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Schistosoma mansoni
cluster # 8566 cluster # 8566       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8566#0 length = 1178 sequences # 7  

consensusID : consensus_8566#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1178
fasta sequence
                              [TTATTAAGCTGTCTCTTGAAGAAGCAATTCAAGGTGTAGAAGATGCACAAGCGGAAGAAGAGCGTTGTATTGATGCATCACGACTAGCTAAAGAAGCTTTAACCAAAGCACGTG-AAGCTGTTATTAAACAACGAGGATTAATCGATGAAACCATTCGTGCATTGGCAGCTGCAGAGAAAGAAGCTGGTCAGTTAGTTCAATCGTTGAACCAAACAAACAGTCAGGTAGATAAACTTTCTCATCAAATTGAAATGCAAACTATGGAAAGTGAAGAAGCCGATAGTAAGATGGAGCGACTCTTAGAAACAAATCCAGTGGATTCATGAAGAAAAGCAACTGTTTGGTATTGAGAATGGCGTATATTGTTTTACCTCACGTGATCCATTCGAAACACGTCGACGTGTTCATTCACTGAAAGAACGTCGTGATCGTCTTAGTCGAACTGTAAATATGCGTGCAATGAATATGCTTGGTAATGCTGAAAAACAATATTCCGAATTGATTAGACGTCAAGAAATTGTTTTAGCTGATAAACATAAAATTCAAACAGTTATTGACGATTTAGATAAACGAAAAGAAGAAGTCTTATTAAGTGCACATAATAAAGTCAATGAGGAATTCTGTAATATTTTTGGAACTCTATTACCAGGAAGTAAAGCACGTTTATCTCCCCCGGAAGGTATGAGTGTCCTTGATGGATTAGAAATTAAAGTTGCATTTGGTGATGTTTGGAAAGAATCACTTGGAGAACTAAGTGGTGGCCAAAGGTCATTAGCTGCCCTTTCGCTTATTCTGGCTTTATTACTCTTCAAACCAGCACCTTTGTATATATTAGATGAAGTGGATGCAGCGCTCGATTTATCTCATACACAAAATATTGGTCAGTTGATTAAAAATCATTTTAAGCATTCACAGTTCATCGTGGTGTCACTTAAGGATGGAATGTTCAACAATGCTAATGTACTATTCAAAACAAAATTTGTTGATGGTGTCTCAACCGTGTCACGGCATGTACCTCTACGAGTTCGCGACGAAAATAAACAGCCTCATACAGACAGACAACGGAAACGTGTTAAATAGATTGTATTTGTATTTGTCTATCTCTTTTTTAAAGAAGACTTATATATCCTTTGATAATGATTTGCTGTACACTGTTTATTGTATTCAAATATCACTTC]

[-] EMBL CD130761             [TTATTAAGCTGTCTCTTGAAGAAGCAATTCAAGGTGTAGAAGATGCACAAGCGGAAGAAGAGCGTTGTATTGATGCATCACGACTAGCTAAAGAAGCTTTAACCAAAGCACGTG AAGCTGTTATTAAACAACGAGGATTAATCGATGAAACCATTCGTGCATTGGCAGCTGCAGAGAAAGAAGCTGGTCAGTTAGTTCAATCGTTGAACCAAACAAACAGTCAGGTAGATAAACTTTCTCATCAAATTGAAATGCAAACTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD160269             [                                                                                                            