cluster # 8355

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Schistosoma mansoni
cluster # 8355 cluster # 8355 Sequences # 6 consensus # 2

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consensus_8355#0 length = 924 sequences # 5

consensus_8355#1 length = 847 sequences # 1

consensusID : consensus_8355#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 924
fasta sequence

                              [GGCGGCTTTTTACCGTGCCAGTAAGACCTGTTTTGTATTCACAAAAATGACTGATTCCGGGATTTTAAGCTTCAAGACGCCCGAGGAAATGCATGACTATATGAAAAATCTGGGATTGGGTTTTGAATATAGTTGTATACGTGAAAACAATCCCGTCAGTTGTCATTCATGGGCACTATGGTGCAGTAATTATAAAAAGCTAGTTACCAACGGTGCAGACATTCTGAAAGAAAATTGCTTCAAGCGTAATTATGGAGACAGTTGCTATCGATATGGGTCATTAAAAGTCATTGGCGATAGAGGTATATTGCGAGATCCAGTCGAGGCTTTCCGTGCATTCGAACATGGTTGTAAGGCAGGAAAACAGGGGAAATGTTGTCAAGCTGCTGGGCGCCTAGTTGCTGATGGTATAGCTAGTCATGCACCAAATTTATCTGTTGCAATGCCACTATTCGAATTAGGTTGTCAAAATAAAGTACCAGAAAGTTGTTTTCATCTTGGTGGTGCAGCAATGGTATTAGCTAAAGATAATGACAAATCAACTAATTCAGAAAAGTCTCCTAATCCTACTGGTAGTGATGATAGTAATCGTCTACGTGTTGAAGCATTCAAAGCATGGATGGAGGGTTGTAAATTGGGTCATGAACTCTGTTGTCGTAATATTGCAAAAATGTACTCCAATGGTGATGGTGTTGAAATGGATGAATTGAAAGCAAAAGAATTCCTATTAAAAGCTGATCAACTGGCGACACATAACAACGTAACACATACTTCTACTAATACTACTACTACTGCTGTGAATAAAACTAGTACATAATCATTTGTATAATAATAATCACAATCATTTTTGTATTTATCTCCCTGACCCTCACTAAAACGATTAGAATAAATTTTAGATTACTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

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[+] EMBL CD115015             [GGCGGCTTTTTACCGTGCCAGTAAGACCTGTTTTGTATTCACAAAAATGACTGATTCCGGGATTTTAAGCTTCAAGACGCCCGAGGAAATGCATGACTATATGAAAAATCTGGGATTGGGTTTTGAATATAGTTGTATACGTGAAAACAATCCCGTCAGTTGTCATTCATGGGCACTATGGTGCAGTAATTATAAAAAGCTAGTTACCAACGGTGCAGACATTCTGAAAGAAAATTGCTTCAAGCGTAATTATGGAGACAGTTGCTATCGATATGGGTCATTAAAAGCCATTGGCGATAGAGGTATATTGCGAGATCCAGTCGAGGCTTTCCGTGCATTCGAACATGGTTGTAAGGCAGGAAAACAGGGGAAATGTTGTCAAGCTGCTGGGCGCCTAGTTGCTGATGGTATAGCTAGTCATGCACCAAATTTATCTGTTGCAATGCCACTATTCGAATTAGGTTGTCAAAATAAAGTACCAGAAAGTTGTTTTCATCTTGGTGGTGCAGCAATGGTATTAGCTAAAGATAATGACAAATCAACTAATTCAGAAAAGTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD115005             [GGCGGCTTTTTACCGTGCCAGTAAGACCTGTTTTGTATTCACAAAAATGACTGATTCCGGGACTTTAAGCTTCAAGACGCCCGAGGAAATGCATGACTATATGAAAAATCTGGGATTGGGTTTTGAATATAGTTGTATACGTGAAAACAATCCCGTCAGTTGTCATTCATGGGCACTATGGTGCAGTAATTATAAAAAGCTAGTTACCAACGGTGCAGACATTCTGAAAGAAAATTGCTTCAAGCGTAATTATGGAGACAGTTGCTATCGATATGGGTCATTAAAAGTCATTGGCGATAGAGGTATATTGCGAGATCCAGTCGAGGCTTTCCGTGCATTCGAACATGGTTGTAAGGCAGGAAAACAGGGGAAATGTTGTCAAGCTGCTGGGCGCCTAGTTGCTGATGGTATAGCTAGTCATGCA CAAATTTATCTGTTGCAATGCCACTATTCGAATTAGGTTGTCAAAATAAAGTACCAGAAAGTTGTTTTCATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL AI395419             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCTAAAGATAATGACAAATCAACTAATTCAGAAAAGTCTCCTAATCCTACTGGTAGTAATGATAGTAATCGTCTACGTGTTGAAGCATTCAAAGCATGGATGGAGGGTTGTAAATTGGGTCATGAACTCTGTTGTCGTAATATTGCAAAAATGTACTCCAATGGTGATGGTGTTGAAATGGATGAATTGAAAGCAAAAGAATTCCTATTAAAAGCTGATCAACTGGCGACACATAACAACGTAACACATACTTCTACTAATACTACTACTACTGCTGTGAATAAAACTAGTACATAATCATTTGTATAATAATAATCACAATCATTTTTGTATTTATCTCCCTGACCCTCACTAAAACGATTAGAATAAATTTTAGATTACTTGAAAAAAAAAAAAAAAAA   ]
[-] EMBL AI395835             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCAAGCCATGGTTGGAGGGTTGTAAATTGGGTCATGAACTCTGTTGTCGTAATATTGCAAAAATGTACCCCAATGGTGATGGTGTTGAAATGGATGAATTGAAAGCAAAAGAATTCCTATTAAAAGCTGATCAACTGGCGACACATAACAACGTAACACATACTTCTACTAATACTACTACTACTGCTGTGAATAAAACTAGTACATAATCATTTGTATAATAATAATCACAATCATTTTTGTATTTATCTCCCTGACCCTCACTAAAACGATTAGAATAAATTTTAGATTACTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]




