cluster # 8336

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8336 cluster # 8336 Sequences # 6 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8336#0 length = 1019 sequences # 6
consensusID : consensus_8336#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1019
fasta sequence
                              [TAACTAAATCTGACATTTGGTCAATGAATAGTAAAATTGCTTCGAATCTCTTAGGTGCTATTTCACCATCATCTAGTTTATTATCGTCAATGATTGTTCAATCATCATTACCATTTTGTTCATCAATATTTATGGATTCGTCACCAGGAGGAGGAATTGTAGCAGGAAGTTCTGGTACTGGCACTACCAACACTACTACATCTGTCACTACTACAAGCATAAGTGATAATAATACCTTGATGAATAGTAGTAGTATCTTATCTACTCAGAAAAACATTTGTGCCGTAATCAACAGTAGTAGTATTCACAGTAGTAGTACATTAGCTAATGAATTATGTACAAGTACATTTGGCGGTAATTATGGTACACTTTTAACTTCAACTACCCCTCCTACTACTACGTCTGATTGTAGTAGCACTAGTGTTAAAACTACAACCACAACTGAAACATCTTTCACAACGTCCACATCAACTATTACTTATGTTCAATGGCGTATGTTATCCTCGGATGGACATGTTTACTTTTTACATCAAGATGATTTTAAGGCATTGAATATTGACGATCATATTGATTACTGTAAGCCGATGAGTTCTAATGTACAGGAAACAAATTCATCTCATCATAGAAATGTGTCGTTTAAAGAAGCTTTTCCAGCACATAATTATTTTATCGCAGCCAGATACAAAAGTAAAGAACGTTGTTTATCCAAACGAGCAAATAATCGATTCAATTTGCCGAGAAACTTTATATTCTACCGTGTCCGTGCTCGTCCTTTGTTGAATAGTGATAGTAGTAATAACTGTGTTGGCTTTGGTGGTATTCCGTCGTCACCTTCTCCAACTAGGAATCTTAATCGCCAGCATCAAAATAATGGCAGCATTAAAAATTCTGTGATTTGTGAATCCTCTCCTTTTGTTTTATCAGATACAGATGTTAATAAAGAGTAAGTTTGTAAGTGACATATATGTGATTGACGGTGATGGAGAGAAGGGGCGTCCCAGTCCGTTTAACCTTTGTCC]

