cluster # 8459

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Schistosoma mansoni
cluster # 8459 cluster # 8459 Sequences # 6 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_8459#0 length = 573 sequences # 6

consensusID : consensus_8459#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 573
fasta sequence

                              [TTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAATTAATAACCTGCATTTGTATGTCTATGTCTCAAGCAAAATACAAATACCAGACAAAATAGTAATCAAAATTTTTGAACATTTAAGTCAGTAAGGTCGTTGAGTTCCCACACTGTCTTTGTTAAAATGCGACGTAGTTTTTCGAGTTCTTCTGTTACTGTTAGTAACCTTTTGGTCACTTTCTCACGAGCTATAATTAGTTGCTTTAATTCAGGACTTGGTTCTTTGTTCTTTATCGGGGTATCTATATAAGGGACAAGGTCAGAAATGTCAACAGGAAGTAAGCGGTCACAGCTTTCTTTTACTACATGAAAGGCCTGTTTAAGAAGTTCTTTGTTGCTTTTCATCTGCTGCAATGTTTCGACACATTGTGGTCCAGCGATAGATGCTTGGTGAGCACTCACTCCGC-GGGTTTT-AGGATCCA-GCACGCGTAGAACAGCAACATTAAGTCTCTCAACCCACTTAGCATATCTTGCAATGCTTCTTGGCC-GCATTTGGACGCATGTATAGGATTCGATAGATCTTTGGTATGTAGTTGACCTTCTGGTTCCA]

