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Schistosoma mansoni
cluster # 8549 cluster # 8549       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8549#0 length = 1158 sequences # 7  

consensusID : consensus_8549#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1158
fasta sequence
                              [AGGTTATCTCAATCTTGCTGCCAATGTAATTGATAATTTTACTCATGGTGTGGCTATTGCTGGAAGTTATCTTGTATCTCTTCGTTTAGGGATTTTGACGACTACCTGCATATTAGTACATGAAGTTCCTCATGAAATGGCTGATTTTGTAATTTTACTCCGAAGTGGGTTCAGTCGGTGGGAAGCTGCCAAAGCTCAA----CTACAGCATCTGGATCCACTTTGGGCGCCATCCTAACACTT-TGTGCTAATGCTTCAGTAACCGGTTGTACAACGAAATGGATACTTCCTTTTACTGCCGGTGGTTTTCTATACATTGCATTGGTTTCTCTTCTACCTGATATTTTAAAAGAATTATCATTTAAGGAATCAATTATTCATCTAAGTCTTATGTTTTTCGGTTTAACTTCAATGGCAGTTGTCTCATATGCAATGGATTGAATTGATAAATACTTGCGATAATAACCAAAATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGATTATCGAATTTTTATATCCGGTTATTATATATCCCCTTTCTGATTTCCCACTTTATTTGCCTTCTCTTATTTATCCAACTAATATATATATGTGTAAACATAATATTTCTTATTATTATGATAAGGATGATGATGAGAAATCTAGAGAGGATCTCTATAAAACAAGTATTCACTATCATTTACCCTCTTTTTTCTTGGTTGTTTCACATTTTTTCTCTACTGAGAATTTCCTTCTTTCTTTTTCTATGTATGTAATGCAATCTATGGATTGTTTCATTCAATGATAATGATATACCGTAAATTACATCCATTACTGAATATTGTACAAGTTGTGTTGTATAGTGTAATAAGCTAAACTTGTGTTATTATTATTATTGTTATTATTATTATTATGTTCAGTAGTTTGTGGAGATATGTGAAATCTCAGAATAGTTCTCATCATGTTTTAAAATGAGATGGAGAACAATTCAGTACCAAGGAGTACTAAACAACCGTTTCATTCTACTTTAAAATACATTAACAGTGAATATAAATAAATCCTCACCGGATTTAACCTAGGACCATCACATCTTGAGATGAGTATAATATTATTTGGTGACTGCTTCGGTATC]

[+] EMBL CD169162             [AGGTTATCTCAATCTTGCTGCCAATGTAATTGATAATTTTACTCATGGTGTGGCTATTGCTGGAAGTTATCTTGTATCTCTTCGTTTAGGGATTTTGACGACTACCTGCATATTAGTACATGAAGTTCCTCATGAAATGGCTGATTTTGTAATTTTACTCCGAAGTGGGTTCAGTCGGTGGGAAGCTGCCAAAGCTCAA    CTACAGCATCTGGATCCACTTTGGGCGCCATCCTAACACTT TGTGCTAATGCTTCAGTAACCGGTTGTACAACGAAATGGATACTTCCTTTTACTGCCGGTGGTTTTCTATACATTGCATTGGTTTCTCTTCTACCTGATATTTTAAAAGAATTATCATTTAAGGAATCAATTATTCATCTAAGTCTTATGTTTTTCGGTTTAACTTCAATGGCAGTTGTCTCATATGCAATGGATTGAATCGATAAATACTTGCGATAATAACCAAAATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGATTATCGAATTTTTATATCCGGTTATTATATATCCCCTTTCTGATTTCCCACTTTATTTGCCTTCTCTTATTTATCCAACTAATATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD169809             [   TTATCTCAATCTTGCTGCCAATGTAATTGATAATTTTACTCATGGTGTGGCTATTGCTGGAAGTTATCTTGTATCTCTTCGTTTAGGGATTTTGACGACTACCTGCATATTAGTACATGAAGTTCCTCATGAAATGGCTGATTTTGTAATTTTACTCCGAAGTGGGTTCAGTCGGTGGGAAGCTGCCAAAGCTCAA    CTACAGCATCTGGATCCACTTTGGGCGCCATCCTAACACTT