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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8309#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1429 fasta sequence
[CGAGGACAACCA-CCAGCTCATAGATTAGCATCAGAGGTTTATCCTGAAATCACATTCCTTGGCACTGCATCTTCCTCTCCTAATAAATATCGTAATATCAGTTGTATTCTTATGCAGCTAGACTCAAATCATATTTGCGTCGGTTCAAGATGCCACAACACAAACAGCTCAGCGGGATGCTTAAGTCGTAGAAGTAGTGACAGTATCAGTGGTAGTAGAAGACATTAGGTATAGACAGTATGATTCTAGAAAAAGGAATAAATTCGCAGAATAAAAAGTACTGGATAATTTTAAAACCAAAGCCACAAGAGAAGATAAAGATTGGATACTTCTGCATCATCGCAAACAAATGGTGTCTTCACAGTGGCTCTAGTTCGTTCCAATCTACTTAAATCAGATGGTATTGACCAATCCAATTGTTTATTACCTGTCCTTACTCCATCGGAATTCTGTCATTGGTTAACTAATTTCAATAAACTTTTCCATTATGACCAAATTGTTGACCCATTCATCATACCAATTATTTACGATAAACATGATAAGAATTCAAATCCTTCATGGGTATTAAACATGAAACGAAATGAAACAGANAACTGGTTAAAATTATTAGAGCAGCTTGATATTAATATCCGACCGGTC-AGGTTCCGCACACACGTTCATCATGGGCGTTTATTATTGATAATCCTTATCCATTCAAAAATTTGGTAAACAGTAAAAATATTGCCGAAAATTGTTCTGAAATACAACGAAAATGGTCTATTGTTTATTCTGGTGATACCCCTTCATGTCCTGAACTTGTGAGAGCTGGAAAAAATTGTGATTTACTCATACACGAAGCTACTGTAAATGATGAATATGTAGACTTAGCAGTTAAAGCAAAGCACAGCACAACGAGTCAAGCTATTCAAGCTGGACGTGATATGAATGCTTCGTTCATTCTATTGAATCATTTTAGTCAGCGATATGGACGTGTACCACCGATAGATGAATTTAAATCGGATGTGGCCGCATCTTTTGATTTTATGACGGTGAAATTTTCTGATTTACAACGACTACCCTATTATATTCCATATTATCAGTATGCATTCGCTAAACATTGGAATATGGCTAGAACTAAAGCAGATTCTTATACATATCGTAAACTCCGTGAAGCTGATGAATTGCTTGAAAGTGAAGATGGTCATTGTGCAAAAACTAATGATGGTGTTGACGATTATAACCGTTTATTGAATGAACAAAGTGTGAAAGGATAAATTGGAAGATAATGAACATAACGGAAACCTATTTGATTCCTGGTTGTTTCGTTATGTTTTTTTTCTTTTTATTTCCCTTTCAATCACATCCTTGTAACAAAATAGATTGTTTCAGTTTTTCATTATGTTGAATTCGCTTGTTTTTCCTTTATTAACATTAAATATCATATATTCAT]
[+] EMBL CD082080 [CGAGGACAACCA CCAGCTCATAGATTAGCATCAGAGGTTTATCCTGAAATCACATTCCTTGGCACTGCATCTTCCTCTCCTAATAAATATCGTAATATCAGTTGTATTCTTATGCAGCTAGACTCAAATCATATTTGCGTCGGTTCAAGATGCCACAACACAAACAGCTCAGCGGGATGCTTAAGTCGTAGAAGTAGTGACAGTATCAGTGGTAGTAGAAGACATTAGGTATAGACAGTATGATTCTAGAAAAAGGAATAAATTCGCAGAATAAAAAGTACTGGATAATTTTAAAACCAAAGCCACAAGAGAAGATAAAGATTGGATACTTCTGCATCATCGCAAACAAATGGTGTCTTCACAGTGGCTCTAGTTCGTTCCAATCTACTTAAATCAGATGGTATTGACCAATCCAATTGTTTATTACCTGTCCTTACTCCATCGGAATTCTGTCATTGGTTAACTAATTTCAATAAACTTTTCCATTATGACCAAATTGTTGACCCATTCATCATACCAATTATTTACGATAAACATGATAAGAATTCAAATCCTTCATGGGTATTAAACATGAAACGAAATGAAACAGANAACTGGTTAAAATTATTAGAGCAGCTTGATATTAATATCCGACCGGTC AGGTTCCGCACACACGTTCATC ]
