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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8410#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1110 fasta sequence
[AAGAATTTATTTTATAAGAATGAACCAAATGGAATTTAAACATGAGATTTCTGGTTAATGATCAAAATTACAAGGAATACACAAAATAGATTGTAAACATGGTATAGTGAAAGTATTAAACATTGAATGAATCTTATCCAAATGAAATCACGAAAAACCAAGTTAATAATGAAGATTACATTTAAATATGTGGTATCAATGTACATCATATATTTTGATTATACAATAACTAAGATTAGTTCCATCATTATAAATTTTCATACACAGAAACTACTGATATATGAAATAAGTAATAAAAAAATTATGCAAGAATATTTTGGACGATGACAATGATAATTAGAATTACCAAAGATGTTAAATTCCACAGATATAATAGTATATACTGAAATCTTTATA-AATGATGATCTTTTGAATGATGTAGTTGAGTGAGTGGAATATACACAATTTGAATGTACACCAGTTGATGAGAAAAATAAACAGACAACGATGAGTATGCACTATGAACGACGTGATCAACAGTATACCTGGTGTGACAAAATCAAAGCTATTTATTTATCTGTCTATCTAGTACAAAGTAACTTTGCCATCATTCTTTCCTGATAATAATGTGTATGTGTGTGTATGGGTGTACGATGGTTTTCAAATTATAGTTCAATTATTCACTACGTGATCCATGGGCATGGAGATTATTACGATTCGGATGGTTGATAGTATGAGGACGACTTGATGACATGGCCAAATTTAATTTTGGACCTAAATAACTAAGATACACAGGTAATATAATAAGTCCTGTGAATGCCCCAAACAATATCATAGATAAATACATACGAAAATAGAAAATTTGAAATAGACGTGATTTTGATGCAGCTAAAACAACAATACCTCCAAGTTTAGTCAATGTGATACCACGAAGGATAGAACTACCCATTTCACTAAGAGATTCCTTAGCTCGTTCCACTCGAGTTGGTAATACACTGATTGTAAATGAACGAACTATATGTGCACAAGACTCAACAGATATACCTAAAGCCACAACTAAATTGACTAAAGATAATGCATTCGAGGTGATAGACCATAGAGCCATAACGGCTGATACACTAATCACAATAT]
[+] EMBL CD077113 [AAGAATTTATTTTATAAGAATGAACCAAATGGAATTTAAACATGAGATTTCTGGTTAATGATCAAAATTACAAGGAATACACAAAATAGATTGTAAACATGGTATAGTGAAAGTATTAAACATTGAATGAATCTTATCCAAATGAAATCACGAAAAACCAAGTTAATAATGAAGATTACATTTAAATATGTGGTATCAATGTACATCATATATTTTGATTATACAATAACTAAGATTAGTTCCATCATTATAAATTTTCATACACAGAAACTACTGATATATGAAATAAGTAATAAAAAAATTATGCAAGAATATTTTGGACGATGACAATGATAATTAGAATTACCAAAGATGTTAAATTCCACAGATATAATAGTATATACTGAAATCTTTATA AATGATGATCTTTTGAATGATGTAGTTGAGTGAGTGGAATATACACAATTTGAATGTACACCAGTTGATGAGAAAAATAAACAGACAACGATGAGTATGCACTATGAACGACGTGATCAACAGTATACCTGGTGTGACAAAATCAAAGCTATTTATTTATCTGTCTATCTAGTACAAAGTAACTTTGCCATCATTCTTTCCTGATAATAATGTGTATGTGTGTGTATGGGTGTACGATGGTTTTCAAATTATAGTTCAATTATTCACTACGTGATCCATGGGCATGGAG ]
