cluster # 8513

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Schistosoma mansoni
cluster # 8513 cluster # 8513 Sequences # 7 consensus # 3

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consensus_8513#0 length = 750 sequences # 2

consensus_8513#1 length = 692 sequences # 1
consensus_8513#2 length = 595 sequences # 4

consensusID : consensus_8513#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 750
fasta sequence

                              [GTTTCCATTCCTTTCAATCATACTTTGTTTATGTTGTCAAGTTGTTTTTTGTTTCTTTGTCTTGTTTGTGCATTTCCATGATTTGGTAAACAGAGTAATAGTGTTGTTGTTAATCCTGTTTGTTTATTTTAAATGTTGGTTTGATCTGCTTGTTTTTTTTACTATCGCTATAACTGATTTACTATACAATGTAAACTAATGTATATGTGTGAATTTATGCTCAATATGTTAATTGTCGAATTCACTGCATGCTTATGTGTATATGTAACTTTAAATGTGTACAATTACTTCATTAAACTTTGTTGATTTACACTTTTATAAATTGTTTTCTTTGTTGACTTTGAATAGACTTAATGTTGTTCAAAAGGACGATGAGAGCTCCACGACCAAACCACCCAGCTCAGAGAACAAAACTTCATCAAAATCACCCACCTGAGCTACAAATCTTCTCCACCATACTGTCCGTTTGATTATTTCATTTGTTTTTGTTTATCTCTTTTCTACTGTATGTTTGTTTCTCTTCTTCCTTTACTTCATATCGTTAATGTTTCATAGTTATGTCTGTATAATTATAATTNTGGACTGATCATTTTGTGTGTGAATATGTACCAGTTTAGTTATGATCGTTTCTTAATATTCTACTATAAGTTGTACTGTTGCTTTTATTCCCTTTACTCTTATATGTCTATTAAGTATACATGTGTAGTAATTTATTTTATTCTAAATGTGAATGAAATTCTCATTTCTAAC]

[+] EMBL CD082813             [GTTTCCATTCCTTTCAATCATACTTTGTTTATGTTGTCAAGTTGTTTTTTGTTTCTTTGTCTTGTTTGTGCATTTCCATGATTTGGTAAACAGAGTAATAGTGTTGTTGTTAATCCTGTTTGTTTATTTTAAATGTTGGTTTGATCTGCTTGTTTTTTTTACTATCGCTATAACTGATTTACTATACAATGTAAACTAATGTATATGTGTGAATTTATGCTCAATATGTTAATTGTCGAATTCACTGCATGCTTATGTGTATATGTAACTTTAAATGTGTACAATTACTTCATTAAACTTTGTTGATTTACACTTTTATAAATTGTTTTCTTTGTTGACTTTGAATAGACTTAATGTTGTTCAAAAGGACGATGAGAGCTCCACGACCAAACCACCCAGCTCAGAGAACAAAACTTCATCAAAATCACCCACCTGAGCTACAAATCTTCTCCACCATACTGTCCGTTTGATTATTTCATTTGTTTTTGTTTATCTCTTTTCTACTGTATGTTTGTTTCTCTTCTTCCTTTACTTCATATCGTTAATGTTTCATAGTTATGTCTGTATAATTATAATTNTGGACTGATCATTTTGTGTGT                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD076405             [                                                                                                                                          GTTTGATCTGC TGTTTTTTTTACTATCGCTATAACTGATTTACTATACAATGTAAACTAATGTATATGTGTGAATTTATGCTCAATATGTTAATTGTCGAATTCACTGCATGCTTATGTGTATATGTAACTTTAAATGTGTACAATTACTTCATTAAACTTTGTTGATTTACACTTTTATAAATTGTTTTCTTTGTTGACTTTGAATAGACTTAATGTTGTTCAAAAGGACGATGAGAGCTCCACGACCAAACCACCCAGCTCAGAGAACAAAACTTCATCAAAATCACCCACCTGAGCTACAAATCTTCTCCACCATACTGTCCGTTTGATTATTTCATTTGTTTTTGTTTATCTCTTTTCTACTGTATGTTTGTTTCTCTTCTTCCTTTACTTCATATCGTTAATGTTTCATAGTTATGTCTGTATAATTATAATTTTGGACTGATCATTTTGTGTGTGAATATGTACCAGTTTAGTTATGATCGTTTCTTAATATTCTACTATAAGTTGTACTGTTGCTTTTATTCCCTTTACTCTTATATGTCTATTAAGTATACATGTGTAGTAATTTATTTTATTCTAAATGTGAATGAAATTCTCATTTCTAAC]




