These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8563#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 686 fasta sequence [GTTGACGTAATGTTCTGATAGTTGTAAAGGCCATGGTTGTGGTCCATGTGTAACTAGCATATTTCGAGTTGAACCTATTGCAACAGGAGTTACTTCAGAAACAGGATCAATAAAATTGATTTTACGATATGCGGCAACATGAACACGTGAAACAATTAAAACGGATTCATCAAATTTGTTAACTGGTGAGGGATTGTAGATTGCTTTAATTTCAGTGAAACCAACATTAACTCCGATCACATAAAAATGTAAGCATTCGTTAGAATCGAATAATCCATATTCAGTAGATGAATTAAGTCGTGGTGCATGAAAACCTGGGATAATCTTCACAACATTAGAGTCGACTGCACGAATTTCAATGTTTAAATTTCTGCAATCCGTCATACTTTGACCGTCAGAATCAAGAACAGCTAATCCTATTGCCAAACGTTCCAAGTCGAATTCTACGGCAGAGGGATCT--CGTACACTCCATTCTTCATTTGTTGGCTGATTCGAATAACTTCTCGTTAATTCTTCGTCAATAAACTTAGCATTACGACGAGGTGGAATTAGAACTTCATTGCGTTCGTATACAAATTTCATTTCAGAAGGTGGACGCACATAAACTACAGTATATCCACAAATTTGAGGATTCGAAGAGCTTGATGCAACTATGATAGATTCACCGNGATTTAGAGCTGATATAA] [+] EMBL CD160968 [GTTGACGTAATGTTCTGATAGTTGTAAAGGCCATGGTTGTGGTCCATGTGTAACTAGCATATTTCGAGTTGAACCTATTGCAACAGGAGTTACTTCAGAAACAGGATCAATAAAATTGATTTTACGATATGCGGCAACATGAACACGTGAAACAATTAAAACGGATTCATCAAATTTGTTAACTGGTGAGGGATTGTAGATTGCTTTAATTTCAGTGAAACCAACATTAACTCCGATCACATAAAAATGTAAGCATTCGTTAGAATCGAATAATCCTTATTCAGTAGATGAATTAAGTCGTGGTGCATGAAAACCTGGGATAATCTTCACAACATTAGAGTCGACTGCACGAATTTCAATGTTTAAATTTCTGCAATCCGTCATACTTTGACCGTCAGAATCAAGAACAGCTAATCCTATTGCCAAACGTTCCAAGTCGAATTCTACGGCAGAGGGATCT CGTACACTCCATTCTTCATTTGTTGGCTGATTCGAATAACTTCTCGTTAATTCTTCGTCAATAAACTTAGCATTACGACGAGGTGGAATTAGAACTTCATTGCGTTCGTATACAAATTTCATTTCAGAAGGTGGACGCACATANACTACAGTA ] [+] EMBL CD161264 [GTTGACGTAATGTTCTGATAGTTGTAAAGGCCATGGTTGTGGTCCATGTGTAACTAGCATATTTCGAGTTGAACCTATTGCAACAGGAGTTACTTCAGAAACAGGATCAATAAAATTGATTTTACGATATGCGGCAACATGAACACGTGAAACAATTAAAACGGATTCATCAAATTTGTTAACTGGTGAGGGATTGTAGATTGCTTTAATTTCAGTGAAACCAACATTAACTCCGATCACATAAAAATGTAAGCATTCGTTAGAATCGAATAATCCATATTCAGTAGATGAATTAAGTCGTGGTGCATGAAAACCTGGGATAATCTTCACAACATTAGAGTCGACTGCACGAATTTCAATGTTTAAATTTCTGCAATCCGCCATACTTTGACCGTCAGAATCAAGAACAGCTAATCCTATTGCCAAACGTTCCAAGTCGAATTCTACGGCAGAGGGATCT CGTACAC ] [+] EMBL CD161302 [GTTGACGTAATGTTCTGATAGTTGTAAAGGCCATGGTTGTGGTCCATGTGTAACTAGCATATTTCGAGTTGAACCTATTGCAACAGGAGTTACTTCAGAAACAGGATCAATAAAATTGATTTTACGATATGCGGCAACATGAACACGTGAAACAATTAAAACGGATTCATCAAATTTGTTAACTGGTGAGGGATTGTAGATTGCTTTAATTTCAGTGAAACCAACATTAACTCCGATCACATAAAAATGTAAGCATTCGTTAGAATCGAATAATCCATATTCAGTAGATGAATTAAGTCGTGGTGCATGAAAACCTGGGATAATCTTCACAACATTAGAGTCGACTGCACGAATTTCAATGTTTAAATTTCTGCAATCCGTCATACTTTGACCGTCAGAATCAAGAACAGCTAATCCTATTGCCAAACGTTCCAAGTCGAATTCTACGGCAGAGGGATCT CGTACAC ] [-] EMBL CD160951 [ TTGACGTAATGTTCTGATAGTTGTAAAGGCCATGGTTGTGGTCCATGTGTAACTAGCATATTTCGAGTTGAACCTATTGCAACAGGAGTTACTTCAGAAACAGGATCAATAAAATTGATTTTACGATATGCGGCAACATGAACACGTGAAACAATTAAAACGGATTCATCAAATTTGTTAACTGGTGAGGGATTGTAGATTGCTTTAATTTCAGTGAAACCAACATTAACTCCGATCACATAAAAATGTAAGCATTCGTTAGAATCGAATAATCCATATTCAGTAGATGAATTAAGTCGTGGTGCATGAAAACCTGGGATAATCTTCACAACATTAGAGTCGACTGCACGAATTTCAATGTTTAAATTTCTGCAATCCGTCATACTTTGACCGTCAGAATCAAGAACAGCTAATCCTATTGCCAAACGTTCCAAGTCGAATTCTACGGCAGAGGGATCT CGTACACT ] [+] EMBL CD118679 [ TAAAACGGATTCATCAAATTTGTTAACTGGTGAGGGATTGTAGATTGCTTTAATTTCAGTGAAACCAACATTAACTCCGATCACATAAAAATGTAAGCATTCGTTAGAATCGAATAATCCATATTCAGTAGATGAATTAAGTCGTGGTGCATGAAAACCTGGGATAATCTTCACAACATTAGAGTCGACTGCACGAATTTCAATGTTTAAATTTCTGCAATCCGTCATACTTTGACCGTCAGAATCGAGAACAGCTAATCCTATTGCCAAACGTTCCAAGTCGAATTCTACGGCA AGGATTGTNNNNGACACTCCATTCTTCATTTGTTGGCTGATTCGAATAACTTCTCGTTAATTCTTCGTCAATAAACTTAGCATTACGACGAGGTGGAATTAGAACTTCATTGCGTTCGTATACAAATTTCATTTCAGAAGGTGGACGCACATAAACTACAGTATATCCACAAATTTGAGGATTCGAAGAGCTTGATGCAACTATGATAGATTCACCGNGATTTAGAGCTGATATAA] [+] EMBL CD118649 [ TAAAACGGATTCATCAAATTTGTTAACTGGTGAGGGATTGTAGATTGCTTTAATTTCAGTGAAACCAACATTAACTCCGATCACATAAAAATGTAAGCATTCGTTAGAATCGAATAATCCATATTCAGTAGATGAATTAAGCCGTGGCGCATGAAAACCTGGGATAATCTTCACA ] [+] EMBL CD183558 [ CACAACATTAGAGTCGACTGCACGAATTTCAATGTTTAAATTTCTGCAATCCGTCATACTTTGACCGTCAGAATCAAGAACAGCTAATCCTATTGCCAAACGTTCCAAGTCGAATTCTACGGCAGAGGGATCT CGTACACTCCATTCTTCATTTGTTGGCTGATTCGAATAACTTCTCGTTAATTCTTCGTCAATAAACTTAGCATTACGACGAGGTGGAATTAGAACTTCATTGCGTTCGTATACAAATTTCATTTCAGAAGGTGGACGCACATAAACTACAGTATATCCACAAATTTGAGGATTCGAAGAGCTTGATGCAACTATGATAGATTCACCG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||