These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8501#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 940 fasta sequence [AATGAAATAAGTGAAGAAAATCCTTTATTAAACCTTTAAGTAGAAATATCAATATAATAATCAACTATTCCAATCCATTTTCTCATTTTAACTCAATTCACTTTTCTATTTTTTAGAAAAAAGATTGCTATATTTCACCTACAAAATAGTTTAAATTATCTTTGCCTATTTTGTTAATTCTTATTGTAAGTCAAGGTTTTGAAGATACTACTATATGTTGTGTTAAGTATTCATTCTAATTTCATATTAGTTTATTTCAAATTTTTATTGATTTCAATTAGCTTTCATATAACATTAAAGCTCATACCATCATTATTGTTTCTGTTCTACTTCTAATACTACTACTAATACTAATACTACTTAAATCACTACTATTAAACTTACTTCCATAACTGTTACTAATACTGCTGTTGGTAGTTACCGTATTTTGCTCTAACTACTGCTATCAATATTGGGTGAAAATTAATTCCATGTTTTATAGAGTAGATTTCATTTTCTCTTGTTTTAATTTTGTTCTTTTTGTTGTTTATCTATTTTTAAGTTGTGGTCTTTTTTTTTGTTGTAAACTATAGGGATGGTTTCTTTGTTTTAGTATACTGCCGAAATGAAATGGGTTAGTTTTACTATCGTTTTCTAAATTAACTACTGCTAAGCGGTTTCACGTCCTCATTGTGTATGCTTGATATATATTCTTTTATTCAGTGTGATAACAGAAATAATTGCAATTAAAGTTTAGTAGATTATATAGCCAACAACTAAACAGGACACGAAAGAAAATAGAATAAAAGACAAATAAATAAGATGATCTATTCAGCTTGTTTGCTTTACCCTTTTGTCACTTTTATGCGTTTCTATGTGTGTTTGATTTATCTTTATTTGAGCTGCTTGTTTTCTATTTTTGACTTTTTTTCTACCATCTTCAAATAAAGTTCAGTATTAA] [+] EMBL CD129676 [AATGAAATAAGTGAAGAAAATCCTTTATTAAACCTTTAAGTAGAAATATCAATATAATAATCAACTATTCCAATCCATTTTCTCATTTTAACTCAATTCACTTTTCTATTTTTTAGAAAAAAGATTGCTATATTTCACCTACAAAATAGTTTAAATTATCTTTGCCTATTTTGTTAATTCTTATTGTAAGTCAAGGTTTTGAAGATACTACTATATGTTGTGTTAAGTATTCATTCTAATTTCATATTAGTTTATTTCAAATTTTTATTGATTTCAATTAGCTTTCATATAACATTAAAGCTCATACCATCATTATTGGTTCTGGTCTACTTCTAATACTACTACTAATACTAATACTACTTAAATCACTACTATTAAACTTACTTCCATAACTGTTACTAATACTGCTGGTGGTAGTTACCGTATTTTGCTCTAACTACTG ] [+] EMBL CD129675 [AATGAAATAAGTGAAGAAAATCCTTTATTAAACCTTTAAGTAGAAATATCAATATAATAATCAACTATTCCAATCCATTTTCTCATTTTAACTCAATTCACTTTTCTATTTTTTAGAAAAAAGATTGCTATATTTCACCTACAAAATAGTTTAAATTATCTTTGCCTATTTTGTTAATTCTTATTGTAAGTCAAGGTTTTGAAGATACTACTATATGTTGTGTTAAGTATTCATTCTAATTTCATATTAGTTTATTTCAAATTTTTATTGATTTCAATTAGCTTTCATATAACATTAAAGCTCATACCATCATTATTGTTTCTGTTCTACTTCTAATACTACTACTAATACTAATACTACTTAAATCACTACTATTAAACTTACTTCCATAACTGTTACTAATACTGCTGTTGGTAGTTACCGTATTTTGCTCTAACTACTGCTATCAATATTGGGTGAAAATTAATTCCAT ] [+] EMBL CD129666 [AATGAAATAAGTGAAGAAAATCCTTTATTAAACCTTTAAGTAGAAATATCAATATAATAATCAACTATTCCAATCCATTTTCTCATTTTAACTCAATTCACTTTTCTATTTTTTAGAAAAAAGATTGCTATATTTCACCTACAAAATAGTTTAAATTATCTTTGCCTATTTTGTTAATTCTTATTGTAAGTCAAGGTTTTGAAGATACTACTATATGTTGTGTTAAGTATTCATTCTAATTTCATATTAGTTTATTTCAAATTTTTATTGATTTCAATTAGCTTTCATATAACATTAAAGCTCATACCATCATTATTGTTTCTGTTCTACTTCTAATACTACTACTAATACTAATACTACTTAAATCACTACTATTAAACTTACTTCCATAACTGTTACTAATACTGCTGTTGGTAGTTACCGTATTTTGCTCTAACTACTGCTATCAATATTGGGTGA ] [+] EMBL CD129667 [ GATTGCTATATTTCACCTACAAAATAGTTGAAATTATCTTTGCCTATTTTGTTAATTCTTATTGTGCGTCCTGGTTTTGAAGA ] [+] EMBL AI975770 [ TTTGCCTATTTTGTTAATTCTTATTGTAAGTCAAGGTTTTGAAGATACTACTATATGTTGTGTTAAGTATTCATTCTAATTTCATATTAGTTTATTTCAAATTTTTATTGATTTCAATTAGCTTTCATATAACATTAAAGCTCATACCATCATTATTGTTTCTGTTCTACTTCTAATACTACTACTAATACTAATACTACTTAAATCACTACTATTAAACTTACTTCCATAACTGTTACTAATACTGCTGTTGGTAGTTACCGTATTTTGCTCTAACTACTGCTATCAATATTGGGTGAAAATTAATTCCATGTTTTATAGAGTAGATTTCATTTTCTCTTGTTTTAATTTTGTTCTTTTTGTTGTTTATCTATTTTTAAGTTGTGGTCTTTTTTTTTGTTGTAAACTATAGGGATGGTTTCTTTGTTTTAGTATACTGCCGAAATGAAATGGGTTAGTTTTACTATCGTTTTCTAAATTAACTACTG ] [+] EMBL SMAA69193 [ CTACTTCTAATACTACTACTAATACTAATACTACTTAAATCACTACTATTAAACTTACTTCCATAACTGTTACTAATACTGCTGTTGGTAGTTACCGTATTTT ] [-] EMBL CD129652 [ TGAAATGGGTTAGTTTTACTATCGTTTTCTAAATTAACTACTGCTAAGCGGTTTCACGTCCTCATTGTGTATGCTTGATATATATTCTTTTATTCAGTGTGATAACAGAAATAATTGCAATTAAAGTTTAGTAGATTATATAGCCAACAACTAAACAGGACACGAAAGAAAATAGAATAAAAGACAAATAAATAAGATGATCTATTCAGCTTGTTTGCTTTACCCTTTTGTCACTTTTATGCGTTTCTATGTGTGTTTGATTTATCTTTATTTGAGCTGCTTGTTTTCTATTTTTGACTTTTTTTCTACCATCTTCAAATAAAGTTCAGTATTAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||