cluster # 8445

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Schistosoma mansoni
cluster # 8445 cluster # 8445 Sequences # 6 consensus # 2

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consensus_8445#0 length = 1022 sequences # 5

consensus_8445#1 length = 682 sequences # 1

consensusID : consensus_8445#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1022
fasta sequence

                              [CCTCCNAGGCCAGAATTCGGCACGAGGCATAATTTCATTTTTGTGTATGTGTGTGTTGTTTGCTTGCATAATTTCTATTTTAATATTTATTTCCGATTTTTATTTCGTACGTTAATGGTTTCGCTCAGTTTTATATACTACTACTTACGCCTGCTACCCTTCATGGAGGAGCATAAGCTGCCCACCAACATTCTCCATAGTACCACTATATATTCCGTATATTCGTCCGACATATATATGTATCCTTAGTATCGGTTAGTTTTCTGGGTGGTCAATTGATTGGATTTTCTCCGTCATTTTCGATGAAATAGATATTCTCCGAGATTTTTATTCATTCTTCAACAGTAAATTCCTGGTTCTTTGGTCACGATTAATGTATTAAATGCAGTGAGATTTCTCCCTACCTACTGTTCATTCCGACCAGCCTTTCGTTTAAAAAGAATAATAAAACACTTGATATTGCTGTCGTCTTTACTTACTTCTTTGATAACGTTTGTTTAATCAAAATTAGACAAAATGGTAAAGTTAGTAGTATTTTGCAAGTCAGATTCTATATCAACTTGATTGACTTTCTTCGTGTCAATTCACTTCAATTTATTCAGTTTGTTCTAACTATAGATGCTTCTAGTTTATTTCAATGACTTTTTTAATGGTCATCTAACTATTGAAGTGAAGTTTTCTTTAAAAAACTTAATTTTTTTATGCAATTAAAATAGCCTTTCATTTATTATTTTACCAAAATCATTTAATGGCTTCTTATACGTCAATGTGTGAATACTTCGTCGTCTACGTCTCTCTCCCTCTCTCTGAAAAATAATTATTGTCTAATTATTTTATCATATATTTTACTTCTTTTTCTAATGAATTAAGTTTTATTCGTTCATTTGAACAGTTTGAATTTTTATTTAAGAATATAACTATCCTTACTGCTTTTCTATAAAAGATTAAATCGATATTGTTTATATATGATGAATTAAAATGCAAAATCAGTTTCTTTATTTGTTTCAATTGTTTAAAGAAAA]

