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Schistosoma mansoni
cluster # 8480 cluster # 8480       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8480#0 length = 1360 sequences # 7  

consensusID : consensus_8480#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1360
fasta sequence
                              [CGCTTTCTTTCTACGTGACTGACTAATGTGTCACTGACTGCTCGCTCCGCAATCATCTTGATAACAGCGCTTTGTTGCCTAACTTCTGATGGATGTGCCGGGTCCGAATGTATCACAGTTGATGCCACTGGTCATGCATCGAATCATATACATGTTGAAGCTTATCAAGTTAGTAATCAAGCTATGGCGTTAGTGAAAGATAATATTATTGTGCCAACGTATGATGCACCTGAATTAGGTTATGTAAAAGAAACTACCAAAGAACAATTCGTTCCGGAAGTGTTTTATGCGACCAAGGATAAATATGGTAATCGTGTCACACGTGTCGCTCGTCCTTTACCAGTTGAGTTCCTGTTGACAAATATGCCAACAG-CTTTTCCAATTGAACCATTTTATACGATGGCTAAATTTCCTGATGATTTTCCAGTTGATTTTCAATTTCCAATTGAGAATCGTGAGTGTTTAGGTCAAATTCAAGATATACCGAGTTTTGCTCGTATACTTCATAAATTTGGAGTTGATCAAATTCATACATGTTTGACTAATTTTCATATACTTGCATGGTTAGTTAATAATGATACACTTAGTTTACAACTTTTCAACTCTGAAGGTAAATTAAATGAAGATCCATATGGGATCATTGGTTTACTAGATGCAATTGCTTTACGTTGTTCTAATCATCAATCATCTAATAATAATAATAGTTCGATAAAACAATCTGAATTAGCTGTTAAGAAATGGGCTAAAGAATCACCAATTTGGGCTACTGTACAAGAGTTAGCTAATGCAGTTGTTTCCGATATGCCACCTAGTCCTCCATTGCCTACTCAATCAGATTCATATCGTTCTGCGCTCAGTAGTTCTAGTGTTTCTTTAGGAGTTGGTCCAACATCAGTGCTTAAGTCAACTTGGTCATCTCAAACAACAACACCGTCGGGGACAACAGAACTACGAAATTCAGAATCTAGTCACTGGGCCTGTTCTCACTGTACTTTTCATAATAGTCCTGGTACTGATGAATGCGAAATGTGTCGCCTACCTCGACGTGGATGAAGTGTGCTGAGGTGGTAAACCGATAACAGAAAAGATCAATGAACAGTTATCTTGGTAACAATGACGCTTATTCAAGACTAATTATCTCTGCATCTACAATTTCTTTAGAGCTCGTGTATCTTTTCTTTTTACCTAAGGATGGGATAAATAAACAAGAACTTTTTCCCGTCCTCTTTTGTATGTGAATAACGTTTGTCATTTATTGTAGATTGCCCATTTTTTCATCTGAACTTTTCTTGCCCTGTACTCCTATTAATCTGTTACTTTTGTCTNTAAAATAATAATTACTCAACGTTACCAAAAAAAG]

[+] EMBL CD114321             [CGCTTTCTTTCTACGTGACTGACTAATGTGTCACTGACTGCTCGCTCCGCAATCATCTTGATAACAGCGCTTTGTTGCCTAACTTCTGATGGATGTGCCGGGTCCGAATGTATCACAGTTGATGCCACTGGTCATGCATCGAATCATATACATGTTGAAGCTTATCAAGTTAGTAATCAAGCTATGGCGTTAGTGAAAGATAATATTATTGTGCCAACGTATGATGCACCTGAATTAGGTTATGTAAAAGAAACTACCAAAGAACAATTCGTTCCGGAAGTGTTTTATGCGACCAAGGATAAATATGGTAATCGTGTCACACGTGTCGCTCGTCCTTTACCAGTTGAGTTCCTGTTGACAAATATGCCAACAGCCTTTTCCAATTGAACCATTTTATACGATGGCTAAATTTCCTGATGATTTTCCAGTTGATTTTCAATTTCCAATTGAGAATCGTGAGTGTTTAGGTCAAATTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD080339             [                                                                                                                                                                                                                                                                  aggGAACAATTCGTTCCGGAAGTGTTTTATGCGACCAAGGATAAATATGGTAATCGTGTCACACGTGTCGCTCGTCCTTTACCAGTTGAGTTCCTGTTGACAAATATGCCAACAG