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Schistosoma mansoni
cluster # 8309 cluster # 8309       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8309#0 length = 1429 sequences # 6  

consensusID : consensus_8309#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1429
fasta sequence
                              [CGAGGACAACCA-CCAGCTCATAGATTAGCATCAGAGGTTTATCCTGAAATCACATTCCTTGGCACTGCATCTTCCTCTCCTAATAAATATCGTAATATCAGTTGTATTCTTATGCAGCTAGACTCAAATCATATTTGCGTCGGTTCAAGATGCCACAACACAAACAGCTCAGCGGGATGCTTAAGTCGTAGAAGTAGTGACAGTATCAGTGGTAGTAGAAGACATTAGGTATAGACAGTATGATTCTAGAAAAAGGAATAAATTCGCAGAATAAAAAGTACTGGATAATTTTAAAACCAAAGCCACAAGAGAAGATAAAGATTGGATACTTCTGCATCATCGCAAACAAATGGTGTCTTCACAGTGGCTCTAGTTCGTTCCAATCTACTTAAATCAGATGGTATTGACCAATCCAATTGTTTATTACCTGTCCTTACTCCATCGGAATTCTGTCATTGGTTAACTAATTTCAATAAACTTTTCCATTATGACCAAATTGTTGACCCATTCATCATACCAATTATTTACGATAAACATGATAAGAATTCAAATCCTTCATGGGTATTAAACATGAAACGAAATGAAACAGANAACTGGTTAAAATTATTAGAGCAGCTTGATATTAATATCCGACCGGTC-AGGTTCCGCACACACGTTCATCATGGGCGTTTATTATTGATAATCCTTATCCATTCAAAAATTTGGTAAACAGTAAAAATATTGCCGAAAATTGTTCTGAAATACAACGAAAATGGTCTATTGTTTATTCTGGTGATACCCCTTCATGTCCTGAACTTGTGAGAGCTGGAAAAAATTGTGATTTACTCATACACGAAGCTACTGTAAATGATGAATATGTAGACTTAGCAGTTAAAGCAAAGCACAGCACAACGAGTCAAGCTATTCAAGCTGGACGTGATATGAATGCTTCGTTCATTCTATTGAATCATTTTAGTCAGCGATATGGACGTGTACCACCGATAGATGAATTTAAATCGGATGTGGCCGCATCTTTTGATTTTATGACGGTGAAATTTTCTGATTTACAACGACTACCCTATTATATTCCATATTATCAGTATGCATTCGCTAAACATTGGAATATGGCTAGAACTAAAGCAGATTCTTATACATATCGTAAACTCCGTGAAGCTGATGAATTGCTTGAAAGTGAAGATGGTCATTGTGCAAAAACTAATGATGGTGTTGACGATTATAACCGTTTATTGAATGAACAAAGTGTGAAAGGATAAATTGGAAGATAATGAACATAACGGAAACCTATTTGATTCCTGGTTGTTTCGTTATGTTTTTTTTCTTTTTATTTCCCTTTCAATCACATCCTTGTAACAAAATAGATTGTTTCAGTTTTTCATTATGTTGAATTCGCTTGTTTTTCCTTTATTAACATTAAATATCATATATTCAT]

