These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8333#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1034 fasta sequence [ACCTGACTTGCTCGATTCACTGTCAGAAGTAGATTTGGATGAAATAGTTGACCTCGTATTGAGTTGTCAGAAAAAGTGTGGTGGATTCGCTCCTTGCCCCAAACATGATGCCCATCTGCTCTCAACTTTAAGCGCTATCCAAATACTTGCAATGTATGACTGCTTAAACAAGG-TGAA-TGTTGAGGCCGTGTGTGCATTCGTTTCCAAATTACAGG-TGAGA-TGTGTACGGGTTTACAAGTTTTCCTTAATGCTCAAACTGA-TAGTAG-TGTGATGCCTCTGTAGCTCTCATACTTGTTGAGACCTTTCTTTGGTATATAGATGAACAACCAGATGGAAGTTTCGCTGGAGATATTTGGGGGGAAATCGACACTCGTTTTTCATTTTGTGCCGTTGCTACACTGCATATACTTGGAATGCTTTCTAAAAATACTATTGACATTGAAGCTTGTGCTTCATACCTCGAAAAGTGTCAAAATTTGGATGGATGTTTCGGAACTCGACCTGGAAGTGAATCCCATGCAGGTCAAGCATATTGTGTCGTGGGAGCTCTGGCTATACTTCGTCAACTACATCGGTTAAATATAGACCGTGCTGCTTGGTGGCTGGCCGAACGTCAGCTTCCTAGCGGAGGTTTAAATGGAAGACCGGAAAAACACCCTGGTGTGTGCTATTCATGGTGGACTGTAGCTACTCTTGCTATTTTTGGTCGTTTGACATGGATTAAGCAAACTGACCTTACTCGGTTCATCTTAGCTTCTCAAGATGACCAAACTGGCGGTATAGCAGATAAACCCGGAAATATTCCTGACCCATTTCATACTTTATTTGGTCTTGCTGGTCTCTCTTTATTAGCCCAGGTTGACTCATATTTTTCCTCACCAAAGAAAATGGAAAATGGATTAAATGGTGTCGAAGATCCAGCCTTTGTTGCTTTACAAACGGCTAGAAATAAGTTGAAGACTATTAATCCAGTATTATGCATGCCCCAATACATAATAGATCGACTGCAGCTCAAATTTCAACTACTGTAAATA] [+] EMBL CD082251 [ACCTGACTTGCTCGATTCACTGTCAGAAGTAGATTTGGATGAAATAGTTGACCTCGTATTGAGTTGTCAGAAAAAGTGTGGTGGATTCGCTCCTTGCCCCAAACATGATGCCCATCTGCTCTCAACTTTAAGCGCTATCCAAATACTTGCAATGTATGACTGCTTAAACAAGG TGAA TGTTGAGGCCGTGTGTGCATTCGTTTCCAAATTACAGG TGAGA TGTGTACGGGTTTACAAGTTTTCCTTAATGCTCAAACTGA TAGTAG TGTGATGCCTCTGTAGCTCTCATACTTGTTGAGACCTTTCTTTGGTATATAGATGAACAACCAGATGGAAGTTTCGCTGGAGATATTTGGGGGGAAATCGACACTCGTTTTTCATTTTGTGCCGTTGCTACACTGCATATACTTGGAATGCTTTCTAAAAATACTATTGACATTGAAGCTTGTGCTTCATACCTCGAAAAGTGTCAAAATTTGGATGGATGTTTCGGAACTCGACCTGGAAGTGAATCCCATGCAGGTCAAGCATATTGTGTCGTGGGAGCTCTGGCTATACTTCGTCAACTACATCGGTTAAATATAGACCGTGCTGCTTGGTGGCTGGCCGAACGTCAGCTTCCTAGCGGAGGTTTAAATG ] [-] EMBL CD171440 [ tatTGACTGCTTAAACAAGGTTGAATTGTTGAGGCCGTGTGTGCATTCGTTTCCAAATTACAGGTTGAGATTGTGTACGGGTTTACAAGTTTTCCTTAATGCTCAAACTGATTAGTAGTTGTGATGCCTCTGTAGCTCTCATACTTGTTGAGACCATTC ] [-] EMBL CD170818 [ TGCTTCATACCTCGAAAAGTGTCAAAATTTGGATGGATGTTTCGGAACTCGACCTGGAAGTGAATCCCATGCAGGTCAAGCATATTGTGTCGTGGGAGCTCTGGCTATACTTCGTCAACTACATCGGTTAAATATAGACCGCGCTGCTTGGTGGCTGGCCGAACGTCAGCTTCCTAGCGGAGGTTTAAATGGAAGACCGGAAAAACACCCTGGTGTGTGCTATTCATGGTGGACTGTAGCTACTCTTGCTATTTTTGGTCGTTTGACATGGATTAAGCAAACTGACCTTACTCGGTTCATCTTAGCTTCTCAAGATGACCAAACTGGCGGTATAGCAGATAAACCCGG ] [+] EMBL CD083330 [ CTATACTTCGTACACTACATCGGTTAAATATAGACCGTGCTGCTTGGTGGCTGGCCGAACGTCAGCTTCCTAGCGGAGGTTTAAATGGAAGACCGGAAAAACACCCTGATGTGTGCTATTCATGGTGGACTGTAGCTACTCTTGCTATTTTTGGTCGTTTGACATGGATTAAGCAAACTGACCTTACTCGGTTCATCTTAGCTTCTCAAGATGACCAAACTGGCGGTATAGCAGATAAACCCGGAAATATTCCTGACCCATTTCATACTTTATTTGGTCTTGCTGGTCTCTCTTTATTAGCCCAGGTTGACTCATATTTTTCCTCACCAAAGAAAATGGAAAATGGATTAAATGGTGTCGAAGATCCAGCCTTTGTTGCTTTACAAACGGCTAGAAATAAGTTGAAGACTATTAATCCAGTATTATGCATGCCCCAATACATAATAGATCGACTGCAGCTCAAATTTCAACTACTGTAAATA] [+] EMBL CD083403 [ TGTGTGCTATTCATGGTGGACTGTAACTACTCTTGCTATTGTTGGTCGTTTGACATGGATTAAGCAAACTGACCTTACTCGGTTCATCT ] [-] EMBL CD141490 [ CATGGATTAAGCAAACTGACCTTACTCGGTTCATCTTAGCTTCTCAAGATGACCAAACTGGCGGTATAGCAGATAACCCCGGAAATATTCCTGACCCATTTCATACTTTATTTGGTCTTGCTGGTCTCTCTTTATTAGCCCAGGTTGACTCATATTTTTCCTCACCAAAGAAAATGGAAAATGGATTAAATGGTGTCGAAGATCCAGCCTTTGTTGCTTTACAAACGGCTAGAAATAAGTTGAAGACTATTAATCCAGTATTATGCATGCCCCAATACATAATAGATCGACTGCAGCTCAAATTTCAACTACTG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||