These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8371#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 557 fasta sequence [CGGGAATTCTATTCCATTTCAACGAAGTTATCGTCACAAACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGTGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACAGGCAAAAGTATGT-TTGTGTGGCAGATAGGTACACATATACACAGATTGATAAATTGTATATTTGTTAACCAATTGTCAGCTGTTTTGACTCTCTCCCTCTCTTGATTTCTTTCTCTCTTAACACATAACACAAATAATACAGATATACACGAAAACAAAATTGATTAGGTTATAATAGTAGAAATTGTCTTTTGACATCAATTCTCACAATTTACATTGCCGTCAACACTGTTGGTATTATTGACTAAAGTAGGCGATTGTGATTTTAGCAACGAATTATTATCATTATTATCCTCAACGATAGGAGTAGTAGTCAAATCATTGACAATACTAAGCGACGACAAAGACTGATCATCAATAATACAATGATTGTTTAGTTCAGATGGTGATGATGACGATGATGATGATGAATT] [+] EMBL CD090640 [CGGGAATTCTATTCCATTTCAACGAAGTTATCGTCACAAACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGTGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACAGGCTCCATTATGT TTGTGTGGCNTATTGGTGCACATATACACAGATTGATAAATTGTATATTTGTTAACCATTTGTCAGCTGTTTTGACTCTCTCCCTCTCTTGATTTCTTTCTCTCTTACCCCATANCACANATAATACAG ] [+] EMBL CD090656 [ ACGAAGTTATCGTCACAAACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGTGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACATGCAAAAGTATGTCNNGAGTGGCAGATAGGGACACATATACACAGATTGATAAATTGTATATTTGTTAACCAATTGNCAGCAGNAAAGACTCTCTCCCTCTCTAGATNNCNGTCTCTCTTAACACATAACACA ] [+] EMBL CD090646 [ AACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGTGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACAGGCAAAAGTATGT TTGTGTGGCAGATAGGTACACATATACACAGATNGATAAATTGTATATTTGTTAACCAATTGTCATCTGTNNTGACTCTCTCCCTCCCTTGATTTCTTTCTCTCTTAACACATAACACAAATAATACTTTTATTCTCTAAAACAAAATTGATTATGTTATAATAGCAGAAATTGCCTTTTGACATCAATTCTCACAATTTACATTGCCGTCAACACTGTTGGTATTATTGACTAAAGCANGCGATTGTGATTTTAGC TTTTTTTATTATCATTATTATCCTCATCGATAGGAGTAGTAGTCAAATCATTGACAATACTAAGCGACGACAAAGACTGATTATCAATAATACAATGATTGTTNAGTTCAGATGGTGACGATGACTATGATGATGATGAATT] [+] EMBL CD090659 [ AACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGCGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACTGGCAAAAGTATGT TTGTGTGGCAGATAGGTACACATATACACAGATTGATAAATTGTATATTTGTTAACCAATTGTCAGCTGTTTTGACTCTCTCCCTCTCTTGATTTCTTTCTCTCTTAACACATAACACAAATAATACAGATATACACGAAAACAAAATTGATTAGGTTATAATAGTAGAAATTGTCTTTTGACATCAATTCTCACAATTTACATTGCCGTCAACACTGTTGGTATTATTGACTAAAGTAGGCGATTGTGATTTTAGCAGCGAATTATTATCATTATTATCCTCAACGATAGGAGTAGTAGTCAAATCATTGACAATACTAAGCGACGACAAAGACTGATCATCAATAATACAATGATTGTTTAGTTCAGATGGTGATGATGACGATGATGATGATGAAT ] [+] EMBL CD090665 [ AACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGTGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACATGCAAAAGTATGT TTGTGTGGCAGATAGGTACACATATACACAGATTGATAAATTGTATATTTGTTAACCAATTGTCAGCTGTTTTGACTCTCTCCCTCTCTTGATTTCTTTCTCTCTTAACACATAACACAAATAATACAGATATACACGAAAACAAAATTGATTAGGTTATAATAGTAGAAATTGTCTTTTGACATCAATTCTCACAATTTACATTGCCGTCAACACTGTTGGTATTATTGACTAAAGTAGGCGATTGTGATTTTAGCAACGAATTATTATCATTATTATCCTCAACGATAGGAGTAGTAGTCAAATCATTGACAATACTAAGCGACGACAAAGACTGATCATCAATAATACAATGATTGTTTAGTTCAGATGGTGATGATGACGATGATGATGATGAAT ] [-] EMBL CD090618 [ ACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGTGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACAGGCAAAAGTATGT TTGTGTGGCAGATAGGTGCACATATACACAGATTGATAAATTGTATATTTGTTAACCAATTGTCAGCTGTTTTGACTCTCTCCCTCTCTTGATTTCTTTCTCTCTTAACACATAACACAAATAATACAGATATACACGAAAACAAAATTGATTAGGTTATAATAGTAGAAATTGTCTTTTGACATCAATTCTCACAATTTACATTGCCGTCAACACTGTTGGTATTATTGACTAAAGTAGGCGATTGTGATTTTAGCAACGAATTATTATCATTATTATCCTCAACGATAGGAGTAGTAGTCAAATCATTGACAATACTAAGCGACGACAAAGACTGATCATCAATAATACAATGATTGTTTAGTTCAGATGGTGATGATGACGATGATGATGATGAATT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||