cluster # 8454

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8454 cluster # 8454 Sequences # 6 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8454#0 length = 1259 sequences # 6
consensusID : consensus_8454#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1259
fasta sequence
                              [TATTTGATGCCGATTTCGATCACCATTGTGATGATGAGAATTCAAAATCCAGCATTACTCTATTTGCTGAATTATTTCTACCGAAATTGAATCGTTGGGTGTGTATTGATCCATCATCGCCTACAGGTGTTGTGGATAAAGTGAATTTCAAACATGGATCTTTATATGTTGTCGGTGCTTATTCTGTACGATCAACTAGTCTTGAGTTAGTATCTTATGTTGGTAGAAATCCAGTTGACTTGTCTCCTCGTTATGTTCAGGATTGGTGTGTTTCTGCTCGTACTCATCGCATTCCTGCTGAGAAATGGAGTAGTTTTCTTGATATACAAAGTAGATTTTTTTGATAAAGATGCTGCTGAATATGATGCTTTAGTTTCTAAGTCGGATACGCTCCCAACTTTCCAACGAGATAGTAAAGATAAAGATTCTATTCAAGAAAAGCTTTTATCTGAACCTCTACCCAAACGCATGCAAGACTTTAAGAATCATCCATTGTACGTTCTCCAACGCCATTTACTTAAATTTCAAGTTATTTATCCACCTGATTCAATCCCTTTGGGATATTTTCGTAATGAACCGGTTTATTCTCGTGATTGTCTTCATCTTTGTCATACCAGAGAATCATGGTTAAAAGAGGCTATGACTGTTCGTCTTCATGAAAAACCTGCAAAAGTTGTTAAAGCTCGTTTATCAATGAAACGTAAGTTGTTACAAGGTTCTGATTCTACACCTCCAACTGTTGAAATATTCGGTCCATGGCAAGTGGAACCGTATGCACCACCGAAAGCTGAAAATGGTATTGTCCCACGTAATGCACATGGAAATGTTGACTTGTTTAAACCTTGCATGCTCCCCATAGGCTGTGCACACTTATGTCTTTCTGGTATACAGTATATTGCTAGAAAACTTGGAATTGATTGTGCAGAAGCTGTTGTTGGTTGGACATTTCATGGTAGTGGTTGGGCTCATCCAAATATAAAAGGTTATGTTGTTTGTAAAGAGTCTGTACCAGTTCTTATTGATGCATGGCGTACAGAACAAATGAATGCAGCAAAATTAGAGCATGAAGAACGAATAGAACGTGTGCTAAAAAACTGGAAACGATTAGTTCGTGGACTTTTCATATGGCATCGAGTTAAAGCACAATTCGCTTTAGCTCCGTTGCATAATAAACAGACTACTGTTGAGAAATACGAAAAAAACAAAACAGTAAAACATAAAGAAGTGACTAGCANAAAAAGCTATTCCATTGTATCTTA]

[-] EMBL CD117054             [TATTTGATGCCGATTTCGATCACCATTGTGATGATGAGAATTCAAAATCCAGCATTACTCTATTTGCTGAATTATTTCTACCGAAATTGAATCGTTGGGTGTGTATTGATCCATCATCGCCTACAGGTGTTGTGGATAAAGTGAATTTCAAACATGGATCTTTATATGTTGTCGGTGCTTATTCTGTACGATCAACTAGTCTTGAGTTAGTATCTTATGTTGGTAGAAATCCAGTTGACTTGTCTCCTCGTTATGTTCAGGATTGGTGTGTTTCTGCTCGTACTCATCGCATTCCTGCTGAGAAATGGAGTAGTTTTCTTGATATACAAAGTAGATTTTTTTGATAAAGATGCTGCTGAATATGATGCTTTAGTTTCTAAGTCGGATACGCTCCCAACTTTCCAACGAGATAGTAAAGATAAAGATTCTATTCAAGAAAAGCTTTTATCTGAACCTCTACCCAAACGCATGCAAGACTTTAAGAATCATCCATTGTACGTTCTCCAACGCCATTTACTTAAATTTCAAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD156481             