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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8409#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1171 fasta sequence
[GGATGTGACGGACTTTTATCCAGCTATTTGTCTTGTAAAACTCGTTATGTCGCTGGATCCAAGCAAGGAAGTCCTCGTTAAGCCATCAAACATATTTTTTCACTATTCAACTGAAGGCACTTGCAACACATGCCAAGTGTTGATTGTTAATAAATCAGCAAGAATACTACGCTTCAAAGTTTTATCTACAGCACGTTCCAAGTATTTACTATCAGTATGCAAGGGCGTTTTAAAGTCTGGTGAATTTGTTGAAACAGATATTTCAGTTTCCGGAGTTTCAATAACGGATGATACAAAGGACTTTTTCAAGATCCAGTTTTTCGATTCATACGATGGCTCCGCTTTTTGCGAGCACTATATATGTTCAACTATTGCACGTAACCCGTCTCATAATGTTGCCATTCAAGATTCAGACTCATGCAGCACCTGGCCCAGTCGTTATCATGATGTTGGTTTGTCTACCTCAAGCTTAAGAACAGCATCTTTATCACGAGCTTTTGGAAGCCTTATTGGGTCAGAAAAGCGCCCTATTGCCTCTAAAACATACTCATCATTGGATCGTACGAAATGTGTGGGTCTCTCCAACGTATTCTCTACAGTCAAAGCACATAAAAATAGATCGAATTCAAGTACGTTAACAATCTGTCGTGGCACCAGTGATAGTCAATCAGAAAACTCCAGAACAAGCATCATTCTGCTTCATAATCTACTTTATAATTCCTTATTTATTCTAAGTTTGATTGTTTGTTTATTTGGAATTTTATTACCGTTCCTTCCATATGATTGTAAATTATGGTTATTGTCAAAAGTACTTCATGAGCGATGGAAGATTAATTATATTACCACTACTCCAAGTTCATTGACTTCTCCATATCATTCACAAAACGTTCATGACCATTCTCAATCTTATAAGCAAAGTTCTGGGGCCACTTATTCATCGACAACTGAATGTCCTACAGGGGAAAATCCACCAAAAGATGAGTTTAATCGTCACACTCGTCTGGCATTTTTTGCTTTCAAGAGTGCATTGCGTAGTATTTGCAGAGCAATAATTGCTTTAGATCCGTTAGTCGCAGTCGCTAATATGTCATGGTTTTGCTTAGGTTTGTTACTTATGTATCATTGGATAAAAAGAAAGTANAGCCGAAC-AGAAATGCACAACTGATACCTT]
[+] EMBL AI975503 [GGATGTGACGGACTTTTATCCAGCTATTTGTCTTGTAAAACTCGTTATGTCGCTGGATCCAAGCAAGGAAGTCCTCGTTAAGCCATCAAACATATTTTTTCACTATTCAACTGAAGGCACTTGCAACACATGCCAAGTGTTGATTGTTAATAAATCAGCAAGAATACTACGCTTCAAAGTTTTATCTACAGCACGTTCCAAGTATTTACTATCAGTATGCAAGGGCGTTTTAAAGTCTGGTGAATTTGTTGAAACAGATATTTCAGTTTCCGGAGTTTCAATAACGGATGATACAAAGGACTTTTTCAAGATCCAGTTTTTCGATTCATACGATGGCTCCGCTTTTTGCGAGCACTATATATGTTCAACTATTGCACGTAACCCGTCTCATAATGTTGCCATTCAAGATTCAGACTCATGCAGCACCTGGCCCAGTCGTTATCATGATGTTGGTTTGTCTACCTCAAGCTTAAGAACAGCATCTTTATCACGAGCTTTTGGAAGCCTTATTGGGTCAGAAAAGCGCCCTATTGCCTCTAAAACATACTCATCATTGGATCGTACGAAATGTGTGGGTCTCTCCAACGTATTCTCTACAGTCAAAGCACATAAAAATAGATCGAATTCAAGTACGTTAACAATCTGTCGTGGCACCAGTGATAGTCAA ]