CACGTGCAAGCTGTTATTAAACAACGAGGATTAATCGATGAAACCATTCGTGCATTGGCAGCTGCAGAGAAAGAAGCTGGTCAGTTCGTTCAATCGTTGAACCAAACAAACAGTCGGGTAGATTAACTTTCTCATCAAATTGAGATGCAAACTATGGAAAGTGAAGAAGCCGATAGTAAGATGGAGCGACTCTTAGAAACAAATCCAGTGGATTCATGAAGAAAAGCAACTGTTTGGTATTGAGAATGGCGTATATTGTTTTACCTCACGTGATCCATTCGAAACACGTCGACGTGTTCATTCACTGAAAGAACGTCGTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD079012             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GAGAATGGCGTATATTGTTTTACTTCACGTGATCCAATTGAAACACGTCGACGTGTTCATTCACTGAAAGAACGTCGTGATCGTCTTAGTCGAACTGTAAATATGCGTGCAATGAATATGCTTGGTAATGCTGAAAAACAATATTCCGAATTGATTAGACGTCAAGAAATTGTTTTAGCTGATAAACATAAAATTCAAACAGTTATTGACGATTTAGATAAACGAAAAGAAGAAGTCTTATTAAGTGCACATAATAAAGTCAATGAGGAATTCTGTAATATTTTTGGAACTCTATTACCAGGAAGTAAAGCACGTTTATCTCCCCCGGAAGGTATGAGTGTCCTTGATGGATTAGAAATTAAAGTTGCATTTGGTGATGTTTGGAAAGAATCACTTGGAGAACTAAGTGGTGGCCAAAGGTCATTAGCTGCCCTTTCGCTTATTCTGGCTTTATTACTCTTCANACCAGCACCTTTGTATATATTAGATGAAGTGGATGCAGCGCTCGATTTATCTCATACACAANATATTGGTCAGTTGATTAAAAATCATTTTAAGCATTCACAGTTCATCGTGGTGTCACTTAAGGATGGAATGTTC                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD073461             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTAAGTGCACATAATAAAGTCAATGAGGAATTCTGTAATATTTTTGGAACTCTATTACCAGGAAGTAAAGCACGTTTATCTCCCCCGGAAGGTATGAGTGTCCTTGATGGATTAGAAATTAAAGTTGCATTTGGTGATGTTTGGAAAGAATCACTTGGAGAACTAAGTGGTGGCCAAAGGTCATTAGCTGCCCTTTCGCTTATTCTGGCTTTATTACTCTTCAAACCAGCACCTTTGTATATATTAGATGAAGTGGATGCAGCGCTCGATTTATCTCATACACAAAATATTGGTCAGTTGATTAAAAATCATTTTAAGCATTCACAGTTCATCGTGGTGTCACTTAAGGATGGAATGTTCAACAATGCTAATGTACTATTCAAAACAAAATTTGTTGATGGTGTCTCAACCGTGTCACGGCATGTACCTCTACGAGTTCGCGACGAAAATAAACAGCCTCATACAGACAGACAACGGAAACGTGTTAAATAGATTGTATTTGTATTTGTCTATCTCTTTTTTAAAGAAGACTTATATATCCTTTGATAATGATTTGCTGTACACTGTTTATTGTATTCAAATATCACTTC]
[-] EMBL CD160082             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GGAATTCTGTAATATTTTGGGAACTCTATTACCAGGAAGTAAAGCACGTTTATCTCCCCCGGAAGTTATGAGTGTCCTTGATGAATTAGAAATTAAAGTTGCATTTGGTGATGTTTGGAAAGAATCACTTGGAGAACTAAGTGGTGGCCAAAGGTCATTAGCTGCCCTTTCGCTTATTCTGGCTTTATTACTCTTCAAACCAGCACCTTTGTATATGTTAGATGAAGTGGATGCAGCGCTCGATTTATCTCATACACAAAATATTGGTCAGTTGATTAAAAATCATTTTAAGCATTCACAGTTCATCGTGGTGTCACTTAAGGATGGAATGTTCAACAATGCTAATGTACTATTCAAAACAAAATTTGTTGATGGTGTCTCAACCGTGTCACGGCATGTACCTCTACGAGTTCGCGACG                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD160395             