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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8317#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 905 fasta sequence
[CAAAAATTTATTACATAAGTATGTAATAAAAGATTGTAGATCATACTACTGATTAATTATTTGAATAGTTAACGTTTAACTAAACAGAAGTTATACATAGAAGAAAAGAAAGATTGTCATATTGGGTTCAACATTTTTGTCACGATTATATGTCATGAGGATAAAGAAGATAACCAGATAGGCTGCTATACATATGTCCATGTAAACGATAAGCTTCATCTCTACATTCCAACCATATTTGATCATTTTTATTTAATTGAATAATAGCTTGATTAGTTACAGTTGCCCAAAACGTACTTTCACACCATGAAAGTAACACAACTT-TACCATTTTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGAAACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATA-ACTGATTCAAAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGTTTA-TTCTCAATACTTTTTGATAAACCTGTATAAAAAGCTATTTGATATTCTACTGGTCTAGGAATCCATATAGGTTGTAATTGTGTTGTTTCTCCGCGAGGACCTGGTGGTCCAGGATTTCCTTGTTCCCCTGTTGGTCCAGCTGGCCCTCGAGCTGATCGAACAGGTATGCGTACACGACCATATCCAGATGAACTAGCTCCGATACATTCTAGTTGTAATTGGCACGTAGATGAACTTTGAGAAATGTTTTTTTGAATATGTGTTGTATTACAAGGTAGTAATAATAATGATAATAACAGAGGGGCTACAAAAATTACGTTTAAATTTAACTTCTTAGTTTTGTTCATTTTTTCGAGTGAATTTATGAAACTTTTAAAATCCTCGTGCCGAATTTTGGCTCGA]
[+] EMBL CD074411 [CAAAAATTTATTACATAAGTATGTAATAAAAGATTGTAGATCATACTACTGATTAATTATTTGAATAGTTAACGTTTAACTAAACAGAAGTTATACATAGAAGAAAAGAAAGATTGTCATATTGGGTTCAACATTTTTGTCACGATTATATGTCATGAGGATAAAGAAGATAACCAGATAGGCTGCTATACATATGTCCATGTAAACGATAAGCTTCATCTCTACATTCCAACCATATTTGATCATTTTTATTTAATTGAATAATAGCTTGATTAGTTACAGTTGCCCAAAACGTACTTTCACACCATGAAAGTAACACAACTT TACCATTTTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGAAACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATA ACTGATTCAAAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGTTTA TTCTCAATACTTTTTGATAAACCTGTATAAAAAGCTATTTGATATTCTACTGGTCTAGGAATCCATATAGGTTGTAATTGTGTTGTTTCTCCGCGAGGACCTGGTGGTCCAGGATTTCCTT ]
[+] EMBL CD198793 [ TAACCAGATAGGCTGCTATACGTATGTCCATGTAAACGATAAGCTTCATCTCTACATTCCAACCATATTTGATCATTTTTATTTAATTGAATAATAGCTTGATTAGTTACAGTTGCCCAAAACGTACTTTCACACCATGAAAGTAACACAACTT TACCATTTTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGAAACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATA ACTGATTCAAAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGNTTA TTCTCAATACTTTTTGATAAACCTGTAT AAAAGCTATTTGATATTCTA ]
[+] EMBL CD198743 [ TAACCAGATAGGCTGCTATACATATGTCCACGTAAACGATAAGCTTCATCTCTACATTCCAACCATATTTGATCATTTTTATTTAATTGAATAATAGCTTGATTAGTTACAGTTGCCCAAAACGTACTTTCACACCATGAAAGTAACACAACTT TACCATTTTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGAAACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATA ACTGATTNCAAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGTTTA TTCTCAATACTTTTTGAT AACCTGTAT AAAAGCTATTT ]
[+] EMBL CD198688 [ TAACCAGATAGGCCGCTATACATATGTCCATGTAAACGATAAGCTTCATCTCTACATTCCAACCATATTTGATCATTTTTATTTAATTGAATAATAGCTTGATTAGTTACAGTTGCCCAAAACGTACTTTCACACCATGAAAGTAACACGACTT TACCATTTTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGANACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATA ACTGATTCAAAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGTTTATTTCTCAt ]
[+] EMBL CD198741 [ TAACCAGATAGGCTGCTATACATATGTCCATGTAAACGATAAGCTTCATCTCTACATTCCAACCATATTTGATCATTTTTATTTAATTGAATAATAGCTTGATTAGTTACAGTTGCCCAAAACGTACTTTCACACCATGAAAGTAACACAACTT TACCATTTTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGAAACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATANACTGATTC AAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGNTTA TTCTCA ]
[-] EMBL CD080501 [ TCACACCATGAAAGTAACAC ACTTNTACCATTNTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGAAACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATA ACTGATTCAAAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGTTTA TTCTCAATACTTTTTGATAAACCTGTATAAAAAGCTATTTGATATTCTACTGGTCTAGGAATCCATATAGGTTGTAATTTTGTTGTTTCTCCGCGAGGACCTGGTGGTCCAGGATTTCCTTGTTCCCCTGTTGGTCCAGCTGGCCCTCGAGCTGATCGAACAGGTATGCGTACACGACCATATCCAGATGAACTAGCTCCGATACATTCTAGTTGTAATTGGCACGTAGATGAACTTTGAGAAATGTTTTTTTGAATATGTGTTGTATTACAAGGTAGTAATAATAATGATAATAACAGAGGGGCTACAAAAATTACGTTTAAATTTAACTTCTTAGTTTTGTTCATTTTTTCGAGTGAATTTATGAAACTTTTAAAATCCTCGTGCCGAATTTTGGCTCGA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||