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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8528#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1090 fasta sequence
[GGCAACTGCATCACAAGAAGAAGTACTTGTAGTAGCATGTGAACTCGAGTAGTGTATGTTAAGCTGTTGCGTCAAAGTTTCTAACAGGCGCATTTGTGCGTCAAGTTGTGCTTGCTGTTGCTGTAGTATTCGGCTGAGCTGGTCATCTGATATAGGCATTTTGAATGAATTTTCCTTTTTCCTCGTCGCCACTGTTATAATTG--TGTTTTGCTATATAAACGACCCAGCTATTCCTATTGCTTAGTATTCTTATACGATGACACTCGACAAGACCCCAAAATCAGAACACTTTCAACAGGAATGAAATTGTATTCAAGATAATAATGATAAGTGAACATCAATCACTAGTTTGAATAACGTTCATATATTTATAGTATATACATAAGAAGCTTCTAGATTTTTCTCCAATAATATGCCCGGGCTGATCGGTTTAGAATTAGCCAATCAGCGCGCAGCAACACCATCATGCATGAAACATGCTTTAATCCAATCTATGTCCCACTAACATA-GGGGCTTTGAAACACAACA-TTTTTGGTCACTTTAGTTATGGTTGTAACTGACGCTCATTTTTCGGAGCACTTGCAAAGTTTACAATGATCGTGAAAGGATTACTTTGAAGAATCATGCTTAGACACTTTTGAGCTTCGAGCTACATTAGACAAACAGATTATGGTTTCTGAAAATATGTCCAACCTATCATTTTAGTGATCATTAATTGTCTACTGAGTGGAAAACTACTAGTTTTTTGAGTAATGTCGCTCATATTAACAATCTTACGAAGGTTCACACCATCAGTGTTCGGTCATACGTATGTGATTCACTGCAAGCTTGATTGCATTCGTATATTCAAAGTATTATCACCATATCATATGAATTTAATTATATGGCTTTAATGCTATTAAACTTTGGTTTGTGATTTTTGTCTTCAGGTTTTAGATGAAGAGGCAGAAGTATTTGTAGTAAAAATGTGGCGTCTGTTAATATATGTGATTGCAGAGAAAAAAGCTGGACTAAGTGCTTAAATAACATACTCAGATGACTTACTTTTGTACAAATGTTTTTTATTCTGATTTGTATAAATAAATTGTAT]
[+] EMBL CD199310 [GGCAACTGCATCACAAGAAGAAGTACTTGTAGTAGCATGTGAACTCGAGTAGTGTATGTTAAGCTGTTGCGTCAAAGTTTCTAACAGGCGCATTTGTGCGTCAAGTTGTGCTTGCTGTTGCTGTAGTATTCGGCTGAGCTGGTCATCTGATATAGGCATATTGAATGAATTTTCCTTTTTCCCCGTCGCCACTGTTATAATTGTATTTTTTGCTATATAAACGACCCAGCTATTCCTATTGCTTAGTATTC ]
[+] EMBL CD114860 [ TTTGAATGAATTTTCCTTTTTCCTCGTCGCCACTGTTATAATTG TGTTTTGCTATATAAACGACCCAGCTATTCCTATTGCTTAGTATTCTTATACGATGACACTCGACAAGACCCCAAAATCAGAACACTTTCAACAGGAATGAAATTGTATTCAAGATAATAATGATAAGTGAACATCAATCACTAGTTTGAATAACGTTCATATATTTATAGTATATACATAAGAAGCTTCTAGATTTTTCTCCAATAATATGCCCGGGCTGATCGGTTTAGAATTAGCCAATCAGCGCGCAGCAACACCATCATGCATGAAACATGCTTTAATCCAATCTATGTCCCACTAACATA GGGGCTTTGAAACACAACA TTTTTGGTCACTTTAGTTATGGTTGTAACTGACGCTCATTTTTCGGAGCACTTGCAAAGTTTACAATGATCGTGAAAGGATTACTTTGAAGAATCATGCTTAGACACTTTTGAGCTTCGAGCTACATTAGACAAACAGATTATGGTTTCTGAAAATATGTCCAACCTATCATTTTAGTGATCATTAATTGTCTACTGAGTGGAAAACTACTAGTTTTTTGAGTAATGTCGCTCATATTAACAATCTTACGAAGGTTCACACCA ]
