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Schistosoma mansoni
cluster # 8443 cluster # 8443       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8443#0 length = 1476 sequences # 6  

consensusID : consensus_8443#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1476
fasta sequence
                              [TTACGATTATCTCCTAAATCATCAACTGTAACACTGAAATCTGATAAATTGTCAACTATTTCATTCTTCGCTTCTTCAATATGTTGAAGCCAGTTTTGAAATTCGTACATATCAGTTGTAAAGCATTTAGCTAATGGATACACCTCAGCAAATTTAATTTCTGTTTGATTTAATCGATTATCAAGTGTTATCATTTGTTTTGAAACACTAGACACAGCATCACTCAATTCATGATAAAATTTATCTGTTGTAAATGGTACGAAAGATTTGTTTGTTTTTATAGGCGATGATGATAATGATGATTTTATGGCACTATTCTGATTACCCGAACTTGTTGATAATGCAGATGATTGTATTATGTCATGAATTTGATCGCATAATTGAGTTAAATAAATTTGATGTTTTTTCCAGTTCCCTTGAAATTGTTCTATTCTTTCATGCAGTTTATCTAACATAACAGGCTGATATGGTAGAACAGCTAAATAAGGAAATTCAGTACCAAGCGAATGTATAGTTGGCATTTTTACCGATGATTCATTAATTGTAAAATGATTTTCATCAGAATAATTATCCCAATCTAATGATGGTGCAGCGGATATTTTTGGATCAAAACGTTTCAACGCTAAATCTAACCATTGC-ACCTTGATTTCTAATTTATGCATTAATTGTTTAGCTTTTTGACGATTACTACCAACAATTTTAGCTAAATCGGTAAGCTTTTCATTGAATTCATCATATCGTTTTAATTCATTATCTATTTGTTCTACATGTCCAAGTTTACCATCTGAATGATTAGGGAAATGTGTTGTTGTCAATGTCGAAGGATTAGTAAACAAATCAATAGGTTTACAAATTTGTTTTAATTGATTCCAAAAATTATGAACTTGTTGATATTGTGGTTCTAATCCATTGATCATTTCATATTCTAATTGATCTATCAATGACTTCTCTATTTGGGTTGAATAAACTTCTTTTGTATTGTTTTCTAGTAATCCATTAAGCCGGGATTCAACACTAAGCAAACGTGAACTGAGTGTATTCACAGAGGATGTTAAAGATTGAGCTACAGGCAAACTAGATTCTAAAATAAACAATTTTCGTTTTGTATCTGATTGCAGTTCTTCATAAATATCACTTAGATTTACTAAACGATTTTGTATAGAATCTTCATTTACAAAATATCTACCTGATTTACATAACTGTTCACCGCTTAATTTAATCTCATCAATAGTTGATTGATAATTTTCAATCTCTTCTGATAAACTTTTTAATTTTTTTAATTCTTCAGTTAAATCCATTAAAATTGTTGTATTACCTGGTGTTGTTTTAGTTACTTGTATTGGTTCATTTAAACACAATTGTTTTTGTTTTAACCAATTTAATATTTGATGAATTCGTTCATTACCTAATTTTTCACTTTCATTACATAAACGAAATTTATTCAAATTCAATTGTATCTCTTTACGTACACAATCA]

[+] EMBL CD064492             [TTACGATTATCTCCTAAATCATCAACTGTAACACTGAAATCTGATAAATTGTCAACTATTTCATTCTTCGCTTCTTCAATATGTTGAAGCCAGTTTTGAAATTCGTACATATCAGTTGTAAAGCATTTAGCTAATGGATACACCTCAGCAAATTTAATTTCTGTTTGATTTAATCGATTATCAAGTGTTATCATTTGTTTTGAAACACTAGACACAGCATCACTCAATTCATGATAAAATTTATCTGTTGTAAATGGTACGAAAGATTTGTTTGTTTTTATAGGCGATGATGATAATGATGATTTTATGGCACTATTCTGATTACCCGAACTTGTTGATAATGCAGATGATTGTATTATGTCATGAATTTGATCGCATAATTGAGTTAAATAAATTTGATGTTTTTTCCAGTTCCCTTGAAATTGTTCTATTCTTTCATGCAGTTTATCTAACATAACAGGCTGATATGGTAGAACAGCTAAATAAGGAAATTCAGTACCAAGCGAATGTATAGTTGGCATTTTTACCGATGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD133886             