These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8549#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1158 fasta sequence [AGGTTATCTCAATCTTGCTGCCAATGTAATTGATAATTTTACTCATGGTGTGGCTATTGCTGGAAGTTATCTTGTATCTCTTCGTTTAGGGATTTTGACGACTACCTGCATATTAGTACATGAAGTTCCTCATGAAATGGCTGATTTTGTAATTTTACTCCGAAGTGGGTTCAGTCGGTGGGAAGCTGCCAAAGCTCAA----CTACAGCATCTGGATCCACTTTGGGCGCCATCCTAACACTT-TGTGCTAATGCTTCAGTAACCGGTTGTACAACGAAATGGATACTTCCTTTTACTGCCGGTGGTTTTCTATACATTGCATTGGTTTCTCTTCTACCTGATATTTTAAAAGAATTATCATTTAAGGAATCAATTATTCATCTAAGTCTTATGTTTTTCGGTTTAACTTCAATGGCAGTTGTCTCATATGCAATGGATTGAATTGATAAATACTTGCGATAATAACCAAAATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGATTATCGAATTTTTATATCCGGTTATTATATATCCCCTTTCTGATTTCCCACTTTATTTGCCTTCTCTTATTTATCCAACTAATATATATATGTGTAAACATAATATTTCTTATTATTATGATAAGGATGATGATGAGAAATCTAGAGAGGATCTCTATAAAACAAGTATTCACTATCATTTACCCTCTTTTTTCTTGGTTGTTTCACATTTTTTCTCTACTGAGAATTTCCTTCTTTCTTTTTCTATGTATGTAATGCAATCTATGGATTGTTTCATTCAATGATAATGATATACCGTAAATTACATCCATTACTGAATATTGTACAAGTTGTGTTGTATAGTGTAATAAGCTAAACTTGTGTTATTATTATTATTGTTATTATTATTATTATGTTCAGTAGTTTGTGGAGATATGTGAAATCTCAGAATAGTTCTCATCATGTTTTAAAATGAGATGGAGAACAATTCAGTACCAAGGAGTACTAAACAACCGTTTCATTCTACTTTAAAATACATTAACAGTGAATATAAATAAATCCTCACCGGATTTAACCTAGGACCATCACATCTTGAGATGAGTATAATATTATTTGGTGACTGCTTCGGTATC] [+] EMBL CD169162 [AGGTTATCTCAATCTTGCTGCCAATGTAATTGATAATTTTACTCATGGTGTGGCTATTGCTGGAAGTTATCTTGTATCTCTTCGTTTAGGGATTTTGACGACTACCTGCATATTAGTACATGAAGTTCCTCATGAAATGGCTGATTTTGTAATTTTACTCCGAAGTGGGTTCAGTCGGTGGGAAGCTGCCAAAGCTCAA CTACAGCATCTGGATCCACTTTGGGCGCCATCCTAACACTT TGTGCTAATGCTTCAGTAACCGGTTGTACAACGAAATGGATACTTCCTTTTACTGCCGGTGGTTTTCTATACATTGCATTGGTTTCTCTTCTACCTGATATTTTAAAAGAATTATCATTTAAGGAATCAATTATTCATCTAAGTCTTATGTTTTTCGGTTTAACTTCAATGGCAGTTGTCTCATATGCAATGGATTGAATCGATAAATACTTGCGATAATAACCAAAATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGATTATCGAATTTTTATATCCGGTTATTATATATCCCCTTTCTGATTTCCCACTTTATTTGCCTTCTCTTATTTATCCAACTAATATA ] [+] EMBL CD169809 [ TTATCTCAATCTTGCTGCCAATGTAATTGATAATTTTACTCATGGTGTGGCTATTGCTGGAAGTTATCTTGTATCTCTTCGTTTAGGGATTTTGACGACTACCTGCATATTAGTACATGAAGTTCCTCATGAAATGGCTGATTTTGTAATTTTACTCCGAAGTGGGTTCAGTCGGTGGGAAGCTGCCAAAGCTCAA CTACAGCATCTGGATCCACTTTGGGCGCCATCCTAACACTT TGTGCTAATGCTTCAGTAACCGGTTGTACAACGAAATGGATACTTCCTTTTACTGCCGGTGGTTTTCTATACATTGCATTGGTTTCTCTTCTACCTGATATTTTAAAAGAATTATCATTTAAGGAATCAATTATTCATCTAAGTCTTATGTTTTTCGGTTTAACTTCAATGGCAGTTGTCTCATATGCAATGGATTGAATTGATAAATACTTGCGATAATAACCAAAATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGATTATCGAATTTTTATATCCGGTTATTATATATCCCCTTTC ] [+] EMBL CD168867 [ TTATCTCAATCTTGCTGCCAATGTAATTGATAATTTTACTCATGGTGTGGCTATTGCTGGAAGTTATCTTGTATCTCTTCGTTTAGGGATTTTGACGACTACCTGCATATTAGTACATGAAGTTCCTCATGAAATGGCTGATTTTGTAATTTTACTCCGAAGTGGGTTCAGTCGGTGGGAAGCTGCCAAAGCTCAA CTACA ] [-] EMBL CD169576 [ CTGATTTTGTAATTTTACTCCGAAGTGGGTTCAGTCGGTGGGAAGCTGCCAAAGCTCAA CTACAGCATCTGGATCCACTTTGGGCGCCATCCTAACACTT TGTGCTAATGCTTCAGTAACCGGTTGTACAACGAAATGGATACTTCCTTTTACTGCCGGTGGTTTTCTATACATTGCATTGGTTTCTCTTCTACCTGATATTTTAAAAGAATTATCATTTAAGGAATCAATTATTCATCTAAGTCTTATGTTTTTCGGTTTAACTTCAATGGCAGTTGTCTCATATGCAATGGATTGAATTGATAAATACTTGCAATAATAACCAAAATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGATTATCGAATTTTTATATCCGGTTATTATATATCCCCTTTCTGATTTCCCACTTTATTTGCCTTCTCTTATTTATCCAACTAATATATATATGTGTAAACATAATATTTCTTATTATTATGATAAGGATGATGATGAGAAATCTAGAGAGGATCTCTATAAAACAAGTACTCACTATCATTTACCCTCTTTTTTCTTGGTTGTTTCACATTTTTTCTCTACTGAGAAT ] [-] EMBL CD169222 [ CGAAGTGGGTTCAGTCGGTGGGAAGCTGCCAAAGCTCAATTAGCTACAGCATCTGGATCCACTTTGGGCGCCATCCTAACACTT TGTGCTAATGCTTCAGTAACCGGTTGTACAACGAAATGGATACTTCCTTTTACTGCCGGTGGTTTTCTATACATTGCATTGGTTTCTCTTCTACCTGATATTTTAAAAGAATTATCATTTAAGGAATCAATTATTCATCTAAGTCTTATGTTTTTTGGTTTAACTTCAATGGCAGTTGTCTCATATGCAATGGATTGAATTGATAAATATTTGCGATAATAACCAAAATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGACTATCGAATTTTTATATCCGGTTATTATATATCCCCTTTCTGATTTCCCACTTTATTTGCCTTCTCTTGTTTATCCAACTAATATATATATGTGTAAACATAATATTTCTTATTATTATGATAAGGATGATGATGAGAAATCTAGAGAGGATCTCTATAAAACAAGTATTCACTATCATTTACCCTCTTTTTTCTTGGTTGTTTCACATTTTTTCTCTACTGAGAAT ] [-] EMBL CD181931 [ TTTGGGCGCCATCCT ACACTTNNGTGCTAATGCTCNAGTAACCGGTTGTACAACGAAATGGATACTTCCTTNTACTGCCGGTGGTTTTCTATACANTGCATTGGTGTCTCTTCTACCTGATA TTTAAAAGAATTATCATTTAAGGAATCAATTATTCATCTAAGTCTTATGTTTTTTGGTTTAACTTCAATGGCAGTTGTCTCATATGCAATGGATTGAATTGATAAATATTTGCGATAATAACCAAAATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGATTATCG ] [+] EMBL CD129414 [ AATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGATTATCGAATTTTTATATCCGGTTATTATATATCCCCCTTCTGATTTCCCACTTTATTTGCCTTCTCTTATTTATCCAACTAATATATATATGTGTAAACATAATATTTCTTATTATTATGATAAGGATGATGATGAGAAATCTAGAGAGGATCTCTATAAAACAAGTATTCACTATCATTTACCCTCTTTTTTCTTGGTTGTTTCACATTTTTTCTCTACTGAGAATTTCCTTCTTTCTTTTTCTATGTATGTAATGCAATCTATGGATTGTTTCATTCAATGATAATGATATACCGTAAATTACATCCATTACTGAATATTGTACAAGTTGTGTTGTATAGTGTAATAAGCTAAACTTGTGTTATTATTATTATTGTTATTATTATTATTATGTTCAGTAGTTTGTGGAGATATGTGAAATCTCAGAATAGTTCTCATCATGTTTTAAAATGAGATGGAGAACAATTCAGTACCAAGGAGTACTAAACAACCGTTTCATTCTACTTTAAAATACATTAACAGTGAATATAAATAAATCCTCACCGGATTTAACCTAGGACCATCACATCTTGAGATGAGTATAATATTATTTGGTGACTGCTTCGGTATC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||