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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8491#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1096 fasta sequence
[CTTTGTTGCATGGGGAATTAGCACGGAATCCATGGGTATTATAGATGAAGGTCTACCAGAAATTGTTGATGAATTGGATTATCAATACAGAACTGCAAACTGGCTTATTAAAACCAGAGAGCCATTTTGCCTTGGAGATGATGTAAGAGGACAACTTTTATCTCTCTTACGCAAACAAAGTGAATTTTCACGGACGCAGTTTAAAGATAAAGGTGTTTTTAAAGTTCCGTTTGTTGGATCTATGGTATTTGAAGATGGATATGGAGATTATGTTTTGGATTGGTTTCCCCCAAGTGACCAATCAATAATTCCAACCAATATTGTTGTCTATATTCATGGAGGTTATTGGCAGTTAG-TTGGATGGGGAGAATCCAGTAACTGGGCAGTTCCTGTTACAAATGCAGATAGTATATTTGTCTCTTTGTCTTACAGGTTAGCTCCAAAAGAAAAACTGGAAGCGATGTCACAAAGTCTATGTCTCGGTATGCAAAAAGTTATGACTCTTACGCATAAAATGTTTGGTAACTTAGATGATACGAAGCTCCGTATAACCCTATTTGGACATTCTGCCGGTGCACACTTAGTTCTGGAAATGATATATTGGGCTCATATGGACCTCGAATCAAATAATAATTGGCTATGCTGTTTGCGAAACCTTGTTTTAATGTCGGGAGTTTATGATCTACGTCCAATTATCCATACTTACGTAAATAAAGCAATAAAGTTTAAAACGATTGAGGAGGCTTTGTCTGTCAGTCCAATCCGACACTTCATGCAAGATGGTCTAAATCTACTGCTCAGCAAATCACTTCATTGGATTGTTGCTTGGGCAGAGTACGAATCGCCAGCTATGAAGGGCCAATTTAAATCACTAGCGGACTTGTTAAGTAAAGCATCAAACAGAAGTGGCCAAGGTTCACCTTTGCAATTTACCTATGAAACGTTTTATATGTCAAATGAAGATCATTTTACTTCACTCCTCGGTTTGCATGATGGTCCAAATCACAGTGCTATCCTCAAAAAAATCATAGATCTCATTAACCTCAAGCCTATTTAGTCGGGTCGCCCAATATAAAATCATAGAATAAAACGGTGA]
[+] EMBL CD083118 [CTTTGTTGCAT GGGAATTAGCACGGAATCCATGGGTATTATAGATGAAGGTCTACCAGAAATTGTTGATGAATTGGATTATCAATACAGAACTGCAAACTGGCTTATTAAAACCAGAGAGCCATTTTGCCTTGGAGATGATGTAAGAGGACAACTTTTATCTCTCTTACGCAAACAAAGTGAATTTTCACGGACGCAGTTTAAAGATAAAGGTGTTTTTAAAGTTCCGTTTGTTGGATCTATGGTATTTGAAGATGGATATGGAGATTATGTTTTGGATTGGTTTCCCCCAAGTGACCAATCAATAATTCCAACCAATATTGTTGTCTATATTCATGGAGGTTATTGGCAGTTAG TTGGATGGGGAGAATCCAGTAACTGGGCAGTTCCTGTTACAAATGCAGATAGTATATTTGTCTCTTTGTCTTACAGGTTAGCTCCAAAAGAAAAACTGGAAGCGATGTCACAAAGTCTATGTCTCGGTATGCAAAAAGTTATGACTCTTACGCATAAAATGTTTGGTAACTTAGATGATACGAAGCTCCGTATAACCCTATTTGGACATTCTGCCGGTGCACACTTAGTTCTGGAA ]
[+] EMBL CD081930 [ gGTTGCATGGGGAATTAGCACGGAATCCATGGGTATTATAGATGAAGGTCTACCAGAAATTGTTGATGAATTGGATTATCAATACAGAACTGCAAACTGGCTTATTAAAACCAGAGAGCCATTTTGCCTTGGAGATGATGTAAGAGGACAACTTTTATCTCTCTTACGCAAACAAAGTGAATTTTCACGGACGCAGTTTAAAGATAAAGGTGTTTTTAAAGTTCCGTTTGTTGGATCTATGGTATTTGAAGATGGATATGGAGATTATGTTTTGGATTGGTTTCCCCCAAGTGACCAATCAATAATTCCAACCAATATTGTTGTCTATATTCATGGAGGTTATTGGCAGTTAG TTGGATGGGGAGAATCCAGTAACTGGGCAGTTCCTGTTACAAATGCAGATAGTATATTTGTCTCTTTGTCTTACAGGTTAGCTCCAAAAGAAAAACTGGAAGCGATGTCACAAAGTCTATGTCTCGGTATGCAAAAAGTTATGACTCTTACGCATAAAATGTTTGGTAACTTAGATGATACGAAGCTCCGTATAACCCTATTTGGACATTCTGCCGGTGCACACTTAGTTCTGGAAATGATATATTGGGCTCATATGGACCTCGAATCANATAATAATTGGCTATGCTGNTTG ]
