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Schistosoma mansoni
cluster # 822 cluster # 822       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_822#0 length = 1337 sequences # 2  

consensusID : consensus_822#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1337
fasta sequence
                              [GGAGCCATAATTCGGCACGACGGCTTATGGTATAAGATTTGTTATTCATGTTAGTGGTGAGGCTGGTAAATTTCATCTTCTTCCATTGACAATGAATATTGGTTCAGGTTTAGCTTTACTCGGTTTGGCGCCAACTGTTTGTGACATAATCGCATTAAATCTTTTACGATCAAGAGATATTTATCAACGTGCAAAATTTGAAACAATTGCCGAAGAACAAGCTCATTTATCTAGTCGTCGTGCTGATAAAGCACAACGTAAAAAATATGGTTTATCTAAACGTAATACAGAAACAATAAATGAGAATTCAGATGAAAATGGTAAAATTATACAATGGAAAGATGATCAAGAATTTACAGTAAGTGATACACAAACTATACATTCATCAACATAAACATTTGAATAATTGTAAATTCAAATCAAGCGGTATGTTTTTTTCTCTTTTGCTTTTTTCTCTAAATTAAAAGAGATAGAATCGTTTCCTTCAATCTTCACTAATATCTTTTTATTATTATTTATTCGTACATATATGATGGTAGTTGCATTATATCTTAGCTTCTTTTAATATCGGTTATGCATTTCTTTTTTATGTTGCAATGTTATACATGACAATCGTCTATATGTTACCATGTACATTATTATCTGTTTACAAATCATTACTAGCATCGAATACAAGGATTAATATACATTAGAAAGTATATCTATATATATGGTTATAATACTTATAAATCTGTTGTAAATGTTCACAAACTCTTACTATTATTACCATTTGTCTGCTTTAAATGTTATTCCTTTATTCTCTATTNTGTACTCAACCAATTTCTATTCGGTTATCTGTTGTTGTTTTTTTATTTATAATTTCATTCCTGTTACGAATTGTTTATTGAGAATGAACAAGGAAAAAAAACTGCATTTTTCTCGCCCCCCCTTCCCCCCAAAAATAAACGAAAAAGAAAATAGATCAGTTGTATCTGAATATGAAAAAAAATGTTCAAATATCAATTGTTTACCATCTTAAAAAATTAATATCCATTTAGCGCTTGGAAACAAAAAAAACTTTTTTGCGAGACATTTTTCTTCTTAGATGAAAAAAACTAATAATCAATAAATTGGAACTAATCATAACATCTAAGTATTTATTTTAAATTTTTACTACGTTTACTATGATGTAACTTTATTCTATTTATTTGGTGAAAGAATATAATTTGTGATGTTGTTTATTTTTCTCTTTTAATTCTTTAGTCTTTTTATGATAAAATTATTTTACAAACATTATTGATGATAATCTTAATGTATTATGCATTTGTCAAAAGTATACATCTATGAATTATTATAAG]

