These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8476#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 737 fasta sequence [AGAAAACGGATATTGATCATATGTTGATAAGGCGCGCGGGGGGGAGGGTATCAGCGAATTTGAAATAATTTTTTTCGTTTCATGACAAATAAAAGTCGTGATATCCCCTGTTTTTTTTCCTCTTCATTTCTGCATGTTTTATACGCATATACCTGAGCAGTCCTACCTAATATGATGTATATCTCTAAGCGCTTGTTATGTAACTTTGTCGAAATAATATAACACATTTGAATATGATCATGTTTAATAGAGTAACAACACAAACAAACAAACAAAACTCTTTGTGCCTTATTATTATTATTGTTTAAAACATAACAAGAAGACTCAACTGCACAGCTGTCAATATCTCTATTGCCTACCAATTAGCACCATAACTTTCCTGCTTTATATTATCTTTATTAGCTTTTTATTCTCATGAATTAATTCATTATTTGTTTTTTTTATATAAATAATACACCATACAATATGTGTATGCATTTTTGTTTATTACTAGTTGTTGTTGTCGTGTTGTTTTCTCTTCTCATTTTTATAAGATAAAAAGAAATGAACAAACTACTATTACTACTTTTATGTTGTAATTATAAACGCTTTTTTAAAAAAAGAAGGGGCTAGGCTGAATATTTATTTG-CCCAGAGACAAAAGTAATCTAAACCGTACATAGTTTCATGCTTTTTGGTTTTTATACGGTTT--CATTTTATGTTTATGCTGTTATACAAATAAAGCACATACATATAATG] [+] EMBL CD083073 [AGAAAACGGATATTGATCATATGTTGATAAGGCGCGCGGGGGGGAGGGTATCAGCGAATTTGAAATAATTTTTTTCGTTTCATGACAAATAAAAGTCGTGATATCCCCTGTTTTTTTTCCTCTTCATTTCTGCATGTTTTATACGCATATACCTGAGCAGTCCTACCTAATATGATGTATATCTCTAAGCGCTTGTTATGTAACTTTGTCGAAATAATATAACACATTTGAATATGATCATGTTTAATAGAGTAACAACACAAACAAACAAACAAAACTCTTTGTGCCTTATTATTATTATTGTTTAAAACATAACAAGAAGACTCAACTGCACAGCTGTCAATATCTCTATTGCCTACCAATTAGCACCATAACTTTCCTGCTTTATATTATCTGTATTAGCTTTTTATTCTCATGAATTAATTCATTATTTGTTTTTTTTATATAAATAATACACCATACAATATGTGTATGCATTTTTGTTTATTACTAGTTGTTGTTGTCGTGTTGTTTTCTCTTCTCATTNTTATAAGATAAAAAGAAATGAACAAACTACTATTACTACTTTTATGTTGTAATTATAAACGCTNTTTT AAAAAAGAA GGGCTAGGCTGAATATTTATTTGCCCCAGAGACAAAAGT ATCTAAACCGTACATANGTTCATGCCTTTTGG TTTTATACGGGTTNNCA TTTATG TTATGCTNGTATAC AATAAAGt ] [-] EMBL BF936261 [ TCTCTAAGCGCTTGTTATGTAACTTTGTCGAAATAATATAACACATTTGAATATGATCATGTTTAATAGAGTAACAACACAAACAAACAAACAAAACTCTTTGTGCCTTATTATTATTATTGTTTAAAACATAACAAGAAGACTCAACTGCACAGCTGTCAATATCTCTATTGCCTACCAATTAGCACCATAACTTTCCTGCTTTATATTATCTTTATTAGCTTTTTATTCTCATGAATTAATTCATTATTTGTTTTTTTTATATAAATAATACACCATACAATATGTGTATGCATTTTTGTTTATTACTAGTTGTTGTTGTCGTGTTGTTTTCTCTTCTCATTTTTATAAGATAAAAAGAAATGAACAAACTACTATTACTACTTTTATGTTGTAATTATAAACGCTTTTTTAAAAAAAGAAGGGGCTAGGCTGAATATTTATTTG CCCAGAGACAAAAGTAATCTAAACCGTACATAGTTTCATGCTTTTTGGTTTTTATACGGTTT