These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8222#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1091 fasta sequence [TCAAATATTACTTACATAATTGAAACGGATCACAATAGTTATACAGATGATGTTAAAAATACTCATAAACGTCAAATGGCTGAGAAAATGATAGCCTCTGCTCTTGGTGGAACTCCTGAGGACATGGCTCTAGCAAAAGAGTCCGCTGCTGCTTTTCTTTCGGAAAATCTTCCTGAGGCAATATTTGGCGCTCCAAAGGCTGGGCCTGGTATGTGGGCAAGTTTACTGAGGTGTTTTAAACCATTGGATGGAAGCACATGTCAAATAATACGATTCCCACA-AAACGAAGC-TGCTCATGCCTTAACTTTTGTCAAATTTAATAATCATCCAGCTGAACAATTCCTTGTTGTGGCTCTTGTCAAGGATCTTATCCTCAATCCCCGTTCATGTTCTGGTGGTTGTTTAAAGACATATCGAATTTGGAACAATGGAGAACGTCTCGAATTCCTTCTCGAAACACCAGTTGATGATTTTCCAGCAGCTCTATGTGCTTTTCAAGGTCGTCTTCTTGTGGGTGTCGGAAATCGTTTACGAATATATGATCTAGGGAAAAAAAAGTTGTTGAAAAAATGTGAAAACAAGCACATTCCTACTCTAATCAATGGTATTTATTCTGTAGGCAGTCGGATAATTGTGACAGATGTTCAAGAAAGTGTTCATTGGGTCCGCTATAGACCACGCTCGGATAGCCAATTAGTTATATTTGCAGATGATACTAATCCCCGTTGGATTATACATTTAGCAGTATTGGATGCTTCAACAGTAGCAGTTTCAGATAAGTTTGGAAATGTCACTATTCTGCGTTTACCACCTAATGTAATCGATGATATTGAAGATGATCCTAGTGGTAATCGCGCGCTTTGGGATAGAGGTTTCCTTGGCGGAGCAAGCCAAAAGTGTGATGTGCTATGTCATTTTTACGTCGGTGAGGTTGTTACTTGTTTACAAAAGGCCACTTTGATCCCTGGAGGTTCTGAAGGTATTGTTTATTCAACAATATCTGGTAGCATCGGAGTGTTGGTTCCATTTGCCTCTCGGGATGCCTACGATTNCTTNCCACATTTGGAGCTACATATGAGAGCTGAAGGATA] [+] EMBL CD134119 [TCAAATATTACTTACATAATTGAAACGGATCACAATAGTTATACAGATGATGTTAAAAATACTCATAAACGTCAAATGGCTGAGAAAATGATAGCCTCTGCTCTTGGTGGAACTCCTGAGGACATGGCTCTAGCAAAAGAGTCCGCTGCTGCTTTTCTTTCGGAAAATCTTCCTGAGGCAATATTTGGCGCTCCAAAGGCTGGGCCTGGTATGTGGGCAAGTTTACTGAGGTGTTTTAAACCATTGGATGGAAGCACATGTCAAATAATACGATTCCCACA AAACGAAGC TGCTCATGCCTTAACTTTTGTCAAATTTAATAATCATCCAGCTGAACAATTCCTTGTTGT ] [-] EMBL CD189565 [ AGTTTACTGAGGTGTTTTAAACCATTGGATGGAAGCACATGTCAAATAATACGATTCCCACACAAACGAAGCTTGCTCATGCCTTAACTTTTGTCAAATTTAATAATCATCCAGCTGAACAATTCCTTGTTGTGGCTCTTGTCAAGGATCTTATCCTCAATCCCCGTTCATGTTCTGGTGGTTGTTTAAAGACATATCGAATTTGGAACAATGGAGAACGTCTCGAATTCCTTCTCGAAA ] [+] EMBL AA819940 [ TTGTCAAATTTAATAATCATCCAGCTGAACAATTCCTTGTTGTGGCTCTTGTCAAGGATCTTATCCTCAATCCCCGTTCATGTTCTGGTGGTTGTTTAAAGACATATCGAATTTGGAACAATGGAGAACGTCTCGAATTCCTTCACGAAACACCAGTTGATGATTTTCCAGCAGCTCTATGTGCTTTTCAAGGTCGTCTTCTTGTGGGTGTCGGAAATCGTTTACGAATATATGATCTAGGGAAAAAAAAGTTGTTGAAAAAATGTGAAAACAAGCACATTCCTACTCTAATCAATGGTATTTATTCTGTAGGCAGTCGGATAATTGTG ] [+] EMBL CD093963 [ CAGTTGATGATTTTCCAGCAGCTCTATGTGCTTTTCAAGGTCGTCTTCTTGTGGGTGTCGGAAATCGTTTACGAATATATGATCTAGGGAAAAAAAAATTGTTGAAAAAATGTGAAAAC AGCACATTCCTACTCTAATCAATGGTATTTATTCTGTAGGCAGTCGGATAGTTGTGACAGATGTTCAAGAAAGTGTTCATTGGGTCCGCTATAGACCACGCTCGGATAGCCAATTAGTTATATTTGCAGATGATACTAATCCCCGTTGGATTATACATTTAGCAGTATTGGATGCTTCAACAGTAGCAGTTTCAGATAAGTTTGGAAATGTCACTATTCTGCGTTTACCACCTAATGTAATCGATGATATTGAAGATGATCCTAGTGGTAATCGCGCGCTTTGNGATAGA ] [+] EMBL CD156876 [ TGATTTTCCAGCAGCTCTATGTGCTTTTCAAGGTCGTCTTCTTGTGGGTGTCGGAAATCGTTTACGAATATATGATCTAGGGAAAAAAAAGTTGTTGAAAAAATGTGAAAACAAGCACATTCCTACTCTAATCAATGGTATTTATTCTGTAGGCAGTCGGATAATTGTGACAGATGTTCAAGAAAGTGTTCATTGGGTCCGCTATAGACCACGCTCGGATAGCCAATTAGTTATATTTGCAGATGATACTAATCCCCGTTGGATTATACATTTAGCAGTATTGGATGCTTCAACAGTAGCAGTTTCAGATAAGTTTGGAAATGTCACTATTCTGCGTTTACCACCTAATGTAATCGATGATATTGAAGATGATCCTAGTGGTAATCGCGCGCTTTGGGATAGAGGTTTCCTTGGCGGAGCAAGCCAAAAGTGTGATGTGCTATGTCATTTTTACGTCGGTGAGGTTGTTACTTGTTTACAAAAGGCCACTTTGATCCCTGGAGGTTCTGAAGGTATTGTTTATTCAACAATATCTGGTAGCATCGGAGTGTTGGTTCCATTTGCCTCTCGGGATGCCTACGATTNCTTNCCACATTTGGAGCTACATATGAGAGCTGAAGGATA] [+] EMBL CD156872 [ TGATTTTCCAGCAGCTCTATGTGCTTTTCAAGGTCGTCTTCTTGTGGGTGTCGGAAATCGTTTACGAATATATGATCTAGGGAAAAAAAAGTTGTTGAAAAAATGTGAAAACAAGCACATTCCTACTCTAATCAATGGTATTTATTCTGTAGGCAGTCGGATAATTGTGACAGATGTTCAAGAAAGTGTTCATTGGGTCCGCTATAGACCACGCTCGGATAGCCAATTAGTTATATTTGCAGATGATACTAATCCCCGTTGGATTATACATTTAGCAGTATTGGATGCTTCAACAGTAGCAGTTTCAGATAAGTTTGGAAGTGTCACTATTCTGCGTTTACCACCTAATGTAATCGATGATATTGAAGATGATCCTAGTGGTAATCGCGCGCTTTGGGATAGAGGTTTCCTTGGCGGAGCAAGCCAAAAGTGTGATGTGCTATGTCATTTTTACGTCGGTGAGGTTGTTACTTGTTTACAAAAGGCCACTTTGATCCCTGNAGGTTCTGAAGGTATTGTTTATTCAACAATATCTGGTAGCATCGGAat ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||