cluster # 8485

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8485 cluster # 8485 Sequences # 7 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8485#0 length = 1346 sequences # 7
consensusID : consensus_8485#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1346
fasta sequence
                              [CACACCAACATCGAAAAATGAATCAAATAATTTAACATCTGTTGCTGATAAATCCAAACAGAAACGGTTAAACAATTCTTCAATTACAAAACCTAATGTCAAGAAAACGGAATCATTACCAACAGCATATCCTTTTAATCTGGAGTTAAAAGTTCAAATAGATAATCCTGAATTAGTACTTGTTGAAGATATTTACAATGTTGATAGTAATGCGATTAAACTTACTACTGAATTAAGTTTTGGTTACAATATGAAACAGGATATTGTTGTTATAAATGCTTTAATCAACAGTTTGTCTATTGCTGCCTGCCCTTACAATGAAACAGTTGGTGGGCCATTTTCTAAGGAGATTTTATCTCCTTCTGATTTGAGTTTTTATGCATCTCAACCAATCAATGGTAGTTTACATGGAACTTTTCATATGGATACTTTAACAATCAATATTAACCCAAACACAATCAGATTATTATCAGCAATTTCCTCATCTGTTCAATCATCTTTAACCACT-GACAAAAATCCAGATATATGTGAAACTGTTTCAAATGATGAATCTATGAAAAGCGTCAATGTAGATCATTCGGATGAAAAATCACTTACTGAGTTTTGGAAACCGATTCAACTAAAAGAATTAAATATGCCTTATTTAGGATTGACATCAGATTCAAAAGATAAAATTGTATGTGTTGAAAAGGCTTGTGATATTGCGAAAGTTGTCGAAGAAACGGAAAACCGCCGCATAGATATCATAAATATTCGATTAAAAACTATTCGAATTATATTGGAATCTCAGTTGGATACGAAATTTATGCCAATGCTTGTTCTTGACTCTACTTTAGATGCAGTTCTAACTAAACCAATTACACATGTCGAACTAAAGTTTCTAATAGAATTATCCTTATCATATTACAATGATTCAATTAATCAATGGGAACCATTAATTGAAACTTTACCAGAAGAAGGTGATCGTATGTGGTCCCTTCAATTGGAATTAGTCAGTATTAATAATAATAAGGCAGAATGTTTAACCGACGATGACTGGGAGAATGTTGGCTGTCTACAAGCATCAACGAATACAATATTAATTCTGTCCAGAGATAATTTAGAAATCACTATATCTAAAACTGCTTTAGAAATGTTAAATAATTTGGGTCGTTCATTTGAAGCAGCCTATAAGTTG-AAAATATCAAATCGAAATACGATGATTCTACCAATCGAATTATAGCACCCTATTGCATTATGAATAAAACCGGTTGTCAGCTAATGCTACGATATAATTCTCAAGCTCTATCGTTGATTCACTTCGACAGTGATAATACAATGACTAAAAGTGAATCTCTTCATCAAAC]

[+] EMBL CD196157             [CACACCAACATCGAAAAATGAATCAAATAATTTAACATCTGTTGCTGATAAATCCAAACAGAAACGGTTAAACAATTCTTCAATTACAAAACCTAATGTCAAGAAAACGGAATCATTACCAACAGCATATCCTTTTAATCTGGAGTTAAAAGTTCAAATAGATAATCCTGAATTAGTACTTGTTGAAGATATTTACAATGTTGATAGTAATGCGATTAAACTTACTACTGAATTAAGTTTTGGTTACAATATGAAACAGGATATTGTTGTTATAAATGCTTTAATCAACAGTTTGTCTATTGCTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD096598             [                                                                                  