cluster # 839

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Schistosoma mansoni
cluster # 839 cluster # 839 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_839#0 length = 987 sequences # 2

consensusID : consensus_839#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 987
fasta sequence

                              [CTCGAGCCATATTCGGCACGAGGCTTTGTGTACCGGGGGTTTAAATCACCATGCTTAATGTTGTTAACGCATTCTGTTTTCTTTCCATTGCAGCGCGACCAAGGATAAACGCTTCGGAAGAAGAAGAAGGGCAAGCCCTGCATGCACTGAACTTACAAGGTGACTCATAGGACTATTTTGTAAACCAGCTATTATTTCTGTTTATGGCCCGCGAATTTCAATTTCGAAAACAAAAGACTCGTGGCTTCCATTCCGTGTTCTCTCTTAATGTGAAGTTCTCGGTTAATATTGTGTGTTGTGGTTTCAGGTCTTCTCCACCTTTTTGTGACTGTTGACAACATATGTTACATTTGTCTTCGGTTTGGTGTTTGGAGGCTTTTGCTCCGCAAACCTAACAAGCTGAATGTTTGTTTTGTAATCGTTCTATTGTTGTTCTATTGTTATTTTGGGTTCGTAAGTTACAAGTAGATCGACATACCGGGCTTTATTAACGAAAGAGAGCAAAAATTTGGACATAATATAAAGTTTCTTAATTTTTGGTCCTGTATGCTTTACATTTTGGATTTATTTAAACGTTCATTTTGGATCCGATTTCGGTCCTATCTGTCGATTTCATTTGTCGGCCTGCTTGAACCTCTGGGCTGAATGCTTCTGCCCTCTGGATATTTCAACAAGTTATCTGTTTTGCCTGATTTAAAACATCATTATGTTTGTTAATCGCACAACTTATTAAGGTGTGTTTAGGAAACGTTTACAACCTTCCGTTGTAAACGTTGCANAAATGTCCAATCAGGACATCGTGGTTGTTGACAATATGCAATGAAAAGTGTGTTTACGATTCAGATGTCAACTTTTGAGCTGCTAACTTCTAGCTGACCACCACCCATCATTTGTCGTCAGGATCGACCAAG-AATAAGAATCGAANACTTGTTGAAA-ATATTTGTGCTGAGAG-TTTATAGTGTACC-AAAATATGANTAT-AATAAAGCT]

