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Schistosoma mansoni
cluster # 8209 cluster # 8209       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8209#0 length = 778 sequences # 6  

consensusID : consensus_8209#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 778
fasta sequence
                              [ATATGGGATCATGTCGTCACATTGATGACGAAATATATAGCTATTGTACAATCGAATACTGCTTTTAAACATACATTTGATCGTCTTAAAGTTGAATTTCAAACATGGTTACGTTTAGTCAATACTGAAAGTCCAAATAATAATGATTATCAGAGTTGTACTGGTCATTGCAATGAATTACGTTCAACATTTTATAATAATGTATCTATACGACCAGATACATTTATGCCTGAAATCAATTTTGCTATAGCATTGAAATTTCTAACTACTGATCGTAATCAAACTGCTGAAAGTGTACAAGCTCAGTTAAATCATGGTAAAGAATTATCTAATAGTCAACTTG-AAAAAACTAAAACTTTAATGGCCGAAAAGATTAATATCCCTGAATCTATACGTAATATGACAAATAAACAATGGGATCAATTAGAACCTCAATTGACTAAAGCTATTGAAGAAATTGATAAGATCTCTATATTCATAACAAGATCTATTTCACCGAAAGTTTCTTCCACCTCCAGTCTCTTCTTAACATTGAATCTATTTTTTTGGTTCTCTATTCTATTGATCACTATTGGTTTAATGTGGTTAATTATACGATATCATTTTGTACCGACAGAAATTAGTCTACATACTCGTAATCGTATTCGCCTTGGTGCTAGTATTGGATTTTGTATTCTTGCATTTAGTATTATTTTAGCTTGTTTATTCTATTTAATTGGTGGATACCTCTATACTGAAGGTTGTCGTTATGTAAATCCTGAACAGAATGTAATCAATA]

