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Schistosoma mansoni
cluster # 8556 cluster # 8556       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8556#0 length = 1381 sequences # 7  

consensusID : consensus_8556#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1381
fasta sequence
                              [GGCCAAGATTCGGCCGAGGAGAACAGCTGCTATATGTGTTTACCCATATCAAGTTAAAACATGTGCAGAAACTTTTAAGAAATTAAAATTACCAAATTTTAACATTGCTTCTGTTGCTACTGGTTTTCCTACTGGACAGTATCCCCTAGAAACTCGGCTATTGGAAATTAAATCAGCTATAAATGATGGAGCGAATGAAATTGATGTGGTAATAAATAGAACATTAGCTTTACAAGGCGATTGGGAAGGAGTTTATAATGAAGTATGTGCAATGCGTAAAGCTTGTGGTGATCAAACACACTTAAAGACTATTCTTGCCACTGGTGAATTAAGCAGTTATGATAATGTTTATAAGGCTTCAATGGTTTGTATGTTAGCTGGAGCAGATTTTATTAAAACTTCTACTGGCAAAGAAACAGTCAATGCAACACTCCCAGTTTCATTGGTTATGGCTAGAGCTATTCAAGATTTCAAAGAAGTATATGGCATCAAGATTGGCTTTAAACCTGCCGGTGGTCTTCGTACAGCTAAAGATGCTATCGACTATCTTCAATTAATCGATAATGTTCTCGGCTCTGATTGGACAAATCCAGATTATTTACGATTTGGAGCTAGTTCACTATTAGCCAATGTTGAAACTCGACTATACAGTCTATGCCATAATGGTTTAATGCCATTACCTGGTGAATTAGACTTCTTCTAATTTTTGGTTACTTTTTTCCCCTGTTTTCTTTCAATTTGTTCGACTTGATTATTTTTGATGGTTATATTTACCTTTCCTCTTTTTTCTT-AAAAAAAG-TCGTTTCTATTAA-TTTTTTTTTATACTGATGAACCAAAC-GTTATTTATATTTTGTACACATTTCGTTTTGACTGCAAAAAGAATACAAAGAGGTGGTGACGGGAGTAAAGAGAAAAGCAAAACGAAAAAAAATCGACAATTGTATGTTTAGTTAATAGTTTTTTTTTTAACAAAAAAAAGAAAGAAATGACAAGGGGTTTCTATTTACGCTTATTCTCATTTGTTCCTTGTCGGTTTTCACGGAGTCCCTCCGACATCTATTCTTAGGTTTGTATGTATCACACATCGAAATAAATTAC----ATATATATATATATATATATACTTGCGGAGAAAGGTCAGAGGACGAAACAAAAGTGAAAAAAAATTAGGAAAGTAAACAAAACGATAGAACACAGTAATGGATGAATAGAAAAACAAAACAAAAAGAGAAATAAATC-C-ATAATATTTGTAAACATATTCCATAAACAAAAAATCAATAAATTTTATTACACATTATGATAATTGTATACCTTTTATTTTCTATATATTGCCTCAAAATCCTGTTTATATAGTAAATATTATTGTAAACAATCAATAATAATGA]

[+] EMBL CD079522             [GGCCAAGATTCGGCCGAGGAGAACAGCTGCTATATGTGTTTACCCATATCAAGTTAAAACATGTGCAGAAACTTTTAAGAAATTAAAATTACCAAATTTTAACATTGCTTCTGTTGCTACTGGTTTTCCTACTGGACAGTATCCCCTAGAAACTCGGCTATTGGAAATTAAATCAGCTATAAATGATGGAGCGAATGAAATTGATGTGGTAATAAATAGAACATTAGCTTTACAAGGCGATTGGGAAGGAGTTTATAATGAAGTATGTGCAATGCGTAAAGCTTGTGGTGATCAAACACACTTAAAGACTATTCTTGCCACTGGTGAATTAAGCAGTTATGATAATGTTTATAAGGCTTCAATGGTTTGTATGTTAGCTGGAGCAGATTTTATTAAAACTTCTACTGGCAAAGAAACAGTCAATGCAACACTCCCAGTTTCATTGGTTATGGCTAGAGCTATTCAAGATTTCAAAGAAGTATATGGCATCAAGATTGGCTTTAAACCTGCCGGTGGTCTTCGTACAGCTAAAGATGCTATCGACTATCTTCAATTAATCGATAATGTTCTCGGCTCTGATTGGACAAATCCAGATTATTTACGATTTGGAGCTAGTTCACTATTAGCCAATGTTGAAACTCGACTATACAGTCTATGCCATAATGGTTTAATGCCATTACCTGGTGAATTAGACTTCTTCTAATTTTTGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD078995             