[+] EMBL CD073207 [AAGAATTTATTTTATAAGAATGAACCAAATGGAATTTAAACATGAGATTTCTGGTTAATGATCAAAATTACAAGGAATACACAAAATAGATTGTAAACATGGTATAGTGAAAGTATTAAACATTGAATGAATCTTATCCAAATGAAATCACGAAAAACCAAGTTAATAATGAAGATTACATTTAAATATGTGGTATCAATGTACATCATATATTTTGATTATACAATAACTAAGATTAGTTCCATCATTATAAATTTTCATACACAGAAACTACTGATATATGAAATAAGTAATAAAAAAATTATGCAAGAATATTTTGGACGATGACAATGATAATTAGAATTACCAAAGATGTTAAATTCCACAGATATAATAGTATATACTGAAATCTTTATA AATGATGATCTTTTGAATGATGTAGTTGAGTGAGTGGAATATACACAATTTGAATGTACACCAGTTGATGAAAAAAATAAACAGACAACGATGAGTATGCACTATGAACGACGTGATCAACAGTATACGTGGTGTGACAAAATCAAA ]
[-] EMBL CD078747 [ aaTACCAAAGATG TAAATTCCNCAGATATAATAGTATATACTGAAATCTTTATA AATGATGATCTTNTGAATGATGTAGTTGAGTGAGTGGAATATACACAATTTGAATGTACACCAGTTGATGAAAAAAATAAACAGACAACGATGAGTATGCACTATGAACGACGTGATCAACAGTATACGTGGTGTGACAAAATCAAAGCTATTTATTTATCTGTCTATCTAGTACAAAGTAACTTTGCCATCATTCTTTCCTGATAATAATGTGTATGTGTGTGTATGGGTGTACGATGGTTTTCAAGTTATAGTTCAATTATTCACTACGTGATCCATGGGCACGGAGATTATTACGATTCGGATGGTTGATAGTATGAGGACGACTTGATGACATGGCCAAATTTAATTTTGGACCTAAATAACTAAGATACACAGGTAATATAATAAGTCCTGTGAATGCCCCAAACAATATCATAGATAAATACATACGAAAATAGAAAATTTGAAATAGACGTGATTTTGATGCAGCTAAAACAACAATACCTCCAAGTTTAGTCAATGTGATACCACGAAGGATAGAACTACCCATTTCACTAAGAGATTCCTTAGCTCGTTCC ]
[-] EMBL CD079249 [ TAAATTCCACAGATATAATAGTATATACTGAAATC TTACAGAATGATGATCTTNTGAATGATGTAGTTGAGTGAGTGGAATATACACAATTTGAATGTACACCAGTTGATGAGAAAAATAAACAGACAACGATGAGTATGCACTATGAACGACGTGATCAACAGTATACCTGGTGTGACAAAATCAAAGCTATTTATTTATCTGTCTATCTAGTACAAAGTAACTTTGCCATCATTCTTTCCTGATAATAATGTGTATGTGTGTGTATGGGTGTACGATGGTTTTCAAATTATAGTTCAATTATTCACTACGTGATCCATGGGCATGGAGATTATTACGATTCGGATGGTTGATATTATGAGGACGACATGATGACATGGCCAAATTTAATTTTGGACCTAAATAACTAAGATACACAGGTAATATAATAAGTCCTGTGAATGCCCCAAACAATATCATAGATAAATACATACGAAAATAGAAAATTTGAAATAAACGTGATTTTGATGCAGCTAAAACAACAATACCTCCAAGTTTAGTCAATGTGATACCACGAAGGATAGAACTACCCATTTCACTAAGAGATTCCT ]
[-] EMBL AI110991 [ ATGGGCACGGAGATTATTANGATTCGGATNGTNGATAGTATGAGGANGACTTGATGACATGGCCAAATTTAATTTTGGACCTAAATAACTAAGATACACAGGTNATATAATAAGTCCTGTGAATGCCCCANACAATATCATAGATAAATACATACGAAAATAGNAAATTTGAAATAGANGTGATTTTGATGCAGCTAAAACAACAATACCTCCAAGTTTAGTCAATGTGATACCACGAAGGATAGAACT ]
[+] EMBL CD168893 [ ATTTTGGACCTAAATAACTAAGATACACAGGTAATATAATAAGTCCTGTGAATGCCCCAAACAATATCATAGATAAATACATACGAAAATAGAAAATTTGAAATAAACGTGATTTTGATGCAGCTAAAACAACAATACCTCCAAGTTTAGTCAATGTGATACCACGAAGGATAGAACTACCCATTTCACTAAGAGATTCCTTAGCTCGTTCCACTCGAGTTGGTAATACACTGATTGTAAATGAACGAACTATATGTGCACAAGACTCAACAGATATACCTAAAGCCACAACTAAATTGACTAAAGATAATGCATTCGAGGTGATAGACCATAGAGCCATAACGGCTGATACACTAATCACAATAT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||