>consensus_8513#0
GTTTCCATTCCTTTCAATCATACTTTGTTTATGTTGTCAAGTTGTTTTTTGTTTCTTTGT
CTTGTTTGTGCATTTCCATGATTTGGTAAACAGAGTAATAGTGTTGTTGTTAATCCTGTT
TGTTTATTTTAAATGTTGGTTTGATCTGCTTGTTTTTTTTACTATCGCTATAACTGATTT
ACTATACAATGTAAACTAATGTATATGTGTGAATTTATGCTCAATATGTTAATTGTCGAA
TTCACTGCATGCTTATGTGTATATGTAACTTTAAATGTGTACAATTACTTCATTAAACTT
TGTTGATTTACACTTTTATAAATTGTTTTCTTTGTTGACTTTGAATAGACTTAATGTTGT
TCAAAAGGACGATGAGAGCTCCACGACCAAACCACCCAGCTCAGAGAACAAAACTTCATC
AAAATCACCCACCTGAGCTACAAATCTTCTCCACCATACTGTCCGTTTGATTATTTCATT
TGTTTTTGTTTATCTCTTTTCTACTGTATGTTTGTTTCTCTTCTTCCTTTACTTCATATC
GTTAATGTTTCATAGTTATGTCTGTATAATTATAATTNTGGACTGATCATTTTGTGTGTG
AATATGTACCAGTTTAGTTATGATCGTTTCTTAATATTCTACTATAAGTTGTACTGTTGC
TTTTATTCCCTTTACTCTTATATGTCTATTAAGTATACATGTGTAGTAATTTATTTTATT
CTAAATGTGAATGAAATTCTCATTTCTAAC

consensusID : consensus_8513#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 692
fasta sequence

                              [CCAATAATTCGGCACGAGGGATTATGCTGATTTAAATGAATTAATAGCTTTAACAGAACTTATCGGACCATTAGGGATAAAGTTTATTTGTGATCGATTAATGCATTCTGTTGGTGATCGTGTTGATGAAATCAATAAACTAGTTCGTCAAAATCGTGGTACTCTTGAATGTTTACGGGAATGTATAAATGATCCAGTAAGAACTCGTCAACTTAATGGGAATTTACAAAATTGTGATCAACTTTTAATCTTGTTAAAAGAAATTGGTGTAGCACTTGCTTTTCGTAAATTATGCTTTGAAGCTGTTCATTCTGTATTACAGAAACGTACTCCATTTCTATTGGACACTGTTCATAACCTTCGTGATTATATCATACAAAAATCAAGCAGCGATACCCAATTATTAACTGGATCATCATCTACAGAAAATAATGGAAAATATGGAATGGAACGTATTTATGCACATTTTAATGAACAATTAATATTAAATAATCTATGTGCTTCTGTTGGTATATCCTCTGATTTAGATTATAATTTATGTTCAATATTAAATAATCGACGTATAGCTACATTAGCTACTGCAAATCAAGCTGGTTTAAATTTATCTCTAAATGGTACTAATAGTAATATATCTTATCAAGAATTAGAATATCATATTGCTTGCTTATTTATTGNATTTATTGCTAATGCTT]

[+] EMBL CD081640             [CCAATAATTCGGCACGAGGGATTATGCTGATTTAAATGAATTAATAGCTTTAACAGAACTTATCGGACCATTAGGGATAAAGTTTATTTGTGATCGATTAATGCATTCTGTTGGTGATCGTGTTGATGAAATCAATAAACTAGTTCGTCAAAATCGTGGTACTCTTGAATGTTTACGGGAATGTATAAATGATCCAGTAAGAACTCGTCAACTTAATGGGAATTTACAAAATTGTGATCAACTTTTAATCTTGTTAAAAGAAATTGGTGTAGCACTTGCTTTTCGTAAATTATGCTTTGAAGCTGTTCATTCTGTATTACAGAAACGTACTCCATTTCTATTGGACACTGTTCATAACCTTCGTGATTATATCATACAAAAATCAAGCAGCGATACCCAATTATTAACTGGATCATCATCTACAGAAAATAATGGAAAATATGGAATGGAACGTATTTATGCACATTTTAATGAACAATTAATATTAAATAATCTATGTGCTTCTGTTGGTATATCCTCTGATTTAGATTATAATTTATGTTCAATATTAAATAATCGACGTATAGCTACATTAGCTACTGCAAATCAAGCTGGTTTAAATTTATCTCTAAATGGTACTAATAGTAATATATCTTATCAAGAATTAGAATATCATATTGCTTGCTTATTTATTGNATTTATTGCTAATGCTT]




