These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8220#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 751 fasta sequence [ATAGAGAAAAAGACAAGCAAGTGAGCAATCGAAACTGTTAATTACGACTAGAATATACATTTACAATAACTAATCATTCCAAAATGAATTAATCAGTGAAAGAAAAGAGAATTCACTCTGTATTAATCATGGATCGATTTGATTTAATCAGCCTTATTTCAGATTATTTTAGCAATTAAGCTATTTGTACAGGGTCATTGTATTCTTAACGGAGTGTTAAGAGGGTAAATATTTGGGGATTTTATATGATTGTTTTGATATTATTATTGATATTGTGAAGATGATGGTAGCAGTGTGGTTGTTGTTGGTGGTGGTAAACGATGATTACCGTCATCGACTGAATTACGAACACGTCTGAAGTGAACAGGTGGCTTGCTATTCGTTCCATTATTGATATTTCTAAATTCTTGATTTATTGAAGGATGCATAGTTCCACTAGACGAAGGAGGATGAGAGGTAGTTGGTGCAGAATTGGGAGGTTCTTGAGATAATGTAGTAGTAGAAGTCGGTTTACTTGTAAATCGTTCAACGATATGTTTTGGATGTGTAGTCCATTTAATCATAGTCTCTGATGAACGATAAAGGAAGAAAAGTTTTGCCAC-AACTGTTCCTCTAATAATAGTAAGTTATTTTCACGTACAAGATAAATTTCATGGCATAAATTCAAAATACGATCCACATGAGGTAATTCTTCAAGACGAATCACATAAGAAATATTACTGTACGCAGTACGTAGCAGCCGACTAGCTAA] [-] EMBL CD059567 [ATAGAGAAAAAGACAAGCAAGTGAGCAATCGAAACTGTTAATTACGACTAGAATATACATTTACAATAACTAATCATTCCAAAATGAATTAATCAGTGAAAGAAAAGAGAATTCACTCTGTATTAATCATGGATCGATTTGATTTAATCAGCCTTATTTCAGATTATTTTAGCAATTAAGCTATTTGTACAGGGTCATTGTATTCTTAACGGAGTGTTAAGAGGGTAAATATTTGGGGA ] [+] EMBL CD194458 [ AACTGTTAATTACGACTAGACTATACATTTACAATAACTAATCATTCCAAAATGAATTAATCAGTGAAAGAAAAGAAAATTCACTCTGTATTAATCATGGATCGATTTGATTTAATCAGTCTTATTTCAGATTATTTTAACAATTAAGCTATTTGTACAGGGCCATTGTATTCTTAACGGAGTGTTAAGAGGGTAAATATTTGGGGATTTTATATGATTGTTTTGATATTATTATTGATATTGTGAAGATGATGGTAGCAGTGTGGTTGTTGTTGGTGGTGGTAAACGATGATTACCGTCATCGACTGAATTACGAACACGTCTGAAGTGAACAGGTGGCTTGCTATTCGTTCCATTATTGATATTTCTAAATTCTTGATTTATTGAAGGATGCATAGTTCCACTAGACGAAGGA ] [-] EMBL CD144761 [ cACGGAGTGTTAAGAGGGTAAATATTTGGGGATTTTATATGATTGTTTTGTTATTATTATTGATATTGTGAAGATGATGGTAGCAGTGTGGTTGTTGTTGGTGGTGGTAAACGATGATTACCGTCATCGACTGAATTACGAACACGTCTGAAGTGAACAGGTGGCTTGCTATTCGTTCCATTATTGATATTTCTAAATTCTTGATTTATTGAAGGATGCATAGTTCCACTAGACGAAGGAGGATGAGAGGTAGTTGGTGCAGAATTGGGAGGTTCTTGAGATAATGTAGTAGTAGAAGTCGGTTTACTTGTAAATCGTTCAACGATATGTTTTGGATGTGTAGTCCATTTAATCATAGTCTCTGATGAGCGATAAAGGAAGAAAAGTTTTGCCAC ctccgtgg ] [+] EMBL CD144611 [ GGTAAATATTTGGGGATTTTATATGATTGTTTTGATATTATTATTGATATTGTGAAGATGATGGTAGCAGTGTGGTTGTTGTTGGTGGTGGTAAACGATGATTACCGTCATCGACTGAATTACGAACACGTCTGAAGTGAACAGGTGGCTTGCTATTCGTTCCATTATTGATATTTCTAAATTCTTGATTTATTGAAGGATGCATAGTTCCACTANACGAAGGAGGATGAGAGGTAGTTGGTGCATAATTGGGAGGTTCTTGAGATAATGTAGTAGTAGAAGTCGGTTTACTTGTAAATCGTTCAACGATATGTTCTGGATGTCTAGTCCATTTAATCATAGTCTCTGATGAACGATAAAGGAAGAAAA ] [-] EMBL CD193356 [ GGATGAGAGGTAGTTGGTGCAGAATTGGGAGGTTCTTGAGATAATGTAGTAGTAGAAGTCGGTTTACTTGTAAATCGTTCAACGATATGTTTTGGATGTGTAGTCCATTTAATCATAGTCTCTGATGAACGATAAAGGAAGAAAAGTTTTGCCACTAACTGTTCCTCTAATAATAGTAAGTTATTTTCACGTACAAGATAAATTTCATGGCATAAATTCAAAATACGATCCACATGAGGTAATTCTTCAAGACGAATCACATAAGAAATATTACTGTACGCAGTACGTAGCAGCCGACTAGCTAA] [-] EMBL CD112452 [ AGGTTCTTGAGATAATGTAGTAGTAGAAGTCGGTTTACTTGTAAATCGTTCAACGATATGTTTTGGATGTCTAGTCCATTTAATCATAGTCTCTGATGAACGATAAAGGAAGAAAAGTTTTGCCACTAACTGTTCCTCTAATAATAGTAAGTTATTTTCACGTACAAGATAAATTTCATGGCATAAATTCAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||