[+] EMBL CD080750             [CCTCCNAGGCCAGAATTCGGCACGAGGCATAATTTCATTTTTGTGTATGTGTGTGTTGTTTGCTTGCATAATTTCTATTTTAATATTTATTTCCGATTTTTATTTCGTACGTTAATGGTTTCGCTCAGTTTTATATACTACTACTTACGCCTGCTACCCTTCATGGAGGAGCATAAGCTGCCCACCAACATTCTCCATAGTACCACTATATATTCCGTATATTCGTCCGACATATATATGTATCCTTAGTATCGGTTAGTTTTCTGGGTGGTCAATTGATTGGATTTTCTCCGTCATTTTCGATGAAATAGATATTCTCCGAGATTTTTATTCATTCTTCAACAGTAAATTCCTGGTTCTTTGGTCACGATTAATGTATTAAATGCAGTGAGATTTCTCCCTACCTACTGTTCATTCCGACCAGCCTTTCGTTTAAAAAGAATAATAAAACACTTGATATTGCTGTCGTCTTTACTTACTTCTTTGATAACGTTTGTTTAATCAAAATTAGACAAAATGGTAAAGTTAGTAGTATTTTGCAAGTCAGATTCTATATCAACTTGATTGACTNTCTTCGTGTCAATTCACTTCAATTTATTCAGTTTGTTCTAACTATAGATGCTTCTAGTTTATTTCAATGACTNTNTTAATGGTCATCTAACTATTGAAGTGAAGTTNTCTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD096075             [                                                                                                                                                                                                    ATAGTACCACTATATATTCCGTATATTCGTCGNACATATATATGTATCCTTAGTATCGGTTAGTTTTCTGGGTGGTCAATTGATTGGATTTTCTCCGTCATTTTCGATGAAATAGATATTCTCCGAGATTTTTATTCATTCTTCAACAGTAAATTCCTGGTTCTTTGGTCACGATTAATGTATTAAATGCAGTGAGATTTCTCCCTACCTACTGTTCATTCCGACCAGCCTTTCGTTTAAAAAGAATAATAAAACACTTGATATTGCTGTCGTCTTTACTTACTTCTTTGATAACGTTTGTTTAATCAAAATTAGACAAAATGGTAAAGTTAGTAGTATTTTGCAAGTCAGATTCTATATCAACTTGATTGACTTTCTTCGTGTCAATTCACTTCAATTTATTCAGTTTGTTCTAACTATAGATGCTTCTAGTTTATTTCAATGACTTTTTTAATGGTCATCTAACTATTGAAGTGAAGTTTTCTTTAAAAAACTTAATTTTTTTATGCAATTAAAATAGCCTTTCATTTATTATTTTACCAAAATCATTTAATGGCTTCTTATACGTCAATGTGTG                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD074674             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CACGATTAATGTATTAAATGCAGTGAGATTTCTCCCTACCTACTGTTCATTCCGACCAGCCTTTCGTTTAAAAAGAATAATAAAACACTTGATATTGCTGTCGTCTTTACTTACTTCTTTGATAACGTTTGTTTAATCAAAATTAGACAAAATGGTAAAGTTAGTAGTATTTTGCAAGTCAGATTCTATATCAACTTGATTGACTTTCTTCGTGTCAATTCACTTCAATTTATTCAGTTTGTTCTAACTATAGATGCTTCTAGTTTATTTCAATGACTTTTTTAATGGTCATCTAACTATTGAAGTGAAGTTTTCTTTAAAAAACTTAATTTTTTTATGCAATTAAAATAGCCTTTCATTTATTATTTTACCAAAATCATTTAATGGCTTCTTATACGTCAATGTGTGAATACTTCGTCGTCTACGTCTCTCTCCCTCTCTCTGAAAAATAATTATTGTCTAATTATTTTATCATATATTTTACTTCTTTTTCTAATGAATTAAGTTTTATTCGTTCATTTGAACAGTTTGAATTTTTATTTAAGAATATAACTATCCTTACTGCTTTTCTATAAAAGATTAAATCGATATTGTTTATATATGATGAATTAAAATGCAAAATC                                  ]
[-] EMBL CD075241             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tacTACTT  TTCTTTGATAACGTTTGTTTAATCAAAATTAGACAAAATGGTAAAGTTAGTAGTATTTTGCAAGTCAGATTCTATATCAACTTGATTGACTTTCTTCGTGTCAATTCACTTCAATTTATTCAGTTTGTTCTAACTATAGATGCTTCTAGTTTATTTCAATGACTTTTTTAATGGTCATCTAACTATTGAAGTGAAGTTTTCTTTAAAAAACTTAATTTTTTTATGCAATTAAAATAGCCTTTCATTTATTATTTTACCAAAATCATTTAATGGCTTCTTATACGTCAATGTGTGAATACTTCGTCGTCTACGTCTCTCTCCCTCTCTCTGAAAAATAATTATTGTCTAATTATTTTATCATATATTTTACTTCTTTTTCTAATGAATTAAGTTTTATTCGTTCATTTGAACAGTTTGAATTTTTATTTAAGAATATAACTATCCTTACTGCTTTTCTATAAAAGATTAAATCGATATTGTTTATATATGATGAATTAAAATGCAAAATCAGTTTCTTTATTTGTTTCAATTGTTTAAAGAAAA]
[-] EMBL CD071855             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTTTCTTCGTGTCAATTCACTTCAATTTATTCAGTTTGTTCTAACTATAGATGCTTCTAGTTTATTTCAATGACTTTTTTAATGGTCATCTAACTATTGAAGTGAAGTTTTCTTTAAAAAACTTAATTTTTTTATGCAATTAAAATAGCCTTTCATTTATTATTTTACCAAAATCATTTAATGGCTTCTTATACGTCAATGTGTGAATAC                                                                                                                                                                                                                                                    ]