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTGAAATTGTTCTATTCTTTCATGTAGTTTATCTAACATAACAGGTTGATATGGTAGAACAGCTAAATAAGGAAATTCAGTACCAAGTGAATGTATAGTTGGCATTTTTACCGATGATTCATTAATTGTAAAATGATTTTCATCAGAATAATTATCCCAATCTAATGATGGTGCAGCGGATATTTTTGGATCAAAACGTTTCAACGCTAAATCTAACCATTGC ACCTTGATTTCTAATTTATGCATTAATTGTTTAGCTTTTTGACGATTACTACCAACAATTTTAGCTAAATCGGTAAGCTTTTCATTGAATTCATCATATCGTTTTAATTCATTATCTATTTGTTCTACATGTCCAAGTTTACCATCTGAATGATTAGGGAAATGTGTTGTTGTCAATGTCGAAGGATTAGTAAACAAGTCAATAGGTTTACAAATTTGTTTTAATTGATTCCAAAAATTATGAACTTGTTGATATTGTGGTTCTAATCCATTGATCATTTCATATTCTAATTGATCTATCAATGACTTCTCTATTTGGGTTGAATAAACTTCTTTTGTATTGGTTTCTAGTAATCCATTAAGCCGGGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD201259             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATTTTTACCGATGATTCATTAATTGTAAAATGATTTTCATCAGAATAATTATCCCAATCTAATGATGGTGCAGCGGATATTTTTGGATCAAAACGTTTCAACGCTAAATCTAACCATTGC GCCTTGATTTCTAATTTATGCATTAATTGTTTAGCTTTTTGACGATTACTACCAACAATTTTAGCTAAATCGGTAAGCTTTTCATTGAATTCATCATATCGTTTTAATTCATTATCTATTTGTTCTACATGTCCAAGTTTACCATCTGAATGATTAGGGAAATGTGTTGTTGTCAATGTCGAAGGATTAGTAAACAAATCAATAGGTTTACAAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD191736             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATNTAACCA TGCGCCCTTGATTTCTAATTTATGCATTAATGTTTTAGCTTTTTGACGATTACTACCTACAATTTTAGCTANATCGGTAAGCTTTTCATTGAACTCATCATATCGTTTTAATTCATTATCTATNTGTTCTACATGTCCAAGTTTACCATCTGAATGATTAGGGAAATGTGTTGTTGTCAATGTCGAAGGATTAGTAAACAAATCAATAGGTTTACAAATTTGTTTTAATTGATTCCAAAAATTATGAACTTGTTGATATTGCGGTTCTAATCCATTGATCATTTCATATTCTAATTGATCTATCAATGACTTCTCTATTTGGGTTGAATAAACTTCTTTTGTATTGTTTTCTAGTAATCCATTAAGCCGGGATTCAACACTAAGCAAACGTGAACTGAGTGTATTCACAGAGGATGTTAAAGATTGAGCTACAGGCAAACTAGATTCTAAAATAAACAATTTTCGTTTTGTATCTGATTGCAGTTCTTCATAAATATCACTTAGATTTACTAAACGATTTTGTATAGAATCTTCATTTACAAAATATCTACCTGATTTACATAACTGTTCACCGCTTAATTT                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD112905             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGACGATTACTACCAACAATTTTAGCTAAATCGGTAAGCTTTTCATTGAATTCATCATATCGTTTTAATTCATTATCTATTTGTTCTACATGTCCAAGTTTACCATCTGAATGATTAGGGAAATGTGTTGTTGTCAATGTCGAAGGATTAGTAAACAAATCAATAGGTTTACAAATTTGTTTTAATTGATTCCAAAAATTATGAACTTGTTGATATTGTGGTTCTAATCCATTGATCATTTCATATTCTAATTGATCTATCAATGACTTCTCTATTTGGGTTGAAT