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GCAAGACTTTAAGAATCATCCATTGTACGTTCTCCAACGCCATTTACTTAAATTTCAAGTTATTTATCCACCTGATTCAATCCCTTTGGGATATTTTCGTAATGAACCGGTTTATTCTCGTGATTGTCTTCATCTTTGTCATACCAGAGAATCATGGTTAAAAGAGGCTATGACTGTTCGTCTTCATGAAAAACCTGCAAAAGTTGTTAAAGCTCGTTTATCAATGAAACGTAAGTTGTTACAAGGTTCTGATTCTACACCTCCAACTGTTGAAATATTCGGTCCATGGCAAGTGGAACCGTATGCACCACCGAAAGCTGAAAATGGTATTGTCCCACGTAATGCACATGGAAATGTTGACTTGTTTAAACCTTGCATGCTCCCCATAGGCTGTGCACACTTATGTCTTTCTGGTATACAGTATATTGCTAGAAAACTTGGAATTGATTGTGCAGAAGCTGTTGTTGGTTGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD201232             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAGAATCATCCATTGTACGTTCTCCAACGCCATTTACTTAAATTTCAAGTTATTTATCCACCTGATTCAATCCCTTTGGGATATTTTCGTAATGAACCGGTTTATTCTCGTGATTGTCTTCATCTTTGTCATACCAGAGAATCATGGTTAAAAGAGGCTATGACTGTTCGTCTTCATGAAAAACCTGCAAAAGTTGTTAAAGCTCGTTTATCAATGAAACGTAAGTTGTTACAAGGTTCTGATTCTACACCTCCAACTGTTGAAATATTCGGTCCATGGCAAGTGGAACCGTATGCACCACCGAAAGCTGAAAATGGTACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD071944             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAGAATCATCCATTGTACGTTCTCCAACGCCATTTACTTAAATTTCAAGTTATTTATCCACCTGATTCAATCCCTTTGGGATATTTTCGTAATGAACCGGTTTATTCTCGTGATTGGCTTCATCTTTGTCATACCAGAGAATCATGGTTAAAAGAGGCTATGACTGTTCGTCTTCATGAAAAACCTGCAAAAGTTGTTAAAGCTCGTTTATCAATGAAACGTAAGTTGTTACAAGGTTCTGATTCTACACCTCCAACTGTTGAAATATTCGGTCCATGGCAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD152392             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAGCTCGTTTATCAATGAAACGTAAGTTGTTACAAGGTTCTGATTCTACACCTCCAACTGTTGAAATATTCGGTCCATGGCAAGTGGAACCGTATGCACCACCGAAAGCTGAAAATGGTATTGTCCCACGTAATGCACATGGAAATGTTGACTTGTTTAAACCTTGCATGCTCCCCATAGGCTGTGCACACTTATGTCTTTCTGGTATACAGTATATTGCTAGAAAACTTGGAATTGATTGTGCAGAAGCTGTTGTTGGTTGGACATTTCATGGTAGTGGTTGGGCTCATCCAAATATAAAAGGTTATGTTGTTTGTAAAGAGTCTGTACCAGTTCTTATTGATGCATGGCGTACAGAACAAATGAATGCAGCAAAATTAGAGCATGAAGAACGAATAGAACGTGTGCTAAAAAACTGGAAACGATTAGTTCGTGGACTTTTCATATGGCATCGAGTTAAAGCACAATTCGCTTTAGCTCCGTTGCATAATAAACAGACTACTGTTGAGAAATACGAAAAAAACAAAACAGTAAAACATAAAGAAGTGACTAGCANAAAAAGCTATTCCATTGTATCTTA]
