGTGATCGACTCATTAAACTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD118097             [                        GATTATCATCCGCACCTGTTAGATTGTTGTTAGATGCAG CACCAGAACAAGA ATGCA CACTCGACTGTAGTTCTCATGGTGTATGTGAATATATGGATGGTTATGATCAGCCTGTATGCCGATGCTTTTCTGGTTGGACAGGTTCCGATTGTAATACAAAACGATGCGATACTCGTTGTTTTATAAATGGATATTGTGCTAATGGTACATGTATTTGCAAAGTCGGTTGGAATGGAAAGTACTGTACATTAGATGGTTGCCCAGATCATTGTAATGGACACGGTCAATGCACCATGTATCCATTGTCTAGTTCTTATTATTGTCAATGTTCTCCTGGTTGGTCAGGTAATGCGTGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD202234             [                                                      TAGATGCAG CACCAGAACAAGA ATGCA CACTCGACTGTAGTTCTCATGGTGTATGTGAATATATGGATGGTTATGATCAGCCTGTATGCCGATGCTTTTCTGGTTGGACAGGTTCCGATTGTAATACAAAACGATGCGATACTCGTTGTTTTATAAATGGATATTGTACTAATGGTACATGTATTTGCAAAGTCGGTTGGAATGGAAAGTACTGTACATTAGATGGTTGCCCAGATCATTGTAATGGACACGGTCAATGCACCATGTATCCATTGTCTAGTTCTTATTATTGTCAATGTTCTCCTGGTTGGTCAGGTAGTGCGTGTCAACGACAAATCGAAACAATATGTGATGATGGAATAGATAATGATCATGATGATCTTGTTGATTGTTTAGATCCCGATTGCTGTACATCGACACATTGTGATCGACTCATTAAACTTGGTCCAAATGCTGGTGGCGTAGCTGCTGATAACGCTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD197768             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTTGATTGTTTAGATCCCGATTGCTGTACATCGACACATTGTGATCGACTCATTAAACTTGGTCCAAATGCTGGTGGCGTAGCCGCTGATAACGCTCAACAAAGTTGTGCACACAGTGAATCATTTGATTGTTATTTATTAATTACACCGATTGCACCATTGGACAGTGCATTTTATGTCAATTAGAATTCCTTCTAAGACGTGAACGTATTGTTGTAGAGAACTTCGATCCCAGACGTATTTCCGTTGTTCGTGGTGTAATTCGTCAATGGGACGGAACTGTATTTTGGGGTTGTCGTGTATCCGATAGAGCTAATATGCAAAATGGATATACACTAACTGATAAAAGTGGAAGATTTGACCTACCAGTTGATGGGGGAACAATTGTTCAGTTAGAATTCCTACGGTATCCTACTGATCAATTTTCAGCCGTACAT           ]
[-] EMBL CD152482             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATCCGATAGAGCTAATATGCAAAATGGATATACACTAACTGATAAAAGTGGAAGATTTGACTTACCAGTTGATGGGGGAACAATTGTTCAGTTAGAATTCATACGGTATCCTACTGATCAATCTTCAGCCGTACATAATTTATATGT]


>consensus_8207#0 CTTCATCGTCTGCACGAGCGATGGGATTATCATCCGCACCTGTTAGATTGTTGTTAGATG CAGCACCAGAACAAGAATGCACACTCGACTGTAGTTCTCATGGTGTATGTGAATATATGG ATGGTTATGATCAGCCTGTATGCCGATGCTTTTCTGGTTGGACAGGTTCCGATTGTAATA CAAAACGATGCGATACTCGTTGTTTTATAAATGGATATTGTACTAATGGTACATGTATTT GCAAAGTCGGTTGGAATGGAAAGTACTGTACATTAGATGGTTGCCCAGATCATTGTAATG GACACGGTCAATGCACCATGTATCCATTGTCTAGTTCTTATTATTGTCAATGTTCTCCTG GTTGGTCAGGTAGTGCGTGTCAACGACAAATCGAAACAATATGTGATGATGGAATAGATA ATGATCATGATGGTCTTGTTGATTGTTTAGATCCCGATTGCTGTACATCGACACATTGTG ATCGACTCATTAAACTTGGTCCAAATGCTGGTGGCGTAGCTGCTGATAACGCTCAACAAA GTTGTGCACACAGTGAATCATTTGATTGTTATTTATTAATTACACCGATTGCACCATTGG ACAGTGCATTTTATGTCAATTAGAATTCCTTCTAAGACGTGAACGTATTGTTGTAGAGAA CTTCGATCCCAGACGTATTTCCGTTGTTCGTGGTGTAATTCGTCAATGGGACGGAACTGT ATTTTGGGGTTGTCGTGTATCCGATAGAGCTAATATGCAAAATGGATATACACTAACTGA TAAAAGTGGAAGATTTGACCTACCAGTTGATGGGGGAACAATTGTTCAGTTAGAATTCCT ACGGTATCCTACTGATCAATTTTCAGCCGTACATAATTTATATGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)