[+] EMBL CD081583             [GGAGCCATAATTCGGCACGACGGCTTATGGTATAAGATTTGTTATTCATGTTAGTGGTGAGGCTGGTAAATTTCATCTTCTTCCATTGACAATGAATATTGGTTCAGGTTTAGCTTTACTCGGTTTGGCGCCAACTGTTTGTGACATAATCGCATTAAATCTTTTACGATCAAGAGATATTTATCAACGTGCAAAATTTGAAACAATTGCCGAAGAACAAGCTCATTTATCTAGTCGTCGTGCTGATAAAGCACAACGTAAAAAATATGGTTTATCTAAACGTAATACAGAAACAATAAATGAGAATTCAGATGAAAATGGTAAAATTATACAATGGAAAGATGATCAAGAATTTACAGTAAGTGATACACAAACTATACATTCATCAACATAAACATTTGAATAATTGTAAATTCAAATCAAGCGGTATGTTTTTTTCTCTTTTGCTTTTTTCTCTAAATTAAAAGAGATAGAATCGTTTCCTTCAATCTTCACTAATATCTTTTTATTATTATTTATTCGTACATATATGATGGTAGTTGCATTATATCTTAGCTTCTTTTAATATCGGTTATGCATTTCTTTTTTATGTTGCAATGTTATACATGACAATCGTCTATATGTTACCATGTACATTATTATCTGTTTACAAATCATTACTAGCATCGAATACAAGGATTAATATACATTAGAAAGTATATCTATATATATGGTTATAATACTTATAAATCTGTTGTAAATGTTCACAAACTCTTACTATTATTACCATTTGTCTGCTTTAAATGTTATTCCTTTATTCTCTATTNTGTACTCAACCAATTTCTATTCGGTTATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD075407             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTATTACCATTTGTCTGCTTTAAATGTTATTCCTTTATTCTCTATTTTGTACTCAACCAATTTCTATTCGGTTATCTGTTGTTGTTTTTTTATTTATAATTTCATTCCTGTTACGAATTGTTTATTGAGAATGAACAAGGAAAAAAAACTGCATTTTTCTCGCCCCCCCTTCCCCCCAAAAATAAACGAAAAAGAAAATAGATCAGTTGTATCTGAATATGAAAAAAAATGTTCAAATATCAATTGTTTACCATCTTAAAAAATTAATATCCATTTAGCGCTTGGAAACAAAAAAAACTTTTTTGCGAGACATTTTTCTTCTTAGATGAAAAAAACTAATAATCAATAAATTGGAACTAATCATAACATCTAAGTATTTATTTTAAATTTTTACTACGTTTACTATGATGTAACTTTATTCTATTTATTTGGTGAAAGAATATAATTTGTGATGTTGTTTATTTTTCTCTTTTAATTCTTTAGTCTTTTTATGATAAAATTATTTTACAAACATTATTGATGATAATCTTAATGTATTATGCATTTGTCAAAAGTATACATCTATGAATTATTATAAG]


>consensus_822#0 GGAGCCATAATTCGGCACGACGGCTTATGGTATAAGATTTGTTATTCATGTTAGTGGTGA GGCTGGTAAATTTCATCTTCTTCCATTGACAATGAATATTGGTTCAGGTTTAGCTTTACT CGGTTTGGCGCCAACTGTTTGTGACATAATCGCATTAAATCTTTTACGATCAAGAGATAT TTATCAACGTGCAAAATTTGAAACAATTGCCGAAGAACAAGCTCATTTATCTAGTCGTCG TGCTGATAAAGCACAACGTAAAAAATATGGTTTATCTAAACGTAATACAGAAACAATAAA TGAGAATTCAGATGAAAATGGTAAAATTATACAATGGAAAGATGATCAAGAATTTACAGT AAGTGATACACAAACTATACATTCATCAACATAAACATTTGAATAATTGTAAATTCAAAT CAAGCGGTATGTTTTTTTCTCTTTTGCTTTTTTCTCTAAATTAAAAGAGATAGAATCGTT TCCTTCAATCTTCACTAATATCTTTTTATTATTATTTATTCGTACATATATGATGGTAGT TGCATTATATCTTAGCTTCTTTTAATATCGGTTATGCATTTCTTTTTTATGTTGCAATGT TATACATGACAATCGTCTATATGTTACCATGTACATTATTATCTGTTTACAAATCATTAC TAGCATCGAATACAAGGATTAATATACATTAGAAAGTATATCTATATATATGGTTATAAT ACTTATAAATCTGTTGTAAATGTTCACAAACTCTTACTATTATTACCATTTGTCTGCTTT AAATGTTATTCCTTTATTCTCTATTNTGTACTCAACCAATTTCTATTCGGTTATCTGTTG TTGTTTTTTTATTTATAATTTCATTCCTGTTACGAATTGTTTATTGAGAATGAACAAGGA AAAAAAACTGCATTTTTCTCGCCCCCCCTTCCCCCCAAAAATAAACGAAAAAGAAAATAG ATCAGTTGTATCTGAATATGAAAAAAAATGTTCAAATATCAATTGTTTACCATCTTAAAA AATTAATATCCATTTAGCGCTTGGAAACAAAAAAAACTTTTTTGCGAGACATTTTTCTTC TTAGATGAAAAAAACTAATAATCAATAAATTGGAACTAATCATAACATCTAAGTATTTAT TTTAAATTTTTACTACGTTTACTATGATGTAACTTTATTCTATTTATTTGGTGAAAGAAT ATAATTTGTGATGTTGTTTATTTTTCTCTTTTAATTCTTTAGTCTTTTTATGATAAAATT ATTTTACAAACATTATTGATGATAATCTTAATGTATTATGCATTTGTCAAAAGTATACAT CTATGAATTATTATAAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)