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Schistosoma mansoni
cluster # 8491 cluster # 8491       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8491#0 length = 1096 sequences # 7  

consensusID : consensus_8491#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1096
fasta sequence
                              [CTTTGTTGCATGGGGAATTAGCACGGAATCCATGGGTATTATAGATGAAGGTCTACCAGAAATTGTTGATGAATTGGATTATCAATACAGAACTGCAAACTGGCTTATTAAAACCAGAGAGCCATTTTGCCTTGGAGATGATGTAAGAGGACAACTTTTATCTCTCTTACGCAAACAAAGTGAATTTTCACGGACGCAGTTTAAAGATAAAGGTGTTTTTAAAGTTCCGTTTGTTGGATCTATGGTATTTGAAGATGGATATGGAGATTATGTTTTGGATTGGTTTCCCCCAAGTGACCAATCAATAATTCCAACCAATATTGTTGTCTATATTCATGGAGGTTATTGGCAGTTAG-TTGGATGGGGAGAATCCAGTAACTGGGCAGTTCCTGTTACAAATGCAGATAGTATATTTGTCTCTTTGTCTTACAGGTTAGCTCCAAAAGAAAAACTGGAAGCGATGTCACAAAGTCTATGTCTCGGTATGCAAAAAGTTATGACTCTTACGCATAAAATGTTTGGTAACTTAGATGATACGAAGCTCCGTATAACCCTATTTGGACATTCTGCCGGTGCACACTTAGTTCTGGAAATGATATATTGGGCTCATATGGACCTCGAATCAAATAATAATTGGCTATGCTGTTTGCGAAACCTTGTTTTAATGTCGGGAGTTTATGATCTACGTCCAATTATCCATACTTACGTAAATAAAGCAATAAAGTTTAAAACGATTGAGGAGGCTTTGTCTGTCAGTCCAATCCGACACTTCATGCAAGATGGTCTAAATCTACTGCTCAGCAAATCACTTCATTGGATTGTTGCTTGGGCAGAGTACGAATCGCCAGCTATGAAGGGCCAATTTAAATCACTAGCGGACTTGTTAAGTAAAGCATCAAACAGAAGTGGCCAAGGTTCACCTTTGCAATTTACCTATGAAACGTTTTATATGTCAAATGAAGATCATTTTACTTCACTCCTCGGTTTGCATGATGGTCCAAATCACAGTGCTATCCTCAAAAAAATCATAGATCTCATTAACCTCAAGCCTATTTAGTCGGGTCGCCCAATATAAAATCATAGAATAAAACGGTGA]

[+] EMBL CD083118             [CTTTGTTGCAT GGGAATTAGCACGGAATCCATGGGTATTATAGATGAAGGTCTACCAGAAATTGTTGATGAATTGGATTATCAATACAGAACTGCAAACTGGCTTATTAAAACCAGAGAGCCATTTTGCCTTGGAGATGATGTAAGAGGACAACTTTTATCTCTCTTACGCAAACAAAGTGAATTTTCACGGACGCAGTTTAAAGATAAAGGTGTTTTTAAAGTTCCGTTTGTTGGATCTATGGTATTTGAAGATGGATATGGAGATTATGTTTTGGATTGGTTTCCCCCAAGTGACCAATCAATAATTCCAACCAATATTGTTGTCTATATTCATGGAGGTTATTGGCAGTTAG TTGGATGGGGAGAATCCAGTAACTGGGCAGTTCCTGTTACAAATGCAGATAGTATATTTGTCTCTTTGTCTTACAGGTTAGCTCCAAAAGAAAAACTGGAAGCGATGTCACAAAGTCTATGTCTCGGTATGCAAAAAGTTATGACTCTTACGCATAAAATGTTTGGTAACTTAGATGATACGAAGCTCCGTATAACCCTATTTGGACATTCTGCCGGTGCACACTTAGTTCTGGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD081930             [   