AACTTCTTTTGTATTGTTTTCTAGTAATCCATTAAGCCGGGATTCAACACAAAGCAAACGTGAACTGAGTGTATTCACAGAGGATGTTAAAGATTGAGCTACAGGCAAACTAGATTCTAAAATAAACAATTTTCGTTTTGTATCTGATTGCAGTTCTTCATAAATATCACTTAGATTTACTAAACGATTTTGTATAGAATCTTCATTTACAAAATATCTACCTGATTTACATAACTGTTCACCGCTTAATTTAATCTCATCAATAGTTGATTGATAATTTTCAAT                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD069288             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCTAATTGATCTATCAGTGACTTCTCTATTTGGGTTGAATAAACTTCTTTTGTATTGTTTTCTAGTAATCCATTAAGCCGGGATTCAACACTAAGCAAACGTGAACTGAGTGTATTCACAGAGGATGTTAAAGATTGAGCTACAGGCAAACTAGATTCTAAAATAAACAATTTTCGTTTTGTATCTGATTGCAGTTCTTCATAAATATCACTTAGATTTACTAAACGATTTTGTATAGAATCTTCATTTACAAAATATCTACCTGATTTACATAACTGTTCACCGCTTAATTTAATCTCATCAATAGTTGATTGATAATTTTCAATCTCTTCTGATAAACTTTTTAATTTTTTTAATTCTTCAGTTAAATCCATTAAAATTGTTGTATTACCTGGTGTTGTTTTAGTTACTTGTATTGGTTCATTTAAACACAATTGTTTTTGTTTTAACCAATTTAATATTTGATGAATTCGTTCATTACCTAATTTTTCACTTTCATTACATAAACGAAATTTATTCAAATTCAATTGTATCTCTTTACGTACACAATCA]


>consensus_8443#0 TTACGATTATCTCCTAAATCATCAACTGTAACACTGAAATCTGATAAATTGTCAACTATT TCATTCTTCGCTTCTTCAATATGTTGAAGCCAGTTTTGAAATTCGTACATATCAGTTGTA AAGCATTTAGCTAATGGATACACCTCAGCAAATTTAATTTCTGTTTGATTTAATCGATTA TCAAGTGTTATCATTTGTTTTGAAACACTAGACACAGCATCACTCAATTCATGATAAAAT TTATCTGTTGTAAATGGTACGAAAGATTTGTTTGTTTTTATAGGCGATGATGATAATGAT GATTTTATGGCACTATTCTGATTACCCGAACTTGTTGATAATGCAGATGATTGTATTATG TCATGAATTTGATCGCATAATTGAGTTAAATAAATTTGATGTTTTTTCCAGTTCCCTTGA AATTGTTCTATTCTTTCATGCAGTTTATCTAACATAACAGGCTGATATGGTAGAACAGCT AAATAAGGAAATTCAGTACCAAGCGAATGTATAGTTGGCATTTTTACCGATGATTCATTA ATTGTAAAATGATTTTCATCAGAATAATTATCCCAATCTAATGATGGTGCAGCGGATATT TTTGGATCAAAACGTTTCAACGCTAAATCTAACCATTGCACCTTGATTTCTAATTTATGC ATTAATTGTTTAGCTTTTTGACGATTACTACCAACAATTTTAGCTAAATCGGTAAGCTTT TCATTGAATTCATCATATCGTTTTAATTCATTATCTATTTGTTCTACATGTCCAAGTTTA CCATCTGAATGATTAGGGAAATGTGTTGTTGTCAATGTCGAAGGATTAGTAAACAAATCA ATAGGTTTACAAATTTGTTTTAATTGATTCCAAAAATTATGAACTTGTTGATATTGTGGT TCTAATCCATTGATCATTTCATATTCTAATTGATCTATCAATGACTTCTCTATTTGGGTT GAATAAACTTCTTTTGTATTGTTTTCTAGTAATCCATTAAGCCGGGATTCAACACTAAGC AAACGTGAACTGAGTGTATTCACAGAGGATGTTAAAGATTGAGCTACAGGCAAACTAGAT TCTAAAATAAACAATTTTCGTTTTGTATCTGATTGCAGTTCTTCATAAATATCACTTAGA TTTACTAAACGATTTTGTATAGAATCTTCATTTACAAAATATCTACCTGATTTACATAAC TGTTCACCGCTTAATTTAATCTCATCAATAGTTGATTGATAATTTTCAATCTCTTCTGAT AAACTTTTTAATTTTTTTAATTCTTCAGTTAAATCCATTAAAATTGTTGTATTACCTGGT GTTGTTTTAGTTACTTGTATTGGTTCATTTAAACACAATTGTTTTTGTTTTAACCAATTT AATATTTGATGAATTCGTTCATTACCTAATTTTTCACTTTCATTACATAAACGAAATTTA TTCAAATTCAATTGTATCTCTTTACGTACACAATCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)