These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8309#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1429 fasta sequence [CGAGGACAACCA-CCAGCTCATAGATTAGCATCAGAGGTTTATCCTGAAATCACATTCCTTGGCACTGCATCTTCCTCTCCTAATAAATATCGTAATATCAGTTGTATTCTTATGCAGCTAGACTCAAATCATATTTGCGTCGGTTCAAGATGCCACAACACAAACAGCTCAGCGGGATGCTTAAGTCGTAGAAGTAGTGACAGTATCAGTGGTAGTAGAAGACATTAGGTATAGACAGTATGATTCTAGAAAAAGGAATAAATTCGCAGAATAAAAAGTACTGGATAATTTTAAAACCAAAGCCACAAGAGAAGATAAAGATTGGATACTTCTGCATCATCGCAAACAAATGGTGTCTTCACAGTGGCTCTAGTTCGTTCCAATCTACTTAAATCAGATGGTATTGACCAATCCAATTGTTTATTACCTGTCCTTACTCCATCGGAATTCTGTCATTGGTTAACTAATTTCAATAAACTTTTCCATTATGACCAAATTGTTGACCCATTCATCATACCAATTATTTACGATAAACATGATAAGAATTCAAATCCTTCATGGGTATTAAACATGAAACGAAATGAAACAGANAACTGGTTAAAATTATTAGAGCAGCTTGATATTAATATCCGACCGGTC-AGGTTCCGCACACACGTTCATCATGGGCGTTTATTATTGATAATCCTTATCCATTCAAAAATTTGGTAAACAGTAAAAATATTGCCGAAAATTGTTCTGAAATACAACGAAAATGGTCTATTGTTTATTCTGGTGATACCCCTTCATGTCCTGAACTTGTGAGAGCTGGAAAAAATTGTGATTTACTCATACACGAAGCTACTGTAAATGATGAATATGTAGACTTAGCAGTTAAAGCAAAGCACAGCACAACGAGTCAAGCTATTCAAGCTGGACGTGATATGAATGCTTCGTTCATTCTATTGAATCATTTTAGTCAGCGATATGGACGTGTACCACCGATAGATGAATTTAAATCGGATGTGGCCGCATCTTTTGATTTTATGACGGTGAAATTTTCTGATTTACAACGACTACCCTATTATATTCCATATTATCAGTATGCATTCGCTAAACATTGGAATATGGCTAGAACTAAAGCAGATTCTTATACATATCGTAAACTCCGTGAAGCTGATGAATTGCTTGAAAGTGAAGATGGTCATTGTGCAAAAACTAATGATGGTGTTGACGATTATAACCGTTTATTGAATGAACAAAGTGTGAAAGGATAAATTGGAAGATAATGAACATAACGGAAACCTATTTGATTCCTGGTTGTTTCGTTATGTTTTTTTTCTTTTTATTTCCCTTTCAATCACATCCTTGTAACAAAATAGATTGTTTCAGTTTTTCATTATGTTGAATTCGCTTGTTTTTCCTTTATTAACATTAAATATCATATATTCAT] [+] EMBL CD082080 [CGAGGACAACCA CCAGCTCATAGATTAGCATCAGAGGTTTATCCTGAAATCACATTCCTTGGCACTGCATCTTCCTCTCCTAATAAATATCGTAATATCAGTTGTATTCTTATGCAGCTAGACTCAAATCATATTTGCGTCGGTTCAAGATGCCACAACACAAACAGCTCAGCGGGATGCTTAAGTCGTAGAAGTAGTGACAGTATCAGTGGTAGTAGAAGACATTAGGTATAGACAGTATGATTCTAGAAAAAGGAATAAATTCGCAGAATAAAAAGTACTGGATAATTTTAAAACCAAAGCCACAAGAGAAGATAAAGATTGGATACTTCTGCATCATCGCAAACAAATGGTGTCTTCACAGTGGCTCTAGTTCGTTCCAATCTACTTAAATCAGATGGTATTGACCAATCCAATTGTTTATTACCTGTCCTTACTCCATCGGAATTCTGTCATTGGTTAACTAATTTCAATAAACTTTTCCATTATGACCAAATTGTTGACCCATTCATCATACCAATTATTTACGATAAACATGATAAGAATTCAAATCCTTCATGGGTATTAAACATGAAACGAAATGAAACAGANAACTGGTTAAAATTATTAGAGCAGCTTGATATTAATATCCGACCGGTC