gGTTGCATGGGGAATTAGCACGGAATCCATGGGTATTATAGATGAAGGTCTACCAGAAATTGTTGATGAATTGGATTATCAATACAGAACTGCAAACTGGCTTATTAAAACCAGAGAGCCATTTTGCCTTGGAGATGATGTAAGAGGACAACTTTTATCTCTCTTACGCAAACAAAGTGAATTTTCACGGACGCAGTTTAAAGATAAAGGTGTTTTTAAAGTTCCGTTTGTTGGATCTATGGTATTTGAAGATGGATATGGAGATTATGTTTTGGATTGGTTTCCCCCAAGTGACCAATCAATAATTCCAACCAATATTGTTGTCTATATTCATGGAGGTTATTGGCAGTTAG TTGGATGGGGAGAATCCAGTAACTGGGCAGTTCCTGTTACAAATGCAGATAGTATATTTGTCTCTTTGTCTTACAGGTTAGCTCCAAAAGAAAAACTGGAAGCGATGTCACAAAGTCTATGTCTCGGTATGCAAAAAGTTATGACTCTTACGCATAAAATGTTTGGTAACTTAGATGATACGAAGCTCCGTATAACCCTATTTGGACATTCTGCCGGTGCACACTTAGTTCTGGAAATGATATATTGGGCTCATATGGACCTCGAATCANATAATAATTGGCTATGCTGNTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD196309             [          atGGGAATTAGCACGGAATCCATGGGTATTATAGATGAAGGTCTACCAGAAATTGTTGATGAATTGGATTATCAATACAGAACTGCAAACTGGCTTATTAAAACCAGAGAGCCATTTTGCCTCGGAGATGATGTAAGAGGACAACTTTTATCTCTCTTACGCAAACAAAGTGAATTTTCACGGACGCAGTTTAAAGATAAAGGTGTTTTTAAAGTTCCGTTTGTTGGATCTATGGTATTTGAAGATGGATATGGAGATTATGTTTTGGATTGGTTTCCCCCAAGTGACCAATCGATAATGCC ANCGATATTGNTGTCTATATTCATGGAGGCTATTGGCAGNTAGNNTGGAT GGGAG ATCCAGTAACTGGGCAGNTCCTGTTACAANTGCAGATAGNATATTTGTCTCTTTGNCNTACAGGGTAGCTCC AAAGGAAAACTGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD182266             [                                                                                                                                                                                     GAATTTTCACGGACGCAGTTTAAAGATAAAGGTGTTTTTAAAGTTCCGTTTGTTGGATCTATGGTATTTGAAGATGGATATGGAGATTATGTTTTGGATTGGTTTCCCCCAAGTGACCAATCAATAATTCCAGCCAATATTGTTGTCTATATTCATGGAGGTTATTGACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD190496             [                                                                                                                                                                                                                                                                  ATATGGAGATTATGTTTTGGATTGGTTTCCCCCAAGTGACCAATCAATAATTCCAACCAATATTGTTGTCTATATTCATGGAGGTTATTGGCAGTTAG TTGGATGGGGAGAATCCAGTAACTGGGCAGTTCCTGTTACAAATGCAGATAGTATATTTGTCTCTTTGTCTTACAGGTTAGCTCCAAAAGAAAAACTGGAAGCGATGTCACAAAGTCTATGTCTCGGTATGCAAAAAGTTATGACTCTTACGCATAAAATGTTTGGTAACTTAGATGATACGAAGCTCCGTATAACCCTATTTGGACATTCTGCCGGTGCACACTTAGTTCTGGAAATGATATATTGGGCTCATATGGACCCCGAATCAAATAATAATTGGCTATGCTGTTTGCGAAACCTTGTTTTAATGTCGGGAGTTTATGATCTACGTCCAATTATCCATACTTACGTAAATAAAGCAATAAAGTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD076692             