cluster # 8476

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Schistosoma mansoni
cluster # 8476 cluster # 8476 Sequences # 7 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_8476#0 length = 737 sequences # 7
consensusID : consensus_8476#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 737
fasta sequence
                              [AGAAAACGGATATTGATCATATGTTGATAAGGCGCGCGGGGGGGAGGGTATCAGCGAATTTGAAATAATTTTTTTCGTTTCATGACAAATAAAAGTCGTGATATCCCCTGTTTTTTTTCCTCTTCATTTCTGCATGTTTTATACGCATATACCTGAGCAGTCCTACCTAATATGATGTATATCTCTAAGCGCTTGTTATGTAACTTTGTCGAAATAATATAACACATTTGAATATGATCATGTTTAATAGAGTAACAACACAAACAAACAAACAAAACTCTTTGTGCCTTATTATTATTATTGTTTAAAACATAACAAGAAGACTCAACTGCACAGCTGTCAATATCTCTATTGCCTACCAATTAGCACCATAACTTTCCTGCTTTATATTATCTTTATTAGCTTTTTATTCTCATGAATTAATTCATTATTTGTTTTTTTTATATAAATAATACACCATACAATATGTGTATGCATTTTTGTTTATTACTAGTTGTTGTTGTCGTGTTGTTTTCTCTTCTCATTTTTATAAGATAAAAAGAAATGAACAAACTACTATTACTACTTTTATGTTGTAATTATAAACGCTTTTTTAAAAAAAGAAGGGGCTAGGCTGAATATTTATTTG-CCCAGAGACAAAAGTAATCTAAACCGTACATAGTTTCATGCTTTTTGGTTTTTATACGGTTT--CATTTTATGTTTATGCTGTTATACAAATAAAGCACATACATATAATG]