[-] EMBL CD162904 [ ACCANCCAGCTCATAGATTAGCATCAGAGGCGTATCCTGAAATCACATTTCTTGGCACTGCATCTTCCTCTCCTAATAAATATCGTAATATCAGTTGTATTCTTATGCAGCTAGATCCAGATa ]
[-] EMBL CD184401 [ CATTCATCATAGCAATTATTTACGATAAACATGATAAGAATTCAAATCCTTCATGGGTATTAAACATGAAACGAAATGAAACAGAAAACTGGTTAAAATTATTAGAGCAGCTTGATATTAATATCCGACCGGTCAAGGTTCCGCACACACGTTCATCATGGGCGTTTATTATTGATAATCCTTATCCATTCAAAAATTTGGTAAACAGTAAAAATATTGCCGAAAATTGTTCTGAAATACAACGAAAATGGTCTATTGTTTATTCTGGTGATACCCCTTCATGTCCTGAACTTGTGAGAGCTGGAAAAAATTGTGATTTACTCATACACGAAGCTACTGTAAATGATGAATATGTAGACTTAGCAGTTAAAGCAAAGCACAGCACAACGAGTCAAGCTATTCAAGCTGGACGTGATATGAATGCTTCGTTCATTCTATTGA ]
[-] EMBL CD075695 [ GATTTACTCATACACGAAGCTACTGTAAATGATGAATATGTAGACTTAGCAGTTAAAGCAAAGCACAGCACAACGAGTCAAGCTATTCAAGCTGGACGTGATATGAATGCTTCGTTCATTCTATTGAATCATTTTAGTCAGCGATATGGACGTGTACCACCGATAGATGAATTTAAATCGGATGTGGCCGCATCTTTTGATTTTATGACGGTGAAATTTTCTGATTTACAACGACTACCCTATTATATTCCATATTATCAGTATGCATTCGCTAAACATTGGAATATGGCTAGAACTAAAGCAGATTCTTATACATATCGTAAACTCCGTGAAGCTGATGAATTGCTTGAAAGTGAAGATGGTCATTGTGCAAAAACTAATGATGGTGTTGACGATTATAACCGTTTATTGAATGAACAAAGTGTGAAAGGATAAATTGGAAGATAATGAACATAACGGAAACCTATTTGATTCCTGGTTGTTTCGTTATGTTTTTTTTCTTTTTATTTCCCTTTCAATCACATCCTTGTAACAAAATAGATTGTTTCAGTTTTTCATTATGTTGAATTCGCTTGTTTTTCCTTTATTAACATTAAATATCATATATTCAT]
[+] EMBL CD063939 [ tcccaACACGAAGCTACTGTAAATGATGAATATGTAGACTTA CAGTTAAAGCAAAGCACAGCACAACGAGTCAAGCTATTCAAGCTGGACGTGATATGAATGCTTCGTTCATTCTATTGAATCATTTTAGTCAGCGATATGGACGTGTACCACCGATAGATGAATTTAAATCGGATGTGGCCGCATCTTTTGATTTTATGACGGTGAAATTTTCTGATTTACAACGACTACCCTATTATATTCCATATTATCAGTATGCATTCGCTAAACATTGGAATATGGCTAGAACTAAAGCAGATTCTTATACATATCGTAAACTCCGTGAAGCTGATGAATTGCTTGAAAGTGAAGATGGTCATTGTGCAAAA ]
[-] EMBL CD140044 [ TGACGGTGAAATTTTCTGATTTACAACGACTACCCTATTATATTCCATATTATCAGTATGCATTCGCTAAACATTGGAATATGGCTAGAACTAAAGCAGATTCTTATACATATCGTAAACTCCGTGAAGCTGATGAATTGCTTGAAAGTGAAGATGGTCATTGTGCAAAAACTAATGATGGTGTTGACGATTATAACCGTTTATTGAATG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||