These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8410#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1110 fasta sequence [AAGAATTTATTTTATAAGAATGAACCAAATGGAATTTAAACATGAGATTTCTGGTTAATGATCAAAATTACAAGGAATACACAAAATAGATTGTAAACATGGTATAGTGAAAGTATTAAACATTGAATGAATCTTATCCAAATGAAATCACGAAAAACCAAGTTAATAATGAAGATTACATTTAAATATGTGGTATCAATGTACATCATATATTTTGATTATACAATAACTAAGATTAGTTCCATCATTATAAATTTTCATACACAGAAACTACTGATATATGAAATAAGTAATAAAAAAATTATGCAAGAATATTTTGGACGATGACAATGATAATTAGAATTACCAAAGATGTTAAATTCCACAGATATAATAGTATATACTGAAATCTTTATA-AATGATGATCTTTTGAATGATGTAGTTGAGTGAGTGGAATATACACAATTTGAATGTACACCAGTTGATGAGAAAAATAAACAGACAACGATGAGTATGCACTATGAACGACGTGATCAACAGTATACCTGGTGTGACAAAATCAAAGCTATTTATTTATCTGTCTATCTAGTACAAAGTAACTTTGCCATCATTCTTTCCTGATAATAATGTGTATGTGTGTGTATGGGTGTACGATGGTTTTCAAATTATAGTTCAATTATTCACTACGTGATCCATGGGCATGGAGATTATTACGATTCGGATGGTTGATAGTATGAGGACGACTTGATGACATGGCCAAATTTAATTTTGGACCTAAATAACTAAGATACACAGGTAATATAATAAGTCCTGTGAATGCCCCAAACAATATCATAGATAAATACATACGAAAATAGAAAATTTGAAATAGACGTGATTTTGATGCAGCTAAAACAACAATACCTCCAAGTTTAGTCAATGTGATACCACGAAGGATAGAACTACCCATTTCACTAAGAGATTCCTTAGCTCGTTCCACTCGAGTTGGTAATACACTGATTGTAAATGAACGAACTATATGTGCACAAGACTCAACAGATATACCTAAAGCCACAACTAAATTGACTAAAGATAATGCATTCGAGGTGATAGACCATAGAGCCATAACGGCTGATACACTAATCACAATAT] [+] EMBL CD077113 [AAGAATTTATTTTATAAGAATGAACCAAATGGAATTTAAACATGAGATTTCTGGTTAATGATCAAAATTACAAGGAATACACAAAATAGATTGTAAACATGGTATAGTGAAAGTATTAAACATTGAATGAATCTTATCCAAATGAAATCACGAAAAACCAAGTTAATAATGAAGATTACATTTAAATATGTGGTATCAATGTACATCATATATTTTGATTATACAATAACTAAGATTAGTTCCATCATTATAAATTTTCATACACAGAAACTACTGATATATGAAATAAGTAATAAAAAAATTATGCAAGAATATTTTGGACGATGACAATGATAATTAGAATTACCAAAGATGTTAAATTCCACAGATATAATAGTATATACTGAAATCTTTATA AATGATGATCTTTTGAATGATGTAGTTGAGTGAGTGGAATATACACAATTTGAATGTACACCAGTTGATGAGAAAAATAAACAGACAACGATGAGTATGCACTATGAACGACGTGATCAACAGTATACCTGGTGTGACAAAATCAAAGCTATTTATTTATCTGTCTATCTAGTACAAAGTAACTTTGCCATCATTCTTTCCTGATAATAATGTGTATGTGTGTGTATGGGTGTACGATGGTTTTCAAATTATAGTTCAATTATTCACTACGTGATCCATGGGCATGGAG ] [+] EMBL CD073207 [AAGAATTTATTTTATAAGAATGAACCAAATGGAATTTAAACATGAGATTTCTGGTTAATGATCAAAATTACAAGGAATACACAAAATAGATTGTAAACATGGTATAGTGAAAGTATTAAACATTGAATGAATCTTATCCAAATGAAATCACGAAAAACCAAGTTAATAATGAAGATTACATTTAAATATGTGGTATCAATGTACATCATATATTTTGATTATACAATAACTAAGATTAGTTCCATCATTATAAATTTTCATACACAGAAACTACTGATATATGAAATAAGTAATAAAAAAATTATGCAAGAATATTTTGGACGATGACAATGATAATTAGAATTACCAAAGATGTTAAATTCCACAGATATAATAGTATATACTGAAATCTTTATA