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTGGAAATGATATATTGGGCTCATATGGACCTCGAATCAAATAATAATTGGCTATGCTGTTTGCGAAACCTTGTTTTAATGTCGGGAGTTTATGATCTACGTCCAATTATCCATACTTACGTAAATAAAGCAATAAAGTTTAAAACGATTGAGGAGGCTTTGTCTGTCAGTCCAATCCGACACTTCATGCAAGATGGTCTAAATCTACTGCTCAGCAAATCACTTCATTGGATTGTTGCTTGGGCAGAGTACGAATCGCCAGCTATGAAGGGCCAATTTAAATCACTAGCGGACTTGTTAAGTAAAGCATCAAACAGAAGTGGCCAAGGTTCACCTTTGCAATTTACCTATGAAACGTTTTATATGTCAAATGAAGATCATTTTACTTCACTCCTCGGTTTGCATGATGGTCCAAATCACAGTGCTATCCTCAAAAAAATCATAGATCTCATTAACCTCAAGCCTATTTAGTCGGGTCGCCCAATATAAAATCATAGAATAAAACGGTGA]
[+] EMBL CD140887             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GAATCAAATAATAATTGGCTAAGCTGTTTGCGAAACCTTGTTTTAATGTCGGGAGTTTATGATCTACGTCCAATTATCCATACTTACGTAAATAAAGCAATAAAGTTTAAAACGATTGAGGAGGCTTTGTCTGTCAGTCCAATCCGACACTTCATGCAAGATGGTCTAAATCTACTGCTCAGCAAATCACTTCATTGGATTGTTGCTTGGGCAGAGTACGAATCGCCAGCTATGAAGGGACAATCTAAATCACTAGCGGACTTGTTAAGTAAAGCATCAAACAGAAGTGGACAAGGTTCACCTTTGCAATTTACCTATGAAACGTTTTATATGTCAAATGAAGATCATTTTACTTCACTCCTC                                                                                                                  ]


>consensus_8491#0 CTTTGTTGCATGGGGAATTAGCACGGAATCCATGGGTATTATAGATGAAGGTCTACCAGA AATTGTTGATGAATTGGATTATCAATACAGAACTGCAAACTGGCTTATTAAAACCAGAGA GCCATTTTGCCTTGGAGATGATGTAAGAGGACAACTTTTATCTCTCTTACGCAAACAAAG TGAATTTTCACGGACGCAGTTTAAAGATAAAGGTGTTTTTAAAGTTCCGTTTGTTGGATC TATGGTATTTGAAGATGGATATGGAGATTATGTTTTGGATTGGTTTCCCCCAAGTGACCA ATCAATAATTCCAACCAATATTGTTGTCTATATTCATGGAGGTTATTGGCAGTTAGTTGG ATGGGGAGAATCCAGTAACTGGGCAGTTCCTGTTACAAATGCAGATAGTATATTTGTCTC TTTGTCTTACAGGTTAGCTCCAAAAGAAAAACTGGAAGCGATGTCACAAAGTCTATGTCT CGGTATGCAAAAAGTTATGACTCTTACGCATAAAATGTTTGGTAACTTAGATGATACGAA GCTCCGTATAACCCTATTTGGACATTCTGCCGGTGCACACTTAGTTCTGGAAATGATATA TTGGGCTCATATGGACCTCGAATCAAATAATAATTGGCTATGCTGTTTGCGAAACCTTGT TTTAATGTCGGGAGTTTATGATCTACGTCCAATTATCCATACTTACGTAAATAAAGCAAT AAAGTTTAAAACGATTGAGGAGGCTTTGTCTGTCAGTCCAATCCGACACTTCATGCAAGA TGGTCTAAATCTACTGCTCAGCAAATCACTTCATTGGATTGTTGCTTGGGCAGAGTACGA ATCGCCAGCTATGAAGGGCCAATTTAAATCACTAGCGGACTTGTTAAGTAAAGCATCAAA CAGAAGTGGCCAAGGTTCACCTTTGCAATTTACCTATGAAACGTTTTATATGTCAAATGA AGATCATTTTACTTCACTCCTCGGTTTGCATGATGGTCCAAATCACAGTGCTATCCTCAA AAAAATCATAGATCTCATTAACCTCAAGCCTATTTAGTCGGGTCGCCCAATATAAAATCA TAGAATAAAACGGTGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)