TGTGCTAATGCTTCAGTAACCGGTTGTACAACGAAATGGATACTTCCTTTTACTGCCGGTGGTTTTCTATACATTGCATTGGTTTCTCTTCTACCTGATATTTTAAAAGAATTATCATTTAAGGAATCAATTATTCATCTAAGTCTTATGTTTTTCGGTTTAACTTCAATGGCAGTTGTCTCATATGCAATGGATTGAATTGATAAATACTTGCGATAATAACCAAAATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGATTATCGAATTTTTATATCCGGTTATTATATATCCCCTTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD168867             [   TTATCTCAATCTTGCTGCCAATGTAATTGATAATTTTACTCATGGTGTGGCTATTGCTGGAAGTTATCTTGTATCTCTTCGTTTAGGGATTTTGACGACTACCTGCATATTAGTACATGAAGTTCCTCATGAAATGGCTGATTTTGTAATTTTACTCCGAAGTGGGTTCAGTCGGTGGGAAGCTGCCAAAGCTCAA    CTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD169576             [                                                                                                                                            CTGATTTTGTAATTTTACTCCGAAGTGGGTTCAGTCGGTGGGAAGCTGCCAAAGCTCAA    CTACAGCATCTGGATCCACTTTGGGCGCCATCCTAACACTT TGTGCTAATGCTTCAGTAACCGGTTGTACAACGAAATGGATACTTCCTTTTACTGCCGGTGGTTTTCTATACATTGCATTGGTTTCTCTTCTACCTGATATTTTAAAAGAATTATCATTTAAGGAATCAATTATTCATCTAAGTCTTATGTTTTTCGGTTTAACTTCAATGGCAGTTGTCTCATATGCAATGGATTGAATTGATAAATACTTGCAATAATAACCAAAATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGATTATCGAATTTTTATATCCGGTTATTATATATCCCCTTTCTGATTTCCCACTTTATTTGCCTTCTCTTATTTATCCAACTAATATATATATGTGTAAACATAATATTTCTTATTATTATGATAAGGATGATGATGAGAAATCTAGAGAGGATCTCTATAAAACAAGTACTCACTATCATTTACCCTCTTTTTTCTTGGTTGTTTCACATTTTTTCTCTACTGAGAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD169222             [                                                                                                                                                                CGAAGTGGGTTCAGTCGGTGGGAAGCTGCCAAAGCTCAATTAGCTACAGCATCTGGATCCACTTTGGGCGCCATCCTAACACTT TGTGCTAATGCTTCAGTAACCGGTTGTACAACGAAATGGATACTTCCTTTTACTGCCGGTGGTTTTCTATACATTGCATTGGTTTCTCTTCTACCTGATATTTTAAAAGAATTATCATTTAAGGAATCAATTATTCATCTAAGTCTTATGTTTTTTGGTTTAACTTCAATGGCAGTTGTCTCATATGCAATGGATTGAATTGATAAATATTTGCGATAATAACCAAAATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGACTATCGAATTTTTATATCCGGTTATTATATATCCCCTTTCTGATTTCCCACTTTATTTGCCTTCTCTTGTTTATCCAACTAATATATATATGTGTAAACATAATATTTCTTATTATTATGATAAGGATGATGATGAGAAATCTAGAGAGGATCTCTATAAAACAAGTATTCACTATCATTTACCCTCTTTTTTCTTGGTTGTTTCACATTTTTTCTCTACTGAGAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD181931             [                                                                                                                                                                                                                              