ATTACAAAACCTAATGTCAAGAAAACGGAATCATTACCAACAGCATATCCTTTTAATCTGGAGTTAAAAGTTCAAATAGATAATCCTGAATTAGTACTTGTTGAAGATATTTACAATGTTGATAGTAATGCGATTAAACTTACTACTGAATTAAGTTTTGGTTACAATATGAAACAGGTTATTGTTGTTATAAATGCTTTAATCAACAGTTTGTCTATTGCTGCCTGCCCTTACAATGAAACAGTTGGTGGGCCATTTTCTAAGGAGATTTTATCTCCTTCTGATTTGAGTTTTTATGCATCTCAACCAATCAATGGTAGTTTACATGGAACTTTTCATATGGATACTTTAACAATCAATATTAACCCAAACACAATCAGATTATTATCAGCAATTTCCTCATCTGTTCAATCATCTTTAACCACT GACAAAAATCCAGATATATGTGAAACTGTTTCAAATGATGAATCTATGAAAAGCGTCAATGTAGATCATTCGGATG AAAATCACTTACTGAGTTTTGGAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD202669             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTATTATCAACAATTTCCTCATCTGTTCAATCATCTTTAACCACT GACAAAAATCCAGATATATGTGAAACTGTTTCAAATGATGAATCTATGAAAAGCGTCAATGTATATCATTCCGATGAAAAATCACTTACTGAGTTTTGGAAACCGATTCAACTAAAAGAATTAAATATGCCTTATTTAGGATTGACATCATATTCAAAAGATAAAATTGTATGTGTTGAAAAGGCTTGTGATATTGCCAAAGTTGTCGAAGAAACGGAAAACCGCCGCATATATATCATAAATATTCGATTAAAAACTATTCGAATTATATTGGAATCTCAGTTGGATACGAAATTTATGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD202688             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TATTATCAGCAATTTCCTCATCTGTTCAATCATCTTTAACCACT GACAAAAATCCAGATATATGTGAAACTGTTTCAAATGATGAATCTATGAAAAGCGTCAATGTAGATCATTCGGATGAAAAATCACTTACTGAGTTTTGGAAACCGATTCAACTAAAAGAATTAAATATGCCTTATTTAGGATTGACATCAGATTCAAAAGATAAAATTGTATGTGTTGAAAAGGCTTGTGATATTGCGAAAGTTGTCGAAGAAACGGAAAACCGCCGCATAGATATCATAAATATTCGATTAAAAACTATTCGAATTATATTGGAATCTCAGTTGGATACGAAATTTATGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD111431             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCACTGGACAAAAATCCAGATATATGTGAAACTGTTTCAAATGATGAATCTATGAAAAGCGTCAATGTAGATCATTCAGATGAAAAATCACTTACTGAGTTTTGGAAACCGATTCAACTAAAAGAATTAAATATGCCTTATTTAGGATTGACATCAGATTCAAAAGATAAAATTGAATGTGTTGAAAAGGCTTGTGATATTGCGAAAGTTGTCGAAGAAACGGAAAACCGCCGCATAGATATCATAAATATTCGATTAAAAACTATTCGAATTATATTGGAATCTCAGTTGGATACGAAATTTATGCCAATGCTTGTTCTTGACTCTACTTTAGATGCAGTTCTAACTAAACCAATTACACATGTCGAACTAAAGTTTCTAATAGAATTATCCTTATCATATTACAATGATTCAATTAATCAATGGGAACCATTAATTGAAACTTTACCAGAAGAAGGTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD201537             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAGATAAAATTGAATGTGTTGAAAAGGCTTGTGATATTGCGAAAGTTGTCGAAGAAACGGAAAACCGCCGCATAGATATCATAAATATTCGATTAAAAACTATTCGAATTATATTGGAATCTCAGTTGGATACGAAATTTATGCCAATGCTTGTTCTTGACTCTACTTTAGATGCAGTTCTAACTAAACCAATTACACATGTCGAGCTAAAGTTTCTAATAGAATTATCCTTATCATATTACAATGATTCAATTAATCAATGGGAACCATTAATTGAAACTTTACCAGAAGAAGGTGATCGTATGTGGTCCCTTCAATTGGAATTAGTCAGTATTAATAATAATAAGGCAGAATGTTTAACCGACGATGACTGGGAGAATGTTGGCTGTCTACAAGCATCAACGAATACAATATTAATTCTGTCCAGAGATAATTTAGAAATCACTATATCTAAAACTGCTTTAGAAATGTTAAATAATTTGGGTCGTTCATTTGAAGCAGCCTATAAGTTG