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Schistosoma mansoni
cluster # 8222 cluster # 8222       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8222#0 length = 1091 sequences # 6  

consensusID : consensus_8222#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1091
fasta sequence
                              [TCAAATATTACTTACATAATTGAAACGGATCACAATAGTTATACAGATGATGTTAAAAATACTCATAAACGTCAAATGGCTGAGAAAATGATAGCCTCTGCTCTTGGTGGAACTCCTGAGGACATGGCTCTAGCAAAAGAGTCCGCTGCTGCTTTTCTTTCGGAAAATCTTCCTGAGGCAATATTTGGCGCTCCAAAGGCTGGGCCTGGTATGTGGGCAAGTTTACTGAGGTGTTTTAAACCATTGGATGGAAGCACATGTCAAATAATACGATTCCCACA-AAACGAAGC-TGCTCATGCCTTAACTTTTGTCAAATTTAATAATCATCCAGCTGAACAATTCCTTGTTGTGGCTCTTGTCAAGGATCTTATCCTCAATCCCCGTTCATGTTCTGGTGGTTGTTTAAAGACATATCGAATTTGGAACAATGGAGAACGTCTCGAATTCCTTCTCGAAACACCAGTTGATGATTTTCCAGCAGCTCTATGTGCTTTTCAAGGTCGTCTTCTTGTGGGTGTCGGAAATCGTTTACGAATATATGATCTAGGGAAAAAAAAGTTGTTGAAAAAATGTGAAAACAAGCACATTCCTACTCTAATCAATGGTATTTATTCTGTAGGCAGTCGGATAATTGTGACAGATGTTCAAGAAAGTGTTCATTGGGTCCGCTATAGACCACGCTCGGATAGCCAATTAGTTATATTTGCAGATGATACTAATCCCCGTTGGATTATACATTTAGCAGTATTGGATGCTTCAACAGTAGCAGTTTCAGATAAGTTTGGAAATGTCACTATTCTGCGTTTACCACCTAATGTAATCGATGATATTGAAGATGATCCTAGTGGTAATCGCGCGCTTTGGGATAGAGGTTTCCTTGGCGGAGCAAGCCAAAAGTGTGATGTGCTATGTCATTTTTACGTCGGTGAGGTTGTTACTTGTTTACAAAAGGCCACTTTGATCCCTGGAGGTTCTGAAGGTATTGTTTATTCAACAATATCTGGTAGCATCGGAGTGTTGGTTCCATTTGCCTCTCGGGATGCCTACGATTNCTTNCCACATTTGGAGCTACATATGAGAGCTGAAGGATA]

