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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8225#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 759 fasta sequence
[ATTTAGATATGATGTCCGAACAAATTCAAACTAGCTAACTACAATAAGCTGCTTATTTTAGTAGGCACAATCTGAACTCTAATTAGTGGTTAGTCACATAGCCGATTAAATGATTGGTCTCACTATAATCAATGATAAAGCGCTTGATATAGACTCATAGCCATTTCGTTTAAAGTACTTGATAAAGTATGGTTGACACTGGTATACTGAACGTTTGCAACATGAACAATCGAATTAGCAGCTCCACGATTAGATAGTATGGCTAATAATCAGGTCTCATAATGTACGTCCGATAATAAGTCTGGATAAACATGGACAGTTGATAGAAAGCCAAGGGATTTTCTACGCATTGTGTTCTGTAGACAGGTTTTTTGTTTGCAAATAAACAACACAATAGATTGGAACGTAATGTGAGGTAACTGAGTCCTGGTAATCTTAGGCTGAAGGTTACTTCTAATCGGTTTATTAATAAGTATAGTTGAGCTGTTGTCGTCGATTATAGGTTCATCAAGCTGAAGACCTGTACTCACCTCATTTAGAATCTACTTTAAGGAAAGTCTTAGGCATTTGTTTGGGTTGCACTCCCCATCGTTAGAATTAGTCGCATCGGTTGAACGTCATCGGTTTTGAACGTAATCCTAGATAGTCCGTTCTAGTTTTGCCCCGCCGGCCATAATTTATCGACAACACATAACCTAGTTTTCTTTATCATGACGCATTTGAAACCTTACTGATATCCTTCTCGATTTCAAAAATACC]
[+] EMBL CD196452 [ATTTAGATATGATGTCCGAACAAATTCAAACTAGCTAACTACAATAAGCTGCTTATTTTAGTAGGCACAATCTGAACTCTAATTAGTGGTTAGTCACATAGCCGATTAAATGATTGGTCTCACTATAATCAATGATAAAGCGCTTGATATAGACTCATAGCCATTTCGTTTAAAGTACTTGATAAAGTATGGTTGACACTGGTATACTGAACGTTTGCAACATAAACAATCGAATTAGCAGCTCCACGATTAGATAGTATGGCTAATAATCAGGTCTCATAATGTACGTCCGATAATAAGTCTGGATAAACATGGACAGTTGATAGAAAGCCAAGGGATTTTCTACGCATTGTGTTCTGTAGACAGGTTTTTTGTTTGCAAATAAACAACACAATAGATTGGAACGTAATGTGAGGTAACTGAGTCCTGGTAATCTTAGGCTGAAGGTTACTTCTAATCGGTTTATTAATAAGTATAGTTGAGC ]
[+] EMBL CD196474 [ATTTAGATATGATGTCCGAACAAATTCAAACTAGCTAACTACAATAAGCTGCTTATTTTAGTAGGCACAATCTGAACTCTAATTAGTGGTTAGTCACATAGCCGATTAAATGATTGGTCTCACTATAATCAATGATAAAGCGCTTGATATAGACTCATAGCCATTTCGTTTAAAGTACTTGATAAAGTATGGTTGACACTGGTATACTGAACGTTTGCAACATGAACAATCGAATTAGCAGCTCCACGATTAGATAGTATGGCTAATAATCAGGTCTCATAATGTACGTCCGATAATAAGTCTGGATAAACATGGACAGTCGATAGAAAGCCAAGGGATTTTCTACGCATTGTGTTCTGTAGACAGGTTTTTTGTTTGCAAATAAACAACACAATAGATTGGAACGTAATGTGAGGTAACTGAGTCCTGGTAATCTTAGGCTGAAGGTTA ]
[+] EMBL CD196466 [ATTTAGATATAATGTCCGAACAAATTACAACTAGCTAACTACAATAAGCTGCTTATTTTAGTAGGCACAATCTGAACTCTAATTAGTGGTTAGTCACATAGCCGATTAAATGATTGGTCTCACTATAATCAATGATAAAGCGCTTGATATAGACTCATAGCCATTTCGTTTAAAGTACTTGATAAAGTATGGTTGACACTGGTATACTGAACGTTTGCAACATGAAC ]
[-] EMBL CD196622 [ ATTTTCTACGCATTGTGTTCTGTAGACAGGTTTTTTGTTTGCAAATAAACAACACAATAGATTGGAACGTAATGTGAGGTAACTGAGTCCTGGTAATCTTAGGCTGAAGGTTACTTCTAATCGGTTTATTAATAAGTATAGTTGAGCTGTTGTCGTCGATTATAGGTTCATCAAGCTGAAGACCTGTACTCACCTCATTTAGAATCTACTTTAAGGAAAGTCTTAGGCATTTGTTTGGGTTGCACTCCCCATCGTTAGAATTAGTCGCATCGGTTGAACGTCATCGGTTTTGAACGTAATCCTAGATAGTCCGTTCTAGTTTTGCCCCGCCGGCCATAATTTATCGACAACACATAACCTAGTTTTCTTTATCATGACGCATTTGAAACCTTACTGATATCCTTCTCGATTTCAAAAATACC]
[-] EMBL CD196675 [ TTTTCTACGCATTGTGTTCTGTAGACAGGTTTTTTGTTTGCAAATAAACAACACAATAGATTGGAACGTAATGTGAGGTAACTGAGTCCTGGTAATCTTAGGCTGAAGGTTACTTCTAATCGGTTTATTAATAAGTATAGTTGAGCTGTTGTCGTCGATTATAGGTTCATCAAGCTGAAGACCTGTACTCACCTCATTTAGAATCTACTTTAAGGAAAGTCTTAGGCATTTGTTTGGGTTGCACTCCCCATCGTTAGAATTAGTCGCATCGGTTGAACGTCATCGGTTTTGAACGTAATCCTAGATAGTCCGTTCTAGTTTTGCCCCGCCGGCCATAATTTATCGACAACACATAACCTAGTTTTCTTTATCATGACGCATTTGAAACCTTACTGATATCCTTCTCGATTTCAAAAATACC]
[-] EMBL CD196543 [ CGCATTGTGTTCTGTAGACAGGTTTTTTGTTTGCAAATAAACAACACAATAGATTGGAACGTAATGTGAGGTAACTGAGTCCTGGTAATCTTAGGCTGAAGGTTACTTCTAATCGGTTTATTAATAAGTATAGTTGAGCTGTTGTCGTCGATTATAGGTTCATCAAGCTGAAGACCTGTACTCACCTCATTTAGAATCTACTTTAAGGAAAGTCTTAGGCATTTGTTTGGGTTGCACTCCCCATCGTTAGAATTAGTCGCATCGGTTGAACGTCATCGGTTTTGAACGTAATCCTAGATAGTCCGTTCTAGTTTTGCCCCGCCGGCCATAATTTATCGACAACACATAACCTAGTTTTCTTTATCATGACGCATTTGAAACCTTACTGATATCCTTCTCGATTTCAAAAATACC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||