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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8222#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1091 fasta sequence
[TCAAATATTACTTACATAATTGAAACGGATCACAATAGTTATACAGATGATGTTAAAAATACTCATAAACGTCAAATGGCTGAGAAAATGATAGCCTCTGCTCTTGGTGGAACTCCTGAGGACATGGCTCTAGCAAAAGAGTCCGCTGCTGCTTTTCTTTCGGAAAATCTTCCTGAGGCAATATTTGGCGCTCCAAAGGCTGGGCCTGGTATGTGGGCAAGTTTACTGAGGTGTTTTAAACCATTGGATGGAAGCACATGTCAAATAATACGATTCCCACA-AAACGAAGC-TGCTCATGCCTTAACTTTTGTCAAATTTAATAATCATCCAGCTGAACAATTCCTTGTTGTGGCTCTTGTCAAGGATCTTATCCTCAATCCCCGTTCATGTTCTGGTGGTTGTTTAAAGACATATCGAATTTGGAACAATGGAGAACGTCTCGAATTCCTTCTCGAAACACCAGTTGATGATTTTCCAGCAGCTCTATGTGCTTTTCAAGGTCGTCTTCTTGTGGGTGTCGGAAATCGTTTACGAATATATGATCTAGGGAAAAAAAAGTTGTTGAAAAAATGTGAAAACAAGCACATTCCTACTCTAATCAATGGTATTTATTCTGTAGGCAGTCGGATAATTGTGACAGATGTTCAAGAAAGTGTTCATTGGGTCCGCTATAGACCACGCTCGGATAGCCAATTAGTTATATTTGCAGATGATACTAATCCCCGTTGGATTATACATTTAGCAGTATTGGATGCTTCAACAGTAGCAGTTTCAGATAAGTTTGGAAATGTCACTATTCTGCGTTTACCACCTAATGTAATCGATGATATTGAAGATGATCCTAGTGGTAATCGCGCGCTTTGGGATAGAGGTTTCCTTGGCGGAGCAAGCCAAAAGTGTGATGTGCTATGTCATTTTTACGTCGGTGAGGTTGTTACTTGTTTACAAAAGGCCACTTTGATCCCTGGAGGTTCTGAAGGTATTGTTTATTCAACAATATCTGGTAGCATCGGAGTGTTGGTTCCATTTGCCTCTCGGGATGCCTACGATTNCTTNCCACATTTGGAGCTACATATGAGAGCTGAAGGATA]
[+] EMBL CD134119 [TCAAATATTACTTACATAATTGAAACGGATCACAATAGTTATACAGATGATGTTAAAAATACTCATAAACGTCAAATGGCTGAGAAAATGATAGCCTCTGCTCTTGGTGGAACTCCTGAGGACATGGCTCTAGCAAAAGAGTCCGCTGCTGCTTTTCTTTCGGAAAATCTTCCTGAGGCAATATTTGGCGCTCCAAAGGCTGGGCCTGGTATGTGGGCAAGTTTACTGAGGTGTTTTAAACCATTGGATGGAAGCACATGTCAAATAATACGATTCCCACA AAACGAAGC TGCTCATGCCTTAACTTTTGTCAAATTTAATAATCATCCAGCTGAACAATTCCTTGTTGT ]
[-] EMBL CD189565 [ AGTTTACTGAGGTGTTTTAAACCATTGGATGGAAGCACATGTCAAATAATACGATTCCCACACAAACGAAGCTTGCTCATGCCTTAACTTTTGTCAAATTTAATAATCATCCAGCTGAACAATTCCTTGTTGTGGCTCTTGTCAAGGATCTTATCCTCAATCCCCGTTCATGTTCTGGTGGTTGTTTAAAGACATATCGAATTTGGAACAATGGAGAACGTCTCGAATTCCTTCTCGAAA ]