>consensus_8513#1
CCAATAATTCGGCACGAGGGATTATGCTGATTTAAATGAATTAATAGCTTTAACAGAACT
TATCGGACCATTAGGGATAAAGTTTATTTGTGATCGATTAATGCATTCTGTTGGTGATCG
TGTTGATGAAATCAATAAACTAGTTCGTCAAAATCGTGGTACTCTTGAATGTTTACGGGA
ATGTATAAATGATCCAGTAAGAACTCGTCAACTTAATGGGAATTTACAAAATTGTGATCA
ACTTTTAATCTTGTTAAAAGAAATTGGTGTAGCACTTGCTTTTCGTAAATTATGCTTTGA
AGCTGTTCATTCTGTATTACAGAAACGTACTCCATTTCTATTGGACACTGTTCATAACCT
TCGTGATTATATCATACAAAAATCAAGCAGCGATACCCAATTATTAACTGGATCATCATC
TACAGAAAATAATGGAAAATATGGAATGGAACGTATTTATGCACATTTTAATGAACAATT
AATATTAAATAATCTATGTGCTTCTGTTGGTATATCCTCTGATTTAGATTATAATTTATG
TTCAATATTAAATAATCGACGTATAGCTACATTAGCTACTGCAAATCAAGCTGGTTTAAA
TTTATCTCTAAATGGTACTAATAGTAATATATCTTATCAAGAATTAGAATATCATATTGC
TTGCTTATTTATTGNATTTATTGCTAATGCTT

consensusID : consensus_8513#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 595
fasta sequence

                              [TTCACACGATAAGATGAGATATAACGTTTCGCCTTGTCTATGGATACTAATTTATATTTTCTTCGTTTGGCCCTACAAACGTTTCAACTGCAACGAAATCTGCAACCACCCTAATGTGAGAAACTATGAGAACGTCATTATTGAAAATGATACTTATCGATATTCTCATCATTATGAATATTCAATGAGGATTCAACGTCATCAATCTCAACCAGTTCCGAGTGACCGTTTTAATATTAAGATAAATGGCATACACACTGTTTATCCTCAATTCACGTGTAATTATCAC-AGTAAATACATAAGAAAAATTATGTTTTATGCAGACGATGCAGATGATGTTTATGATTTTCGAGGGTATTACATTGGAACTATGATTAATTACATAGTTAACTATATGGATTTTGATACTGCAGTTTTGGATGAGAAGAAATTATTAGGAGTCAAAAGGACTTTTCGGATTAACGTTGATGGTTCAGAGGTTGAAGCCACAATGACGAGTTTAATACACCCAAATGGGAAAGTATCGTTCTATTATGATAAAATTCCTAAGGAAATTGAGGAAAGTAAGTTCCAACCCAAAATCGTTGGATCAATA]

[+] EMBL CD098447             [TTCACACGATAAGATGAGATATAACGTTTCGCCTTGTCTATGGATACTAATTTATATTTTCTTCGTTTGGCCCTACAAACGTTTCAACTGCAACGAAATCTGCAACCACCCTAATGTGAGAAACTATGAGAACGTCATTATTGAAAATGATACTTATCGATATTCTCATCATTATGAATATTCAATGAGGATTCAACGTCATCAATCTCAACCAGTTCCGAGTGACCGTTTTAATATTAAGATAAATGGCATACACACTGTTTATCCTCAATTCACGTGTAATTATCACAAGTAAATACATAAGAAAAATTATGTTTTATGCGGACGATGCAGATGATGTTTATGATTTTCGAGGGTATTACATTGGAACTA                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD112948             [                                                                                                                         AACTATGAGAACGTCATTATTGAAAACGATACTTATCGATATTCTCATCATTATGAATATTCAATGAGGATTCAACTTCATCAATCTAAACCAGTTCCGAGTGACCGTTTTAATATTAAGATAAATGGCATACACACTGTTTATCCCCAATTCACGTGTAATTATCAC AGTAAATACATACGAAAAATTATGTTTTACGCAGATGATGCAGATGATGTTTATGATTTTCGAGGGTATTACATTGGAACTATGATTAATTACATAGTTAACTATATGGATTTTGATACTGCAGTTTTGGATGAGAAGAAATTATTAGGAGTCAAAAGGACTTTTCGGATTAACGTTGATGGTTCAGAGGTTGAAGCCACAATGACGAGTTTAATACACCCAAATGGGAAAGTATCGTTCTATTATGATAACATTCNTAAGGAAATTGAGGAAAGTAAGTTCCAACCCAAA               ]
[+] EMBL CD083718             [                                                                                                                                            TTGAAAATGATACTTATCGATATTCTCATCATTATGAATATTCAATGAGGATTCAACGTCATCAATCTCAATCAGTTCCGAGTGACCGTTTTAATATTAAGATAAATGGCATACACACTGTTTATCCTCAATTCACGTGTAATTATCAC AGTAAATACATAAGAAAAATTATGTTTTATGCAGACGATGCAGATGATGTTTATGATTTTCGAGGGTATTACATTGGAACTATGATTAATTACCTAGTTAACTATATGGATTTTGATACTGCAGTTTTGGATGAGAAGAAATTATTAGGAGTCAAAAGGACTTTTTCGATTAACGTTGATGGTTCAGAGGTTGAAGCCACAATGACGAGTTTAATACACCCAAATGGGAAAATATCGTTCTATTATGATAAAATTCCTCAGGAAATTGA                                     ]
[+] EMBL CD118264             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CGAGTTTAATATACCCAAATGGGAAAGTATCGTTCTATTATGATAAAATTCCTAAGGAAATTGAGGTGAGTAAGTTCCAATCGAAAATCGTTGGATCAATA]