>consensus_8355#0
GGCGGCTTTTTACCGTGCCAGTAAGACCTGTTTTGTATTCACAAAAATGACTGATTCCGG
GATTTTAAGCTTCAAGACGCCCGAGGAAATGCATGACTATATGAAAAATCTGGGATTGGG
TTTTGAATATAGTTGTATACGTGAAAACAATCCCGTCAGTTGTCATTCATGGGCACTATG
GTGCAGTAATTATAAAAAGCTAGTTACCAACGGTGCAGACATTCTGAAAGAAAATTGCTT
CAAGCGTAATTATGGAGACAGTTGCTATCGATATGGGTCATTAAAAGTCATTGGCGATAG
AGGTATATTGCGAGATCCAGTCGAGGCTTTCCGTGCATTCGAACATGGTTGTAAGGCAGG
AAAACAGGGGAAATGTTGTCAAGCTGCTGGGCGCCTAGTTGCTGATGGTATAGCTAGTCA
TGCACCAAATTTATCTGTTGCAATGCCACTATTCGAATTAGGTTGTCAAAATAAAGTACC
AGAAAGTTGTTTTCATCTTGGTGGTGCAGCAATGGTATTAGCTAAAGATAATGACAAATC
AACTAATTCAGAAAAGTCTCCTAATCCTACTGGTAGTGATGATAGTAATCGTCTACGTGT
TGAAGCATTCAAAGCATGGATGGAGGGTTGTAAATTGGGTCATGAACTCTGTTGTCGTAA
TATTGCAAAAATGTACTCCAATGGTGATGGTGTTGAAATGGATGAATTGAAAGCAAAAGA
ATTCCTATTAAAAGCTGATCAACTGGCGACACATAACAACGTAACACATACTTCTACTAA
TACTACTACTACTGCTGTGAATAAAACTAGTACATAATCATTTGTATAATAATAATCACA
ATCATTTTTGTATTTATCTCCCTGACCCTCACTAAAACGATTAGAATAAATTTTAGATTA
CTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

consensusID : consensus_8355#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 847
fasta sequence

                              [GCAAGACGAAATGATGCGCAATTTGATTTAAACTTGATTTAACCAAACGTGATTCAATATTTATAGTCAGATAAAAAATAAGTTACAGACACGTAATGAATAGGGTAAGCAATCTATACACATACGATTGTATGAAAACAGTCAGGGTTGATAAGCGAATAGGTGAGGAGGTTGAAATCTAGCTTGACATAGTACCAACCACTACAGTATTGCCAAAAGCATCTATCTGAGCTGCAAATCTTCTGTAGCATTTTTCTAAGCAAATATTTTATAAGACTTTTACTCCATCAGCTCTTAATAGTTACCGTAGTTTTGATAAATTCACTTTCTGTAAAACAAATTTCTGCCTTCTATTTTCCTTTTATGAAACAGGCTGCTGGGCGCCTAGTTGCTGATGGTATAGCTAGTCATGCACCAAATTTATCTGTTGCAATGCCACTATTCGAATTAGGTTGTCAAAATAAAGTACCAGAAAGTTGTTTTCATCTTGGTGGTGCAGCAATGGTATTAGCTAAAGATAATGACAAATCAACTAATTCAGAAAAGTCTCCTAATCCTACTGGTAGTAATGATAGTAATCGTCTACGTGTTGAAGCATTCAAAGCATGGATGGAGGGTTGTAAATTGNGTCATGAACTCTGTTGTCGTAATATTGCANAATGTACTCCAATGGTGATGGTGTTGAAATAGATGAATTGAAGCANAGAAATTCTATTAAAGCTGATCACTGGCGACACATACACGTACACATACTTTACACTACTACTACTGCTGNGATAAACTAGACATATCATTTGATATATATCACATCATTNNTGATTATCTCCTGACCTACTAANNCGATAGA]

