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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8438#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 776 fasta sequence
[TCCATATAAAGGACATGGTGCACCTCTTACAGCCATCTCTACTCATCCAAGTCCTGGTGCTTTTAGTTTTTCATCGCTATTTCTCACTGCATCATTAGATTGGACTGTACGTTTATGGTCTACACGTGAACATAAACCTATACATACATTTGATGATTATTCGGATTATGCGTATGATGTATGCTGGAGTCCTGTACATCCAGCTGTATTTTCTGCTGTTGATGGTACTGGAAATTTAGATATATGGGATATGAATCAAGATGCTGAAATTCCTGTGGCTCGCCGCAAATTAGGATTATCAAGCAATGTAGACACATCTTCATCGTCATCATCGAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAAGTCTTTCTCAGCCTGTCACTGATGATTGGTCTAGTTTCGCACATGTATTAGCTGATCTTAAACACTATGAAATGGAACCAGAAGTAGAAACAGAAGCATAATCTTGGTTAAAGGCCTAATTTTCTCTGTTTTTTGTATTTCTATGAATCATACATACCTCTTCTATGTAACACCAATCAGCTTCAATTTTATTTTACGTTGTTTTGAGAATTGAAGTTGCATTTGTAAGTTGACATATTTGGTTTTCATGAAAATTAATAAAGTACTTCAGTATAGGAGTCCCGCTTAAAAATAACAACTTTAAAAGGCTGTGTTGGGTTCCCTTATTTTCTTTTT]
[-] EMBL CD160157 [TCCATATAAAGGACATGGTGCACCTCTTACAGCCATCTCTACTCATCCAAGTCCTGGTGCTTTTAGTTTTTCATCGCTATTTCTCACTGCATCATTAGATTGGACTGTACGTTTATGGTCTACACGTGAACATAAACCTATACATACATTTGATGATTATTCGGATTATGCGTATGATGTATGCTGGAGTCCTGTACATCCAGCTGTATTTTCTGCTGTTGATGGTACTGGAAATTTAGATATATGGGATATGAATCAAGATGCTGAAATTCCTGTGGCTCGCCGCAAATTAGGATTATCAAGCAATGTAGACACATCTTCATCGTCATCATCGAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAA ]
[-] EMBL CD160175 [ TACTCATCCAAGTCCTGGTGCTTTTAGTTTTTCATCGCTATTTCTCACTGCATCATTAGATTGGACTGTACGTTTATGGTCTACACGTGAACATAAACCTATACATACATTTGATGATTATTCGGATTATGTGTATGATGTATGCTGGAGTCCTGTACATCCAGCTGTATTTTCTGCTGTTGATGGTACTGGAAATTTAGATATATGGGATATGAATCAAGATGCTGAAATTCCTGTGGCTCGTCGCAAATTAGGATTATCAAGCAATGTAGACACATCTTCATCGTCATCATCGAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAA ]
[+] EMBL CD135302 [ TAGACACATCTTCATCGTCATCATCGAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAAGTCTTTCTCAGCCTGTCACTGATGATTGGTCTAGTTTCGCACATGTATTAGCTGATCTTAAACACTATGAAtt ]
[+] EMBL CD159528 [ CATCATCGAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAAGTCTTTCTCAGCCTGTCACTGATGATTGGTCTAGTTTCGCACATGTATTAGCTGATCTTAAACACTATGAAATGGAACCAGAAGTAGAAACAGAAGCATAATTTTGGTTAAAGGCCTAATTTTCTCTGTTTTTTGTATTTCTATGAATCATACATACCTCTTCTATGTAACACCAATCAGCTTCAATTTTATTTTACGTTGTTTTGAGAATTGAAGTTGCGTTTGTAAGTTGACATATTTGGTTTTCATGAAAATTAATAAAGTACTTCAG ]
[+] EMBL CD159539 [ CATCATCGAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAAGTCTTTCTCAGCCTGTCACTGATGATTGGTCTAGTTTCGCACATGTATTAGCTGATCTTAAACACTATGAAATGGAACCAGAAGTAGAAACAGAAGCATAATCTTGGTTAAAGGCCTAATTTTCTCTGTTTTTTGTATTTCTATGAATCATACATACCTCTTCTATGTAACACCAATCAGCTTCAATTTTATTTTACGTTGTTTTGAGAATTGAAGTTGCATTTGTAAGTTGACATATTTGGTTTTCATGAAAATTAATAAAG ]
[+] EMBL CD111389 [ GAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAAGTCTTTCTCAGCCTGTCACTGATGATTGGTCTAGTTTCGCACATGTATTAGCTGATCTTAAACACTATGAAATGGAACCAGAAGTAGAAACAGAAGCATAATCTTGGTTAAAGGCCTAATTTTCTCTGTTTTTTGTATTTCTATGAATCATACATACCTCTTCTATGTAACACCAATCAGCTTCAATTTTATTTTACGTTGTTTTGAGAATTGAAGTTGCATTTGTAAGTTGACATATTTGGTTTTCATGAAAATTAATAAAGTACTTCAGTATAGGAGTCCCGCTTAAAAATAACAACTTTAAAAGGCTGTGTTGGGTTCCCTTATTTTCTTTTT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||