Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8212 cluster # 8212       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8212#0 length = 1052 sequences # 6  
consensusID : consensus_8212#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1052
fasta sequence 
                              [GAGGTGCTACCTCATCCATATTAAACCCGAACTATGGGACCATTTTAGGAAAAAA-TACGTCTCCACAACA-ATACCATCATCATTATTTCTATTATTATTATTATGACAACCAACTCGATAAAAATAATCTAAATAAACCATCTAGTACATCCTGGGTGGGCAGAGAGAATATAAGTACCCTTGGTAGAAATTCACCATCTTATTTTACTGGTTCAAATTCCAACTCACTGGTTAATAACTCTCTTCCCACAAGCAACATATCACCTATTCTTTCAGGAAGAATGTGTCAACGGTTAAATACTCATCCAATCCCAAGACAAAGCAGTTTACAGTTCCCATCTAACGATTTAAAATCTTCCAAGGCGCAGTCAGACTCACTTTTTTTCTCTGGAATGTTAGGATCACATCTACCTATGACTTCACAATCCACTTATCATATTATATCCAGCGAGTCCCACGGGCGACACCTTAACCGAAATAGTTTTCAACATCCACTTGTATTCAGTAATTCAACGTTAAGAGACTCTGGTACATTAACAAAAAGAGGCGAACATCCTAAACATACACACAGATCAATGTCACAACCTCCTAAATTACGAGATTGGCTATCTTTTGAAACAGAATTGTGAAGATACACCTCATGACACTAATGCATATCAACAGGAATATCGAAATCCATTTGTGTTCCTAAACTTAGTTCCAGCTCACCTTTGTCTTTCGATGCTTGCATCAGCATTTTGTTGTTAAGGCGGTTTTATTGATCATCTTCAAATGCTCACATTCATTTTTCGTCTTTCCATTCTCCATACAAAATGCATAACCTACAAAAGCTTTCAGTAACTTCTCTTAAATATGTTTATTGGTAATCGATTGGGTTACTTCTGTACATACTAGTGTAAATTATGGTCTTCATTGTAATTTATTTCCTGACAGTTTTATTTGAAGTCAGTTACCTAGTTGTATTATTGTTTTGTTAGTCAAGTCTTGAATTTTTGGATGATTTTTAAAAACAATCTTTCAACGAATTCATGGTAGGTTCCAGAATATAAAAT]

[+] EMBL CD083911             [GAGGTGCTACCTCATCCATATTAAACCCGAACTATGGGACCATTTTAGGAAAAAA TACGTCTCCACAACAGATACCATCATCATTATTTCTATTATTATTATTATGACAACCAACTCGATAAAAATAATCTAAATAAACCATCTAGTACATCCTGGGTGGGCAGAGAGAATATAAGTACCCTTGGTAGAAATTCACCATCTTATTTTACTGGTTCAAATTCCAACTCACTGGTTAATAACTCTCTTCCCACAAGCAACATATCACCTATTCTTTCAGGAAGAATGTGTCAACGGTTAAATACTCATCCAATCCCAAGACAAAGCAGTTTACAGTTCCCATCTAACGATTTAAAATCTTCCAAGGCGCAGTCAGACTCACTTTTTTTCTCTGGAATGTTAGGATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD082775             [    TGCTACCTCATCCATATTAAACCCGAACTATGGGGCCATTTTAGGAAAAAANTACGTCTCCACAACA ATACCATCATCATTATTTCTATTATTATTATTATGACAACCAACTCGATAAAAATAATCTAAATAAACCATCTAGTACATCCTGGGTGGCCAGAGAGAATATAAGTACGCTTGGTAGAAATTCACCATCTTATTTTACTGGTTCAAATTCCAACTCACTGGTTAATAACTCTCTGCCCACAAGCAACATATCACCTATTCTTTCAGGAAGAATGTGTCAACGGTTAAATACTCATCCAATCCCAAGACAAAGCAGTTTACAGTTCCCATCTAACGATTTAAAATCTTCCAAGGCGCAGTCAGACTCACTTTTTTTCTCTGGAATGTTAGGATCACATCTACCTATGACTTCACAATCCACTTATCATATTATATCCAGCGAGTCCCACGGGCGACACCTTAACCGAAATAGTTTTCAACATCCACTTGTATTCAGTAATTCAACGTTAAGAGACTCTGGTACATTAACAAAAAGAGGCGAACATCCTAAACATACACACAGATCAATGTCACAACCTCCTAAATTACGAGATTGGCTATCTTTTGAAACAGAATTGTGAAGATACACCTCATGACACTAATGCATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD076367             