>consensus_8445#0
CCTCCNAGGCCAGAATTCGGCACGAGGCATAATTTCATTTTTGTGTATGTGTGTGTTGTT
TGCTTGCATAATTTCTATTTTAATATTTATTTCCGATTTTTATTTCGTACGTTAATGGTT
TCGCTCAGTTTTATATACTACTACTTACGCCTGCTACCCTTCATGGAGGAGCATAAGCTG
CCCACCAACATTCTCCATAGTACCACTATATATTCCGTATATTCGTCCGACATATATATG
TATCCTTAGTATCGGTTAGTTTTCTGGGTGGTCAATTGATTGGATTTTCTCCGTCATTTT
CGATGAAATAGATATTCTCCGAGATTTTTATTCATTCTTCAACAGTAAATTCCTGGTTCT
TTGGTCACGATTAATGTATTAAATGCAGTGAGATTTCTCCCTACCTACTGTTCATTCCGA
CCAGCCTTTCGTTTAAAAAGAATAATAAAACACTTGATATTGCTGTCGTCTTTACTTACT
TCTTTGATAACGTTTGTTTAATCAAAATTAGACAAAATGGTAAAGTTAGTAGTATTTTGC
AAGTCAGATTCTATATCAACTTGATTGACTTTCTTCGTGTCAATTCACTTCAATTTATTC
AGTTTGTTCTAACTATAGATGCTTCTAGTTTATTTCAATGACTTTTTTAATGGTCATCTA
ACTATTGAAGTGAAGTTTTCTTTAAAAAACTTAATTTTTTTATGCAATTAAAATAGCCTT
TCATTTATTATTTTACCAAAATCATTTAATGGCTTCTTATACGTCAATGTGTGAATACTT
CGTCGTCTACGTCTCTCTCCCTCTCTCTGAAAAATAATTATTGTCTAATTATTTTATCAT
ATATTTTACTTCTTTTTCTAATGAATTAAGTTTTATTCGTTCATTTGAACAGTTTGAATT
TTTATTTAAGAATATAACTATCCTTACTGCTTTTCTATAAAAGATTAAATCGATATTGTT
TATATATGATGAATTAAAATGCAAAATCAGTTTCTTTATTTGTTTCAATTGTTTAAAGAA
AA

consensusID : consensus_8445#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 682
fasta sequence

                              [AGCCAANAATCGGCACGAGGTCTATGTGTGTGTTGTTTGCTTGCATAATTTCTATTTTAATATTTATTTCCGATTTTTATTTCGTACGTTAATGGTTTCGCTCAGTTTTATATACTACTACTTACGCCTGCTACCCTTCATGGAGGAGCATAAGCTGCCCACCAACATTCTCCATAGTACCACTATATATTCCGTATATTCGTCCGACATATATATGTATCCTTAGTATCGGTTAGTTTTCTGGGTGGTCAATTGATTGGATTTTCTCCGTCATTTTCGATGAAATAGATATTCTCCGAGATTTTTATTCATTCTTCAACAGTAAATTCCTGGTTCTTTGGTCACGATTAATGTATTAAATGCAGTGAGATTTCTCCCTACCTACTGTTCATTCCGACCAGCCTTTCGTTTAAAAAGAATAATAAAACACTTGATATTGCTGTCGTCTTTACTTACTTCTTTGATAACGTTTGTTTAATCAAAATTAGACAAAATGGTAAAGTTAGTAGTATTTTGCAAGTCAGATTCTATATCAACTTGATTGACTTTCTTCGTGTCAATTCACTTCAATTTATTCAGTTTGTTCTAACTATAGATGCTTCTAGTTTATTTCAATGACTNTTTTAATGGTCATCTAACTATTGAAGTGAAAGTNNTCTTAAAAACTTAATTTTTTTATGCA]