>consensus_8513#2
TTCACACGATAAGATGAGATATAACGTTTCGCCTTGTCTATGGATACTAATTTATATTTT
CTTCGTTTGGCCCTACAAACGTTTCAACTGCAACGAAATCTGCAACCACCCTAATGTGAG
AAACTATGAGAACGTCATTATTGAAAATGATACTTATCGATATTCTCATCATTATGAATA
TTCAATGAGGATTCAACGTCATCAATCTCAACCAGTTCCGAGTGACCGTTTTAATATTAA
GATAAATGGCATACACACTGTTTATCCTCAATTCACGTGTAATTATCACAGTAAATACAT
AAGAAAAATTATGTTTTATGCAGACGATGCAGATGATGTTTATGATTTTCGAGGGTATTA
CATTGGAACTATGATTAATTACATAGTTAACTATATGGATTTTGATACTGCAGTTTTGGA
TGAGAAGAAATTATTAGGAGTCAAAAGGACTTTTCGGATTAACGTTGATGGTTCAGAGGT
TGAAGCCACAATGACGAGTTTAATACACCCAAATGGGAAAGTATCGTTCTATTATGATAA
AATTCCTAAGGAAATTGAGGAAAGTAAGTTCCAACCCAAAATCGTTGGATCAATA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8513#0      GTTTCCATTCCTTTCAATCATACTTTGTTTATGTTGTCAAGTTGTTTTTTGTTTCTTTGT 60
consensus_8513#2      ------------------------------------------------------------
consensus_8513#1      -------------------------CCAATAATTCGGCACGAGGGATTATGCTGATTTAA 35
                                                                                  

consensus_8513#0      CTTGTTTGT--GCATTTCCATGATTTGGTAAACAG--AGTAATAGTGTTGTTGTTAATCC 116
consensus_8513#2      -------------------TTCACACGATAAGATG--AGATATAACGTT-----TCGCCT 34
consensus_8513#1      ATGAATTAATAGCTTTAACAGAACTTATCGGACCATTAGGGATAAAGTTTATTTGTGATC 95
                                            *              **  ***  ***           

consensus_8513#0      TGTTTGTTTATTTTAAATGTTGGTTTGATCTGCTTGTTTTTTTTACTA--TCGCTATAAC 174
consensus_8513#2      TGTCTATGGATACTAATTTATA-TTTTCTTCGTTTGGCCCT---ACAA--ACGTTTCAAC 88
consensus_8513#1      GATTAATGCATTCTG-TTGGTGATCGTGTTGATGAAATCAATAAACTAGTTCGTCAAAAT 154
                        *   *  **  *   *  *  *    *               ** *   **    ** 

consensus_8513#0      TGATTTACTATACAATGTAAACTAATGTATATGTGTGAATTTATGCTCAATATGTTAA-T 233
consensus_8513#2      TG-----CAACGAAATCTGCAACCACCCTAATGTGAGAAACTATG---AGAACGTCA--T 138
consensus_8513#1      CGTGGTACTCTTGAATGTTTACGGGAATGTATAAATGATCCAGTAAG-AACTCGTCAACT 213
                       *     *     *** *  *         **    **     *    *    ** *  *