[+] EMBL CD114861 [ TTTGAATGAATTTTCCTTTTTCCTCGTCGCCACTGTTATAATTG TGTTTTGCTATATAAACGACCCAGCTATTCCTATTGCTTAGTATTCTTATACGATGACACTCGACAAGACCCCAAAATCAGAACACTTTCAACAGGAATGAAATTGTATTCAAGATAATAATGATAAGTGAACATCAATCACTAGTTTGAATAACGTTCATATATTTATAGTATATACATAAGAAGCTTCTAGATTTTTCTCCAATAATATGCCCGGGCTGATCGGTTTAGAATTAGCCAATCAGCGCGCAGCAACACCATCATGCATGAAACATGCTTTAATCCAATCTATGTCCCACTAACATA GGGGCTTTGAAACACAACA TTTTTGGTCACTTTAGTTATGGTTGTAACTGACGCTCATTTTTCGGAGCACTTGCAAAGTTTACAATGATCGTGAAAGGATTACTTTGAAGAATCATGCTTAGACACTTTTGAGCTTCGAGCTACATTAGACAAACAGATTATGGTTTCTGAAAATATGTCCAACCTATCATTNTAGTGATCATTAATTGTCTACTGAGTGGAAAACTACTAGTTTTTTGAGTAAT ]
[+] EMBL CD114939 [ TTTGAATGAATTTTCCTTTTTCCTCGTCGCCACTGTTATAATTG TGTTTTGCTATATAAACGACCCAGCTATTCCTATTGCTTAGTATTCTTATACGATGACACTCGACAAGACCCCAAAATCAGAACACTTTCAACAGGAATGAAATTGTATTCAAGATAATAATGATAAGTGAACATCAATCACTAGTTTGAATAACGTTCATATATTTATAGTATATACATAAGAAGCTTCTAGATTTTTCTCCAATAATATGCCCGGGCTGATCGGTTTAGAATTAGCCAATCAGCGCGCAGCAACACCATCATGCATGAAACATGCTTTAATCCAATCTATGTCCCACTAACATANGGGGCTTTGAAACACAACATTTTTTGGTCACTT ]
[-] EMBL CD115079 [ CGCAGCAACACCATCATGCATGAAACATGCTTTAATCCAATCTATGTCCCACTAACATA GGGGCTTTGAAACACAACA TTTTTGGTCACTTTAGTTATGGTTGTAACTGACGCTCACTTTTCGGAGCACTTGCAAAGTTTACAATGATCGTGAAAGGATTACTTTGAAGAATCATGCTTAGACACTTTTGAGCTTCGAGCTACATTAGACAAACAGATTATGGTTTCTGAAAATATGTCCAACCTATCATTTTAGTGATCATTAATTGTCTACTGAGTGGAAAACTACTAGTTTTTTGAGTAATGTCGCTCATATTAACAATCTTACGAAGGTTCACACCATCAGTGTTCGGTCATACGTATGTGATTCACTGCAAGCTTGATTGCATTCGTATATTCAAAGTATTATCACCATATCATATGAATTTAATTATATGGCTTTAATGCTATTAAACTTTGGTTTGTGATTTTTGTCTTCAGGTTTTAGATGAAGAAGCAGAAGTATTTGTAGTAAAAATGTGGCGTCTGTTAATATATGTGATTGCAGAGAAAAAAGCTGGACTAAGTGCTTAA ]
[-] EMBL CD115011 [ CATCATGCATGAAACATGCTTTAATCCAATCTATGTCCCACTAACATA GGGGCTTTGAAACACAACA TTTTTGGTCACTTTAGTTATGGTTGTAACTGACGCTCACTTTTCGGAGCACTTGCAAAGTTTACAATGATCGTGAAAGGATTACTTTGAAGAATCATGCTTAGACACTTTTGAGCTTCGAGCTACATTAGACAAACAGATTATGGTTTCTGAAAATATGTCCAACCTATCATTTTAGTGATCATTAATTGTCTACTGAGTGGAAAACTACTAGTTTTTTGGGTAATGTCGCTCATATTAACAATCTTACGAAGGTTCACACCATCAGTGTTCGGTCATACGTATGTGATTCACTGCAAGCTTGATTGCATTCGTATATTCAAAGTATTATCACCATATCATATGAATTTAATTATATGGCTTTAATGCTATTAAACTTTGGTTTGTGATTTTTGTCTTCAGGTTTTAGATGAAGAGGCAGAAGTATTTGTAGTAAAAATGTGGCGTCTGTTAATATATGTGATTGCAGAGAAAAAAGCTGGACTAAGTGCTTAA ]
[-] EMBL AI975974 [ ttgccatGGTTTTAGATGAAGAGGCAGAAGTATTTGTAGTAAAAATGTGGCGTCTGTTAATATATGTGATGGCAGAAAAAAAAGCTGGAATAAGTGCTTAAATAACATACTCAGATGACTTACTTTTGTACAAATGTTTTTTATTCTGATTTGTATAAATAAATTGTAT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||