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Schistosoma mansoni
cluster # 8501 cluster # 8501       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8501#0 length = 940 sequences # 7  

consensusID : consensus_8501#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 940
fasta sequence
                              [AATGAAATAAGTGAAGAAAATCCTTTATTAAACCTTTAAGTAGAAATATCAATATAATAATCAACTATTCCAATCCATTTTCTCATTTTAACTCAATTCACTTTTCTATTTTTTAGAAAAAAGATTGCTATATTTCACCTACAAAATAGTTTAAATTATCTTTGCCTATTTTGTTAATTCTTATTGTAAGTCAAGGTTTTGAAGATACTACTATATGTTGTGTTAAGTATTCATTCTAATTTCATATTAGTTTATTTCAAATTTTTATTGATTTCAATTAGCTTTCATATAACATTAAAGCTCATACCATCATTATTGTTTCTGTTCTACTTCTAATACTACTACTAATACTAATACTACTTAAATCACTACTATTAAACTTACTTCCATAACTGTTACTAATACTGCTGTTGGTAGTTACCGTATTTTGCTCTAACTACTGCTATCAATATTGGGTGAAAATTAATTCCATGTTTTATAGAGTAGATTTCATTTTCTCTTGTTTTAATTTTGTTCTTTTTGTTGTTTATCTATTTTTAAGTTGTGGTCTTTTTTTTTGTTGTAAACTATAGGGATGGTTTCTTTGTTTTAGTATACTGCCGAAATGAAATGGGTTAGTTTTACTATCGTTTTCTAAATTAACTACTGCTAAGCGGTTTCACGTCCTCATTGTGTATGCTTGATATATATTCTTTTATTCAGTGTGATAACAGAAATAATTGCAATTAAAGTTTAGTAGATTATATAGCCAACAACTAAACAGGACACGAAAGAAAATAGAATAAAAGACAAATAAATAAGATGATCTATTCAGCTTGTTTGCTTTACCCTTTTGTCACTTTTATGCGTTTCTATGTGTGTTTGATTTATCTTTATTTGAGCTGCTTGTTTTCTATTTTTGACTTTTTTTCTACCATCTTCAAATAAAGTTCAGTATTAA]

