Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8526 cluster # 8526       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8526#0 length = 367 sequences # 7  

consensusID : consensus_8526#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 367
fasta sequence
                              [GTAGAAACAAAATGCGTTTATCAATACTGTGTTTGATCTTATGCCTCACAGTCTTCGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGATGGCGATGACGATGATGATGATTCGGATGATGATGATTCGGATGATGATTCGGATGATGACGATGATGATGATGATGGTGATGAAGATGATGATGATT-GTGAAGATTATGATGA]

[+] EMBL CD155377             [GTAAAAACAAAATGCGTTTATCAATACTGTGTTTGATCTTATGCCTCACAGTCTTCGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGATGGCGATGACGATGATGATGATTCGGATGATGATGATTCGGATGGTGATTCGGACTATGACGATG                                                  ]
[+] EMBL CD120340             [  AGAAACAAAATGCGTTTATCAATACTGTGTTTGATCTTATGCCTCACAGTCTTCGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGATGGCGATGACGATGATGATGATTCGGATGATGATGATTCGGATGATGATTCGGATGATGACGATGATGATGATGATGGTGATGAAGATGATGATGATT GTGAAGATTATGATGA]
[+] EMBL CD120458             [  AGAAACAAAATGCGTTTATCAATACTGTGTTTGATCTTATGCCTCACAGTCTTCGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGATGGCGATGACGATGATGATGATTCGGATGATGATGATTCAGATGATGATTCGGATGATGACGATGATGATGATGATGGTGATGAAGATGATGATGGTTCGTGAga          ]
[+] EMBL CD120170             [  AGAAACAAAATGCGTTTATCAATACTGTGTTTGATCTTATGCCTCACAGTCTTCGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGATGGCGATGACGATGATGATGATTCGGATGATGATGATTCGGATGATGATTNCGATGATGACGATGATGATGATGATGGTGATGAAGATGATGATGATT GTGAAGA         ]
[+] EMBL CD120046             [  AGAAACAAAATCCGTTTATCAATACTGTGTTTGATCTTATGCCCCACAGTCTTCGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGATGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGNGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGATGGCGATGACGATGATGATGATTCGGATGATGATGATTCGGATGATGATTCGGATGATGACGATGATGATGATGATGGNGACGAAGATGATGATGATT GTGAAGA         ]
[-] EMBL CD123365             [                                                       CGTCCCATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACCGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATGATGATGATGATAATGATTCGGATGATGA                                                                                                       ]
[+] EMBL CD161545             [                                                            CATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGAACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATGAAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATGATGAT   GATGATAATG                                                                                                                 ]


>consensus_8526#0 GTAGAAACAAAATGCGTTTATCAATACTGTGTTTGATCTTATGCCTCACAGTCTTCGTCC CATTCATTCACGCATATAAACGTCCACACACTTCAACTGCAGTTGAACAGAATAATGAGA ACAAATTTGGACAAGGTCTGAGCGGAATGGGCCTTATCCCAAGAACGAAAGAAGAAGATG AAGGTGATGACATTGCTGACGCTGTTTCTTCTGCTGCTGGTGATGATGATGATGATAATG ATTCGGATGATGATGGCGATGACGATGATGATGATTCGGATGATGATGATTCGGATGATG ATTCGGATGATGACGATGATGATGATGATGGTGATGAAGATGATGATGATTGTGAAGATT ATGATGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)