CTTTTCCAATTGAACCATTTTATACGATGGCTAAATTTCCTGATGATTTTCCAGTTGATTTTCAATTTCCAATTGAGAATCGTGAGTGTTTAGGTCAAATTCAAGATATACCGAGTTTTGCTCGTATACTTCATAAATTTGGAGTTGATCAAATTCATACATGTTTGACTAATTTTCATATACTTGCATGGTTAGTTAATAATGATACACTTAGTTTACAACTTTTCAACTCTGAAGGTAAATTAAATGAAGATCCATATGGGATCATTGGTTTACTAGATGCAATTGCTTTACGTTGTTCTAATCATCAATCATCTAATAATAATAATAGTTCGATAAAACAATCTGAATTAGCTGTTAAGAAATGGGCTAAAGAATCACCAATTTGGGCTACTGTACAAGAGTTAGCTAATGCAGTTGTTTCCGATATGCCACCTAGTCCTCCATTGCCTACTCAATCAGATTCATATCGTTCTGCGCTCAGTAGTTCTAGTGTTTCTTTAGGAGTTGGTCCAACATCAGTGCTTAAGTCAACTTGGTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD079174             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CGTGTCACACGTGTCGCTCGTCCTTTACCAGTTGAGTTCCTGTTGACAAATATGCCAACAG CTTTTCCAATTGAACCATTTTATACGATGGCTAAATTTCCTGATGATTTTCCAGTTGATTTTCAATTTCCAATTGAGAATCGTGAGTGTTTAGGTCAAATTCAAGATATACCGAGTTTTGCTCGTATACTTCATAAATTTGGAGTTGATCAAATTCATACATGTTTGACTAATTTTCATATACTTGCATGGTTAGTTAATAATGATACACTTAGTTTACAACTTTTCAACTCTGAAGGTAAATTAAATGAAGATCCATATGGGATCATTGGTTTACTAGATGCAATTGCTTTACGTTGTTCTAATCATCAATCATCTAATAATAATAATAGTTCGATAAAACAATCTGAATTAGCTGTTAAGAAATGGGCTAAAGAATCACCAATTTGGGCTACTGTACAAGAGTTAGCTAATGCAGTTGTTTCCGATATGCCACCTAGTCCTCCATTGCCTACTCAATCAGATTCATATCGTTCTGCGCTCAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD127141             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATGGCTAAATTTCCTGATGATTTTCCAGTTGATTTTCAATTTCCAATTGAGAATCGTGAGTGTTTAGGTCAAATTCAAGATATACCGAGTTTTGCTCGTATACTTCATAAATTTGGAGTTGATCAAATTCATACATGTTTGACTAATTTTCATATACTTGCATGGTTAGTTAATAATGATACACTTAGTTTACAACTTTTCAACTCTGAAGGTAAATTAAATGAAGATCCATATGGGATCATTGGTTTACTAGATGCAATTGCTTTACGTTGTTCTAATCATCAATCATCTAATAATAATAATAGTTCGATAAAACAATCTGAATTAGCTGTTAAGAAATGGGCTAAAGAATCACCAATTTGGGCTACTGTACAAGAGTTAGCTAATGCAGTTGTTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD074259             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTGTTAAGAAATGGGCTAAAGAATCACCAATTTGGGCTACTGTACAAGAGTTAGCTAATGCAGTTGTTTCCGATATGCCACCTAGTCCTCCATTGCCTACTCAATCAGATTCATATCGTTCTGCGCTCAGTAGTTCTAGTGTTTCTTTAGGAGTTGGTCCAACATCAGTGCTTAAGTCAACTTGGTCATCTCAAACAACAACACCGTCGGGGACAACAGAACTACGAAATTCAGAATCTAGTCACTGGGCCTGTTCTCACTGTACTTTTCATAATAGTCCTGGTACTGATGAATGCGAAATGTGTCGCCTACCTCGACGTGGATGAAGTGTGCTGAGGTGGTAAACCGATAACAGAAAAGATCAATGAACAGTTATCTTGGTAACAATGACGCTTATTCAAGACTAATTATCTCTGCATCTACAATTTCTTTAGAGCTCGTGTATCTTTTCTTTTTACCTAAGGATGGGATAAATAAACAAGAACTTTTTCCCGTCCTCTTTTGTATGTGAATAACGTTTGTCATTTATTGTAGATTGCCCATTTTTTCATCTGAACTTTTCTTGCCCTGTACTCCTATTAGTCTGTTACTTTTGTCTNTAAAATAATAATTACTCAACGTTACCAAAAAAAG]
