These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8454#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1259 fasta sequence [TATTTGATGCCGATTTCGATCACCATTGTGATGATGAGAATTCAAAATCCAGCATTACTCTATTTGCTGAATTATTTCTACCGAAATTGAATCGTTGGGTGTGTATTGATCCATCATCGCCTACAGGTGTTGTGGATAAAGTGAATTTCAAACATGGATCTTTATATGTTGTCGGTGCTTATTCTGTACGATCAACTAGTCTTGAGTTAGTATCTTATGTTGGTAGAAATCCAGTTGACTTGTCTCCTCGTTATGTTCAGGATTGGTGTGTTTCTGCTCGTACTCATCGCATTCCTGCTGAGAAATGGAGTAGTTTTCTTGATATACAAAGTAGATTTTTTTGATAAAGATGCTGCTGAATATGATGCTTTAGTTTCTAAGTCGGATACGCTCCCAACTTTCCAACGAGATAGTAAAGATAAAGATTCTATTCAAGAAAAGCTTTTATCTGAACCTCTACCCAAACGCATGCAAGACTTTAAGAATCATCCATTGTACGTTCTCCAACGCCATTTACTTAAATTTCAAGTTATTTATCCACCTGATTCAATCCCTTTGGGATATTTTCGTAATGAACCGGTTTATTCTCGTGATTGTCTTCATCTTTGTCATACCAGAGAATCATGGTTAAAAGAGGCTATGACTGTTCGTCTTCATGAAAAACCTGCAAAAGTTGTTAAAGCTCGTTTATCAATGAAACGTAAGTTGTTACAAGGTTCTGATTCTACACCTCCAACTGTTGAAATATTCGGTCCATGGCAAGTGGAACCGTATGCACCACCGAAAGCTGAAAATGGTATTGTCCCACGTAATGCACATGGAAATGTTGACTTGTTTAAACCTTGCATGCTCCCCATAGGCTGTGCACACTTATGTCTTTCTGGTATACAGTATATTGCTAGAAAACTTGGAATTGATTGTGCAGAAGCTGTTGTTGGTTGGACATTTCATGGTAGTGGTTGGGCTCATCCAAATATAAAAGGTTATGTTGTTTGTAAAGAGTCTGTACCAGTTCTTATTGATGCATGGCGTACAGAACAAATGAATGCAGCAAAATTAGAGCATGAAGAACGAATAGAACGTGTGCTAAAAAACTGGAAACGATTAGTTCGTGGACTTTTCATATGGCATCGAGTTAAAGCACAATTCGCTTTAGCTCCGTTGCATAATAAACAGACTACTGTTGAGAAATACGAAAAAAACAAAACAGTAAAACATAAAGAAGTGACTAGCANAAAAAGCTATTCCATTGTATCTTA] [-] EMBL CD117054 [TATTTGATGCCGATTTCGATCACCATTGTGATGATGAGAATTCAAAATCCAGCATTACTCTATTTGCTGAATTATTTCTACCGAAATTGAATCGTTGGGTGTGTATTGATCCATCATCGCCTACAGGTGTTGTGGATAAAGTGAATTTCAAACATGGATCTTTATATGTTGTCGGTGCTTATTCTGTACGATCAACTAGTCTTGAGTTAGTATCTTATGTTGGTAGAAATCCAGTTGACTTGTCTCCTCGTTATGTTCAGGATTGGTGTGTTTCTGCTCGTACTCATCGCATTCCTGCTGAGAAATGGAGTAGTTTTCTTGATATACAAAGTAGATTTTTTTGATAAAGATGCTGCTGAATATGATGCTTTAGTTTCTAAGTCGGATACGCTCCCAACTTTCCAACGAGATAGTAAAGATAAAGATTCTATTCAAGAAAAGCTTTTATCTGAACCTCTACCCAAACGCATGCAAGACTTTAAGAATCATCCATTGTACGTTCTCCAACGCCATTTACTTAAATTTCAAGT ] [-] EMBL CD156481 [ GCAAGACTTTAAGAATCATCCATTGTACGTTCTCCAACGCCATTTACTTAAATTTCAAGTTATTTATCCACCTGATTCAATCCCTTTGGGATATTTTCGTAATGAACCGGTTTATTCTCGTGATTGTCTTCATCTTTGTCATACCAGAGAATCATGGTTAAAAGAGGCTATGACTGTTCGTCTTCATGAAAAACCTGCAAAAGTTGTTAAAGCTCGTTTATCAATGAAACGTAAGTTGTTACAAGGTTCTGATTCTACACCTCCAACTGTTGAAATATTCGGTCCATGGCAAGTGGAACCGTATGCACCACCGAAAGCTGAAAATGGTATTGTCCCACGTAATGCACATGGAAATGTTGACTTGTTTAAACCTTGCATGCTCCCCATAGGCTGTGCACACTTATGTCTTTCTGGTATACAGTATATTGCTAGAAAACTTGGAATTGATTGTGCAGAAGCTGTTGTTGGTTGGA ] [-] EMBL CD201232 [ AAGAATCATCCATTGTACGTTCTCCAACGCCATTTACTTAAATTTCAAGTTATTTATCCACCTGATTCAATCCCTTTGGGATATTTTCGTAATGAACCGGTTTATTCTCGTGATTGTCTTCATCTTTGTCATACCAGAGAATCATGGTTAAAAGAGGCTATGACTGTTCGTCTTCATGAAAAACCTGCAAAAGTTGTTAAAGCTCGTTTATCAATGAAACGTAAGTTGTTACAAGGTTCTGATTCTACACCTCCAACTGTTGAAATATTCGGTCCATGGCAAGTGGAACCGTATGCACCACCGAAAGCTGAAAATGGTACTG ] [-] EMBL CD071944 [ AAGAATCATCCATTGTACGTTCTCCAACGCCATTTACTTAAATTTCAAGTTATTTATCCACCTGATTCAATCCCTTTGGGATATTTTCGTAATGAACCGGTTTATTCTCGTGATTGGCTTCATCTTTGTCATACCAGAGAATCATGGTTAAAAGAGGCTATGACTGTTCGTCTTCATGAAAAACCTGCAAAAGTTGTTAAAGCTCGTTTATCAATGAAACGTAAGTTGTTACAAGGTTCTGATTCTACACCTCCAACTGTTGAAATATTCGGTCCATGGCAAG ] [+] EMBL CD152392 [ AAGCTCGTTTATCAATGAAACGTAAGTTGTTACAAGGTTCTGATTCTACACCTCCAACTGTTGAAATATTCGGTCCATGGCAAGTGGAACCGTATGCACCACCGAAAGCTGAAAATGGTATTGTCCCACGTAATGCACATGGAAATGTTGACTTGTTTAAACCTTGCATGCTCCCCATAGGCTGTGCACACTTATGTCTTTCTGGTATACAGTATATTGCTAGAAAACTTGGAATTGATTGTGCAGAAGCTGTTGTTGGTTGGACATTTCATGGTAGTGGTTGGGCTCATCCAAATATAAAAGGTTATGTTGTTTGTAAAGAGTCTGTACCAGTTCTTATTGATGCATGGCGTACAGAACAAATGAATGCAGCAAAATTAGAGCATGAAGAACGAATAGAACGTGTGCTAAAAAACTGGAAACGATTAGTTCGTGGACTTTTCATATGGCATCGAGTTAAAGCACAATTCGCTTTAGCTCCGTTGCATAATAAACAGACTACTGTTGAGAAATACGAAAAAAACAAAACAGTAAAACATAAAGAAGTGACTAGCANAAAAAGCTATTCCATTGTATCTTA] [+] EMBL CD152431 [ AAGCTCGTTTATCAATGAAACGTAAGTTGTTACAAGGTTCTGATTCTACACCTCCAACTGTTAAAATATTCGGTCCATGGCAAGTGGAACCGTATGCACCACCGAAAGCTGGAAATGGTATTGTCCCACGTAATGCACATGGAAATGTTGACTTGTTTAAACCTTGCATGCTCCCCATAGGCTGTGCACACTTATGTCTTTCTGGTATACAGTATATTGCTAGAAAACTTGGAATTGATTGTGCAGAAGCTGTTGTTGGTTGGACATTTCATGGTAGTGGTTGGGCTCATCCAAATATAAAAGGTTATGTTGTTTGTAAAGAGTCTGTACCAGTTCTTATTGATGCATGGCGTACAGAACAAATGAATGCAGCAAAATTAGAGCATGAAGAACGAATAGAACGTGTGCTAAAAAACTGGAAACGATTAGTTCGTGGACTTTTCATATGGCATCGAGTTAAAGCACAATTCGCTTTAGCTCCGTTGCATAATAAACAGACTACTGTTGAGAAATACGAAAAAAACAAAACAGTAAAACATAAAGAAGTGACTAGCANAAAAAGCTATTCCATTGTATCT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||