[+] EMBL CD081411             [AGCCAANAATCGGCACGAGGTCTATGTGTGTGTTGTTTGCTTGCATAATTTCTATTTTAATATTTATTTCCGATTTTTATTTCGTACGTTAATGGTTTCGCTCAGTTTTATATACTACTACTTACGCCTGCTACCCTTCATGGAGGAGCATAAGCTGCCCACCAACATTCTCCATAGTACCACTATATATTCCGTATATTCGTCCGACATATATATGTATCCTTAGTATCGGTTAGTTTTCTGGGTGGTCAATTGATTGGATTTTCTCCGTCATTTTCGATGAAATAGATATTCTCCGAGATTTTTATTCATTCTTCAACAGTAAATTCCTGGTTCTTTGGTCACGATTAATGTATTAAATGCAGTGAGATTTCTCCCTACCTACTGTTCATTCCGACCAGCCTTTCGTTTAAAAAGAATAATAAAACACTTGATATTGCTGTCGTCTTTACTTACTTCTTTGATAACGTTTGTTTAATCAAAATTAGACAAAATGGTAAAGTTAGTAGTATTTTGCAAGTCAGATTCTATATCAACTTGATTGACTTTCTTCGTGTCAATTCACTTCAATTTATTCAGTTTGTTCTAACTATAGATGCTTCTAGTTTATTTCAATGACTNTTTTAATGGTCATCTAACTATTGAAGTGAAAGTNNTCTTAAAAACTTAATTTTTTTATGCA]




>consensus_8445#1
AGCCAANAATCGGCACGAGGTCTATGTGTGTGTTGTTTGCTTGCATAATTTCTATTTTAA
TATTTATTTCCGATTTTTATTTCGTACGTTAATGGTTTCGCTCAGTTTTATATACTACTA
CTTACGCCTGCTACCCTTCATGGAGGAGCATAAGCTGCCCACCAACATTCTCCATAGTAC
CACTATATATTCCGTATATTCGTCCGACATATATATGTATCCTTAGTATCGGTTAGTTTT
CTGGGTGGTCAATTGATTGGATTTTCTCCGTCATTTTCGATGAAATAGATATTCTCCGAG
ATTTTTATTCATTCTTCAACAGTAAATTCCTGGTTCTTTGGTCACGATTAATGTATTAAA
TGCAGTGAGATTTCTCCCTACCTACTGTTCATTCCGACCAGCCTTTCGTTTAAAAAGAAT
AATAAAACACTTGATATTGCTGTCGTCTTTACTTACTTCTTTGATAACGTTTGTTTAATC
AAAATTAGACAAAATGGTAAAGTTAGTAGTATTTTGCAAGTCAGATTCTATATCAACTTG
ATTGACTTTCTTCGTGTCAATTCACTTCAATTTATTCAGTTTGTTCTAACTATAGATGCT
TCTAGTTTATTTCAATGACTNTTTTAATGGTCATCTAACTATTGAAGTGAAAGTNNTCTT
AAAAACTTAATTTTTTTATGCA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8445#0      CCTCCNAGGCCAGAATTCGGCACGAGGCATAATTTCATTTTTGTGTATGTGTGTGTTGTT 60
consensus_8445#1      -------AGCCAANAATCGGCACGAGG----------------TCTATGTGTGTGTTGTT 37
                              ****  * ***********                * ***************

consensus_8445#0      TGCTTGCATAATTTCTATTTTAATATTTATTTCCGATTTTTATTTCGTACGTTAATGGTT 120
consensus_8445#1      TGCTTGCATAATTTCTATTTTAATATTTATTTCCGATTTTTATTTCGTACGTTAATGGTT 97
                      ************************************************************

consensus_8445#0      TCGCTCAGTTTTATATACTACTACTTACGCCTGCTACCCTTCATGGAGGAGCATAAGCTG 180
consensus_8445#1      TCGCTCAGTTTTATATACTACTACTTACGCCTGCTACCCTTCATGGAGGAGCATAAGCTG 157
                      ************************************************************

