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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8352#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 576 fasta sequence
[AGGAATTCACACGGTTGGCTCTTGGAGATGGAGCATCTGGTTATCGATATGGATTGGAATGCTTGTTTCGATTTTACTCGTATGGTTTGGAACGTCGTTTCAAATGGTCTCTTTATAAGGACTTCCAGGAACAAGCCTTGAGAGACTACAAAAACGGACATCTATATGGGTTGGAAAAATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGTTACTACAGAAGTACAGGACCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGTTCTGTGTTAATTATTATATTCCCACTTCAATCAGTTGGATGACCGATGTTCTAATTACTAAAGATTCCTTTTTCTCTTTGTATTTAATTAACTTTCTCACTAAACGTATTATTAAACAGTTTCCAGTAATTTCAGACAACACAGTGATCTAATGCGACTCACTATCAGGACACTTGAAATTT]
[+] EMBL CD129903 [AGGAATTCACACGGTTGGCTCTTGGAGATGGAGCATCTGGTTATCGATATGGATTGGAATGCTTGTTTCGATTTTACTCGTATGGTTTGGAACGTCGTTTCAAATGGTCTCTTTATAAGGACTTCCAGGAACAAGCCTTGAGAGACTACAAAAACGGACATCTATATGGGTTGGAAAAATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGTTACTACAGAAGTACAGGACCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGTTCTGTGTTAATTATTATATTCCCACTTCAATCAGTTGGATGACCGATGTTCTAATTACTAAAGATTCCTTTTTCTCTTTGTATTTAATTAACTTTCTCACTAAACGTATTATTAAACAGTTTCCAGTAATTTCAGACAACACAGTGATCTAATGCGACTCACTATCAGGACACTTGAAATTT]
[+] EMBL CD165055 [ TTGAGAGACTACAAAAACGGACATCTATATGGGTTGGAAAAATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGTTACTACAGAAGTACAGGACCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGTTCTGTGTTAATTATTA ]
[+] EMBL CD189032 [ gGGAAAAATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGTTACTACAGAAGTACAGGACCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGTTCTGAGTTAATTATTATATTCCCACTTCAATCAGTTGGATGACCGATGTTCTAATTACTAAAGATTCCTTTTTCTCTTTGTATTTAATTAACTTTCTCACTAAACGTATTATTAAACAGTTTCCAGTAATTTCAGACAACACAGTGATCTAATG ]
[+] EMBL CD189347 [ AAATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGTTACTACAGAAGTACAGGATCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGCTCTGTGTTAATTATTATATTCCCACTTCAATCAGTTGGATGACCGATGTTCTA ]
[-] EMBL CD188653 [ AATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGTTACTACAGAAGTACAGGACCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGTTCTGTGTTAATTATTATATTCCCACTTCAATCAGTTGGATGACCGATGTTCTAATTACTAAAGATTCCTTTTTCTCTTTGTATTTAATTAACTTTCTCACTAAACGTATTATTAAACAGTTTCCAGTAATTTCAGACAACACAGTGATCTAATGC ]
[+] EMBL CD183527 [ AATTCTGGGCTTTCTTACATTACAGTGGACGCAAAGTAGAAGTCAACCATGCACTAAAAGAGCTACTACAGAAGTACAGGACCATTGAAGACTTTCGTGTCAATTTTGAAGTTCCTGATGGATTTTTTGGTTATCGCAAAAGACTTCCTTCTACATCAGCTTCTGTGCCTCCAAATACATCCTCCGATTTCTCTACTCAGCCCACTTCTGTTTGAGTTCTGTGTTAATTATTATATTCCCACTTCAATCAGTTGGATGACCGATGTTCTAATTACTAAAGATTCCTTTTTCTCTTTGTATTTAATTAACTTTCTCACTAAACGTATTATTAAACAGTTTCCAGTAATTTCAGACAACACAGTGATCTAATG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||