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CACCTTAACCGAAATAGTTTTCAACATCCACTTGTATTCAGTAATTCAACGTTAAGAGACTCTGGTACATTAACAAAAAGAGGCGAACATCCTAAACATACACACAGATCAATGTCACAACCTCCTAAATTACGAGATTGGCTATCTTTTGAAACAGAATTGTGAAGATACACCTCATGACACTAATGCATATCAACAGGAATATCGAAATCCATTTGTGTTCCTAAACTTAGTTCCAGCTCACCTTTGTCTTTCGATGCTTGCATCAGCATTTTGTTGTTAAGGCGGTTTTATTGATCATCTTCAAATGCTCACATTCATTTTTCGTCTTTCCATTCTCCATACAAAATGCATAACCTACAAAAGCTTTCAGTAACTTCTCTTAAATATGTTTATTGGTAATCGATTGGGTTACTTCTGTACATACTAGTGTAAATTATGGTCTTCATTGTAATTTATTTCCTGACAGTTTTATTTGAAGTCAGTTACCTAGTTGTATTATTGTTTTGTTAGTCAAGTCTTGAATTTTTGGATGATTTTTAAAAACAATCTTTCAACGAATTCATGGTAGGTTCCAGAATATAAAAT]
[-] EMBL CD125922             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CACACAGATCAATGTCACAACCTCCTAAATTACGAGATTGGCTATCTTTTGAAACAGAATTGTGAAGATACACCTCATGACACTAATGCATATCAACAGGAATATCGAAATCCATTTGTGTTCCTAAACTTAGTTCCAGCTCACCTTTGTCTTTCGATGCTTGCATCAGCATTTTGTTGTTAAGGCGGTTTTATTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD126145             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CACACAGAT  ATGTCACAACCTCCTAAATTACGAGATTGGCTATCTTTTGAAACAGAATTGTGAAGATACACCTCATGACACTAATGCATATCAACAGGAATATCGAAATCCATTTGTGTTCCTAAACTTAGTTCCAGCTCACCTTTGTCTTTCGATGCTTGCATCAGCATTTTGTTGTTAAGGCGGTTTTATTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD145757             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCAGCATTTTGTTGTTAAGGCGGTTTTATTGATCATCTTCAAATGCTCACATTCATTTTTCGTCTTTCCATTCTCCATACAAAATGCATAACCTACAAAAGCTTTCAGTAACTTCTCTTAAATATGTTTATTGGTAATCGATTGGGTTACTTCTGTACATACTAGTGTAAATTATGGTCTTCATTGTAATTTATTTCCTGACAGTTTTATTTGAAGTCAGTTACCTAGTTGTATTATTGTTTTGT                                                                              ]




>consensus_8212#0
GAGGTGCTACCTCATCCATATTAAACCCGAACTATGGGACCATTTTAGGAAAAAATACGT
CTCCACAACAATACCATCATCATTATTTCTATTATTATTATTATGACAACCAACTCGATA
AAAATAATCTAAATAAACCATCTAGTACATCCTGGGTGGGCAGAGAGAATATAAGTACCC
TTGGTAGAAATTCACCATCTTATTTTACTGGTTCAAATTCCAACTCACTGGTTAATAACT
CTCTTCCCACAAGCAACATATCACCTATTCTTTCAGGAAGAATGTGTCAACGGTTAAATA
CTCATCCAATCCCAAGACAAAGCAGTTTACAGTTCCCATCTAACGATTTAAAATCTTCCA
AGGCGCAGTCAGACTCACTTTTTTTCTCTGGAATGTTAGGATCACATCTACCTATGACTT
CACAATCCACTTATCATATTATATCCAGCGAGTCCCACGGGCGACACCTTAACCGAAATA
GTTTTCAACATCCACTTGTATTCAGTAATTCAACGTTAAGAGACTCTGGTACATTAACAA
AAAGAGGCGAACATCCTAAACATACACACAGATCAATGTCACAACCTCCTAAATTACGAG
ATTGGCTATCTTTTGAAACAGAATTGTGAAGATACACCTCATGACACTAATGCATATCAA
CAGGAATATCGAAATCCATTTGTGTTCCTAAACTTAGTTCCAGCTCACCTTTGTCTTTCG
ATGCTTGCATCAGCATTTTGTTGTTAAGGCGGTTTTATTGATCATCTTCAAATGCTCACA
TTCATTTTTCGTCTTTCCATTCTCCATACAAAATGCATAACCTACAAAAGCTTTCAGTAA
CTTCTCTTAAATATGTTTATTGGTAATCGATTGGGTTACTTCTGTACATACTAGTGTAAA
TTATGGTCTTCATTGTAATTTATTTCCTGACAGTTTTATTTGAAGTCAGTTACCTAGTTG
TATTATTGTTTTGTTAGTCAAGTCTTGAATTTTTGGATGATTTTTAAAAACAATCTTTCA
ACGAATTCATGGTAGGTTCCAGAATATAAAAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)