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAGATTGGCTTTAAACCTGCCGGTGGTCTTCGTACAGCTAAAGATGCTATCGACTATCTTCAATTAATCGATAATGTTCTCGGCTCTGATTGGACAAATCCAGATTATTTACGATTTGGAGCTAGTTCACTATTAGCCAATGTTGAAACTCGACTATACAGTCTATGCCATAATGGTTTAATGCCATTACCTGGTGAATTAGACTTCTTCTAATTTTTGGTTACTTTTTTCCCCTGTTTTCTTTCAATTTGTTCGACTTGATTATTTTTGATGGTTATATTTACCTTTCCTCTTTTTTCTT AAAAAAAG TCGTTTCTATTAA TTTTTTTTTATACTGATGAACCAAAC GTTATTTATATTTTGTACACATTTCGTTTTGACTGCAAAAAGAATACAAAGAGGTGGTGACGGGAGTAAAGAGAAAAGCAAAACGAAAAAAAATCGACAATTGTATGTTTAGTTAATAGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD073446             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGATTGGCTTTAAACCTGCCGGTGGTCTTCGTACAGCTAAAGATGCTATCGACTATCTTCAATTAATCGATAATGTTCTCGGCTCTGATTGGACAAATCCAGATTATTTACGATTTGGAGCTAGTTCACTATTAGCCAATGTTGAAACTCGACTATACAGTCTATGCCATAATGGTTTAATGCCATTACCTGGTGAATTAGACTTCTTCTAATTTTTGGTTACTTTTTTCCCCTGTTTTCTTTCAATTTGTTCGACTTGATTATTTTTGATGGTTATATTTACCTTTCCTCTTTTTTCTT AAAAAAAG TCGTTTCTATTAA TTTTTTTTTATACTGATGAACCAAAC GTTATTTATATTTTGTACACATTTCGTTTTGACTGCAAAAAGAATACAAAGAGGTGGTGACGGGAGTAAAGAGAAAAGCAAAACGAAAAAAAATCGACAATTGTATGTTTAGTTAATAGTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD073788             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTCCCCTGTTTTCTTTCAATTTGTTCGACTTGATTATTTTTGATGGTTATATTTACCTTTCCTCTTTTTTCTTAAAAAAAAG TCGTTTCTATTAA TTTTTTTTTATACTGATGAACCAAAC GTTATTTATATTTTGTACACATTTCGTTTTGACTGCAAAAAGAATACAAAGAGGTGGTGACGGGAGTAAAGAGAAAAGCAAAACGAAAAAAAATCGACAATTGTATGTTTAGTTAATAG TTTTTTTTTAACAAAAAAAAGAAAGAAATGACAAGGGGTTTCTATTTACGCTTATTCTCATTTGTTCCTTGTCGGTTTTCACGGAGTCCCTCCGACATCTATTCTTAGGTTTGTATGTATCACACATCGAAATAAATTAC    ATATATATATATATATATATACTTGCGGAGAAAGGTCAGAGGACGAAACAAAAGTGAAAAAAAATTAGGAAAGTAAACAAAACGATAGAACACAGTAATGGATGAATAGAAAAACAAAACAAAAAGAGAAATAAATC C ATAATATTTGTAAACATATTCCATAAACAAAAAATCAATAAATTTTACTACACATTATGATAATTGTATACCTTTTATTTTCTATATATTGCCTCAAAATCCTGTTTATATAGTAAATATTATTGTAAACAATCAATAATAATGA]
[-] EMBL BF936502             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTTTCAATTTGTTCGACTTGATTATTTTTGATGGTTATATTTACCTTTTCTCTTTTTTCTTAAAAAAAAGTTCGTCTCTATTAATTTTTTTTTTATACTGATGAACCAAACGGTTATTTATATTTTGTACACATTTTG