CATTTTATGTTTATGCTGTTATACAAATAAAGCACATACATATAATG] [-] EMBL BF936087 [ AATATAACACATTTGAATATGATCATGTTTAATAGAGTAACAACACAAACAAACAAACAAAACTCTTTGTGCCTTATTATTATTATTGTTTAAAACATAACAAGAAGACTCAACTGCACAGCTGTCAATATCTCTATTGCCTACCAATTAGCACCATAACTTTCCTGCTTTATATTATCTTTATGAGCTTTTTATTCTCATGAATTAATTCATTATTTGTTTTTTTTATATAAATAATACACCATACAATATGTGTATGCATTTTTGTTTATTACTAGTTGTTGTTGTCGTGTTGTTTTCTCTTCTCATTTTTATAAGATAAAAAGAAATGAACAAACTACTATTACTACTTTTATGTTGTAATTATACACGCTTTTTTAAAAAAAGAAGGGGCTAGGCTGAATATTTATTTG CCCAGAGACAAAAGTAATCTAAACCGCACATA ] [-] EMBL AI976342 [ TTTAATAGAGTACCACCCCAACCAAACAAACAAAACTCTNTGTGCCTTATTATTATTATTGTTTAAAACATAACAAGAAGACTCAACTGCACAGCTGTCAATATCTCTATTGCCTACCAATTAGCACCATAACTTTCCTGCTTTATATTATCTTTATTAGCTTTTTATTCTCATGAATTAATTCATTATTTGTTTTTTTTATATAAATAATACACCATACAATATGTGTATGCATTTTTGTTTATTACTAGTTGTTGTTGTCGTGTTGTTTTCTCTTCTCATTTTTATAAGATAAAAAGAAATGAACAAACTACTATTACTACTTTTATGTTGTAATTATAAACGCTTTTTTAAAAAAAGAAGGGGCTAGGCTGAATATTTATTTG CCCAGAGACAAAAGTAATCTAAACCGTACATAGTTTCATGCTTTTTGGTTTTTATACGGTTT CATTTTATGTTTATGCTGTTATACAAATAAAGCACATACATATAATG] [-] EMBL AI976595 [ CTTATTATTATTATTGTTTAAAACATACCAAGAAGACTCAACTGCACAGCTGTCAATATCTCTATTGCCTACCAATTAGCACCATAACTTTCCTGCTTTATATTATCTTTATTAGCTTTTTATTCTCATGAATTAATTCATTATTTGTTTTTTTTATATAAATAATACACCATACAATATGTGTATGCATTTTTGTTTATTACTAGTTGTTGTTGTCGTGTTGTTTTCTCTTCTCATTTTTATAAGATAAAAAGAAATGAACAAACTACTATTACTACTTTTATGTTGTAATTATAAACGCTTTTTTAAAAAAAGAAGGGGCTAGGCTGAATATTTATTTG CCCAGAGACAAAAGTAATCTAAACCGTACATAGTTTCATGCTTTTTGGTTTTTATACGGTTT CATTTTATGTTTATGCTGTTATACAAATAAAGCACATACATATAATG] [-] EMBL CD076647 [ AGCTGTCAATATCTCTATTGCCTACCAATTAGCACCATAACTTTCCTGCTTTATATTATCTGTATTAGCTTTTTATTCTCATGAATTAATTCATTATTTGTTTTTTTTATATAAATAATACCCCATACAATATGTGTATGCATTTTTGTTTATTACTAGTTGTTGTTGTCGTGTTGTTTTCTCTTCTCATTTTTATAAGATAAAAAGAAATGAACAAACTACTATTACTACTTTTATGTTGTAATTATAAACGCTTTTTTAAAAAAAGAAGGGGCTAGGCTGAATATTTATTTG CCCAGAGACAAAAGTAATTTAAACCGTACATAGTTTCATGCTTTTTGGTTTTTATACGGTTT CATTTTATGTTTATGCTGTTATACAAATAAAGta ] [+] EMBL SM667 [ TTACTACTTTTATGTTGTAATTATAAACGCTTTTTTAAAAAAAGAAGGGGCTAGGCTGAATATTTA TTG CCCAGAGACAAAAGTAATCTAAACCGTACATAGTTTCATGCTTTTg ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||