[+] EMBL CD081983             [GCAAGACGAAATGATGCGCAATTTGATTTAAACTTGATTTAACCAAACGTGATTCAATATTTATAGTCAGATAAAAAATAAGTTACAGACACGTAATGAATAGGGTAAGCAATCTATACACATACGATTGTATGAAAACAGTCAGGGTTGATAAGCGAATAGGTGAGGAGGTTGAAATCTAGCTTGACATAGTACCAACCACTACAGTATTGCCAAAAGCATCTATCTGAGCTGCAAATCTTCTGTAGCATTTTTCTAAGCAAATATTTTATAAGACTTTTACTCCATCAGCTCTTAATAGTTACCGTAGTTTTGATAAATTCACTTTCTGTAAAACAAATTTCTGCCTTCTATTTTCCTTTTATGAAACAGGCTGCTGGGCGCCTAGTTGCTGATGGTATAGCTAGTCATGCACCAAATTTATCTGTTGCAATGCCACTATTCGAATTAGGTTGTCAAAATAAAGTACCAGAAAGTTGTTTTCATCTTGGTGGTGCAGCAATGGTATTAGCTAAAGATAATGACAAATCAACTAATTCAGAAAAGTCTCCTAATCCTACTGGTAGTAATGATAGTAATCGTCTACGTGTTGAAGCATTCAAAGCATGGATGGAGGGTTGTAAATTGNGTCATGAACTCTGTTGTCGTAATATTGCANAATGTACTCCAATGGTGATGGTGTTGAAATAGATGAATTGAAGCANAGAAATTCTATTAAAGCTGATCACTGGCGACACATACACGTACACATACTTTACACTACTACTACTGCTGNGATAAACTAGACATATCATTTGATATATATCACATCATTNNTGATTATCTCCTGACCTACTAANNCGATAGA]




>consensus_8355#1
GCAAGACGAAATGATGCGCAATTTGATTTAAACTTGATTTAACCAAACGTGATTCAATAT
TTATAGTCAGATAAAAAATAAGTTACAGACACGTAATGAATAGGGTAAGCAATCTATACA
CATACGATTGTATGAAAACAGTCAGGGTTGATAAGCGAATAGGTGAGGAGGTTGAAATCT
AGCTTGACATAGTACCAACCACTACAGTATTGCCAAAAGCATCTATCTGAGCTGCAAATC
TTCTGTAGCATTTTTCTAAGCAAATATTTTATAAGACTTTTACTCCATCAGCTCTTAATA
GTTACCGTAGTTTTGATAAATTCACTTTCTGTAAAACAAATTTCTGCCTTCTATTTTCCT
TTTATGAAACAGGCTGCTGGGCGCCTAGTTGCTGATGGTATAGCTAGTCATGCACCAAAT
TTATCTGTTGCAATGCCACTATTCGAATTAGGTTGTCAAAATAAAGTACCAGAAAGTTGT
TTTCATCTTGGTGGTGCAGCAATGGTATTAGCTAAAGATAATGACAAATCAACTAATTCA
GAAAAGTCTCCTAATCCTACTGGTAGTAATGATAGTAATCGTCTACGTGTTGAAGCATTC
AAAGCATGGATGGAGGGTTGTAAATTGNGTCATGAACTCTGTTGTCGTAATATTGCANAA
TGTACTCCAATGGTGATGGTGTTGAAATAGATGAATTGAAGCANAGAAATTCTATTAAAG
CTGATCACTGGCGACACATACACGTACACATACTTTACACTACTACTACTGCTGNGATAA
ACTAGACATATCATTTGATATATATCACATCATTNNTGATTATCTCCTGACCTACTAANN
CGATAGA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8355#0      GGCGGCTTTTTACCGTGC-CAGTAAGACCTGTTTTGTATTCACAAAAATGACTGATTCCG 59
consensus_8355#1      -GCAAGACGAAATGATGCGCAATTTGATTTAAACTTGATTTAACCAAACG--TGATTCAA 57
                       **        *   *** ** *  **  *    *  *** *   *** *  ******  

consensus_8355#0      GGATTTTAAGCTTCAAGACGCCCGAGGAAATGCATGACTATATGAAAAATCTGGGATTGG 119
consensus_8355#1      TATTTATAGTC----AGATAAAAAATAAGTTACA-GAC-ACGTAATGAATAGGGTAA-GC 110
                         ** **  *    ***      *  *  * ** *** *  * *  ***  ** *  * 