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTAATATTTTTGGAACTCTATTACCAGGAAGTAAAGCACGTTTATCTCCCCCGGAAGGTATGAGTGTCCTTGATGGATTAGAAATTAAAGTTGCATTTGGTGATGTTTGGAAAGAATCACTTGGAGAACTAAGTGGTGGCCAAAGGTCATTAGCTGCCCTTTCGCTTATTCTGGCTTTATTACTCTTCAAACCAGCACCTTTGTATATATTAGATGAAGTGGATGCAGCGCTCGATTTATCTCATACACAAAATATTGGTCAGTTGATTAAAAATCATTTTAAGCATTCACAGTTCATCGTGGTGTCACTTAAGGATGGAATGTTCAACAATGCTAATGTACTACTCAAAAC AAATTTGTTGATGGTGTCTCAACCGTGTCACGGCATGTACCTCTACGAGTTCGCGACG                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD160066             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AATATTTTTGGAACTCTATTACCAGGAAGTAAAGCACGTTTATCTCCCCCGGAAGGTATGAGTGTCCTTGATGGATTAGAAATTAAAGTTGCATTTGGTGATGTTTGGAAAGAATCACTTGGAGAACTAAGTGGTGGCCAAAGGTCATTAGCTGCCCTTTCGCTTATTCTGGCTTTATTACTCTTCAAACCAGCACCTTTGTATATAGTAGATGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]


>consensus_8566#0 TTATTAAGCTGTCTCTTGAAGAAGCAATTCAAGGTGTAGAAGATGCACAAGCGGAAGAAG AGCGTTGTATTGATGCATCACGACTAGCTAAAGAAGCTTTAACCAAAGCACGTGAAGCTG TTATTAAACAACGAGGATTAATCGATGAAACCATTCGTGCATTGGCAGCTGCAGAGAAAG AAGCTGGTCAGTTAGTTCAATCGTTGAACCAAACAAACAGTCAGGTAGATAAACTTTCTC ATCAAATTGAAATGCAAACTATGGAAAGTGAAGAAGCCGATAGTAAGATGGAGCGACTCT TAGAAACAAATCCAGTGGATTCATGAAGAAAAGCAACTGTTTGGTATTGAGAATGGCGTA TATTGTTTTACCTCACGTGATCCATTCGAAACACGTCGACGTGTTCATTCACTGAAAGAA CGTCGTGATCGTCTTAGTCGAACTGTAAATATGCGTGCAATGAATATGCTTGGTAATGCT GAAAAACAATATTCCGAATTGATTAGACGTCAAGAAATTGTTTTAGCTGATAAACATAAA ATTCAAACAGTTATTGACGATTTAGATAAACGAAAAGAAGAAGTCTTATTAAGTGCACAT AATAAAGTCAATGAGGAATTCTGTAATATTTTTGGAACTCTATTACCAGGAAGTAAAGCA CGTTTATCTCCCCCGGAAGGTATGAGTGTCCTTGATGGATTAGAAATTAAAGTTGCATTT GGTGATGTTTGGAAAGAATCACTTGGAGAACTAAGTGGTGGCCAAAGGTCATTAGCTGCC CTTTCGCTTATTCTGGCTTTATTACTCTTCAAACCAGCACCTTTGTATATATTAGATGAA GTGGATGCAGCGCTCGATTTATCTCATACACAAAATATTGGTCAGTTGATTAAAAATCAT TTTAAGCATTCACAGTTCATCGTGGTGTCACTTAAGGATGGAATGTTCAACAATGCTAAT GTACTATTCAAAACAAAATTTGTTGATGGTGTCTCAACCGTGTCACGGCATGTACCTCTA CGAGTTCGCGACGAAAATAAACAGCCTCATACAGACAGACAACGGAAACGTGTTAAATAG ATTGTATTTGTATTTGTCTATCTCTTTTTTAAAGAAGACTTATATATCCTTTGATAATGA TTTGCTGTACACTGTTTATTGTATTCAAATATCACTTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)