[+] EMBL CD084357             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cgaggGTTTCCGATATGCCACCTAGTCCTCCATTGCCTACTCAATCAGATTCATATCGTTCTGCGCTCAGTAGTTCTAGTGTTTCTTTAGGAGTTGGTCCAACATCAGTGCTTAAGTCAACTTGGTCATCTCAAACAACAACACCGTCGGGGACAACAGAACTACGAAATTCAGAATCTAGTCACTGGGCCTGTTCTCACTGTACTTTTCATAATAGTCCTGGTACTGATGAATGCGAAATGTGTCGCCTACCTCGACGTGGATGAAGTGTGCTGAGGTGGTAAACCGATAACAGAAAAGATCAATGAACAGTTATCTTGGTAACAATGACGCTTATTCAAGACTAATTATCTCTGCATCTACAATTTCTTTAGAGCTCGTGTATCTTTTCTTTTTACCTAAGGATGGGATAAATAAACAAGAACTTTTTCCCGTCCTCTTTTGTATGTGAATAACGTTTGTCATTTATTGTAGATTGCCCATTTTTTCATCTGAACTTTTCTTGCCCTGTACTCCTATTAATCTGTTACTTTTGTCTCT TAATAATA                        ]
[+] EMBL CD084302             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GTTTCCGATATGCCACCTAGTCCTCCATTGCCTACTCAATCAGATTCATATCGTTCTGCGCTCAGTAGTTCTAGTGTTTCTTTAGGAGTTGGTCCAACATCAGTGCTTAAGTCAACTTGGTCATCTCAAACAACAACACCGTCGGGGACAACAGAACTACGAAATTCAGAATCTAGTCACTGGGCCTGTTCTCACTGTACTTTTCATAATAGTCCTGGTACTGATGAATGCGAAATGTGTCGCCTACCTCGACGTGGATGAAGTGTGCTGAGGTGGTAAACCGATAACAGAAAAGATCAATGAACAGTTATCTTGGTAACAATGACGCTTATTCAAGACTAATTATCTCTGCATCTACAATTTCTTTAGAGCTCGTGTATCTTTTCTTTTTACCTAAGGATGGGATAAATAAACAAGAACTTTTTCCCGTCCTCTTTTGTATGTGAATAACGTTTGTCATTTATTGTAGATTGCCCATTTTTTCATCTGAACTTTTCTTGCCCTGTACTCCTATTAATCTGTT                                             ]


>consensus_8480#0 CGCTTTCTTTCTACGTGACTGACTAATGTGTCACTGACTGCTCGCTCCGCAATCATCTTG ATAACAGCGCTTTGTTGCCTAACTTCTGATGGATGTGCCGGGTCCGAATGTATCACAGTT GATGCCACTGGTCATGCATCGAATCATATACATGTTGAAGCTTATCAAGTTAGTAATCAA GCTATGGCGTTAGTGAAAGATAATATTATTGTGCCAACGTATGATGCACCTGAATTAGGT TATGTAAAAGAAACTACCAAAGAACAATTCGTTCCGGAAGTGTTTTATGCGACCAAGGAT AAATATGGTAATCGTGTCACACGTGTCGCTCGTCCTTTACCAGTTGAGTTCCTGTTGACA AATATGCCAACAGCTTTTCCAATTGAACCATTTTATACGATGGCTAAATTTCCTGATGAT TTTCCAGTTGATTTTCAATTTCCAATTGAGAATCGTGAGTGTTTAGGTCAAATTCAAGAT ATACCGAGTTTTGCTCGTATACTTCATAAATTTGGAGTTGATCAAATTCATACATGTTTG ACTAATTTTCATATACTTGCATGGTTAGTTAATAATGATACACTTAGTTTACAACTTTTC AACTCTGAAGGTAAATTAAATGAAGATCCATATGGGATCATTGGTTTACTAGATGCAATT GCTTTACGTTGTTCTAATCATCAATCATCTAATAATAATAATAGTTCGATAAAACAATCT GAATTAGCTGTTAAGAAATGGGCTAAAGAATCACCAATTTGGGCTACTGTACAAGAGTTA GCTAATGCAGTTGTTTCCGATATGCCACCTAGTCCTCCATTGCCTACTCAATCAGATTCA TATCGTTCTGCGCTCAGTAGTTCTAGTGTTTCTTTAGGAGTTGGTCCAACATCAGTGCTT AAGTCAACTTGGTCATCTCAAACAACAACACCGTCGGGGACAACAGAACTACGAAATTCA GAATCTAGTCACTGGGCCTGTTCTCACTGTACTTTTCATAATAGTCCTGGTACTGATGAA TGCGAAATGTGTCGCCTACCTCGACGTGGATGAAGTGTGCTGAGGTGGTAAACCGATAAC AGAAAAGATCAATGAACAGTTATCTTGGTAACAATGACGCTTATTCAAGACTAATTATCT CTGCATCTACAATTTCTTTAGAGCTCGTGTATCTTTTCTTTTTACCTAAGGATGGGATAA ATAAACAAGAACTTTTTCCCGTCCTCTTTTGTATGTGAATAACGTTTGTCATTTATTGTA GATTGCCCATTTTTTCATCTGAACTTTTCTTGCCCTGTACTCCTATTAATCTGTTACTTT TGTCTNTAAAATAATAATTACTCAACGTTACCAAAAAAAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)