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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8371#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 557 fasta sequence
[CGGGAATTCTATTCCATTTCAACGAAGTTATCGTCACAAACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGTGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACAGGCAAAAGTATGT-TTGTGTGGCAGATAGGTACACATATACACAGATTGATAAATTGTATATTTGTTAACCAATTGTCAGCTGTTTTGACTCTCTCCCTCTCTTGATTTCTTTCTCTCTTAACACATAACACAAATAATACAGATATACACGAAAACAAAATTGATTAGGTTATAATAGTAGAAATTGTCTTTTGACATCAATTCTCACAATTTACATTGCCGTCAACACTGTTGGTATTATTGACTAAAGTAGGCGATTGTGATTTTAGCAACGAATTATTATCATTATTATCCTCAACGATAGGAGTAGTAGTCAAATCATTGACAATACTAAGCGACGACAAAGACTGATCATCAATAATACAATGATTGTTTAGTTCAGATGGTGATGATGACGATGATGATGATGAATT]
[+] EMBL CD090640 [CGGGAATTCTATTCCATTTCAACGAAGTTATCGTCACAAACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGTGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACAGGCTCCATTATGT TTGTGTGGCNTATTGGTGCACATATACACAGATTGATAAATTGTATATTTGTTAACCATTTGTCAGCTGTTTTGACTCTCTCCCTCTCTTGATTTCTTTCTCTCTTACCCCATANCACANATAATACAG ]
[+] EMBL CD090656 [ ACGAAGTTATCGTCACAAACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGTGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACATGCAAAAGTATGTCNNGAGTGGCAGATAGGGACACATATACACAGATTGATAAATTGTATATTTGTTAACCAATTGNCAGCAGNAAAGACTCTCTCCCTCTCTAGATNNCNGTCTCTCTTAACACATAACACA ]
[+] EMBL CD090646 [ AACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGTGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACAGGCAAAAGTATGT TTGTGTGGCAGATAGGTACACATATACACAGATNGATAAATTGTATATTTGTTAACCAATTGTCATCTGTNNTGACTCTCTCCCTCCCTTGATTTCTTTCTCTCTTAACACATAACACAAATAATACTTTTATTCTCTAAAACAAAATTGATTATGTTATAATAGCAGAAATTGCCTTTTGACATCAATTCTCACAATTTACATTGCCGTCAACACTGTTGGTATTATTGACTAAAGCANGCGATTGTGATTTTAGC TTTTTTTATTATCATTATTATCCTCATCGATAGGAGTAGTAGTCAAATCATTGACAATACTAAGCGACGACAAAGACTGATTATCAATAATACAATGATTGTTNAGTTCAGATGGTGACGATGACTATGATGATGATGAATT]
[+] EMBL CD090659 [ AACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGCGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACTGGCAAAAGTATGT TTGTGTGGCAGATAGGTACACATATACACAGATTGATAAATTGTATATTTGTTAACCAATTGTCAGCTGTTTTGACTCTCTCCCTCTCTTGATTTCTTTCTCTCTTAACACATAACACAAATAATACAGATATACACGAAAACAAAATTGATTAGGTTATAATAGTAGAAATTGTCTTTTGACATCAATTCTCACAATTTACATTGCCGTCAACACTGTTGGTATTATTGACTAAAGTAGGCGATTGTGATTTTAGCAGCGAATTATTATCATTATTATCCTCAACGATAGGAGTAGTAGTCAAATCATTGACAATACTAAGCGACGACAAAGACTGATCATCAATAATACAATGATTGTTTAGTTCAGATGGTGATGATGACGATGATGATGATGAAT ]
[+] EMBL CD090665 [ AACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGTGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACATGCAAAAGTATGT TTGTGTGGCAGATAGGTACACATATACACAGATTGATAAATTGTATATTTGTTAACCAATTGTCAGCTGTTTTGACTCTCTCCCTCTCTTGATTTCTTTCTCTCTTAACACATAACACAAATAATACAGATATACACGAAAACAAAATTGATTAGGTTATAATAGTAGAAATTGTCTTTTGACATCAATTCTCACAATTTACATTGCCGTCAACACTGTTGGTATTATTGACTAAAGTAGGCGATTGTGATTTTAGCAACGAATTATTATCATTATTATCCTCAACGATAGGAGTAGTAGTCAAATCATTGACAATACTAAGCGACGACAAAGACTGATCATCAATAATACAATGATTGTTTAGTTCAGATGGTGATGATGACGATGATGATGATGAAT ]
[-] EMBL CD090618 [ ACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGTGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACAGGCAAAAGTATGT TTGTGTGGCAGATAGGTGCACATATACACAGATTGATAAATTGTATATTTGTTAACCAATTGTCAGCTGTTTTGACTCTCTCCCTCTCTTGATTTCTTTCTCTCTTAACACATAACACAAATAATACAGATATACACGAAAACAAAATTGATTAGGTTATAATAGTAGAAATTGTCTTTTGACATCAATTCTCACAATTTACATTGCCGTCAACACTGTTGGTATTATTGACTAAAGTAGGCGATTGTGATTTTAGCAACGAATTATTATCATTATTATCCTCAACGATAGGAGTAGTAGTCAAATCATTGACAATACTAAGCGACGACAAAGACTGATCATCAATAATACAATGATTGTTTAGTTCAGATGGTGATGATGACGATGATGATGATGAATT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||