consensus_8513#0      TGTCG--AATTCACTGCATGCTTATGTGTATATGTAACTTTAAATGTGTACAATTACTTC 291
consensus_8513#2      TATTG--AA---AATG-ATACTTATCGATATTCTCATCATTATGAATATTCAATGAGG-- 190
consensus_8513#1      TAATGGGAATTTACAAAATTGTGATCAACTTTTAATCTTGTTAAAAGAAATTGGTGTAGC 273
                      *   *  **   *    **  * **     *         *                   

consensus_8513#0      ATTAAACTTTGTTGATTTACACTTTTATAAATTGTTTTCTTTGTTGACTTTGAATAGACT 351
consensus_8513#2      ATTCAACGTCATCAATCTCAACCAGTTCCGAGTGACCGTTTTAAT-------ATTAAGAT 243
consensus_8513#1      ACTTGCTTTTCGTAAATTATGCT--TTGAAGCTGTTCATTCTGTATTACAGAAACGTACT 331
                      * *     *     *  *   *   *      **     * *          *      *

consensus_8513#0      TAATGTTGTTCAAAAGGACGATGAGAGCTCCACGACCAAACCACCCAGCTCAGAGAACAA 411
consensus_8513#2      AAATGGCATACACACTGTTTATCCTCAATTCACGTGTAATTATCACAGT---AAATACAT 300
consensus_8513#1      CCATTTCTATTGGACACTGTTCATAACCTTCGTGATTATATCATACAAA---AATCAAGC 388
                        **         *              * *  *   *       **      *  *   

consensus_8513#0      AACTTCATCAAAATCACCCACCTGAGCTACAAATCTTCTCCACCATACTGTCCGTTTGAT 471
consensus_8513#2      AAGAAAAATTATGTTTTATGCAGACGATGCAGATGATGTTTATGATTTTCGAGGGTATTA 360
consensus_8513#1      AGCGATACCCA-ATTATTAACTGGATCATCA---TCTACAGAAAATAATGGAAAATATGG 444
                      *     *   *  *      *        **     *    *  **  *      *    

consensus_8513#0      TATTTCATTTGTTTTTGTTTATCTCTTTTC-TACTGTATGTTTGTTTCTCTTCTTCCTTT 530
consensus_8513#2      CATTGGAACTATGATTAATTACATAGTTA---ACTATATGGATTTTGATACTGCAGTTTT 417
consensus_8513#1      AATGGAACGTATTTATGCACATTTTAATGAACAATTAATATTAAATAATCTATGTGCTTC 504
                       **   *  * *   *    *  *   *    * *  **      *  *        ** 

consensus_8513#0      ACTTCATATCGTTAATGTTTCATAGTTATGTCTGTATAATTATAATTNTGGACTGATCAT 590
consensus_8513#2      GGATGAGAAGA--AATTATTAGGAGTCAAA--AGGACTTTTCGGATTA-ACGTTGATGGT 472
consensus_8513#1      TGTTGGTATATCCTCTGATTTAGA-TTATAA-TTTATGTTCAATATTA---AATAATCGA 559
                         *   *       *  **   * * *       *   *    ***      * **   

consensus_8513#0      TTTGTGTGTGAATATGTACCAGTTTAGTTATGATCGTTTCTTAATATTCTACTATAAGTT 650
consensus_8513#2      TCAGAGGTTGAA-----GCCA---CAATGACGAGT-----TTAATACAC--CCAAATGGG 517
consensus_8513#1      CGTATAGCTACATT--AGCTACTGCAAATCAAGCTG---GTTTAAATTTATCTCTAAATG 614
                              *  *      * *    *              ** * *     *   *    

consensus_8513#0      GTACTGTTGCTTTTATTCCCTTTACTCTTATATGTCTATTAAGTATACATGTGTAGTAAT 710
consensus_8513#2      AAAGTATCG-TTCTATTATGATAAAATTCCTAAGGAAATTGAGGAAA-GTAAGTTCCAAC 575
consensus_8513#1      GTACTAATAGTAATAT-ATCTTATCAAGAATTAGAATATCATAT-TGCTTGCTTATTTAT 672
                        * *     *  ***     *        *  *   **          *   *    * 

consensus_8513#0      TTATTTTATTCTAAATGTGAATGAAATTCTCATTTCTAAC 750
consensus_8513#2      CCAAAATCGTTGGATCAATA-------------------- 595
consensus_8513#1      TGNATTTATTGCTAATGCTT-------------------- 692
                            *  *   *