[+] EMBL CD195576             [TAACTAAATCTGACATTTGGTCAATGAATAGTAAAATTGCTTCGAATCTCTTAGGTGCTATTTCACCATCATCTAGTTTATTATCGTCAATGATTGTTCAATCATCATTACCATTTTGTTCATCAATATTTATGGATTCGTCACCAGGAGGAGGAATTGTAGCAGGAAGTTCTGGTACTGGCACTACCAACACTACTACATCTGTCACTACTACAAGCATAAGTGATAATAATACCTTGATGAATAGTAGTAGTATCTTATCTACTCAGAAAAACATTTGTGCCGTAATCAACAGTAGTAGTATTCACAGTAGTAGTACATTAGCTAATGAATTATGTACAAGTACATTTGGCGGTAATTATGGTACACTTTTAACTTCAACTACCCCTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD095625             [                                                                                                                                                                 GCAGGAAGTTCTGGTACTGGCACTACCAACACTACTACATCTGTCACTACTACAAGCATAAGTGATAATAATACCTTGATGAATAGTAGTAGTATCTTATCTACTCAGAAAAACATTTGTGCTGTAATCAACAGTAGTAGTATTCACAGTAATAGTACATTAGCTAATGAATTATGTACAAGTACATTTGGCGGTAATTATGGTACACTTTTAACTTCAACTACCCCTCCTACTACTACGTCTGATTGTAGTAGCACTAGTGTTAAAACTACAACCACAACTGAAACATCTTTCACAACGTCCACATCAACTATTACTTATGTTCAATGGCGTATGTTATCCTCGGATGGACATGTTTACTTTTTACATCAAGATGATTTTAAGGCATTGAATATTGACGATCATATTGATTACTGTAAGCCGATGAGTTCTAATGTACAGGAAACAAATTCATCTCATCATAGAAGTGTGTCGTTTAAAGAAGCTTTTCCAGCACATAATTATTTTATCGCAGCCAGATACAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD156096             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCGGATGGACATGTTTACTTTTTACATCAAGATGATTTTAAGGCATTGAATATTGACGATCATATTGATTACTGTAAGCCGATGAGTTCTAATGTACAGGAAACAAATTCATCTCATCATAGAAATGTGTCGTTTAAAGAAGCTTTTCCAGCACATAATTATTTTATCGCAGCCAGATACAAAAGTAAAGAACGTTGTTTATCCAAACGAGCAAATAATCGATTCAATTTGCCGAGAAACTTTATATTCTACCGTGTCCGTGCTCGTCCTTTGTTGAATAGTGATAGTAGTAATAACTGTGTTGGCTTTGGTGGTATTCCGTCGTCACCTTCTCCAACTAGGAATCTTAATCGCCAGCATCAAAATAATGGCAGCATTAAAAATTCTGTGATTTGTGAATCCTCTCCTTTTGTTTTATCAGATACAGATGTTAATAAAGAGTAAGTTTGTAAGTGACATATATGTGATTGACGGTGATGGAGAGAAGGGGCGTCCCAGTCCGTTTAACCTTTGTCC]
[-] EMBL CD156144             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCGGATGGACATGTTTACTTTTTACATCAAGATGATTTTAAGGCATTGAATATTGACGATCATATTGATTACTGTAAGCCGATGAGTTCTAATGTACAGGAAACAAATTCATCTCATCATAGAAATGTGTCGTTTAAAGAAGCTTTTCCAGCACATAATTATTTTATCGCAGCCAGATACAAAAGTAAAGAACGTTGTTTATCCAAACGAGCAAATAATCGATTCAATTTGCCGAGAAACTTTATATTCTACCGTGTCCGTGCTCGTCCTTTGTTGAATAGTGATAGTAGTAATAACTGTGTTGGCTTTGGTGGTATTCCGTCGTCACCTTCTCCAACTAGGAATCTTAATCGCCAGCATCAAAATAATGGCAGCATTAAAAATTCTGTGATTTGTGAATCCTCTCCTTTTGTTTTATCAGATACAGATGTTAATAAAGAGTAAGTTTGTAAGTGACATATATGTGATTGACGGTGATGGAGAGAAGGGGCGTCCCAGTCCGTTTAACCTTTGTCC]
[-] EMBL CD132460             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTAAGGCATTGAATATTGACGATCATATTGATTACTGTAAGCCGATGAGTTCTAATGTACAGGAAACAAATTCATCTCATCATAGAAATGCGTCGTTTAAAGAAGCTTTTCCAGCACATAATTATTTTATCGCAGCCAGATACAAAAGTAAAGAACGTTGTTTATCCAAACGAGCAAATAATCGATTCAATTTGCCGAGAAACTTTATATTCTACCGTGTCCGTGCTCGTCCTTTGTTGA                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD187823             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAAGGCAGTGAATATTGACGATCATATTGATTACTGTGAGCCGATGAGTTCTAATGTACAGGAAACAAATTCATCTCATCATAGAAATGTGTCGTTTAAAGAAGCTTTTCCAGCACATAATTATTTTATCGCAGCCAGATACAAAAGTAAAGAACGTTGTTTATCCAAACGAGCAAATAATCGATTCAATTTGCCGAGAAACTTTATATTCTACCGTGTCCGTGCTCGTCCTTTGTTGAATAGTGGTAGTAagg                                                                                                                                                                                                                                ]




>consensus_8336#0
TAACTAAATCTGACATTTGGTCAATGAATAGTAAAATTGCTTCGAATCTCTTAGGTGCTA
TTTCACCATCATCTAGTTTATTATCGTCAATGATTGTTCAATCATCATTACCATTTTGTT
CATCAATATTTATGGATTCGTCACCAGGAGGAGGAATTGTAGCAGGAAGTTCTGGTACTG
GCACTACCAACACTACTACATCTGTCACTACTACAAGCATAAGTGATAATAATACCTTGA
TGAATAGTAGTAGTATCTTATCTACTCAGAAAAACATTTGTGCCGTAATCAACAGTAGTA
GTATTCACAGTAGTAGTACATTAGCTAATGAATTATGTACAAGTACATTTGGCGGTAATT
ATGGTACACTTTTAACTTCAACTACCCCTCCTACTACTACGTCTGATTGTAGTAGCACTA
GTGTTAAAACTACAACCACAACTGAAACATCTTTCACAACGTCCACATCAACTATTACTT
ATGTTCAATGGCGTATGTTATCCTCGGATGGACATGTTTACTTTTTACATCAAGATGATT
TTAAGGCATTGAATATTGACGATCATATTGATTACTGTAAGCCGATGAGTTCTAATGTAC
AGGAAACAAATTCATCTCATCATAGAAATGTGTCGTTTAAAGAAGCTTTTCCAGCACATA
ATTATTTTATCGCAGCCAGATACAAAAGTAAAGAACGTTGTTTATCCAAACGAGCAAATA
ATCGATTCAATTTGCCGAGAAACTTTATATTCTACCGTGTCCGTGCTCGTCCTTTGTTGA
ATAGTGATAGTAGTAATAACTGTGTTGGCTTTGGTGGTATTCCGTCGTCACCTTCTCCAA
CTAGGAATCTTAATCGCCAGCATCAAAATAATGGCAGCATTAAAAATTCTGTGATTTGTG
AATCCTCTCCTTTTGTTTTATCAGATACAGATGTTAATAAAGAGTAAGTTTGTAAGTGAC
ATATATGTGATTGACGGTGATGGAGAGAAGGGGCGTCCCAGTCCGTTTAACCTTTGTCC
clustalw multiple alignements is not computed in this case