TTTGGGCGCCATCCT ACACTTNNGTGCTAATGCTCNAGTAACCGGTTGTACAACGAAATGGATACTTCCTTNTACTGCCGGTGGTTTTCTATACANTGCATTGGTGTCTCTTCTACCTGATA TTTAAAAGAATTATCATTTAAGGAATCAATTATTCATCTAAGTCTTATGTTTTTTGGTTTAACTTCAATGGCAGTTGTCTCATATGCAATGGATTGAATTGATAAATATTTGCGATAATAACCAAAATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGATTATCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD129414             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AATAACAACCATATTACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACTCAAAAGATTATCGAATTTTTATATCCGGTTATTATATATCCCCCTTCTGATTTCCCACTTTATTTGCCTTCTCTTATTTATCCAACTAATATATATATGTGTAAACATAATATTTCTTATTATTATGATAAGGATGATGATGAGAAATCTAGAGAGGATCTCTATAAAACAAGTATTCACTATCATTTACCCTCTTTTTTCTTGGTTGTTTCACATTTTTTCTCTACTGAGAATTTCCTTCTTTCTTTTTCTATGTATGTAATGCAATCTATGGATTGTTTCATTCAATGATAATGATATACCGTAAATTACATCCATTACTGAATATTGTACAAGTTGTGTTGTATAGTGTAATAAGCTAAACTTGTGTTATTATTATTATTGTTATTATTATTATTATGTTCAGTAGTTTGTGGAGATATGTGAAATCTCAGAATAGTTCTCATCATGTTTTAAAATGAGATGGAGAACAATTCAGTACCAAGGAGTACTAAACAACCGTTTCATTCTACTTTAAAATACATTAACAGTGAATATAAATAAATCCTCACCGGATTTAACCTAGGACCATCACATCTTGAGATGAGTATAATATTATTTGGTGACTGCTTCGGTATC]


>consensus_8549#0 AGGTTATCTCAATCTTGCTGCCAATGTAATTGATAATTTTACTCATGGTGTGGCTATTGC TGGAAGTTATCTTGTATCTCTTCGTTTAGGGATTTTGACGACTACCTGCATATTAGTACA TGAAGTTCCTCATGAAATGGCTGATTTTGTAATTTTACTCCGAAGTGGGTTCAGTCGGTG GGAAGCTGCCAAAGCTCAACTACAGCATCTGGATCCACTTTGGGCGCCATCCTAACACTT TGTGCTAATGCTTCAGTAACCGGTTGTACAACGAAATGGATACTTCCTTTTACTGCCGGT GGTTTTCTATACATTGCATTGGTTTCTCTTCTACCTGATATTTTAAAAGAATTATCATTT AAGGAATCAATTATTCATCTAAGTCTTATGTTTTTCGGTTTAACTTCAATGGCAGTTGTC TCATATGCAATGGATTGAATTGATAAATACTTGCGATAATAACCAAAATAACAACCATAT TACATAATATGTAAAATTGTAAAGAAAAGACGCTCATCGATAGTTGAAAAAAAGAACACT CAAAAGATTATCGAATTTTTATATCCGGTTATTATATATCCCCTTTCTGATTTCCCACTT TATTTGCCTTCTCTTATTTATCCAACTAATATATATATGTGTAAACATAATATTTCTTAT TATTATGATAAGGATGATGATGAGAAATCTAGAGAGGATCTCTATAAAACAAGTATTCAC TATCATTTACCCTCTTTTTTCTTGGTTGTTTCACATTTTTTCTCTACTGAGAATTTCCTT CTTTCTTTTTCTATGTATGTAATGCAATCTATGGATTGTTTCATTCAATGATAATGATAT ACCGTAAATTACATCCATTACTGAATATTGTACAAGTTGTGTTGTATAGTGTAATAAGCT AAACTTGTGTTATTATTATTATTGTTATTATTATTATTATGTTCAGTAGTTTGTGGAGAT ATGTGAAATCTCAGAATAGTTCTCATCATGTTTTAAAATGAGATGGAGAACAATTCAGTA CCAAGGAGTACTAAACAACCGTTTCATTCTACTTTAAAATACATTAACAGTGAATATAAA TAAATCCTCACCGGATTTAACCTAGGACCATCACATCTTGAGATGAGTATAATATTATTT GGTGACTGCTTCGGTATC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)