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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8209#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 778 fasta sequence
[ATATGGGATCATGTCGTCACATTGATGACGAAATATATAGCTATTGTACAATCGAATACTGCTTTTAAACATACATTTGATCGTCTTAAAGTTGAATTTCAAACATGGTTACGTTTAGTCAATACTGAAAGTCCAAATAATAATGATTATCAGAGTTGTACTGGTCATTGCAATGAATTACGTTCAACATTTTATAATAATGTATCTATACGACCAGATACATTTATGCCTGAAATCAATTTTGCTATAGCATTGAAATTTCTAACTACTGATCGTAATCAAACTGCTGAAAGTGTACAAGCTCAGTTAAATCATGGTAAAGAATTATCTAATAGTCAACTTG-AAAAAACTAAAACTTTAATGGCCGAAAAGATTAATATCCCTGAATCTATACGTAATATGACAAATAAACAATGGGATCAATTAGAACCTCAATTGACTAAAGCTATTGAAGAAATTGATAAGATCTCTATATTCATAACAAGATCTATTTCACCGAAAGTTTCTTCCACCTCCAGTCTCTTCTTAACATTGAATCTATTTTTTTGGTTCTCTATTCTATTGATCACTATTGGTTTAATGTGGTTAATTATACGATATCATTTTGTACCGACAGAAATTAGTCTACATACTCGTAATCGTATTCGCCTTGGTGCTAGTATTGGATTTTGTATTCTTGCATTTAGTATTATTTTAGCTTGTTTATTCTATTTAATTGGTGGATACCTCTATACTGAAGGTTGTCGTTATGTAAATCCTGAACAGAATGTAATCAATA]
[+] EMBL CD140771 [ATATGGGATCATGTCGTCACATTGATGACGAAATATATAGCTATTGTACAATCGAATACTGCTTTTAAACATACATTTGATCGTCTTAAAGTTGAATTTCAAACATGGTTACGTTTAGTCAATACTGAAAGTCCAAATAATAATGATTATCAGAGTTGTACTGGTCATTGCAATGAATTACGTTCAACATTTTATAATAATGTATCTATACGACCAGATACATTTATGCCTGAAATCAATTTTGCTATAGCATTGAAATTTCTAACTACTGATCGTAATCAAACTGCTGAAAGTGTACAAGCTCAGTTAAATCATGGTAAAGAATTATCTAATAGTCAACTTG AAAAAACTAAAACTTTAATGGCCGAAAAGATTAATATCCCTGAATCTATACGTAA ]
[+] EMBL CD140871 [ TTGATGACGAAATATATAGCTATTGTACAATCGAATACTGCTTTTAAACATACATTTGATCGTCTTAAAGTTGAATTTCAAACATGGTTACGTTTAGTCAATACTGAAAGTCCAAATAATAATGATTATCAGAGTCGTACTGGTCATTGCAATGAATTACGTTCAACATTTTATAATAATGTATCTATACGACCAGATACATTTATGCCTGAAATCAACTTTGCTATAGCATTGAAATTTCTAACTACTGATCGTAATCAAACTGCTGAAAGTGTACAAGCTCAGTTAAATCATGGTAAAGAATTATCTAATAGTCAACTTG AAAAAACTAAAACTTTAATGGCCGAAAAGATTAATATCCCTGAATCTATACGTAATATGACAAATAAACAATGGGATCAATTAGAACCTCAATTGACTAAAGCTATTGAAGAAA ]
[+] EMBL CD094972 [ GTCTTAAAGTTGAATTTCAAACATGGTTACGTTTAGTCAATACTGAAAGTCCAAATAATAATGATTAACAGAGTTGTACTGGTCATTGCAATGAATTACGTTCAACATTTTATAATAATGTATCTATACGACCAGATACATTTATGCCTGAAATCAATTTTGCTATAGCATTGAAATTTCTAACTACTGATCGTAATCAAACTGCTGAAAGTGTACAAGCTCAGTTAAAACATGGTAAAGAATTATCTAATAGTCAACTTG AAAAAACTAAAACTTTAATGGCCGAAAAGATTAATATCCCTGAATCTATACGTAATATGACAAATAAACAATGGGATCAATTAGAACCTCAATTGACTAAAGCTATTGAAGAAATTGATAAGATCTCTATATTCATAACAAGATCTATTTCACCGAAAGTTTCTTCCACCTCCAGTCTCTTCTTAACATTGAATCTATTTTTTTGGTTCTCTATTCTATTGATCACTATTGGTTTAATGTGGTTAATTATACGATATCATTTTGTACCGACAGAAATTAGTCTACATACTCGTAATCGTATTCGCCTTGGTGCTAGTATTGGATTTTGTATTCTTGCATTTAGTATTATTTTAGCTTGTTTATTCTATTTAATTGATGGATACCTCTATACTG ]
[-] EMBL CD197406 [ ATTATCTAATAGTCAACTTG AAAAAACTAAAACTTTAATGGCCGAAAAGATTAATATCCCTGAATCTATACGTAATATGACAAATAAACAATGGGATCAATTAGAACCTCAATTGACTAAAGCTATTGAAGAAATTGATAAGATCTCTATATTCATAACAAGATCTATTTCACCGAAAGTTTCTTCCACCTCCAGTCTCTTCTTAACATTGAATCTATTTTTTTGGTTCTCTATTCTATTGATCACTATTGGTTTAATGTGGTTAATTATACGATATCATTTTGTACCGACAGAAATTAGTCTACATACTCGTAATCGTATTCGCCTTGGTGCTAGTATTGGATTTTGTATTCTTGCATTTAGTATTATTTTAGCTTGTTTATTCTATTTAATTGGTGGATACCTCTATACTGAAGGTTGTCGTTATGTAAATCCTGAACAGAATGTAATCAATA]
[-] EMBL CD197513 [ CTAATAGTCAACTTGAAAAAAACTAAAACTTTAATGGCCGAAAAGATANATATGCCTGAATCTATACGTAATATGACAAATAAACAATGGGATCAATTAGAACCTCAATTGACTAAAGCTATTGAAGAAATTGATAAGATCTCTATATTCATAACAAGATCTATTTCACCGAAAGTTTCTTCCACCTCCAGTCTCTTCTTAACATTGAATCTATTTTTTTGGTTCTCTATTCTATTGATCACTATTGGTTTAATGTGGTTAATTATACGATATCATTTTGTACCGACAGAAATTAGTCTACATACTCGTAATCGTATTCGCCTTGGTGCTAGTATTGGATTTTGTATTCTTGCATTTAGTATTATTTTAGCTTGTTTATTCTATTTAATTGGTGGATACCTCTATACTGAAGGTTGTCGTTATGTAAATCCTGAACAGAATGTAATCAATA]
[-] EMBL CD197470 [ TTGGTTCTCTATTCTATTGATCACTATTGGTTTAATGTGGTTAATTATACGATATCATTTTGTACCGACAGAAATTAGTCTACATACTCGTAATCGTATTCGCCTTGGTGCTAGTATTGGATTTTGTATTCTTGCATTTAGTATTATTTTAGCTTGTTTATTCTATTTAATTGGTGGATACCTCTATACTGAAGGTTGTCGTTATGTAAATCCTGAACAGAATGTAATCAATA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||