TTTGACTGCAAAAAGAATACAAAGAGGTGGTGACGGGAGTAAAGAGAAAAGCAAAACGAAAAAAAATCGACAATTGTATGTTTAGTTAATAGTTTTTTTTTTAACAAAAAAAAGAAAGAAATGACAAGGGGTTTCTATTTACGCTTATTCTCATTTGTTCCTTGTCGGTTTTCACGGAGTCCCTCCGACATCTATTCTTAGGTTTGTATGTATCACACATCGAAATAAATTACATATATATATATATATATATATATACTTGCGGAGAAAGGTCAGAGGACGAAACGAAAGTGAAAAAAAATTAGGAAAGTAAACAAAACGATAGAACACAGTAATGGATGAATAGAAAAACAAAACAAAAAGAGAAATAAATC C ATAATATTTGTAAACATATTCCATAAACAAAAAATCAATAAATTTTATTACACATTATGATAATTGTATACCTTTTATTTTCTATATATTGCCTCAAAATCCTGTTTATATAATAAATATTATTGTAAACATTCActcgtgc   ]
[+] EMBL AI559033             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CATTTCGTTTTGACTGCAAAAAGAATACAAAGAGGTGGTGACGGGAGTAAAGAGAAAAGCAAAACGAAAAAAAATCGACAATTGTATGTTTAGTTAATAGTTTTTTTTTTAACAAAAAAAAGAAAGAAATGACAAGGGGTTTCTATTTACGCTTATTCTCATTTGTTCCTTGTCGGTTTTCACGGAGTCCCTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL AA801607             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AATCGCGATAATATTTGTAAACATATTCGATAAACAAAGAATCAATAAATTTTATTACACATTATGATAATTGTATACCTTTTATTTTCTATATATTGCCTCAAAATCC                                           ]


>consensus_8556#0 GGCCAAGATTCGGCCGAGGAGAACAGCTGCTATATGTGTTTACCCATATCAAGTTAAAAC ATGTGCAGAAACTTTTAAGAAATTAAAATTACCAAATTTTAACATTGCTTCTGTTGCTAC TGGTTTTCCTACTGGACAGTATCCCCTAGAAACTCGGCTATTGGAAATTAAATCAGCTAT AAATGATGGAGCGAATGAAATTGATGTGGTAATAAATAGAACATTAGCTTTACAAGGCGA TTGGGAAGGAGTTTATAATGAAGTATGTGCAATGCGTAAAGCTTGTGGTGATCAAACACA CTTAAAGACTATTCTTGCCACTGGTGAATTAAGCAGTTATGATAATGTTTATAAGGCTTC AATGGTTTGTATGTTAGCTGGAGCAGATTTTATTAAAACTTCTACTGGCAAAGAAACAGT CAATGCAACACTCCCAGTTTCATTGGTTATGGCTAGAGCTATTCAAGATTTCAAAGAAGT ATATGGCATCAAGATTGGCTTTAAACCTGCCGGTGGTCTTCGTACAGCTAAAGATGCTAT CGACTATCTTCAATTAATCGATAATGTTCTCGGCTCTGATTGGACAAATCCAGATTATTT ACGATTTGGAGCTAGTTCACTATTAGCCAATGTTGAAACTCGACTATACAGTCTATGCCA TAATGGTTTAATGCCATTACCTGGTGAATTAGACTTCTTCTAATTTTTGGTTACTTTTTT CCCCTGTTTTCTTTCAATTTGTTCGACTTGATTATTTTTGATGGTTATATTTACCTTTCC TCTTTTTTCTTAAAAAAAGTCGTTTCTATTAATTTTTTTTTATACTGATGAACCAAACGT TATTTATATTTTGTACACATTTCGTTTTGACTGCAAAAAGAATACAAAGAGGTGGTGACG GGAGTAAAGAGAAAAGCAAAACGAAAAAAAATCGACAATTGTATGTTTAGTTAATAGTTT TTTTTTTAACAAAAAAAAGAAAGAAATGACAAGGGGTTTCTATTTACGCTTATTCTCATT TGTTCCTTGTCGGTTTTCACGGAGTCCCTCCGACATCTATTCTTAGGTTTGTATGTATCA CACATCGAAATAAATTACATATATATATATATATATATACTTGCGGAGAAAGGTCAGAGG ACGAAACAAAAGTGAAAAAAAATTAGGAAAGTAAACAAAACGATAGAACACAGTAATGGA TGAATAGAAAAACAAAACAAAAAGAGAAATAAATCCATAATATTTGTAAACATATTCCAT AAACAAAAAATCAATAAATTTTATTACACATTATGATAATTGTATACCTTTTATTTTCTA TATATTGCCTCAAAATCCTGTTTATATAGTAAATATTATTGTAAACAATCAATAATAATG A



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)