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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8556#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1381 fasta sequence
[GGCCAAGATTCGGCCGAGGAGAACAGCTGCTATATGTGTTTACCCATATCAAGTTAAAACATGTGCAGAAACTTTTAAGAAATTAAAATTACCAAATTTTAACATTGCTTCTGTTGCTACTGGTTTTCCTACTGGACAGTATCCCCTAGAAACTCGGCTATTGGAAATTAAATCAGCTATAAATGATGGAGCGAATGAAATTGATGTGGTAATAAATAGAACATTAGCTTTACAAGGCGATTGGGAAGGAGTTTATAATGAAGTATGTGCAATGCGTAAAGCTTGTGGTGATCAAACACACTTAAAGACTATTCTTGCCACTGGTGAATTAAGCAGTTATGATAATGTTTATAAGGCTTCAATGGTTTGTATGTTAGCTGGAGCAGATTTTATTAAAACTTCTACTGGCAAAGAAACAGTCAATGCAACACTCCCAGTTTCATTGGTTATGGCTAGAGCTATTCAAGATTTCAAAGAAGTATATGGCATCAAGATTGGCTTTAAACCTGCCGGTGGTCTTCGTACAGCTAAAGATGCTATCGACTATCTTCAATTAATCGATAATGTTCTCGGCTCTGATTGGACAAATCCAGATTATTTACGATTTGGAGCTAGTTCACTATTAGCCAATGTTGAAACTCGACTATACAGTCTATGCCATAATGGTTTAATGCCATTACCTGGTGAATTAGACTTCTTCTAATTTTTGGTTACTTTTTTCCCCTGTTTTCTTTCAATTTGTTCGACTTGATTATTTTTGATGGTTATATTTACCTTTCCTCTTTTTTCTT-AAAAAAAG-TCGTTTCTATTAA-TTTTTTTTTATACTGATGAACCAAAC-GTTATTTATATTTTGTACACATTTCGTTTTGACTGCAAAAAGAATACAAAGAGGTGGTGACGGGAGTAAAGAGAAAAGCAAAACGAAAAAAAATCGACAATTGTATGTTTAGTTAATAGTTTTTTTTTTAACAAAAAAAAGAAAGAAATGACAAGGGGTTTCTATTTACGCTTATTCTCATTTGTTCCTTGTCGGTTTTCACGGAGTCCCTCCGACATCTATTCTTAGGTTTGTATGTATCACACATCGAAATAAATTAC----ATATATATATATATATATATACTTGCGGAGAAAGGTCAGAGGACGAAACAAAAGTGAAAAAAAATTAGGAAAGTAAACAAAACGATAGAACACAGTAATGGATGAATAGAAAAACAAAACAAAAAGAGAAATAAATC-C-ATAATATTTGTAAACATATTCCATAAACAAAAAATCAATAAATTTTATTACACATTATGATAATTGTATACCTTTTATTTTCTATATATTGCCTCAAAATCCTGTTTATATAGTAAATATTATTGTAAACAATCAATAATAATGA]
[+] EMBL CD079522 [GGCCAAGATTCGGCCGAGGAGAACAGCTGCTATATGTGTTTACCCATATCAAGTTAAAACATGTGCAGAAACTTTTAAGAAATTAAAATTACCAAATTTTAACATTGCTTCTGTTGCTACTGGTTTTCCTACTGGACAGTATCCCCTAGAAACTCGGCTATTGGAAATTAAATCAGCTATAAATGATGGAGCGAATGAAATTGATGTGGTAATAAATAGAACATTAGCTTTACAAGGCGATTGGGAAGGAGTTTATAATGAAGTATGTGCAATGCGTAAAGCTTGTGGTGATCAAACACACTTAAAGACTATTCTTGCCACTGGTGAATTAAGCAGTTATGATAATGTTTATAAGGCTTCAATGGTTTGTATGTTAGCTGGAGCAGATTTTATTAAAACTTCTACTGGCAAAGAAACAGTCAATGCAACACTCCCAGTTTCATTGGTTATGGCTAGAGCTATTCAAGATTTCAAAGAAGTATATGGCATCAAGATTGGCTTTAAACCTGCCGGTGGTCTTCGTACAGCTAAAGATGCTATCGACTATCTTCAATTAATCGATAATGTTCTCGGCTCTGATTGGACAAATCCAGATTATTTACGATTTGGAGCTAGTTCACTATTAGCCAATGTTGAAACTCGACTATACAGTCTATGCCATAATGGTTTAATGCCATTACCTGGTGAATTAGACTTCTTCTAATTTTTGGT ]
