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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8363#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 683 fasta sequence
[TTTTCAAGGACACTACTAATGATTAGATTTATTCTTATACAAAATAGAGCCGGCAAAACACGCTTGGCTAAATGGTATATGAATCTTGATGATGAGGAGAAACAAAAACTAACTGAAGAAGTCCATGCTTTGGTCACCGTACGAGATGCCAAGCATACTAACTTTGTTGAATTTCGAAATTTTAAGATAGTTTATCGTCGTTATGCTGGCTTGTATTTTTGCATGTGTATTGACCTAATGGACAATAGTCTCGCATATTTAGAGGCGATCCATAATTTTGTAGAAGTCTTAAATGAACTGTTCCACAATGTTTGTGAATTGGACCTCGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCG-TTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCAAACCAAAGTTTTAAAGCAGGTCATTATGTACTCAGCTTTGGAGTGACGTCAATTACGTCTTTTCCTTAGGACAAGCTCACTGCAAATCACAGGTGCGATATTTTAGACTTCAATAACTGTTATGTTTCTGTTTTGCATATTCATTTAATTATGTAGCCAATTTAAATTTTATCCTTCACTTCTCAGAGGTTTTATTCTGGGATTATATCCAAGTCGTTGATTTCTTTGGTTTCTTACTTTGTTGTGTATTTTTCGACCAAAAGTTATTCAATAATTCATCTC]
[+] EMBL CD197009 [TTTTCAAGGACACTACTAATGATTAGATTTATTCTTATACAAAATAGAGCCGGCAAAACACGCTTGGCTAAATGGTATATGAATCTTGATGATGAGGAGAAACAAAAACTAACTGAAGAAGTCCATGCTTTGGTCACCGTACGAGATGCCAAGCATACTAACTTTGTTGAATTTCGAAATTTTAAGATAGTTTATCGTCGTTATGCTGGCTTGTATTTTTGCATGTGTATTGACCTAATGGACAATAGTCTCGCATATTTAGAGGCGATCCATAATTTTGTAGAAGTCTTAAATGAACTGTTCCACAATGTTTGTGAATTGGACCTCGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCG TTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCCAACCAAAGTTTTAAAGCAGGT ]
[+] EMBL CD081955 [ GGCTAAATGGTATATGAATCTTGATGATGAGGAGAAACAAAAACTAATTGAAGAAGTCCATGCTTTGGTCACCGTACGAGATGCCAAGCATACTAACTTTGTTGAATTTCGAAATTTTAAGATAGTTTATCGTCGTTATGCTGGCTTGTATTTTTGCATGTGTATTGACCTAATGGACAATAGTCTCGCATATTTAGAGGCGATCCATAATTTTGTAGAAGTCTTAAATGAACTGTTCCACAATGTTTGTGAATTGGACCTCGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCG TTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCAAACCAAAGTTTTAAAGCAGGTCATTATGTACTCAGCTTTGGAGTGACGTCAATTACGTCTTTTCCTTAGGACAAGCTCACTGCAAATCACAGGTGCGATATTTTAGACTTCAATAACTGTTATGTTTCTGTTTTGCATATTCATTTAATTATGTAGCCAATTTAAATTTTATCCTTCACTTCTCAGAGGTTTTATTCTGGGATTATATCCAAGTCGTTGATTTCTTTGGTTTCTTACTTTGTTGTGTATTTTTCGACCAAAAGTTATTCAATAATTCATCTC]
[-] EMBL CD188268 [ GTCACCGTACGAGATGCCAAGCATACTAACTTTGTTGAATTTCGTAATTTTAAGATAGTTNATCGTCGTTATGCTGGCTTGTATTTTTGCATGTGTATTGACCTAATGGACAATAGTCTCGCATATTTAGAGGCGATCCATAATTTTGTAGAAGTCTTAAATGAACTGTTCCACAATGTTTGTGAATTGGACCTCGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCG TTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCAAACCAAAGTTTTTAAGCAGGTCATTATGTACTCAGCTTTGGAGTGACGTCAATTACGTCTTTTCCTTAGGACAAGCTCACTGCAAATCACAGGTGCGATATTTTAGACTTCAATAACTGTTATGTTTCTGTTTTGCATATTCACTTAATTATGTAGCCAATTTAAATTTTATCCTTCACTTCTCAGAGGTTTTATTCTG ]
[-] EMBL CD154927 [ GACCTAATGGACAATAGTCTCGCATATTTAGAGGCGATCCATAATTTTGTAGAAGTCTTAGATGAACTGTTCCACAATGTTTGTGAATTGGACCTAGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCG TTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCAAACCAAAGTTTTAAAGCAGGTCATTATGTACTCAGCTTTGGAGTGACGTCAATTACGTCTTTTCCTTAGGACAAGCTCACTGCAAATCACAGGTGCGATATTTTAGACTTCAATAACTGTTATGTTTCTGTTTTGCATATTCATTTAATTATGTAGCCAATTTAAATTTTATCCTTCACTTCTCAGAGGTTTTATTCTGGGATTATATCCAAGT ]
[-] EMBL CD155011 [ GACCTAATGGACAATAGTCTCGCATATTTAGAGGCGATCCATAATTTTGTAGAAGTCTTAAATGAACTGTTCCACAATGTTTGTGAATTGGACCTCGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCG TTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCAAACCAAAGTTTTAAAGCAGGTCATTATGTACTCAGCTTTGGAGTGACGTCAATTACGTCTTTTCCTTAGGACAAGCTCACTGCAAATCACAGGTGCGATATTTTAGACTTCAATAACTGTTATGTTTCTGTTTTGCATATTCATTTAATTATGTAGCCAATTTAAATTTTATCCTTCACTTCTCAGAGGTTTTATTCTGGGATTATATCCAAGT ]
[-] EMBL CD196364 [ CAATGTTTGTGAATTGGACCTCGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCGTTTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCATACCTAAGTTTTAAAGCAGGTCATTATGTACTCAGCTTTGGAGTGACGTCAATTACGTCTTTTCCTTAGGACAAGCTCACTGCAAATCACAGGTGCGATATTTTAGACTTCAATAACTGTTATGTTTCTGTTTTGCATATTCATTTAATTATGTAGCCAATTTAAATTTTATCCTTCACTTCTCAGAGGTTTTATTCTGGGATTATATCCAAGTCGTTGATTTCTTTGGTTTCTTACTTTGTTGTGTATTTTTCGACCACAAGTTATTCAAT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||