These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8233#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 615 fasta sequence [TGAATTAGGTGACTGTTG-GCTATTAGCTGCTATTGCT-TGTTTATCAA-TGGACAA-GAAATTA-TTTGAACAAGTTGTTGCTATAGATCAAAATTTTACTAAAGAATATTGTGGTTTATTTCGTTTTCATTTTTGGAATTATGGTGAATGGAAAGAAGTTGTCGTGGATGATCGTCTACCAACATATCAAAAATCATTAGTTTATATACATTCAACTG-AAAAAAATGAATTTTGGTCAGCATTATTAGAAAAAGCTTATGCAAAATTATGCGGCTCATATGAAGCACTTAAAGGCGGTACAACTAGTGAAGCATTAGAAGATTTTACTGGTGGAATTTCTGAAATGTTTGATTTGAAAAAAGATACACCATCAAATTTATTACAAGTTATGTTGAAAAGTCAAGAGTTAAGTTCATTGATGGCATGTTCTATTCAAGCTGATCCAAATACTTTTGAAGCTCGTTTACCAAATGGATTAATTATGGGACATGCATATTCAATTACGTCTGTTAAAATGTTAGATATATCAATTCCAAATAAAACTGGTAAAATACCATTAGTTCGTGTACGTAATCCATGGGGTGATGAATCGGAATGGAAAGGTGCATGGAGTGATAA] [+] EMBL CD066227 [TGAATTAGGTGACTGTTG GCTATTAGCTGCTATTGCT TGTTTATCAA TGGACAA GAAATTA TTTGAACAAGTTGTTGCTATAGATCAAAATTTTACTAAAGAATATTGTGGTTTATTTCGTTTTCA TTTTGGAATTATGGTGAATGGAAAGAAGTTGTCGTGGATGATCGTCTACCAACATATCAAAAATCATTAGTTTATATACATTCAACTGAAAAAAAATGAATTTTGGTCAGCATTATTAGAAAAAGCTTATGCAAAATTATGCGGCTCATATGAAGCACTTAAAGGCGGTACAACTAGTGAAGCATTAGAAGATTTTACTGGTGGAATTTCTGAAATGTTTGATTTGAAAAAAGATACACCATCAAATTTATTACAAGTTATGTTGAAAAGTCAAGAGTTAAGTTCATTGATGGCATGTTCTATTCAAGCTGATCCAAATACTTTTGAAGCTCGTTTACCAAATGGATTAATTATGGGACATGCATATTCAATTACGTCTGTTAAAATGTTAGATATATCAATTCCAAATAAAACTGGTAAAATACCATTAGTTCGTGTACG ] [+] EMBL CD068300 [ TGTTGCGCTATTAGCTGCTATTGCTATGTTTATCAA TGGACAA GAAATTA TTTGAACAAGTTGTTGCTATAGATCAAAATTTTACTAAAGAATATTGTGGTTTATTTCGTTTTCATTTTTGGAATTATGGTGAATGGAAAGAAGTTGTCGTGGATGATCGTCTACCAACATATCAAAAATCATTAGTTTATATACATTCAACTG AAAAAAATGATTTTTGGTCAGCATTATTAGAAAAAGCTTATGCAAAATTATGCGGCTCATATGA ] [+] EMBL CD066274 [ TGCT TGTTTATCAAGTGGACAANGAAATTACTTTGAACAAGTTGTTGCTATAGATCAAAATTTTACTAAAGAATATTGTGGTTTATTTCGTTTTCATTTTTGGAATTATGGTGAATGGAAAGAAGTTGTCGTGGATGATCGTCTACCAACATATCAAAAATCATTAGTTTATATACATTCAACTG AAAAAAATGAATTTTGGTCAGCATTATTAGAAAAAGCTTATGCAAAATTATGCGGCTCATACGAAGCACTTAAAGGCGGTACAACTAGTGAAGCATTAGAAGATTTTACTGGTGGAATTTCTGAAATGTTTGATTTGAAAAAAGATACACCATCAAATTTATTACAAGTTATGTTGAAAAGTCAAGAGTTAAGTTCATTGATGGCATGTTCTATTCAAGCTGATCCAAATACTTTTGAAGCTCGTTTACCAAATGGATTAATTATGGGACATGCATATTCAATTACGTCTGTTAAAATGTTAGATATATCAATTCCAAATAAAACTGGTAAAATACCATTAGTTCGTGTACG ] [-] EMBL CD066204 [ TGCTATAGATCAAAATTTTACTAAAGAATATTGTGGTTTATTTCGTTTTCATTTTTGGAATTATGGTGAATGGAAAGAAGTTGTCGTGGATGATCGTCTACCAACATATCAAAAATCATTAGTGTATATACATTCAACTG AAAAAAATGAATTTTGGTCAGCATTATTAGAAAAAGCTTATGCAAAATTATGCGGCTCATATGAAGCACTTAAAGGCGGTACAACTAGTGAAGCATTAGAAGATTTTACTGGTGGAATTTCTGAAATGTTTGATTTGAAAAAAGATACACCATCAAATTTATTACAAGTTATGTTGAAAAGTCAAGAGTTAAGTTCATTGATGGCATGTTCTATTCAAGCTGATCCAAATACTTTTGAAGCTCGTTTACCAAATGGATTAATTATGGGACATGCATATTCAATTACGTCTGTTAAAATGTTAGATATATCAATTCCAAATAAAACTGGTAAAATACCATTAGTTCGTGTACGT ] [-] EMBL CD197699 [ TAAAGCCGGTACAACTAGTGAAGCATTAGAAGATTTTACTGGTGGAATTTCTGAAATGTTTGATTTGAAAAAAGATACACCATCAAATTTATTACAAGTTATGTTGAAAAGTCAAGAGTTAAGTTCATTGATGGCATGTTCTATTCAAGCTGATCCAAATACTTTTGAAGCTCGTTTACCAAATGGATTAATTATGGGACATGCATATTCAATTACGTCTGTTAAAATGTTAGATATATCAATTCCAAACAAAACTGGTAAAATACCATTAGTTCGTGTACGTAATCCATGGGGTGATGAATCGGAATGGAAAGGTGCATGGAGTGATAA] [-] EMBL CD197798 [ TAAAGGCGGTACAACTAGTGAAGCATTAGAAGATTTTACTGGTGGAATTTCTGAAATGTTTGATTTGAAAAAAGATACACCATCAAATTTATTACAAGTTATGTTGAAAAGTCAAGAGTTAAGTTCATTGATGGCATGTTCTATTCAAGCTGATCCAAATACTTTTGAAGCTCGTTTACCAAATGGATTAATTATGGGACATGCATATTCAATTACGTCTGTTAANATGTTAGATATATCAATTCCAAATAAAACTGGTAAAATACCATTAGTTCGTGTACGTAATCCATGGGGTGATGAATCGGAATGGAAAGGTGCATGGAGTGATAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||