[+] EMBL CD196309 [ atGGGAATTAGCACGGAATCCATGGGTATTATAGATGAAGGTCTACCAGAAATTGTTGATGAATTGGATTATCAATACAGAACTGCAAACTGGCTTATTAAAACCAGAGAGCCATTTTGCCTCGGAGATGATGTAAGAGGACAACTTTTATCTCTCTTACGCAAACAAAGTGAATTTTCACGGACGCAGTTTAAAGATAAAGGTGTTTTTAAAGTTCCGTTTGTTGGATCTATGGTATTTGAAGATGGATATGGAGATTATGTTTTGGATTGGTTTCCCCCAAGTGACCAATCGATAATGCC ANCGATATTGNTGTCTATATTCATGGAGGCTATTGGCAGNTAGNNTGGAT GGGAG ATCCAGTAACTGGGCAGNTCCTGTTACAANTGCAGATAGNATATTTGTCTCTTTGNCNTACAGGGTAGCTCC AAAGGAAAACTGGA ]
[+] EMBL CD182266 [ GAATTTTCACGGACGCAGTTTAAAGATAAAGGTGTTTTTAAAGTTCCGTTTGTTGGATCTATGGTATTTGAAGATGGATATGGAGATTATGTTTTGGATTGGTTTCCCCCAAGTGACCAATCAATAATTCCAGCCAATATTGTTGTCTATATTCATGGAGGTTATTGACA ]
[-] EMBL CD190496 [ ATATGGAGATTATGTTTTGGATTGGTTTCCCCCAAGTGACCAATCAATAATTCCAACCAATATTGTTGTCTATATTCATGGAGGTTATTGGCAGTTAG TTGGATGGGGAGAATCCAGTAACTGGGCAGTTCCTGTTACAAATGCAGATAGTATATTTGTCTCTTTGTCTTACAGGTTAGCTCCAAAAGAAAAACTGGAAGCGATGTCACAAAGTCTATGTCTCGGTATGCAAAAAGTTATGACTCTTACGCATAAAATGTTTGGTAACTTAGATGATACGAAGCTCCGTATAACCCTATTTGGACATTCTGCCGGTGCACACTTAGTTCTGGAAATGATATATTGGGCTCATATGGACCCCGAATCAAATAATAATTGGCTATGCTGTTTGCGAAACCTTGTTTTAATGTCGGGAGTTTATGATCTACGTCCAATTATCCATACTTACGTAAATAAAGCAATAAAGTTTA ]
[-] EMBL CD076692 [ CTGGAAATGATATATTGGGCTCATATGGACCTCGAATCAAATAATAATTGGCTATGCTGTTTGCGAAACCTTGTTTTAATGTCGGGAGTTTATGATCTACGTCCAATTATCCATACTTACGTAAATAAAGCAATAAAGTTTAAAACGATTGAGGAGGCTTTGTCTGTCAGTCCAATCCGACACTTCATGCAAGATGGTCTAAATCTACTGCTCAGCAAATCACTTCATTGGATTGTTGCTTGGGCAGAGTACGAATCGCCAGCTATGAAGGGCCAATTTAAATCACTAGCGGACTTGTTAAGTAAAGCATCAAACAGAAGTGGCCAAGGTTCACCTTTGCAATTTACCTATGAAACGTTTTATATGTCAAATGAAGATCATTTTACTTCACTCCTCGGTTTGCATGATGGTCCAAATCACAGTGCTATCCTCAAAAAAATCATAGATCTCATTAACCTCAAGCCTATTTAGTCGGGTCGCCCAATATAAAATCATAGAATAAAACGGTGA]
[+] EMBL CD140887 [ GAATCAAATAATAATTGGCTAAGCTGTTTGCGAAACCTTGTTTTAATGTCGGGAGTTTATGATCTACGTCCAATTATCCATACTTACGTAAATAAAGCAATAAAGTTTAAAACGATTGAGGAGGCTTTGTCTGTCAGTCCAATCCGACACTTCATGCAAGATGGTCTAAATCTACTGCTCAGCAAATCACTTCATTGGATTGTTGCTTGGGCAGAGTACGAATCGCCAGCTATGAAGGGACAATCTAAATCACTAGCGGACTTGTTAAGTAAAGCATCAAACAGAAGTGGACAAGGTTCACCTTTGCAATTTACCTATGAAACGTTTTATATGTCAAATGAAGATCATTTTACTTCACTCCTC ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||