[+] EMBL CD081606             [CTCGAGCCATATTCGGCACGAGGCTTTGTGTACCGGGGGTTTAAATCACCATGCTTAATGTTGTTAACGCATTCTGTTTTCTTTCCATTGCAGCGCGACCAAGGATAAACGCTTCGGAAGAAGAAGAAGGGCAAGCCCTGCATGCACTGAACTTACAAGGTGACTCATAGGACTATTTTGTAAACCAGCTATTATTTCTGTTTATGGCCCGCGAATTTCAATTTCGAAAACAAAAGACTCGTGGCTTCCATTCCGTGTTCTCTCTTAATGTGAAGTTCTCGGTTAATATTGTGTGTTGTGGTTTCAGGTCTTCTCCACCTTTTTGTGACTGTTGACAACATATGTTACATTTGTCTTCGGTTTGGTGTTTGGAGGCTTTTGCTCCGCAAACCTAACAAGCTGAATGTTTGTTTTGTAATCGTTCTATTGTTGTTCTATTGTTATTTTGGGTTCGTAAGTTACAAGTAGATCGACATACCGGGCTTTATTAACGAAAGAGAGCAAAAATTTGGACATAATATAAAGTTTCTTAATTTTTGGTCCTGTATGCTTTACATTTTGGATTTATTTAAACGTTCATTTTGGATCCGATTTCGGTCCTATCTGTCGATTTCATTTGTCGGCCTGCTTGAACCTCTGGGCTGAATGCTTCTGCCCTCTGGATATTTCAACAAGTTATCTGTTTTGCCTGATTTAAAACATCATTATGTTTGTTAATCGCACAACTTATTAAGGTGTGTTTAGGAAACGTTTACAACCTTCCGTTGTAAACGTTGCANAAATGTCCAATCAGGACATCGTGGTTGTTGACAATATGCAATGAAAAGTGTGTTTACGATTCAGATGTCAACTTTTGAGCTGCTAACTTCTAGCTGACCACCACCCATCATTTGTCGTCAGGATCGACCAAG AATAAGAATCGAANACTTGTTGAAA ATATTTGTGCTGAGAG TTTATAGTGTACC AAAATATGANTAT AATAAAG  ]
[-] EMBL CD075429             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCCGCAAACCTAACAAGCTGAATGTTTGTTTTGTAATCGTTCTATTGTTGTTCTATTGTTATTTTGGGTTCGTAAGTTACAAGTAGATCGACATACCGGGCTTTATTAACGAAAGAGAGCAAAAATTTGGACATAATATAAAGTTTCTTAATTTTTGGTCCTGTATGCTTTACATTTTGGATTTATTTAAACGTTCATTTTGGATCCGATTTCGGTCCTATCTGTCGATTTCATTTGTCGGCCTGCTTGAACCTCTGGGCTGAATGCTTCTGCCCTCTGGATATTTCAACAAGTTATCTGTTTTGCCTGATTTAAAACATCATTATGTTTGTTAATCGCACAACTTATTAAGGTGTGTTTAGGAAACGTTTACAACCTTCCGTTGTAAACGTTGCAAAAATGTCCAATCAGGACATCGTGGTTGTTGACAATATGCAATGAAAAGTGTGTTTACGATTCAGATGTCAACTTTTGAGCTGCTAACTTCTAGCTGACCACCACCCATCATTTGTCGTCAGGATCGACCAAGAAATAAGAATCGAAAACTTGTTGAAATAT TTTGTGCTGAGAGTTTTATAGTGTACCAAAAATATGATAATAAATAAAGCT]




>consensus_839#0
CTCGAGCCATATTCGGCACGAGGCTTTGTGTACCGGGGGTTTAAATCACCATGCTTAATG
TTGTTAACGCATTCTGTTTTCTTTCCATTGCAGCGCGACCAAGGATAAACGCTTCGGAAG
AAGAAGAAGGGCAAGCCCTGCATGCACTGAACTTACAAGGTGACTCATAGGACTATTTTG
TAAACCAGCTATTATTTCTGTTTATGGCCCGCGAATTTCAATTTCGAAAACAAAAGACTC
GTGGCTTCCATTCCGTGTTCTCTCTTAATGTGAAGTTCTCGGTTAATATTGTGTGTTGTG
GTTTCAGGTCTTCTCCACCTTTTTGTGACTGTTGACAACATATGTTACATTTGTCTTCGG
TTTGGTGTTTGGAGGCTTTTGCTCCGCAAACCTAACAAGCTGAATGTTTGTTTTGTAATC
GTTCTATTGTTGTTCTATTGTTATTTTGGGTTCGTAAGTTACAAGTAGATCGACATACCG
GGCTTTATTAACGAAAGAGAGCAAAAATTTGGACATAATATAAAGTTTCTTAATTTTTGG
TCCTGTATGCTTTACATTTTGGATTTATTTAAACGTTCATTTTGGATCCGATTTCGGTCC
TATCTGTCGATTTCATTTGTCGGCCTGCTTGAACCTCTGGGCTGAATGCTTCTGCCCTCT
GGATATTTCAACAAGTTATCTGTTTTGCCTGATTTAAAACATCATTATGTTTGTTAATCG
CACAACTTATTAAGGTGTGTTTAGGAAACGTTTACAACCTTCCGTTGTAAACGTTGCANA
AATGTCCAATCAGGACATCGTGGTTGTTGACAATATGCAATGAAAAGTGTGTTTACGATT
CAGATGTCAACTTTTGAGCTGCTAACTTCTAGCTGACCACCACCCATCATTTGTCGTCAG
GATCGACCAAGAATAAGAATCGAANACTTGTTGAAAATATTTGTGCTGAGAGTTTATAGT
GTACCAAAATATGANTATAATAAAGCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case