[+] EMBL AI395420             [TTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAATTAATAACCTGCATTTGTATGTCTATGTCTCAAGCAAAATACAAATACCAGACAAAATAGTAATCAAAATTTTTGAACATTTAAGTCAGTAAGGTCGTTGAGTTCCCACACTGTCTTTGTTAAAATGCGACGTAGTTTTTCGAGTTCTTCTGTTACTGTTAGTAACCTTTTGGTCACTTTCTCACGAGCTATAATTAGTTGCTTTAATTCAGGACTTGGTTCTTTGTTCTTTATCGGGGTATCTATATAAGGGACAAGGTCAGAAATGTCAACAGGAAGTAAGCGGTCACAGCTTTCTTTTACTACATGAAAGGCCTGTTTAAGAAGTTCTTTGGTGCTTTTCATCTGCTGCAATGTTTCGACACATTGTGGTCCAGCGATAGATGCTTGGTGAGCACTCACTCCGC GGGTTTT AGGA                                                                                                                                      ]
[+] EMBL SMAA25680            [                          ATAACCTGCATTTGTATGTCTATGTCTCAAGCAAAATACAAATACCAGACAAAATAGTAATCAAAATTTTTGAACATTTAAGTCAGTAAGGTCGTTGAGTTCCCACACTGTCTTTGTTAAAATGCGACGTAGTTTTTCGAGTTCTTCTGTTACTGTTAGTAACCTTTTGGTCACTTTCTCACGAGCTATAATTAGTTGCTTTAATTCAGGACTTGGTTCTTTGTTCTTTATCGGGGTATCTATATAAGGGACAAGGTCAGAAATGTCAACAGGAAGTAAGCGGTCACAGCTTTCTTTTACTACATGAAAGGCCTGTTTAAGAAGTTCTTTGTTGCTTTTCATCTGCTGCAATGTTTCGACACATTGTGGTCCAGCGATAGATGCTTGGTGAGCACTCACTCCGCGGGGTTTTNGGGTTCCA                                                                                                                                  ]
[+] EMBL SMAA25679            [                          ATAACCTGCATTTGTATGTCTATGTCTCAAGCAAAATNCAAATACCAGACAAAATAGTAATCAAAATTTTTGAACATTTAAGTCAGTAAGGTCGTTGAGTTCCCACACTGTCTTTGTTAAAATGCGACGTAGTTTTTCGAGTTCTTCTGTTACTGTTAGTAACCTTTTGGTCACTTTCTCACGAGCTATAATTAGTTGCTTTAATTCAGGACTTGGTTCTTTGTTCTTTATCGGGGTATCTATATAAGGGACAAGGTCAGAAATGTCAACAGGAAGTAAGCGGTCACAGCTTTCTTTTACTACATGAAAGGCCTGTTTAAGAAGTTCTTTGTTGCTTTNCATCTGCTGCAATGTTTCGACACATTGTGG                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD140176             [                                                                                                                                                                                        GTAACCTTTTGGTCACTTTCTCACGAGCTATAATTAGTTGCTTTAATTCAGGACTTGGTTCTTTGTTCTTTATCGGGGTATCTATATAAGGGACAAGGTCAGAAATGTCAACAGGAAGTAAGCGGTCCCAGCTTTCTTTTACTACATGAAAGGCCTGTTTAAGAAGTTCTTTGTTGCTTTTCATCTGCTGCAATGTTTCGACACATTGTGGTCCAGCGATAGATGCTTGGTGAGCACTCACTCCGC GGGTTTT AGGATCCATGCACGCGTAGAACAGCAACATTAAGTCTCTCAACCCACTTAGCATATCTTGCAATGCTTCTTGGCC GCATTTGGACGCATGTATAGGATTCGATAGATCTTTGGTATGTAGTTGACCTTCTGGTTCCA]
[+] EMBL CD140315             [                                                                                                                                                                                        GTAACCTTTTGGTCACTTTCTCACGAGCTATAATTAGTTGCTTTAATTCAGGACTTGGTTCTTTGTTCTTTATCGGGGTATCTATATAAGGGACAAGGTCAGAAATGTCAACAGGAAGTAAGCGGTCACAGCTTTCTTTTACTACATGAAAGGCCTGTTTAAGAAGTTCTTTGTTGCTTTTCATCTGCTGCAATGTTTCGACACATTGTGGTCCAGCGATAGATGCTTGGTGAGCACTCACTCCGC GGGTTTT AGGATCCATGCACGCGTAGAACAGCAACATNTAGTCTCTCAACCCACTTAGCATATCTTGCAATGCTTCTTGGCCGGCATTTGGACGCATGTATAG                                          ]
[-] EMBL CD193038             [                                                                                                                                                                                                                                                          gCTTTATCGGGGTATCTATATAAGGGACAAGGTCAGAAATGTCAACAGGAAGTAAGCGGTCACAGCTTTCTTTTACTACATGAAAGGCCTGTTTAAGAAGTTCTTTGTTGCTTTTCATCTGCTGCAATGTTTCGACACATTGTGGTC                                                                                                                                                                                    ]




>consensus_8459#0
TTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAATTAATAACCTGCATTTGTATGTCTATGTCTCAAGCAA
AATACAAATACCAGACAAAATAGTAATCAAAATTTTTGAACATTTAAGTCAGTAAGGTCG
TTGAGTTCCCACACTGTCTTTGTTAAAATGCGACGTAGTTTTTCGAGTTCTTCTGTTACT
GTTAGTAACCTTTTGGTCACTTTCTCACGAGCTATAATTAGTTGCTTTAATTCAGGACTT
GGTTCTTTGTTCTTTATCGGGGTATCTATATAAGGGACAAGGTCAGAAATGTCAACAGGA
AGTAAGCGGTCACAGCTTTCTTTTACTACATGAAAGGCCTGTTTAAGAAGTTCTTTGTTG
CTTTTCATCTGCTGCAATGTTTCGACACATTGTGGTCCAGCGATAGATGCTTGGTGAGCA
CTCACTCCGCGGGTTTTAGGATCCAGCACGCGTAGAACAGCAACATTAAGTCTCTCAACC
CACTTAGCATATCTTGCAATGCTTCTTGGCCGCATTTGGACGCATGTATAGGATTCGATA
GATCTTTGGTATGTAGTTGACCTTCTGGTTCCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case