[+] EMBL CD129676             [AATGAAATAAGTGAAGAAAATCCTTTATTAAACCTTTAAGTAGAAATATCAATATAATAATCAACTATTCCAATCCATTTTCTCATTTTAACTCAATTCACTTTTCTATTTTTTAGAAAAAAGATTGCTATATTTCACCTACAAAATAGTTTAAATTATCTTTGCCTATTTTGTTAATTCTTATTGTAAGTCAAGGTTTTGAAGATACTACTATATGTTGTGTTAAGTATTCATTCTAATTTCATATTAGTTTATTTCAAATTTTTATTGATTTCAATTAGCTTTCATATAACATTAAAGCTCATACCATCATTATTGGTTCTGGTCTACTTCTAATACTACTACTAATACTAATACTACTTAAATCACTACTATTAAACTTACTTCCATAACTGTTACTAATACTGCTGGTGGTAGTTACCGTATTTTGCTCTAACTACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD129675             [AATGAAATAAGTGAAGAAAATCCTTTATTAAACCTTTAAGTAGAAATATCAATATAATAATCAACTATTCCAATCCATTTTCTCATTTTAACTCAATTCACTTTTCTATTTTTTAGAAAAAAGATTGCTATATTTCACCTACAAAATAGTTTAAATTATCTTTGCCTATTTTGTTAATTCTTATTGTAAGTCAAGGTTTTGAAGATACTACTATATGTTGTGTTAAGTATTCATTCTAATTTCATATTAGTTTATTTCAAATTTTTATTGATTTCAATTAGCTTTCATATAACATTAAAGCTCATACCATCATTATTGTTTCTGTTCTACTTCTAATACTACTACTAATACTAATACTACTTAAATCACTACTATTAAACTTACTTCCATAACTGTTACTAATACTGCTGTTGGTAGTTACCGTATTTTGCTCTAACTACTGCTATCAATATTGGGTGAAAATTAATTCCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD129666             [AATGAAATAAGTGAAGAAAATCCTTTATTAAACCTTTAAGTAGAAATATCAATATAATAATCAACTATTCCAATCCATTTTCTCATTTTAACTCAATTCACTTTTCTATTTTTTAGAAAAAAGATTGCTATATTTCACCTACAAAATAGTTTAAATTATCTTTGCCTATTTTGTTAATTCTTATTGTAAGTCAAGGTTTTGAAGATACTACTATATGTTGTGTTAAGTATTCATTCTAATTTCATATTAGTTTATTTCAAATTTTTATTGATTTCAATTAGCTTTCATATAACATTAAAGCTCATACCATCATTATTGTTTCTGTTCTACTTCTAATACTACTACTAATACTAATACTACTTAAATCACTACTATTAAACTTACTTCCATAACTGTTACTAATACTGCTGTTGGTAGTTACCGTATTTTGCTCTAACTACTGCTATCAATATTGGGTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD129667             [                                                                                                                          GATTGCTATATTTCACCTACAAAATAGTTGAAATTATCTTTGCCTATTTTGTTAATTCTTATTGTGCGTCCTGGTTTTGAAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AI975770             [                                                                                                                                                                TTTGCCTATTTTGTTAATTCTTATTGTAAGTCAAGGTTTTGAAGATACTACTATATGTTGTGTTAAGTATTCATTCTAATTTCATATTAGTTTATTTCAAATTTTTATTGATTTCAATTAGCTTTCATATAACATTAAAGCTCATACCATCATTATTGTTTCTGTTCTACTTCTAATACTACTACTAATACTAATACTACTTAAATCACTACTATTAAACTTACTTCCATAACTGTTACTAATACTGCTGTTGGTAGTTACCGTATTTTGCTCTAACTACTGCTATCAATATTGGGTGAAAATTAATTCCATGTTTTATAGAGTAGATTTCATTTTCTCTTGTTTTAATTTTGTTCTTTTTGTTGTTTATCTATTTTTAAGTTGTGGTCTTTTTTTTTGTTGTAAACTATAGGGATGGTTTCTTTGTTTTAGTATACTGCCGAAATGAAATGGGTTAGTTTTACTATCGTTTTCTAAATTAACTACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL SMAA69193            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTACTTCTAATACTACTACTAATACTAATACTACTTAAATCACTACTATTAAACTTACTTCCATAACTGTTACTAATACTGCTGTTGGTAGTTACCGTATTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD129652             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGAAATGGGTTAGTTTTACTATCGTTTTCTAAATTAACTACTGCTAAGCGGTTTCACGTCCTCATTGTGTATGCTTGATATATATTCTTTTATTCAGTGTGATAACAGAAATAATTGCAATTAAAGTTTAGTAGATTATATAGCCAACAACTAAACAGGACACGAAAGAAAATAGAATAAAAGACAAATAAATAAGATGATCTATTCAGCTTGTTTGCTTTACCCTTTTGTCACTTTTATGCGTTTCTATGTGTGTTTGATTTATCTTTATTTGAGCTGCTTGTTTTCTATTTTTGACTTTTTTTCTACCATCTTCAAATAAAGTTCAGTATTAA]


>consensus_8501#0 AATGAAATAAGTGAAGAAAATCCTTTATTAAACCTTTAAGTAGAAATATCAATATAATAA TCAACTATTCCAATCCATTTTCTCATTTTAACTCAATTCACTTTTCTATTTTTTAGAAAA AAGATTGCTATATTTCACCTACAAAATAGTTTAAATTATCTTTGCCTATTTTGTTAATTC TTATTGTAAGTCAAGGTTTTGAAGATACTACTATATGTTGTGTTAAGTATTCATTCTAAT TTCATATTAGTTTATTTCAAATTTTTATTGATTTCAATTAGCTTTCATATAACATTAAAG CTCATACCATCATTATTGTTTCTGTTCTACTTCTAATACTACTACTAATACTAATACTAC TTAAATCACTACTATTAAACTTACTTCCATAACTGTTACTAATACTGCTGTTGGTAGTTA CCGTATTTTGCTCTAACTACTGCTATCAATATTGGGTGAAAATTAATTCCATGTTTTATA GAGTAGATTTCATTTTCTCTTGTTTTAATTTTGTTCTTTTTGTTGTTTATCTATTTTTAA GTTGTGGTCTTTTTTTTTGTTGTAAACTATAGGGATGGTTTCTTTGTTTTAGTATACTGC CGAAATGAAATGGGTTAGTTTTACTATCGTTTTCTAAATTAACTACTGCTAAGCGGTTTC ACGTCCTCATTGTGTATGCTTGATATATATTCTTTTATTCAGTGTGATAACAGAAATAAT TGCAATTAAAGTTTAGTAGATTATATAGCCAACAACTAAACAGGACACGAAAGAAAATAG AATAAAAGACAAATAAATAAGATGATCTATTCAGCTTGTTTGCTTTACCCTTTTGTCACT TTTATGCGTTTCTATGTGTGTTTGATTTATCTTTATTTGAGCTGCTTGTTTTCTATTTTT GACTTTTTTTCTACCATCTTCAAATAAAGTTCAGTATTAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)