[+] EMBL CD083073             [AGAAAACGGATATTGATCATATGTTGATAAGGCGCGCGGGGGGGAGGGTATCAGCGAATTTGAAATAATTTTTTTCGTTTCATGACAAATAAAAGTCGTGATATCCCCTGTTTTTTTTCCTCTTCATTTCTGCATGTTTTATACGCATATACCTGAGCAGTCCTACCTAATATGATGTATATCTCTAAGCGCTTGTTATGTAACTTTGTCGAAATAATATAACACATTTGAATATGATCATGTTTAATAGAGTAACAACACAAACAAACAAACAAAACTCTTTGTGCCTTATTATTATTATTGTTTAAAACATAACAAGAAGACTCAACTGCACAGCTGTCAATATCTCTATTGCCTACCAATTAGCACCATAACTTTCCTGCTTTATATTATCTGTATTAGCTTTTTATTCTCATGAATTAATTCATTATTTGTTTTTTTTATATAAATAATACACCATACAATATGTGTATGCATTTTTGTTTATTACTAGTTGTTGTTGTCGTGTTGTTTTCTCTTCTCATTNTTATAAGATAAAAAGAAATGAACAAACTACTATTACTACTTTTATGTTGTAATTATAAACGCTNTTTT AAAAAAGAA GGGCTAGGCTGAATATTTATTTGCCCCAGAGACAAAAGT ATCTAAACCGTACATANGTTCATGCCTTTTGG TTTTATACGGGTTNNCA TTTATG TTATGCTNGTATAC AATAAAGt              ]
[-] EMBL BF936261             [                                                                                                                                                                                     TCTCTAAGCGCTTGTTATGTAACTTTGTCGAAATAATATAACACATTTGAATATGATCATGTTTAATAGAGTAACAACACAAACAAACAAACAAAACTCTTTGTGCCTTATTATTATTATTGTTTAAAACATAACAAGAAGACTCAACTGCACAGCTGTCAATATCTCTATTGCCTACCAATTAGCACCATAACTTTCCTGCTTTATATTATCTTTATTAGCTTTTTATTCTCATGAATTAATTCATTATTTGTTTTTTTTATATAAATAATACACCATACAATATGTGTATGCATTTTTGTTTATTACTAGTTGTTGTTGTCGTGTTGTTTTCTCTTCTCATTTTTATAAGATAAAAAGAAATGAACAAACTACTATTACTACTTTTATGTTGTAATTATAAACGCTTTTTTAAAAAAAGAAGGGGCTAGGCTGAATATTTATTTG CCCAGAGACAAAAGTAATCTAAACCGTACATAGTTTCATGCTTTTTGGTTTTTATACGGTTT  CATTTTATGTTTATGCTGTTATACAAATAAAGCACATACATATAATG]
[-] EMBL BF936087             [                                                                                                                                                                                                                       AATATAACACATTTGAATATGATCATGTTTAATAGAGTAACAACACAAACAAACAAACAAAACTCTTTGTGCCTTATTATTATTATTGTTTAAAACATAACAAGAAGACTCAACTGCACAGCTGTCAATATCTCTATTGCCTACCAATTAGCACCATAACTTTCCTGCTTTATATTATCTTTATGAGCTTTTTATTCTCATGAATTAATTCATTATTTGTTTTTTTTATATAAATAATACACCATACAATATGTGTATGCATTTTTGTTTATTACTAGTTGTTGTTGTCGTGTTGTTTTCTCTTCTCATTTTTATAAGATAAAAAGAAATGAACAAACTACTATTACTACTTTTATGTTGTAATTATACACGCTTTTTTAAAAAAAGAAGGGGCTAGGCTGAATATTTATTTG CCCAGAGACAAAAGTAATCTAAACCGCACATA                                                                               ]
[-] EMBL AI976342             [                                                                                                                                                                                                                                                  TTTAATAGAGTACCACCCCAACCAAACAAACAAAACTCTNTGTGCCTTATTATTATTATTGTTTAAAACATAACAAGAAGACTCAACTGCACAGCTGTCAATATCTCTATTGCCTACCAATTAGCACCATAACTTTCCTGCTTTATATTATCTTTATTAGCTTTTTATTCTCATGAATTAATTCATTATTTGTTTTTTTTATATAAATAATACACCATACAATATGTGTATGCATTTTTGTTTATTACTAGTTGTTGTTGTCGTGTTGTTTTCTCTTCTCATTTTTATAAGATAAAAAGAAATGAACAAACTACTATTACTACTTTTATGTTGTAATTATAAACGCTTTTTTAAAAAAAGAAGGGGCTAGGCTGAATATTTATTTG CCCAGAGACAAAAGTAATCTAAACCGTACATAGTTTCATGCTTTTTGGTTTTTATACGGTTT  CATTTTATGTTTATGCTGTTATACAAATAAAGCACATACATATAATG]
[-] EMBL AI976595             [                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTTATTATTATTATTGTTTAAAACATACCAAGAAGACTCAACTGCACAGCTGTCAATATCTCTATTGCCTACCAATTAGCACCATAACTTTCCTGCTTTATATTATCTTTATTAGCTTTTTATTCTCATGAATTAATTCATTATTTGTTTTTTTTATATAAATAATACACCATACAATATGTGTATGCATTTTTGTTTATTACTAGTTGTTGTTGTCGTGTTGTTTTCTCTTCTCATTTTTATAAGATAAAAAGAAATGAACAAACTACTATTACTACTTTTATGTTGTAATTATAAACGCTTTTTTAAAAAAAGAAGGGGCTAGGCTGAATATTTATTTG CCCAGAGACAAAAGTAATCTAAACCGTACATAGTTTCATGCTTTTTGGTTTTTATACGGTTT  CATTTTATGTTTATGCTGTTATACAAATAAAGCACATACATATAATG]
[-] EMBL CD076647             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGCTGTCAATATCTCTATTGCCTACCAATTAGCACCATAACTTTCCTGCTTTATATTATCTGTATTAGCTTTTTATTCTCATGAATTAATTCATTATTTGTTTTTTTTATATAAATAATACCCCATACAATATGTGTATGCATTTTTGTTTATTACTAGTTGTTGTTGTCGTGTTGTTTTCTCTTCTCATTTTTATAAGATAAAAAGAAATGAACAAACTACTATTACTACTTTTATGTTGTAATTATAAACGCTTTTTTAAAAAAAGAAGGGGCTAGGCTGAATATTTATTTG CCCAGAGACAAAAGTAATTTAAACCGTACATAGTTTCATGCTTTTTGGTTTTTATACGGTTT  CATTTTATGTTTATGCTGTTATACAAATAAAGta             ]
[+] EMBL SM667                [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTACTACTTTTATGTTGTAATTATAAACGCTTTTTTAAAAAAAGAAGGGGCTAGGCTGAATATTTA TTG CCCAGAGACAAAAGTAATCTAAACCGTACATAGTTTCATGCTTTTg                                                                 ]




>consensus_8476#0
AGAAAACGGATATTGATCATATGTTGATAAGGCGCGCGGGGGGGAGGGTATCAGCGAATT
TGAAATAATTTTTTTCGTTTCATGACAAATAAAAGTCGTGATATCCCCTGTTTTTTTTCC
TCTTCATTTCTGCATGTTTTATACGCATATACCTGAGCAGTCCTACCTAATATGATGTAT
ATCTCTAAGCGCTTGTTATGTAACTTTGTCGAAATAATATAACACATTTGAATATGATCA
TGTTTAATAGAGTAACAACACAAACAAACAAACAAAACTCTTTGTGCCTTATTATTATTA
TTGTTTAAAACATAACAAGAAGACTCAACTGCACAGCTGTCAATATCTCTATTGCCTACC
AATTAGCACCATAACTTTCCTGCTTTATATTATCTTTATTAGCTTTTTATTCTCATGAAT
TAATTCATTATTTGTTTTTTTTATATAAATAATACACCATACAATATGTGTATGCATTTT
TGTTTATTACTAGTTGTTGTTGTCGTGTTGTTTTCTCTTCTCATTTTTATAAGATAAAAA
GAAATGAACAAACTACTATTACTACTTTTATGTTGTAATTATAAACGCTTTTTTAAAAAA
AGAAGGGGCTAGGCTGAATATTTATTTGCCCAGAGACAAAAGTAATCTAAACCGTACATA
GTTTCATGCTTTTTGGTTTTTATACGGTTTCATTTTATGTTTATGCTGTTATACAAATAA
AGCACATACATATAATG
clustalw multiple alignements is not computed in this case