[+] EMBL CD082080             [CGAGGACAACCA CCAGCTCATAGATTAGCATCAGAGGTTTATCCTGAAATCACATTCCTTGGCACTGCATCTTCCTCTCCTAATAAATATCGTAATATCAGTTGTATTCTTATGCAGCTAGACTCAAATCATATTTGCGTCGGTTCAAGATGCCACAACACAAACAGCTCAGCGGGATGCTTAAGTCGTAGAAGTAGTGACAGTATCAGTGGTAGTAGAAGACATTAGGTATAGACAGTATGATTCTAGAAAAAGGAATAAATTCGCAGAATAAAAAGTACTGGATAATTTTAAAACCAAAGCCACAAGAGAAGATAAAGATTGGATACTTCTGCATCATCGCAAACAAATGGTGTCTTCACAGTGGCTCTAGTTCGTTCCAATCTACTTAAATCAGATGGTATTGACCAATCCAATTGTTTATTACCTGTCCTTACTCCATCGGAATTCTGTCATTGGTTAACTAATTTCAATAAACTTTTCCATTATGACCAAATTGTTGACCCATTCATCATACCAATTATTTACGATAAACATGATAAGAATTCAAATCCTTCATGGGTATTAAACATGAAACGAAATGAAACAGANAACTGGTTAAAATTATTAGAGCAGCTTGATATTAATATCCGACCGGTC AGGTTCCGCACACACGTTCATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD162904             [        ACCANCCAGCTCATAGATTAGCATCAGAGGCGTATCCTGAAATCACATTTCTTGGCACTGCATCTTCCTCTCCTAATAAATATCGTAATATCAGTTGTATTCTTATGCAGCTAGATCCAGATa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD184401             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CATTCATCATAGCAATTATTTACGATAAACATGATAAGAATTCAAATCCTTCATGGGTATTAAACATGAAACGAAATGAAACAGAAAACTGGTTAAAATTATTAGAGCAGCTTGATATTAATATCCGACCGGTCAAGGTTCCGCACACACGTTCATCATGGGCGTTTATTATTGATAATCCTTATCCATTCAAAAATTTGGTAAACAGTAAAAATATTGCCGAAAATTGTTCTGAAATACAACGAAAATGGTCTATTGTTTATTCTGGTGATACCCCTTCATGTCCTGAACTTGTGAGAGCTGGAAAAAATTGTGATTTACTCATACACGAAGCTACTGTAAATGATGAATATGTAGACTTAGCAGTTAAAGCAAAGCACAGCACAACGAGTCAAGCTATTCAAGCTGGACGTGATATGAATGCTTCGTTCATTCTATTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD075695             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GATTTACTCATACACGAAGCTACTGTAAATGATGAATATGTAGACTTAGCAGTTAAAGCAAAGCACAGCACAACGAGTCAAGCTATTCAAGCTGGACGTGATATGAATGCTTCGTTCATTCTATTGAATCATTTTAGTCAGCGATATGGACGTGTACCACCGATAGATGAATTTAAATCGGATGTGGCCGCATCTTTTGATTTTATGACGGTGAAATTTTCTGATTTACAACGACTACCCTATTATATTCCATATTATCAGTATGCATTCGCTAAACATTGGAATATGGCTAGAACTAAAGCAGATTCTTATACATATCGTAAACTCCGTGAAGCTGATGAATTGCTTGAAAGTGAAGATGGTCATTGTGCAAAAACTAATGATGGTGTTGACGATTATAACCGTTTATTGAATGAACAAAGTGTGAAAGGATAAATTGGAAGATAATGAACATAACGGAAACCTATTTGATTCCTGGTTGTTTCGTTATGTTTTTTTTCTTTTTATTTCCCTTTCAATCACATCCTTGTAACAAAATAGATTGTTTCAGTTTTTCATTATGTTGAATTCGCTTGTTTTTCCTTTATTAACATTAAATATCATATATTCAT]
[+] EMBL CD063939             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcccaACACGAAGCTACTGTAAATGATGAATATGTAGACTTA CAGTTAAAGCAAAGCACAGCACAACGAGTCAAGCTATTCAAGCTGGACGTGATATGAATGCTTCGTTCATTCTATTGAATCATTTTAGTCAGCGATATGGACGTGTACCACCGATAGATGAATTTAAATCGGATGTGGCCGCATCTTTTGATTTTATGACGGTGAAATTTTCTGATTTACAACGACTACCCTATTATATTCCATATTATCAGTATGCATTCGCTAAACATTGGAATATGGCTAGAACTAAAGCAGATTCTTATACATATCGTAAACTCCGTGAAGCTGATGAATTGCTTGAAAGTGAAGATGGTCATTGTGCAAAA                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD140044             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGACGGTGAAATTTTCTGATTTACAACGACTACCCTATTATATTCCATATTATCAGTATGCATTCGCTAAACATTGGAATATGGCTAGAACTAAAGCAGATTCTTATACATATCGTAAACTCCGTGAAGCTGATGAATTGCTTGAAAGTGAAGATGGTCATTGTGCAAAAACTAATGATGGTGTTGACGATTATAACCGTTTATTGAATG                                                                                                                                                                                                    ]


>consensus_8309#0 CGAGGACAACCACCAGCTCATAGATTAGCATCAGAGGTTTATCCTGAAATCACATTCCTT GGCACTGCATCTTCCTCTCCTAATAAATATCGTAATATCAGTTGTATTCTTATGCAGCTA GACTCAAATCATATTTGCGTCGGTTCAAGATGCCACAACACAAACAGCTCAGCGGGATGC TTAAGTCGTAGAAGTAGTGACAGTATCAGTGGTAGTAGAAGACATTAGGTATAGACAGTA TGATTCTAGAAAAAGGAATAAATTCGCAGAATAAAAAGTACTGGATAATTTTAAAACCAA AGCCACAAGAGAAGATAAAGATTGGATACTTCTGCATCATCGCAAACAAATGGTGTCTTC ACAGTGGCTCTAGTTCGTTCCAATCTACTTAAATCAGATGGTATTGACCAATCCAATTGT TTATTACCTGTCCTTACTCCATCGGAATTCTGTCATTGGTTAACTAATTTCAATAAACTT TTCCATTATGACCAAATTGTTGACCCATTCATCATACCAATTATTTACGATAAACATGAT AAGAATTCAAATCCTTCATGGGTATTAAACATGAAACGAAATGAAACAGANAACTGGTTA AAATTATTAGAGCAGCTTGATATTAATATCCGACCGGTCAGGTTCCGCACACACGTTCAT CATGGGCGTTTATTATTGATAATCCTTATCCATTCAAAAATTTGGTAAACAGTAAAAATA TTGCCGAAAATTGTTCTGAAATACAACGAAAATGGTCTATTGTTTATTCTGGTGATACCC CTTCATGTCCTGAACTTGTGAGAGCTGGAAAAAATTGTGATTTACTCATACACGAAGCTA CTGTAAATGATGAATATGTAGACTTAGCAGTTAAAGCAAAGCACAGCACAACGAGTCAAG CTATTCAAGCTGGACGTGATATGAATGCTTCGTTCATTCTATTGAATCATTTTAGTCAGC GATATGGACGTGTACCACCGATAGATGAATTTAAATCGGATGTGGCCGCATCTTTTGATT TTATGACGGTGAAATTTTCTGATTTACAACGACTACCCTATTATATTCCATATTATCAGT ATGCATTCGCTAAACATTGGAATATGGCTAGAACTAAAGCAGATTCTTATACATATCGTA AACTCCGTGAAGCTGATGAATTGCTTGAAAGTGAAGATGGTCATTGTGCAAAAACTAATG ATGGTGTTGACGATTATAACCGTTTATTGAATGAACAAAGTGTGAAAGGATAAATTGGAA GATAATGAACATAACGGAAACCTATTTGATTCCTGGTTGTTTCGTTATGTTTTTTTTCTT TTTATTTCCCTTTCAATCACATCCTTGTAACAAAATAGATTGTTTCAGTTTTTCATTATG TTGAATTCGCTTGTTTTTCCTTTATTAACATTAAATATCATATATTCAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)