AATGATGATCTTTTGAATGATGTAGTTGAGTGAGTGGAATATACACAATTTGAATGTACACCAGTTGATGAAAAAAATAAACAGACAACGATGAGTATGCACTATGAACGACGTGATCAACAGTATACGTGGTGTGACAAAATCAAA ] [-] EMBL CD078747 [ aaTACCAAAGATG TAAATTCCNCAGATATAATAGTATATACTGAAATCTTTATA AATGATGATCTTNTGAATGATGTAGTTGAGTGAGTGGAATATACACAATTTGAATGTACACCAGTTGATGAAAAAAATAAACAGACAACGATGAGTATGCACTATGAACGACGTGATCAACAGTATACGTGGTGTGACAAAATCAAAGCTATTTATTTATCTGTCTATCTAGTACAAAGTAACTTTGCCATCATTCTTTCCTGATAATAATGTGTATGTGTGTGTATGGGTGTACGATGGTTTTCAAGTTATAGTTCAATTATTCACTACGTGATCCATGGGCACGGAGATTATTACGATTCGGATGGTTGATAGTATGAGGACGACTTGATGACATGGCCAAATTTAATTTTGGACCTAAATAACTAAGATACACAGGTAATATAATAAGTCCTGTGAATGCCCCAAACAATATCATAGATAAATACATACGAAAATAGAAAATTTGAAATAGACGTGATTTTGATGCAGCTAAAACAACAATACCTCCAAGTTTAGTCAATGTGATACCACGAAGGATAGAACTACCCATTTCACTAAGAGATTCCTTAGCTCGTTCC ] [-] EMBL CD079249 [ TAAATTCCACAGATATAATAGTATATACTGAAATC TTACAGAATGATGATCTTNTGAATGATGTAGTTGAGTGAGTGGAATATACACAATTTGAATGTACACCAGTTGATGAGAAAAATAAACAGACAACGATGAGTATGCACTATGAACGACGTGATCAACAGTATACCTGGTGTGACAAAATCAAAGCTATTTATTTATCTGTCTATCTAGTACAAAGTAACTTTGCCATCATTCTTTCCTGATAATAATGTGTATGTGTGTGTATGGGTGTACGATGGTTTTCAAATTATAGTTCAATTATTCACTACGTGATCCATGGGCATGGAGATTATTACGATTCGGATGGTTGATATTATGAGGACGACATGATGACATGGCCAAATTTAATTTTGGACCTAAATAACTAAGATACACAGGTAATATAATAAGTCCTGTGAATGCCCCAAACAATATCATAGATAAATACATACGAAAATAGAAAATTTGAAATAAACGTGATTTTGATGCAGCTAAAACAACAATACCTCCAAGTTTAGTCAATGTGATACCACGAAGGATAGAACTACCCATTTCACTAAGAGATTCCT ] [-] EMBL AI110991 [ ATGGGCACGGAGATTATTANGATTCGGATNGTNGATAGTATGAGGANGACTTGATGACATGGCCAAATTTAATTTTGGACCTAAATAACTAAGATACACAGGTNATATAATAAGTCCTGTGAATGCCCCANACAATATCATAGATAAATACATACGAAAATAGNAAATTTGAAATAGANGTGATTTTGATGCAGCTAAAACAACAATACCTCCAAGTTTAGTCAATGTGATACCACGAAGGATAGAACT ] [+] EMBL CD168893 [ ATTTTGGACCTAAATAACTAAGATACACAGGTAATATAATAAGTCCTGTGAATGCCCCAAACAATATCATAGATAAATACATACGAAAATAGAAAATTTGAAATAAACGTGATTTTGATGCAGCTAAAACAACAATACCTCCAAGTTTAGTCAATGTGATACCACGAAGGATAGAACTACCCATTTCACTAAGAGATTCCTTAGCTCGTTCCACTCGAGTTGGTAATACACTGATTGTAAATGAACGAACTATATGTGCACAAGACTCAACAGATATACCTAAAGCCACAACTAAATTGACTAAAGATAATGCATTCGAGGTGATAGACCATAGAGCCATAACGGCTGATACACTAATCACAATAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||