consensus_8445#0      CCCACCAACATTCTCCATAGTACCACTATATATTCCGTATATTCGTCCGACATATATATG 240
consensus_8445#1      CCCACCAACATTCTCCATAGTACCACTATATATTCCGTATATTCGTCCGACATATATATG 217
                      ************************************************************

consensus_8445#0      TATCCTTAGTATCGGTTAGTTTTCTGGGTGGTCAATTGATTGGATTTTCTCCGTCATTTT 300
consensus_8445#1      TATCCTTAGTATCGGTTAGTTTTCTGGGTGGTCAATTGATTGGATTTTCTCCGTCATTTT 277
                      ************************************************************

consensus_8445#0      CGATGAAATAGATATTCTCCGAGATTTTTATTCATTCTTCAACAGTAAATTCCTGGTTCT 360
consensus_8445#1      CGATGAAATAGATATTCTCCGAGATTTTTATTCATTCTTCAACAGTAAATTCCTGGTTCT 337
                      ************************************************************

consensus_8445#0      TTGGTCACGATTAATGTATTAAATGCAGTGAGATTTCTCCCTACCTACTGTTCATTCCGA 420
consensus_8445#1      TTGGTCACGATTAATGTATTAAATGCAGTGAGATTTCTCCCTACCTACTGTTCATTCCGA 397
                      ************************************************************

consensus_8445#0      CCAGCCTTTCGTTTAAAAAGAATAATAAAACACTTGATATTGCTGTCGTCTTTACTTACT 480
consensus_8445#1      CCAGCCTTTCGTTTAAAAAGAATAATAAAACACTTGATATTGCTGTCGTCTTTACTTACT 457
                      ************************************************************

consensus_8445#0      TCTTTGATAACGTTTGTTTAATCAAAATTAGACAAAATGGTAAAGTTAGTAGTATTTTGC 540
consensus_8445#1      TCTTTGATAACGTTTGTTTAATCAAAATTAGACAAAATGGTAAAGTTAGTAGTATTTTGC 517
                      ************************************************************

consensus_8445#0      AAGTCAGATTCTATATCAACTTGATTGACTTTCTTCGTGTCAATTCACTTCAATTTATTC 600
consensus_8445#1      AAGTCAGATTCTATATCAACTTGATTGACTTTCTTCGTGTCAATTCACTTCAATTTATTC 577
                      ************************************************************

consensus_8445#0      AGTTTGTTCTAACTATAGATGCTTCTAGTTTATTTCAATGACTTTTTTAATGGTCATCTA 660
consensus_8445#1      AGTTTGTTCTAACTATAGATGCTTCTAGTTTATTTCAATGACTNTTTTAATGGTCATCTA 637
                      ******************************************* ****************

consensus_8445#0      ACTATTGAAGTGAAGTTTTCTTTAAAAAACTTAATTTTTTTATGCAATTAAAATAGCCTT 720
consensus_8445#1      ACTATTGAAGTGAAAGTNNTCTTAAAAA-CTTAATTTTTTTATGCA-------------- 682
                      **************  *    ******* *****************              

consensus_8445#0      TCATTTATTATTTTACCAAAATCATTTAATGGCTTCTTATACGTCAATGTGTGAATACTT 780
consensus_8445#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8445#0      CGTCGTCTACGTCTCTCTCCCTCTCTCTGAAAAATAATTATTGTCTAATTATTTTATCAT 840
consensus_8445#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8445#0      ATATTTTACTTCTTTTTCTAATGAATTAAGTTTTATTCGTTCATTTGAACAGTTTGAATT 900
consensus_8445#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8445#0      TTTATTTAAGAATATAACTATCCTTACTGCTTTTCTATAAAAGATTAAATCGATATTGTT 960
consensus_8445#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8445#0      TATATATGATGAATTAAAATGCAAAATCAGTTTCTTTATTTGTTTCAATTGTTTAAAGAA 1020
consensus_8445#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8445#0      AA 1022
consensus_8445#1      --