AGGTTCCGCACACACGTTCATC ] [-] EMBL CD162904 [ ACCANCCAGCTCATAGATTAGCATCAGAGGCGTATCCTGAAATCACATTTCTTGGCACTGCATCTTCCTCTCCTAATAAATATCGTAATATCAGTTGTATTCTTATGCAGCTAGATCCAGATa ] [-] EMBL CD184401 [ CATTCATCATAGCAATTATTTACGATAAACATGATAAGAATTCAAATCCTTCATGGGTATTAAACATGAAACGAAATGAAACAGAAAACTGGTTAAAATTATTAGAGCAGCTTGATATTAATATCCGACCGGTCAAGGTTCCGCACACACGTTCATCATGGGCGTTTATTATTGATAATCCTTATCCATTCAAAAATTTGGTAAACAGTAAAAATATTGCCGAAAATTGTTCTGAAATACAACGAAAATGGTCTATTGTTTATTCTGGTGATACCCCTTCATGTCCTGAACTTGTGAGAGCTGGAAAAAATTGTGATTTACTCATACACGAAGCTACTGTAAATGATGAATATGTAGACTTAGCAGTTAAAGCAAAGCACAGCACAACGAGTCAAGCTATTCAAGCTGGACGTGATATGAATGCTTCGTTCATTCTATTGA ] [-] EMBL CD075695 [ GATTTACTCATACACGAAGCTACTGTAAATGATGAATATGTAGACTTAGCAGTTAAAGCAAAGCACAGCACAACGAGTCAAGCTATTCAAGCTGGACGTGATATGAATGCTTCGTTCATTCTATTGAATCATTTTAGTCAGCGATATGGACGTGTACCACCGATAGATGAATTTAAATCGGATGTGGCCGCATCTTTTGATTTTATGACGGTGAAATTTTCTGATTTACAACGACTACCCTATTATATTCCATATTATCAGTATGCATTCGCTAAACATTGGAATATGGCTAGAACTAAAGCAGATTCTTATACATATCGTAAACTCCGTGAAGCTGATGAATTGCTTGAAAGTGAAGATGGTCATTGTGCAAAAACTAATGATGGTGTTGACGATTATAACCGTTTATTGAATGAACAAAGTGTGAAAGGATAAATTGGAAGATAATGAACATAACGGAAACCTATTTGATTCCTGGTTGTTTCGTTATGTTTTTTTTCTTTTTATTTCCCTTTCAATCACATCCTTGTAACAAAATAGATTGTTTCAGTTTTTCATTATGTTGAATTCGCTTGTTTTTCCTTTATTAACATTAAATATCATATATTCAT] [+] EMBL CD063939 [ tcccaACACGAAGCTACTGTAAATGATGAATATGTAGACTTA CAGTTAAAGCAAAGCACAGCACAACGAGTCAAGCTATTCAAGCTGGACGTGATATGAATGCTTCGTTCATTCTATTGAATCATTTTAGTCAGCGATATGGACGTGTACCACCGATAGATGAATTTAAATCGGATGTGGCCGCATCTTTTGATTTTATGACGGTGAAATTTTCTGATTTACAACGACTACCCTATTATATTCCATATTATCAGTATGCATTCGCTAAACATTGGAATATGGCTAGAACTAAAGCAGATTCTTATACATATCGTAAACTCCGTGAAGCTGATGAATTGCTTGAAAGTGAAGATGGTCATTGTGCAAAA ] [-] EMBL CD140044 [ TGACGGTGAAATTTTCTGATTTACAACGACTACCCTATTATATTCCATATTATCAGTATGCATTCGCTAAACATTGGAATATGGCTAGAACTAAAGCAGATTCTTATACATATCGTAAACTCCGTGAAGCTGATGAATTGCTTGAAAGTGAAGATGGTCATTGTGCAAAAACTAATGATGGTGTTGACGATTATAACCGTTTATTGAATG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||