consensus_8355#0      GTTTTGAATATAGTTGTATACGTGAAAACAATCCCGTCAGTTGTCATTCATGGGCACTAT 179
consensus_8355#1      AATCTATACACATACGATTGTATGAAAACAGTCAGG---GTTGATAAGCGAATAGGTGAG 167
                        * *  * * *   *  *   ******** **  *   ****  *  *         * 

consensus_8355#0      GGTGCAGTAATTATAAAAAGCTAGTTACCAACGGTGCAGACATTCTGAAAGAAAATTGCT 239
consensus_8355#1      GAGGTTGAAATCTAGCTTGACATAGTACCAACCACTACAGTATTGCCAAAAGCATCTATC 227
                      *  *  * ***         *    *******         ***   ***   *  *   

consensus_8355#0      TCAAGCGTAA---TTATGGAGACAGTTGCTATCGATATGGGTCATTAAAAGTCATTGGCG 296
consensus_8355#1      TGAGCTGCAAATCTTCTGTAGCATTTTTCTAAGCAAATATTTTATAAGACTTTTACTCCA 287
                      * *   * **   ** ** **    ** ***   * **   * ** * *  *      * 

consensus_8355#0      ATAGAGGTATATTGCGAGATCCAGTCGAGGCTTTCCGTGCATTCGAACATGGTTGTAAGG 356
consensus_8355#1      TCAGCTCTTAATAGTTACCGTAGTTTTGATAAATTCACTTTCTGTAAAACAAATTTCTGC 347
                        **   *  ** *  *       *        * *      *  ** *    * *  * 

consensus_8355#0      CAGGAAAACAGGGGAAATGTTGTCAAGCTGCTGGGCGCCTAGTTGCTGATGGTATAGCTA 416
consensus_8355#1      CTTCTATTTTCCTTTTATGAAA-CAGGCTGCTGGGCGCCTAGTTGCTGATGGTATAGCTA 406
                      *    *          ***    ** **********************************

consensus_8355#0      GTCATGCACCAAATTTATCTGTTGCAATGCCACTATTCGAATTAGGTTGTCAAAATAAAG 476
consensus_8355#1      GTCATGCACCAAATTTATCTGTTGCAATGCCACTATTCGAATTAGGTTGTCAAAATAAAG 466
                      ************************************************************

consensus_8355#0      TACCAGAAAGTTGTTTTCATCTTGGTGGTGCAGCAATGGTATTAGCTAAAGATAATGACA 536
consensus_8355#1      TACCAGAAAGTTGTTTTCATCTTGGTGGTGCAGCAATGGTATTAGCTAAAGATAATGACA 526
                      ************************************************************

consensus_8355#0      AATCAACTAATTCAGAAAAGTCTCCTAATCCTACTGGTAGTGATGATAGTAATCGTCTAC 596
consensus_8355#1      AATCAACTAATTCAGAAAAGTCTCCTAATCCTACTGGTAGTAATGATAGTAATCGTCTAC 586
                      ***************************************** ******************

consensus_8355#0      GTGTTGAAGCATTCAAAGCATGGATGGAGGGTTGTAAATTGGGTCATGAACTCTGTTGTC 656
consensus_8355#1      GTGTTGAAGCATTCAAAGCATGGATGGAGGGTTGTAAATTGNGTCATGAACTCTGTTGTC 646
                      ***************************************** ******************

consensus_8355#0      GTAATATTGCAAAAATGTACTCCAATGGTGATGGTGTTGAAATGGATGAATTGAAAGCAA 716
consensus_8355#1      GTAATATTGCANAA-TGTACTCCAATGGTGATGGTGTTGAAATAGATGAATTGAA-GCAN 704
                      *********** ** **************************** *********** *** 

consensus_8355#0      AAGAATTCCTATTAAAAGCTGATCAACTGGCGACACATAACAACGTAACACATACTTCTA 776
consensus_8355#1      AGAAATTC-TATTAAA-GCTGATCA-CTGGCGACACATA--CACGTA-CACATACTTT-- 756
                      *  ***** ******* ******** *************   ***** *********   

consensus_8355#0      CTAATACTACTACTACTGCTGTGAATAAAACTAGTACATAATCATTTGTATAATAATAAT 836
consensus_8355#1      ---ACACTACTACTACTGCTGNGA--TAAACTAG-ACATA-TCATTTG----ATATATAT 805
                         * **************** **   ******* ***** *******    ***   **

consensus_8355#0      CACAATCATTTTTGTATTTATCTCCCTGACCCTCACTAAAACGATTAGAATAAATTTTAG 896
consensus_8355#1      CACA-TCATTNNTGA--TTATCTCC-TGACC--TACTAANNCGAT-AGA----------- 847
                      **** *****  **   ******** *****   *****  **** ***           

consensus_8355#0      ATTACTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 924
consensus_8355#1      ----------------------------