[+] EMBL CD134119             [TCAAATATTACTTACATAATTGAAACGGATCACAATAGTTATACAGATGATGTTAAAAATACTCATAAACGTCAAATGGCTGAGAAAATGATAGCCTCTGCTCTTGGTGGAACTCCTGAGGACATGGCTCTAGCAAAAGAGTCCGCTGCTGCTTTTCTTTCGGAAAATCTTCCTGAGGCAATATTTGGCGCTCCAAAGGCTGGGCCTGGTATGTGGGCAAGTTTACTGAGGTGTTTTAAACCATTGGATGGAAGCACATGTCAAATAATACGATTCCCACA AAACGAAGC TGCTCATGCCTTAACTTTTGTCAAATTTAATAATCATCCAGCTGAACAATTCCTTGTTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD189565             [                                                                                                                                                                                                                           AGTTTACTGAGGTGTTTTAAACCATTGGATGGAAGCACATGTCAAATAATACGATTCCCACACAAACGAAGCTTGCTCATGCCTTAACTTTTGTCAAATTTAATAATCATCCAGCTGAACAATTCCTTGTTGTGGCTCTTGTCAAGGATCTTATCCTCAATCCCCGTTCATGTTCTGGTGGTTGTTTAAAGACATATCGAATTTGGAACAATGGAGAACGTCTCGAATTCCTTCTCGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL AA819940             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTGTCAAATTTAATAATCATCCAGCTGAACAATTCCTTGTTGTGGCTCTTGTCAAGGATCTTATCCTCAATCCCCGTTCATGTTCTGGTGGTTGTTTAAAGACATATCGAATTTGGAACAATGGAGAACGTCTCGAATTCCTTCACGAAACACCAGTTGATGATTTTCCAGCAGCTCTATGTGCTTTTCAAGGTCGTCTTCTTGTGGGTGTCGGAAATCGTTTACGAATATATGATCTAGGGAAAAAAAAGTTGTTGAAAAAATGTGAAAACAAGCACATTCCTACTCTAATCAATGGTATTTATTCTGTAGGCAGTCGGATAATTGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD093963             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CAGTTGATGATTTTCCAGCAGCTCTATGTGCTTTTCAAGGTCGTCTTCTTGTGGGTGTCGGAAATCGTTTACGAATATATGATCTAGGGAAAAAAAAATTGTTGAAAAAATGTGAAAAC AGCACATTCCTACTCTAATCAATGGTATTTATTCTGTAGGCAGTCGGATAGTTGTGACAGATGTTCAAGAAAGTGTTCATTGGGTCCGCTATAGACCACGCTCGGATAGCCAATTAGTTATATTTGCAGATGATACTAATCCCCGTTGGATTATACATTTAGCAGTATTGGATGCTTCAACAGTAGCAGTTTCAGATAAGTTTGGAAATGTCACTATTCTGCGTTTACCACCTAATGTAATCGATGATATTGAAGATGATCCTAGTGGTAATCGCGCGCTTTGNGATAGA                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD156876             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGATTTTCCAGCAGCTCTATGTGCTTTTCAAGGTCGTCTTCTTGTGGGTGTCGGAAATCGTTTACGAATATATGATCTAGGGAAAAAAAAGTTGTTGAAAAAATGTGAAAACAAGCACATTCCTACTCTAATCAATGGTATTTATTCTGTAGGCAGTCGGATAATTGTGACAGATGTTCAAGAAAGTGTTCATTGGGTCCGCTATAGACCACGCTCGGATAGCCAATTAGTTATATTTGCAGATGATACTAATCCCCGTTGGATTATACATTTAGCAGTATTGGATGCTTCAACAGTAGCAGTTTCAGATAAGTTTGGAAATGTCACTATTCTGCGTTTACCACCTAATGTAATCGATGATATTGAAGATGATCCTAGTGGTAATCGCGCGCTTTGGGATAGAGGTTTCCTTGGCGGAGCAAGCCAAAAGTGTGATGTGCTATGTCATTTTTACGTCGGTGAGGTTGTTACTTGTTTACAAAAGGCCACTTTGATCCCTGGAGGTTCTGAAGGTATTGTTTATTCAACAATATCTGGTAGCATCGGAGTGTTGGTTCCATTTGCCTCTCGGGATGCCTACGATTNCTTNCCACATTTGGAGCTACATATGAGAGCTGAAGGATA]
[+] EMBL CD156872             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGATTTTCCAGCAGCTCTATGTGCTTTTCAAGGTCGTCTTCTTGTGGGTGTCGGAAATCGTTTACGAATATATGATCTAGGGAAAAAAAAGTTGTTGAAAAAATGTGAAAACAAGCACATTCCTACTCTAATCAATGGTATTTATTCTGTAGGCAGTCGGATAATTGTGACAGATGTTCAAGAAAGTGTTCATTGGGTCCGCTATAGACCACGCTCGGATAGCCAATTAGTTATATTTGCAGATGATACTAATCCCCGTTGGATTATACATTTAGCAGTATTGGATGCTTCAACAGTAGCAGTTTCAGATAAGTTTGGAAGTGTCACTATTCTGCGTTTACCACCTAATGTAATCGATGATATTGAAGATGATCCTAGTGGTAATCGCGCGCTTTGGGATAGAGGTTTCCTTGGCGGAGCAAGCCAAAAGTGTGATGTGCTATGTCATTTTTACGTCGGTGAGGTTGTTACTTGTTTACAAAAGGCCACTTTGATCCCTGNAGGTTCTGAAGGTATTGTTTATTCAACAATATCTGGTAGCATCGGAat                                                                           ]


>consensus_8222#0 TCAAATATTACTTACATAATTGAAACGGATCACAATAGTTATACAGATGATGTTAAAAAT ACTCATAAACGTCAAATGGCTGAGAAAATGATAGCCTCTGCTCTTGGTGGAACTCCTGAG GACATGGCTCTAGCAAAAGAGTCCGCTGCTGCTTTTCTTTCGGAAAATCTTCCTGAGGCA ATATTTGGCGCTCCAAAGGCTGGGCCTGGTATGTGGGCAAGTTTACTGAGGTGTTTTAAA CCATTGGATGGAAGCACATGTCAAATAATACGATTCCCACAAAACGAAGCTGCTCATGCC TTAACTTTTGTCAAATTTAATAATCATCCAGCTGAACAATTCCTTGTTGTGGCTCTTGTC AAGGATCTTATCCTCAATCCCCGTTCATGTTCTGGTGGTTGTTTAAAGACATATCGAATT TGGAACAATGGAGAACGTCTCGAATTCCTTCTCGAAACACCAGTTGATGATTTTCCAGCA GCTCTATGTGCTTTTCAAGGTCGTCTTCTTGTGGGTGTCGGAAATCGTTTACGAATATAT GATCTAGGGAAAAAAAAGTTGTTGAAAAAATGTGAAAACAAGCACATTCCTACTCTAATC AATGGTATTTATTCTGTAGGCAGTCGGATAATTGTGACAGATGTTCAAGAAAGTGTTCAT TGGGTCCGCTATAGACCACGCTCGGATAGCCAATTAGTTATATTTGCAGATGATACTAAT CCCCGTTGGATTATACATTTAGCAGTATTGGATGCTTCAACAGTAGCAGTTTCAGATAAG TTTGGAAATGTCACTATTCTGCGTTTACCACCTAATGTAATCGATGATATTGAAGATGAT CCTAGTGGTAATCGCGCGCTTTGGGATAGAGGTTTCCTTGGCGGAGCAAGCCAAAAGTGT GATGTGCTATGTCATTTTTACGTCGGTGAGGTTGTTACTTGTTTACAAAAGGCCACTTTG ATCCCTGGAGGTTCTGAAGGTATTGTTTATTCAACAATATCTGGTAGCATCGGAGTGTTG GTTCCATTTGCCTCTCGGGATGCCTACGATTNCTTNCCACATTTGGAGCTACATATGAGA GCTGAAGGATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)