[+] EMBL CD140771             [ATATGGGATCATGTCGTCACATTGATGACGAAATATATAGCTATTGTACAATCGAATACTGCTTTTAAACATACATTTGATCGTCTTAAAGTTGAATTTCAAACATGGTTACGTTTAGTCAATACTGAAAGTCCAAATAATAATGATTATCAGAGTTGTACTGGTCATTGCAATGAATTACGTTCAACATTTTATAATAATGTATCTATACGACCAGATACATTTATGCCTGAAATCAATTTTGCTATAGCATTGAAATTTCTAACTACTGATCGTAATCAAACTGCTGAAAGTGTACAAGCTCAGTTAAATCATGGTAAAGAATTATCTAATAGTCAACTTG AAAAAACTAAAACTTTAATGGCCGAAAAGATTAATATCCCTGAATCTATACGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD140871             [                     TTGATGACGAAATATATAGCTATTGTACAATCGAATACTGCTTTTAAACATACATTTGATCGTCTTAAAGTTGAATTTCAAACATGGTTACGTTTAGTCAATACTGAAAGTCCAAATAATAATGATTATCAGAGTCGTACTGGTCATTGCAATGAATTACGTTCAACATTTTATAATAATGTATCTATACGACCAGATACATTTATGCCTGAAATCAACTTTGCTATAGCATTGAAATTTCTAACTACTGATCGTAATCAAACTGCTGAAAGTGTACAAGCTCAGTTAAATCATGGTAAAGAATTATCTAATAGTCAACTTG AAAAAACTAAAACTTTAATGGCCGAAAAGATTAATATCCCTGAATCTATACGTAATATGACAAATAAACAATGGGATCAATTAGAACCTCAATTGACTAAAGCTATTGAAGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD094972             [                                                                                  GTCTTAAAGTTGAATTTCAAACATGGTTACGTTTAGTCAATACTGAAAGTCCAAATAATAATGATTAACAGAGTTGTACTGGTCATTGCAATGAATTACGTTCAACATTTTATAATAATGTATCTATACGACCAGATACATTTATGCCTGAAATCAATTTTGCTATAGCATTGAAATTTCTAACTACTGATCGTAATCAAACTGCTGAAAGTGTACAAGCTCAGTTAAAACATGGTAAAGAATTATCTAATAGTCAACTTG AAAAAACTAAAACTTTAATGGCCGAAAAGATTAATATCCCTGAATCTATACGTAATATGACAAATAAACAATGGGATCAATTAGAACCTCAATTGACTAAAGCTATTGAAGAAATTGATAAGATCTCTATATTCATAACAAGATCTATTTCACCGAAAGTTTCTTCCACCTCCAGTCTCTTCTTAACATTGAATCTATTTTTTTGGTTCTCTATTCTATTGATCACTATTGGTTTAATGTGGTTAATTATACGATATCATTTTGTACCGACAGAAATTAGTCTACATACTCGTAATCGTATTCGCCTTGGTGCTAGTATTGGATTTTGTATTCTTGCATTTAGTATTATTTTAGCTTGTTTATTCTATTTAATTGATGGATACCTCTATACTG                                          ]
[-] EMBL CD197406             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATTATCTAATAGTCAACTTG AAAAAACTAAAACTTTAATGGCCGAAAAGATTAATATCCCTGAATCTATACGTAATATGACAAATAAACAATGGGATCAATTAGAACCTCAATTGACTAAAGCTATTGAAGAAATTGATAAGATCTCTATATTCATAACAAGATCTATTTCACCGAAAGTTTCTTCCACCTCCAGTCTCTTCTTAACATTGAATCTATTTTTTTGGTTCTCTATTCTATTGATCACTATTGGTTTAATGTGGTTAATTATACGATATCATTTTGTACCGACAGAAATTAGTCTACATACTCGTAATCGTATTCGCCTTGGTGCTAGTATTGGATTTTGTATTCTTGCATTTAGTATTATTTTAGCTTGTTTATTCTATTTAATTGGTGGATACCTCTATACTGAAGGTTGTCGTTATGTAAATCCTGAACAGAATGTAATCAATA]
[-] EMBL CD197513             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTAATAGTCAACTTGAAAAAAACTAAAACTTTAATGGCCGAAAAGATANATATGCCTGAATCTATACGTAATATGACAAATAAACAATGGGATCAATTAGAACCTCAATTGACTAAAGCTATTGAAGAAATTGATAAGATCTCTATATTCATAACAAGATCTATTTCACCGAAAGTTTCTTCCACCTCCAGTCTCTTCTTAACATTGAATCTATTTTTTTGGTTCTCTATTCTATTGATCACTATTGGTTTAATGTGGTTAATTATACGATATCATTTTGTACCGACAGAAATTAGTCTACATACTCGTAATCGTATTCGCCTTGGTGCTAGTATTGGATTTTGTATTCTTGCATTTAGTATTATTTTAGCTTGTTTATTCTATTTAATTGGTGGATACCTCTATACTGAAGGTTGTCGTTATGTAAATCCTGAACAGAATGTAATCAATA]
[-] EMBL CD197470             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTGGTTCTCTATTCTATTGATCACTATTGGTTTAATGTGGTTAATTATACGATATCATTTTGTACCGACAGAAATTAGTCTACATACTCGTAATCGTATTCGCCTTGGTGCTAGTATTGGATTTTGTATTCTTGCATTTAGTATTATTTTAGCTTGTTTATTCTATTTAATTGGTGGATACCTCTATACTGAAGGTTGTCGTTATGTAAATCCTGAACAGAATGTAATCAATA]


>consensus_8209#0 ATATGGGATCATGTCGTCACATTGATGACGAAATATATAGCTATTGTACAATCGAATACT GCTTTTAAACATACATTTGATCGTCTTAAAGTTGAATTTCAAACATGGTTACGTTTAGTC AATACTGAAAGTCCAAATAATAATGATTATCAGAGTTGTACTGGTCATTGCAATGAATTA CGTTCAACATTTTATAATAATGTATCTATACGACCAGATACATTTATGCCTGAAATCAAT TTTGCTATAGCATTGAAATTTCTAACTACTGATCGTAATCAAACTGCTGAAAGTGTACAA GCTCAGTTAAATCATGGTAAAGAATTATCTAATAGTCAACTTGAAAAAACTAAAACTTTA ATGGCCGAAAAGATTAATATCCCTGAATCTATACGTAATATGACAAATAAACAATGGGAT CAATTAGAACCTCAATTGACTAAAGCTATTGAAGAAATTGATAAGATCTCTATATTCATA ACAAGATCTATTTCACCGAAAGTTTCTTCCACCTCCAGTCTCTTCTTAACATTGAATCTA TTTTTTTGGTTCTCTATTCTATTGATCACTATTGGTTTAATGTGGTTAATTATACGATAT CATTTTGTACCGACAGAAATTAGTCTACATACTCGTAATCGTATTCGCCTTGGTGCTAGT ATTGGATTTTGTATTCTTGCATTTAGTATTATTTTAGCTTGTTTATTCTATTTAATTGGT GGATACCTCTATACTGAAGGTTGTCGTTATGTAAATCCTGAACAGAATGTAATCAATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)