AAAATATCAAATCGAAATACGATGATTCTACCAATCGAATTATAGCACCCTATTGCATTATGAATA                                                                                                       ]
[-] EMBL CD116975             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTAATCAATGGGAACCATTAATTGAAACTTTACCAGAAGAAGGTGATCGTATGTGGTCCCTTCAATTGGAATTAGTCAGTATTAATAATAATAAGGCAGAATGTTTAACCGACGATGACTGGGAGAATGTTGGCTGTCTACAAGCATCAACGAATACAATATTAATTCTGTCCAGAGATAATTTAGAAATCACTATATCTAAAACTGCTTTAGAAATGTTAAATAATTTGGGTCGTTCATTTGAAGCAGCCTATAAGTTGAAAAATATCAAATCGAAATACGATGATTCTACCAATCGAATTATGGCACCCTATTGCATTATGAATAAAACCGGTTGTCAGCTAATGCTACGATATAATTCTCAAGCTCTATCGTTGATTCACTTCGACAGTGATAATACAATGACTAAAAGTGAATCTCTTCATCAAAC]




>consensus_8485#0
CACACCAACATCGAAAAATGAATCAAATAATTTAACATCTGTTGCTGATAAATCCAAACA
GAAACGGTTAAACAATTCTTCAATTACAAAACCTAATGTCAAGAAAACGGAATCATTACC
AACAGCATATCCTTTTAATCTGGAGTTAAAAGTTCAAATAGATAATCCTGAATTAGTACT
TGTTGAAGATATTTACAATGTTGATAGTAATGCGATTAAACTTACTACTGAATTAAGTTT
TGGTTACAATATGAAACAGGATATTGTTGTTATAAATGCTTTAATCAACAGTTTGTCTAT
TGCTGCCTGCCCTTACAATGAAACAGTTGGTGGGCCATTTTCTAAGGAGATTTTATCTCC
TTCTGATTTGAGTTTTTATGCATCTCAACCAATCAATGGTAGTTTACATGGAACTTTTCA
TATGGATACTTTAACAATCAATATTAACCCAAACACAATCAGATTATTATCAGCAATTTC
CTCATCTGTTCAATCATCTTTAACCACTGACAAAAATCCAGATATATGTGAAACTGTTTC
AAATGATGAATCTATGAAAAGCGTCAATGTAGATCATTCGGATGAAAAATCACTTACTGA
GTTTTGGAAACCGATTCAACTAAAAGAATTAAATATGCCTTATTTAGGATTGACATCAGA
TTCAAAAGATAAAATTGTATGTGTTGAAAAGGCTTGTGATATTGCGAAAGTTGTCGAAGA
AACGGAAAACCGCCGCATAGATATCATAAATATTCGATTAAAAACTATTCGAATTATATT
GGAATCTCAGTTGGATACGAAATTTATGCCAATGCTTGTTCTTGACTCTACTTTAGATGC
AGTTCTAACTAAACCAATTACACATGTCGAACTAAAGTTTCTAATAGAATTATCCTTATC
ATATTACAATGATTCAATTAATCAATGGGAACCATTAATTGAAACTTTACCAGAAGAAGG
TGATCGTATGTGGTCCCTTCAATTGGAATTAGTCAGTATTAATAATAATAAGGCAGAATG
TTTAACCGACGATGACTGGGAGAATGTTGGCTGTCTACAAGCATCAACGAATACAATATT
AATTCTGTCCAGAGATAATTTAGAAATCACTATATCTAAAACTGCTTTAGAAATGTTAAA
TAATTTGGGTCGTTCATTTGAAGCAGCCTATAAGTTGAAAATATCAAATCGAAATACGAT
GATTCTACCAATCGAATTATAGCACCCTATTGCATTATGAATAAAACCGGTTGTCAGCTA
ATGCTACGATATAATTCTCAAGCTCTATCGTTGATTCACTTCGACAGTGATAATACAATG
ACTAAAAGTGAATCTCTTCATCAAAC
clustalw multiple alignements is not computed in this case