[+] EMBL AA819940 [ TTGTCAAATTTAATAATCATCCAGCTGAACAATTCCTTGTTGTGGCTCTTGTCAAGGATCTTATCCTCAATCCCCGTTCATGTTCTGGTGGTTGTTTAAAGACATATCGAATTTGGAACAATGGAGAACGTCTCGAATTCCTTCACGAAACACCAGTTGATGATTTTCCAGCAGCTCTATGTGCTTTTCAAGGTCGTCTTCTTGTGGGTGTCGGAAATCGTTTACGAATATATGATCTAGGGAAAAAAAAGTTGTTGAAAAAATGTGAAAACAAGCACATTCCTACTCTAATCAATGGTATTTATTCTGTAGGCAGTCGGATAATTGTG ]
[+] EMBL CD093963 [ CAGTTGATGATTTTCCAGCAGCTCTATGTGCTTTTCAAGGTCGTCTTCTTGTGGGTGTCGGAAATCGTTTACGAATATATGATCTAGGGAAAAAAAAATTGTTGAAAAAATGTGAAAAC AGCACATTCCTACTCTAATCAATGGTATTTATTCTGTAGGCAGTCGGATAGTTGTGACAGATGTTCAAGAAAGTGTTCATTGGGTCCGCTATAGACCACGCTCGGATAGCCAATTAGTTATATTTGCAGATGATACTAATCCCCGTTGGATTATACATTTAGCAGTATTGGATGCTTCAACAGTAGCAGTTTCAGATAAGTTTGGAAATGTCACTATTCTGCGTTTACCACCTAATGTAATCGATGATATTGAAGATGATCCTAGTGGTAATCGCGCGCTTTGNGATAGA ]
[+] EMBL CD156876 [ TGATTTTCCAGCAGCTCTATGTGCTTTTCAAGGTCGTCTTCTTGTGGGTGTCGGAAATCGTTTACGAATATATGATCTAGGGAAAAAAAAGTTGTTGAAAAAATGTGAAAACAAGCACATTCCTACTCTAATCAATGGTATTTATTCTGTAGGCAGTCGGATAATTGTGACAGATGTTCAAGAAAGTGTTCATTGGGTCCGCTATAGACCACGCTCGGATAGCCAATTAGTTATATTTGCAGATGATACTAATCCCCGTTGGATTATACATTTAGCAGTATTGGATGCTTCAACAGTAGCAGTTTCAGATAAGTTTGGAAATGTCACTATTCTGCGTTTACCACCTAATGTAATCGATGATATTGAAGATGATCCTAGTGGTAATCGCGCGCTTTGGGATAGAGGTTTCCTTGGCGGAGCAAGCCAAAAGTGTGATGTGCTATGTCATTTTTACGTCGGTGAGGTTGTTACTTGTTTACAAAAGGCCACTTTGATCCCTGGAGGTTCTGAAGGTATTGTTTATTCAACAATATCTGGTAGCATCGGAGTGTTGGTTCCATTTGCCTCTCGGGATGCCTACGATTNCTTNCCACATTTGGAGCTACATATGAGAGCTGAAGGATA]
[+] EMBL CD156872 [ TGATTTTCCAGCAGCTCTATGTGCTTTTCAAGGTCGTCTTCTTGTGGGTGTCGGAAATCGTTTACGAATATATGATCTAGGGAAAAAAAAGTTGTTGAAAAAATGTGAAAACAAGCACATTCCTACTCTAATCAATGGTATTTATTCTGTAGGCAGTCGGATAATTGTGACAGATGTTCAAGAAAGTGTTCATTGGGTCCGCTATAGACCACGCTCGGATAGCCAATTAGTTATATTTGCAGATGATACTAATCCCCGTTGGATTATACATTTAGCAGTATTGGATGCTTCAACAGTAGCAGTTTCAGATAAGTTTGGAAGTGTCACTATTCTGCGTTTACCACCTAATGTAATCGATGATATTGAAGATGATCCTAGTGGTAATCGCGCGCTTTGGGATAGAGGTTTCCTTGGCGGAGCAAGCCAAAAGTGTGATGTGCTATGTCATTTTTACGTCGGTGAGGTTGTTACTTGTTTACAAAAGGCCACTTTGATCCCTGNAGGTTCTGAAGGTATTGTTTATTCAACAATATCTGGTAGCATCGGAat ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||