[+] EMBL CD078995 [ AAGATTGGCTTTAAACCTGCCGGTGGTCTTCGTACAGCTAAAGATGCTATCGACTATCTTCAATTAATCGATAATGTTCTCGGCTCTGATTGGACAAATCCAGATTATTTACGATTTGGAGCTAGTTCACTATTAGCCAATGTTGAAACTCGACTATACAGTCTATGCCATAATGGTTTAATGCCATTACCTGGTGAATTAGACTTCTTCTAATTTTTGGTTACTTTTTTCCCCTGTTTTCTTTCAATTTGTTCGACTTGATTATTTTTGATGGTTATATTTACCTTTCCTCTTTTTTCTT AAAAAAAG TCGTTTCTATTAA TTTTTTTTTATACTGATGAACCAAAC GTTATTTATATTTTGTACACATTTCGTTTTGACTGCAAAAAGAATACAAAGAGGTGGTGACGGGAGTAAAGAGAAAAGCAAAACGAAAAAAAATCGACAATTGTATGTTTAGTTAATAGTTT ]
[-] EMBL CD073446 [ AGATTGGCTTTAAACCTGCCGGTGGTCTTCGTACAGCTAAAGATGCTATCGACTATCTTCAATTAATCGATAATGTTCTCGGCTCTGATTGGACAAATCCAGATTATTTACGATTTGGAGCTAGTTCACTATTAGCCAATGTTGAAACTCGACTATACAGTCTATGCCATAATGGTTTAATGCCATTACCTGGTGAATTAGACTTCTTCTAATTTTTGGTTACTTTTTTCCCCTGTTTTCTTTCAATTTGTTCGACTTGATTATTTTTGATGGTTATATTTACCTTTCCTCTTTTTTCTT AAAAAAAG TCGTTTCTATTAA TTTTTTTTTATACTGATGAACCAAAC GTTATTTATATTTTGTACACATTTCGTTTTGACTGCAAAAAGAATACAAAGAGGTGGTGACGGGAGTAAAGAGAAAAGCAAAACGAAAAAAAATCGACAATTGTATGTTTAGTTAATAGTTTT ]
[-] EMBL CD073788 [ TTCCCCTGTTTTCTTTCAATTTGTTCGACTTGATTATTTTTGATGGTTATATTTACCTTTCCTCTTTTTTCTTAAAAAAAAG TCGTTTCTATTAA TTTTTTTTTATACTGATGAACCAAAC GTTATTTATATTTTGTACACATTTCGTTTTGACTGCAAAAAGAATACAAAGAGGTGGTGACGGGAGTAAAGAGAAAAGCAAAACGAAAAAAAATCGACAATTGTATGTTTAGTTAATAG TTTTTTTTTAACAAAAAAAAGAAAGAAATGACAAGGGGTTTCTATTTACGCTTATTCTCATTTGTTCCTTGTCGGTTTTCACGGAGTCCCTCCGACATCTATTCTTAGGTTTGTATGTATCACACATCGAAATAAATTAC ATATATATATATATATATATACTTGCGGAGAAAGGTCAGAGGACGAAACAAAAGTGAAAAAAAATTAGGAAAGTAAACAAAACGATAGAACACAGTAATGGATGAATAGAAAAACAAAACAAAAAGAGAAATAAATC C ATAATATTTGTAAACATATTCCATAAACAAAAAATCAATAAATTTTACTACACATTATGATAATTGTATACCTTTTATTTTCTATATATTGCCTCAAAATCCTGTTTATATAGTAAATATTATTGTAAACAATCAATAATAATGA]
[-] EMBL BF936502 [ CTTTCAATTTGTTCGACTTGATTATTTTTGATGGTTATATTTACCTTTTCTCTTTTTTCTTAAAAAAAAGTTCGTCTCTATTAATTTTTTTTTTATACTGATGAACCAAACGGTTATTTATATTTTGTACACATTTTG TTTGACTGCAAAAAGAATACAAAGAGGTGGTGACGGGAGTAAAGAGAAAAGCAAAACGAAAAAAAATCGACAATTGTATGTTTAGTTAATAGTTTTTTTTTTAACAAAAAAAAGAAAGAAATGACAAGGGGTTTCTATTTACGCTTATTCTCATTTGTTCCTTGTCGGTTTTCACGGAGTCCCTCCGACATCTATTCTTAGGTTTGTATGTATCACACATCGAAATAAATTACATATATATATATATATATATATATACTTGCGGAGAAAGGTCAGAGGACGAAACGAAAGTGAAAAAAAATTAGGAAAGTAAACAAAACGATAGAACACAGTAATGGATGAATAGAAAAACAAAACAAAAAGAGAAATAAATC C ATAATATTTGTAAACATATTCCATAAACAAAAAATCAATAAATTTTATTACACATTATGATAATTGTATACCTTTTATTTTCTATATATTGCCTCAAAATCCTGTTTATATAATAAATATTATTGTAAACATTCActcgtgc ]
[+] EMBL AI559033 [ CATTTCGTTTTGACTGCAAAAAGAATACAAAGAGGTGGTGACGGGAGTAAAGAGAAAAGCAAAACGAAAAAAAATCGACAATTGTATGTTTAGTTAATAGTTTTTTTTTTAACAAAAAAAAGAAAGAAATGACAAGGGGTTTCTATTTACGCTTATTCTCATTTGTTCCTTGTCGGTTTTCACGGAGTCCCTCC ]
[-] EMBL AA801607 [ AATCGCGATAATATTTGTAAACATATTCGATAAACAAAGAATCAATAAATTTTATTACACATTATGATAATTGTATACCTTTTATTTTCTATATATTGCCTCAAAATCC ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||