cluster # 8288

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8288 cluster # 8288 Sequences # 6 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_8288#0 length = 391 sequences # 6

consensusID : consensus_8288#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 391
fasta sequence

                              [ACAGGCACCACAACCTGATAGCATTCGTAACACTTAAATAGGGGTAGAGTTGACGCATAGTTTTGTGCTTTTAACTTTGCCTGAAATTGCCGGTACAGTACTGGCTATTTGAAAGAAAATAAGAAAAAATGGATTTTGAAATTTGGTGGTTGCTAGGCATCCCCTTGTTTTTTACCTTGGGCTGGATCGCTGCCCGTGTCGATATTCGTCAGCTATTGTCGGAATCGCGCAGCCTGCCAAAAGGTTATTTTAA-AGGGTTGAATT-TTTTATTGAACGAACAGCCAGACAAAGCAATTGACGCTTTTATTGAGATTGTTCGTCTTGATCCTGAGTCAGTGGAATTACATTTTGCGTTGGGTAATTTATTTCGCCGACGTGGTGAAACCGAACG]

[+] EMBL CD093517             [ACAGGCACCACAACCTGATAGCATTCGTAACACTTAAATAGGGGTAGAGTTGACGCATAGTTTTGTGCTTTTAACTTTGCCTGAAATTGCCGGTACAGTACTGGCTATTTGAAAGAAAATAAGAAAAAATGGATTTTGAAATTTGGTGGCTGCTAGGCATCCCCTTGTTTTTTACCTTGGGCTGGATCGCTGCCCGTGTCGATATTCGTCAGCTATTGTCGGAATCGCGCAGCCTGCCAAAAGGTTATTTTAA AGGGTTGAATT TTTTATTGAACGAACAGCCAGACAAAGCAATTGACGCTTTTATTGAGATTGTTCGTCTTGATCCTGAGTCAGTGGAATTACATTTTGCGTTGGGTAATTTATTTCGCCGACGTGGTGAAACCGAACG]
[+] EMBL CD093586             [ACAGGCACCACAACCTGATAGCATTCGTAACACTTAAATAGGGGTAGAGTTGACGCATAGTTTTGCGCTTTTAACTTTGCCTGAAATTGCCGGTACAGTACTGGCTATTTGAAAGAAAATAAGAAAAAATGGATTTTGAAATTTGGTGGTTGCTAGGCATCCCCTTGTTTTTTACCTTGGGCTGGATCGCTGCCCGTGTCGATATTCGTCAGCTATTGTCGGAATCGCGCAGCCTGCCAAAAGGTTATTTTAA AGGGTTGAATT TTTTATTGAACGAACAGCCAGACAAAGCAATTGACGCTTTTATTGAGATTGTNCGTCTTGATCCTGAGTCAGTGGAATTACATTTTGCGTAGGGTAATTTATTTCGCCGACGTTGTGAAACCGAACG]
[+] EMBL CD093545             [ACAGGCACCACAACCTGATAGCATTCGTAACACTTAAATAGGGGTAGAGTTGACGCATAGTTTTGTGCTTTTAACTTTGCCTGAAATTGCCGGTACAGTACTGGCTATTTGAAAGAAAATAAGAAAAAATGGATTTTGAAATTTGGTGGTTGCTAGGCATCCCCTTGTTTTTTACCTTGGGCTGGATCGCTGCCCGTGTCGATATTCGTCAGCTATTGTCGGAATCGCGCAGCCTGCCAAAAGGTTATTTTAA AGGGTTGAATT TTTTATTGAACGAACAGCCAGACAAAGCAATTGACGCTTTTATTGAGATTGTTCGTCTTGATCCTGAGTCAGTGGAATTACATTTTGCGTTGGGTAATTTATTTCGCCGACGTGGTGAAACCGAACG]
[+] EMBL CD093574             [ACAGGCACCACAACCTGATAGCATTCGTAACACTTAAATAGGGGTAGAGTTGACGCATAGTTTTGTGCTTTTAACTTTGCCTGAAATTGCCGGTACAGTACTGGCTATTTGAAAGAAAATAAGAAAAAATGGATTTTGAAATTTGGTGGTTGCTAGGCATCCCCTTGTTTTTTACCTTGGGCTGGATCGCTGCCCGTGTCGATATTCGTCAGCTATTGTCGGAATCGCGCAGCCTGCCAAAAGGTTATTTTAA AGGGTTGAATT TTTTATTGAACGAACAGCCAGACAAAGCAATTGACGCTTTTATTGAGATTGTTCGTCTTGATCCTGAGTCAGTGGAATTACATTTTGCGTTGGGTAATTTATTTCGCCGACGTGGTGAAACCGAACG]
[+] EMBL CD093558             [ACAGGCACCACAACCTGATAGCATTCGTAACACTTAAATAGGGGTAGAGTTGACGCATAGTTTTGTGCTTTTAACTTTGCCTGAAATTGCCGGTACAGTACTGGCTATTTGAAAGAAAATAAGAAAAAATGGATTTTGAAATTTGGTGGTTGCTAGGCATCCCCTTGTTTTTTACCTTGGGCTGGATCGCTGCCCGTGTCGATATTCGTCAGCTATTGTCGGTATCGCGCAGCCTGCCAAAAGGTTATTTTAA AGGGTTGAATT TTTTATTGAACGAACAGCCAGACAAAGCAATTGACGCTTTTA                                                                                     ]
[+] EMBL CD093476             [ACAGGCACCACAACCTGATAGCATTCGTAACACTTAAATAGGGGTAGAGTTGACGCATAGTTTTGTGCTTTTAACTTTGCCTGAAATTGCCGGTACAGTACTGGCTATTTGAAAGAAAATAAGAAAAAATGGATTTTGAAATTTGGTGGTTGCTAGGCATCCCCTTGTTTTTTACCTTGGGCTGGATCGCTGCCCGTGTCGATATTCGTCAGCTATTGTCGGAATCGCGCAGCCTGCCAAAAGGTTATTTTAACAGGGTTGAATTCTTTTATTGAACGAACAGGCAGACAAAGCAA                                                                                                 ]




>consensus_8288#0
ACAGGCACCACAACCTGATAGCATTCGTAACACTTAAATAGGGGTAGAGTTGACGCATAG
TTTTGTGCTTTTAACTTTGCCTGAAATTGCCGGTACAGTACTGGCTATTTGAAAGAAAAT
AAGAAAAAATGGATTTTGAAATTTGGTGGTTGCTAGGCATCCCCTTGTTTTTTACCTTGG
GCTGGATCGCTGCCCGTGTCGATATTCGTCAGCTATTGTCGGAATCGCGCAGCCTGCCAA
AAGGTTATTTTAAAGGGTTGAATTTTTTATTGAACGAACAGCCAGACAAAGCAATTGACG
CTTTTATTGAGATTGTTCGTCTTGATCCTGAGTCAGTGGAATTACATTTTGCGTTGGGTA
ATTTATTTCGCCGACGTGGTGAAACCGAACG

clustalw multiple alignements is not computed in this case