[+] EMBL BF936128 [GGATGTGACGGACTTTTATCCAGCTATTTGTCTTGTAAAACTCGTTATGTCGCTGGATCCAAGCAAGGAAGTCCTCGTTAAGCCATCAAACATATTTTTTCACTATTCAACTGAAGGCACTTGCAACACATGCCAAGTGTTGATTGTTAATAAATCAGCAAGAATACTACGCTTCAAAGTTTTATCTACAGCACGTTCCAAGTATTTACTATCAGTATGCAAGGGCGTTTTAAAGTCTGGTGAATTTGTTGAAACAGATATTTCAGTTTCCGGAGTTTCAATAACGGATGATACAAAGGACTTTTTCAAGATCCAGTTTTTCGATTCATACGATGGCTCCGCTTTTTGCGAGCACTATATATGTTCAACTATTGCACGTAACCCGTCTCATAATGTTGCCATTCAAGATTCAGACTCATGCAGCACCTGGCCCAGTCGTTATTATGATGTTG ]
[-] EMBL CD157630 [ CACTTGCAACACATGCCAAGTGTTGATTGTTAATAAATCAGCAAGAATACTACGCTTCAAAGTTTTATCTACAGCACGTTCCAAGTATTTACTATCAGTATGCAAGGGCGTTTTAAAGTCTGGTGAATTTGTTGAAACAGATATTTCAGTTTCCGGAGTTTCAATAACGGATGATACAAAGGACTTTTTCAAGATCCAGTTTTTCGATTCATACGATGGCTCCGCTTTTTGCGAGCACTATATATGTTCA ]
[-] EMBL CD178414 [ GTCTGGTG ATTTGTTGAAACAGATATTTCAGTTTCCGGAGTTTCAATAACGGATGATACAAAGGACTTTTTCAAGATCCAGTTTNTCGATTCATACGATGGCTCCGCTTTTTGCGAGCACTATATATGTTCAACTATTGCACGTAACCCGTCTCATAATGTTGCCATTCAAGATTCAGACTCATGCAGCACCTGGCCCAGTCGTTATCATGATGTTGGTTTGTCTACCTCAAGCTTAAGAACAGCATCTTTATCACGAGCTTTTGGAAGCCTTATTGGGTCAGAAAAGCGCCCTATTGCCTCTAAAACATACTCATCATTGGATCGTACGAAATGTGTGGGTCTCTCCAACGTATTCTCTACAGTCAAAGCACATAAAAATAGATCGAATTCAAGTACGTTAACAATCTGTCGTGGCACCAGTGATAGTCAATCAGAAAACTCCAGAACAAGCATCATTCTGCTTCATAATCTACTTTATAATTCCTTATTTATTCTAAGTTTGATTGTTTGTTTATTTGGAATTTTATTACCGT ]
[+] EMBL CD201363 [ ACGTTAACAATCTGTCGTGGCACCAGTGATAGTCAATCAGAAAACTCCAGAACAAGCATCATTCTGCTTCATAATCTACTTTATAATTCCTTATTTATTCTAAGTTTGATTGTTTGTTTATTTGGAATTTTATTACCGTTCCTTCCATATGATTGTAAATTATGGTTATTGTCAAAAGTACTTCATGAGCGATGGAAGATTAATTATATTACCACTACTCCAAGTTCATTGACTTCTCCATATCATTCACAAAACGTTCATGACCATTCTCAATCTTATAAGCAAAGTTCTGGGGCCACTTATTCATCGACAACTGAATGTCCTACAGGGGAAAATCCACCAAAAGATGAGTTTAATCGTCACACTCGTCTGGCATTTTTTGCTTTCAAGAGTGCATTGCGTAGTATTTGCAGAGCAATAATTGCTTTAGATCCGTTAGTCGCAGTCGCTAATATGTCATGGTTTTGCTTAGGTTTGTTACTTATGTATCATTGGATAAAAAGAAAGTANAGCCGAAC AGAAATGCACAACTGATAC ]
[+] EMBL CD192485 [ ATTGCGTAGTATTTGCAGAGCAATAATTGCTTTAGATCCGTTAGTCGCAGTCGCTAATATGTCATGGTTTTGCTTAGGTTTGTTACTTATGTATCATTGGATAAAAAGAAGGTAAAGCCGAACAAGAAATGCACAACTGATACCTT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||