[+] EMBL CD152431             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAGCTCGTTTATCAATGAAACGTAAGTTGTTACAAGGTTCTGATTCTACACCTCCAACTGTTAAAATATTCGGTCCATGGCAAGTGGAACCGTATGCACCACCGAAAGCTGGAAATGGTATTGTCCCACGTAATGCACATGGAAATGTTGACTTGTTTAAACCTTGCATGCTCCCCATAGGCTGTGCACACTTATGTCTTTCTGGTATACAGTATATTGCTAGAAAACTTGGAATTGATTGTGCAGAAGCTGTTGTTGGTTGGACATTTCATGGTAGTGGTTGGGCTCATCCAAATATAAAAGGTTATGTTGTTTGTAAAGAGTCTGTACCAGTTCTTATTGATGCATGGCGTACAGAACAAATGAATGCAGCAAAATTAGAGCATGAAGAACGAATAGAACGTGTGCTAAAAAACTGGAAACGATTAGTTCGTGGACTTTTCATATGGCATCGAGTTAAAGCACAATTCGCTTTAGCTCCGTTGCATAATAAACAGACTACTGTTGAGAAATACGAAAAAAACAAAACAGTAAAACATAAAGAAGTGACTAGCANAAAAAGCTATTCCATTGTATCT  ]




>consensus_8454#0
TATTTGATGCCGATTTCGATCACCATTGTGATGATGAGAATTCAAAATCCAGCATTACTC
TATTTGCTGAATTATTTCTACCGAAATTGAATCGTTGGGTGTGTATTGATCCATCATCGC
CTACAGGTGTTGTGGATAAAGTGAATTTCAAACATGGATCTTTATATGTTGTCGGTGCTT
ATTCTGTACGATCAACTAGTCTTGAGTTAGTATCTTATGTTGGTAGAAATCCAGTTGACT
TGTCTCCTCGTTATGTTCAGGATTGGTGTGTTTCTGCTCGTACTCATCGCATTCCTGCTG
AGAAATGGAGTAGTTTTCTTGATATACAAAGTAGATTTTTTTGATAAAGATGCTGCTGAA
TATGATGCTTTAGTTTCTAAGTCGGATACGCTCCCAACTTTCCAACGAGATAGTAAAGAT
AAAGATTCTATTCAAGAAAAGCTTTTATCTGAACCTCTACCCAAACGCATGCAAGACTTT
AAGAATCATCCATTGTACGTTCTCCAACGCCATTTACTTAAATTTCAAGTTATTTATCCA
CCTGATTCAATCCCTTTGGGATATTTTCGTAATGAACCGGTTTATTCTCGTGATTGTCTT
CATCTTTGTCATACCAGAGAATCATGGTTAAAAGAGGCTATGACTGTTCGTCTTCATGAA
AAACCTGCAAAAGTTGTTAAAGCTCGTTTATCAATGAAACGTAAGTTGTTACAAGGTTCT
GATTCTACACCTCCAACTGTTGAAATATTCGGTCCATGGCAAGTGGAACCGTATGCACCA
CCGAAAGCTGAAAATGGTATTGTCCCACGTAATGCACATGGAAATGTTGACTTGTTTAAA
CCTTGCATGCTCCCCATAGGCTGTGCACACTTATGTCTTTCTGGTATACAGTATATTGCT
AGAAAACTTGGAATTGATTGTGCAGAAGCTGTTGTTGGTTGGACATTTCATGGTAGTGGT
TGGGCTCATCCAAATATAAAAGGTTATGTTGTTTGTAAAGAGTCTGTACCAGTTCTTATT
GATGCATGGCGTACAGAACAAATGAATGCAGCAAAATTAGAGCATGAAGAACGAATAGAA
CGTGTGCTAAAAAACTGGAAACGATTAGTTCGTGGACTTTTCATATGGCATCGAGTTAAA
GCACAATTCGCTTTAGCTCCGTTGCATAATAAACAGACTACTGTTGAGAAATACGAAAAA
AACAAAACAGTAAAACATAAAGAAGTGACTAGCANAAAAAGCTATTCCATTGTATCTTA
clustalw multiple alignements is not computed in this case