These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8459#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 573 fasta sequence [TTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAATTAATAACCTGCATTTGTATGTCTATGTCTCAAGCAAAATACAAATACCAGACAAAATAGTAATCAAAATTTTTGAACATTTAAGTCAGTAAGGTCGTTGAGTTCCCACACTGTCTTTGTTAAAATGCGACGTAGTTTTTCGAGTTCTTCTGTTACTGTTAGTAACCTTTTGGTCACTTTCTCACGAGCTATAATTAGTTGCTTTAATTCAGGACTTGGTTCTTTGTTCTTTATCGGGGTATCTATATAAGGGACAAGGTCAGAAATGTCAACAGGAAGTAAGCGGTCACAGCTTTCTTTTACTACATGAAAGGCCTGTTTAAGAAGTTCTTTGTTGCTTTTCATCTGCTGCAATGTTTCGACACATTGTGGTCCAGCGATAGATGCTTGGTGAGCACTCACTCCGC-GGGTTTT-AGGATCCA-GCACGCGTAGAACAGCAACATTAAGTCTCTCAACCCACTTAGCATATCTTGCAATGCTTCTTGGCC-GCATTTGGACGCATGTATAGGATTCGATAGATCTTTGGTATGTAGTTGACCTTCTGGTTCCA] [+] EMBL AI395420 [TTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAATTAATAACCTGCATTTGTATGTCTATGTCTCAAGCAAAATACAAATACCAGACAAAATAGTAATCAAAATTTTTGAACATTTAAGTCAGTAAGGTCGTTGAGTTCCCACACTGTCTTTGTTAAAATGCGACGTAGTTTTTCGAGTTCTTCTGTTACTGTTAGTAACCTTTTGGTCACTTTCTCACGAGCTATAATTAGTTGCTTTAATTCAGGACTTGGTTCTTTGTTCTTTATCGGGGTATCTATATAAGGGACAAGGTCAGAAATGTCAACAGGAAGTAAGCGGTCACAGCTTTCTTTTACTACATGAAAGGCCTGTTTAAGAAGTTCTTTGGTGCTTTTCATCTGCTGCAATGTTTCGACACATTGTGGTCCAGCGATAGATGCTTGGTGAGCACTCACTCCGC GGGTTTT AGGA ] [+] EMBL SMAA25680 [ ATAACCTGCATTTGTATGTCTATGTCTCAAGCAAAATACAAATACCAGACAAAATAGTAATCAAAATTTTTGAACATTTAAGTCAGTAAGGTCGTTGAGTTCCCACACTGTCTTTGTTAAAATGCGACGTAGTTTTTCGAGTTCTTCTGTTACTGTTAGTAACCTTTTGGTCACTTTCTCACGAGCTATAATTAGTTGCTTTAATTCAGGACTTGGTTCTTTGTTCTTTATCGGGGTATCTATATAAGGGACAAGGTCAGAAATGTCAACAGGAAGTAAGCGGTCACAGCTTTCTTTTACTACATGAAAGGCCTGTTTAAGAAGTTCTTTGTTGCTTTTCATCTGCTGCAATGTTTCGACACATTGTGGTCCAGCGATAGATGCTTGGTGAGCACTCACTCCGCGGGGTTTTNGGGTTCCA ] [+] EMBL SMAA25679 [ ATAACCTGCATTTGTATGTCTATGTCTCAAGCAAAATNCAAATACCAGACAAAATAGTAATCAAAATTTTTGAACATTTAAGTCAGTAAGGTCGTTGAGTTCCCACACTGTCTTTGTTAAAATGCGACGTAGTTTTTCGAGTTCTTCTGTTACTGTTAGTAACCTTTTGGTCACTTTCTCACGAGCTATAATTAGTTGCTTTAATTCAGGACTTGGTTCTTTGTTCTTTATCGGGGTATCTATATAAGGGACAAGGTCAGAAATGTCAACAGGAAGTAAGCGGTCACAGCTTTCTTTTACTACATGAAAGGCCTGTTTAAGAAGTTCTTTGTTGCTTTNCATCTGCTGCAATGTTTCGACACATTGTGG ] [+] EMBL CD140176 [ GTAACCTTTTGGTCACTTTCTCACGAGCTATAATTAGTTGCTTTAATTCAGGACTTGGTTCTTTGTTCTTTATCGGGGTATCTATATAAGGGACAAGGTCAGAAATGTCAACAGGAAGTAAGCGGTCCCAGCTTTCTTTTACTACATGAAAGGCCTGTTTAAGAAGTTCTTTGTTGCTTTTCATCTGCTGCAATGTTTCGACACATTGTGGTCCAGCGATAGATGCTTGGTGAGCACTCACTCCGC GGGTTTT AGGATCCATGCACGCGTAGAACAGCAACATTAAGTCTCTCAACCCACTTAGCATATCTTGCAATGCTTCTTGGCC GCATTTGGACGCATGTATAGGATTCGATAGATCTTTGGTATGTAGTTGACCTTCTGGTTCCA] [+] EMBL CD140315 [ GTAACCTTTTGGTCACTTTCTCACGAGCTATAATTAGTTGCTTTAATTCAGGACTTGGTTCTTTGTTCTTTATCGGGGTATCTATATAAGGGACAAGGTCAGAAATGTCAACAGGAAGTAAGCGGTCACAGCTTTCTTTTACTACATGAAAGGCCTGTTTAAGAAGTTCTTTGTTGCTTTTCATCTGCTGCAATGTTTCGACACATTGTGGTCCAGCGATAGATGCTTGGTGAGCACTCACTCCGC GGGTTTT AGGATCCATGCACGCGTAGAACAGCAACATNTAGTCTCTCAACCCACTTAGCATATCTTGCAATGCTTCTTGGCCGGCATTTGGACGCATGTATAG ] [-] EMBL CD193038 [ gCTTTATCGGGGTATCTATATAAGGGACAAGGTCAGAAATGTCAACAGGAAGTAAGCGGTCACAGCTTTCTTTTACTACATGAAAGGCCTGTTTAAGAAGTTCTTTGTTGCTTTTCATCTGCTGCAATGTTTCGACACATTGTGGTC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||