These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8566#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1178 fasta sequence [TTATTAAGCTGTCTCTTGAAGAAGCAATTCAAGGTGTAGAAGATGCACAAGCGGAAGAAGAGCGTTGTATTGATGCATCACGACTAGCTAAAGAAGCTTTAACCAAAGCACGTG-AAGCTGTTATTAAACAACGAGGATTAATCGATGAAACCATTCGTGCATTGGCAGCTGCAGAGAAAGAAGCTGGTCAGTTAGTTCAATCGTTGAACCAAACAAACAGTCAGGTAGATAAACTTTCTCATCAAATTGAAATGCAAACTATGGAAAGTGAAGAAGCCGATAGTAAGATGGAGCGACTCTTAGAAACAAATCCAGTGGATTCATGAAGAAAAGCAACTGTTTGGTATTGAGAATGGCGTATATTGTTTTACCTCACGTGATCCATTCGAAACACGTCGACGTGTTCATTCACTGAAAGAACGTCGTGATCGTCTTAGTCGAACTGTAAATATGCGTGCAATGAATATGCTTGGTAATGCTGAAAAACAATATTCCGAATTGATTAGACGTCAAGAAATTGTTTTAGCTGATAAACATAAAATTCAAACAGTTATTGACGATTTAGATAAACGAAAAGAAGAAGTCTTATTAAGTGCACATAATAAAGTCAATGAGGAATTCTGTAATATTTTTGGAACTCTATTACCAGGAAGTAAAGCACGTTTATCTCCCCCGGAAGGTATGAGTGTCCTTGATGGATTAGAAATTAAAGTTGCATTTGGTGATGTTTGGAAAGAATCACTTGGAGAACTAAGTGGTGGCCAAAGGTCATTAGCTGCCCTTTCGCTTATTCTGGCTTTATTACTCTTCAAACCAGCACCTTTGTATATATTAGATGAAGTGGATGCAGCGCTCGATTTATCTCATACACAAAATATTGGTCAGTTGATTAAAAATCATTTTAAGCATTCACAGTTCATCGTGGTGTCACTTAAGGATGGAATGTTCAACAATGCTAATGTACTATTCAAAACAAAATTTGTTGATGGTGTCTCAACCGTGTCACGGCATGTACCTCTACGAGTTCGCGACGAAAATAAACAGCCTCATACAGACAGACAACGGAAACGTGTTAAATAGATTGTATTTGTATTTGTCTATCTCTTTTTTAAAGAAGACTTATATATCCTTTGATAATGATTTGCTGTACACTGTTTATTGTATTCAAATATCACTTC] [-] EMBL CD130761 [TTATTAAGCTGTCTCTTGAAGAAGCAATTCAAGGTGTAGAAGATGCACAAGCGGAAGAAGAGCGTTGTATTGATGCATCACGACTAGCTAAAGAAGCTTTAACCAAAGCACGTG AAGCTGTTATTAAACAACGAGGATTAATCGATGAAACCATTCGTGCATTGGCAGCTGCAGAGAAAGAAGCTGGTCAGTTAGTTCAATCGTTGAACCAAACAAACAGTCAGGTAGATAAACTTTCTCATCAAATTGAAATGCAAACTA ] [+] EMBL CD160269 [ CACGTGCAAGCTGTTATTAAACAACGAGGATTAATCGATGAAACCATTCGTGCATTGGCAGCTGCAGAGAAAGAAGCTGGTCAGTTCGTTCAATCGTTGAACCAAACAAACAGTCGGGTAGATTAACTTTCTCATCAAATTGAGATGCAAACTATGGAAAGTGAAGAAGCCGATAGTAAGATGGAGCGACTCTTAGAAACAAATCCAGTGGATTCATGAAGAAAAGCAACTGTTTGGTATTGAGAATGGCGTATATTGTTTTACCTCACGTGATCCATTCGAAACACGTCGACGTGTTCATTCACTGAAAGAACGTCGTGAT ] [+] EMBL CD079012 [ GAGAATGGCGTATATTGTTTTACTTCACGTGATCCAATTGAAACACGTCGACGTGTTCATTCACTGAAAGAACGTCGTGATCGTCTTAGTCGAACTGTAAATATGCGTGCAATGAATATGCTTGGTAATGCTGAAAAACAATATTCCGAATTGATTAGACGTCAAGAAATTGTTTTAGCTGATAAACATAAAATTCAAACAGTTATTGACGATTTAGATAAACGAAAAGAAGAAGTCTTATTAAGTGCACATAATAAAGTCAATGAGGAATTCTGTAATATTTTTGGAACTCTATTACCAGGAAGTAAAGCACGTTTATCTCCCCCGGAAGGTATGAGTGTCCTTGATGGATTAGAAATTAAAGTTGCATTTGGTGATGTTTGGAAAGAATCACTTGGAGAACTAAGTGGTGGCCAAAGGTCATTAGCTGCCCTTTCGCTTATTCTGGCTTTATTACTCTTCANACCAGCACCTTTGTATATATTAGATGAAGTGGATGCAGCGCTCGATTTATCTCATACACAANATATTGGTCAGTTGATTAAAAATCATTTTAAGCATTCACAGTTCATCGTGGTGTCACTTAAGGATGGAATGTTC ] [-] EMBL CD073461 [ TTAAGTGCACATAATAAAGTCAATGAGGAATTCTGTAATATTTTTGGAACTCTATTACCAGGAAGTAAAGCACGTTTATCTCCCCCGGAAGGTATGAGTGTCCTTGATGGATTAGAAATTAAAGTTGCATTTGGTGATGTTTGGAAAGAATCACTTGGAGAACTAAGTGGTGGCCAAAGGTCATTAGCTGCCCTTTCGCTTATTCTGGCTTTATTACTCTTCAAACCAGCACCTTTGTATATATTAGATGAAGTGGATGCAGCGCTCGATTTATCTCATACACAAAATATTGGTCAGTTGATTAAAAATCATTTTAAGCATTCACAGTTCATCGTGGTGTCACTTAAGGATGGAATGTTCAACAATGCTAATGTACTATTCAAAACAAAATTTGTTGATGGTGTCTCAACCGTGTCACGGCATGTACCTCTACGAGTTCGCGACGAAAATAAACAGCCTCATACAGACAGACAACGGAAACGTGTTAAATAGATTGTATTTGTATTTGTCTATCTCTTTTTTAAAGAAGACTTATATATCCTTTGATAATGATTTGCTGTACACTGTTTATTGTATTCAAATATCACTTC] [-] EMBL CD160082 [ GGAATTCTGTAATATTTTGGGAACTCTATTACCAGGAAGTAAAGCACGTTTATCTCCCCCGGAAGTTATGAGTGTCCTTGATGAATTAGAAATTAAAGTTGCATTTGGTGATGTTTGGAAAGAATCACTTGGAGAACTAAGTGGTGGCCAAAGGTCATTAGCTGCCCTTTCGCTTATTCTGGCTTTATTACTCTTCAAACCAGCACCTTTGTATATGTTAGATGAAGTGGATGCAGCGCTCGATTTATCTCATACACAAAATATTGGTCAGTTGATTAAAAATCATTTTAAGCATTCACAGTTCATCGTGGTGTCACTTAAGGATGGAATGTTCAACAATGCTAATGTACTATTCAAAACAAAATTTGTTGATGGTGTCTCAACCGTGTCACGGCATGTACCTCTACGAGTTCGCGACG ] [-] EMBL CD160395 [ GTAATATTTTTGGAACTCTATTACCAGGAAGTAAAGCACGTTTATCTCCCCCGGAAGGTATGAGTGTCCTTGATGGATTAGAAATTAAAGTTGCATTTGGTGATGTTTGGAAAGAATCACTTGGAGAACTAAGTGGTGGCCAAAGGTCATTAGCTGCCCTTTCGCTTATTCTGGCTTTATTACTCTTCAAACCAGCACCTTTGTATATATTAGATGAAGTGGATGCAGCGCTCGATTTATCTCATACACAAAATATTGGTCAGTTGATTAAAAATCATTTTAAGCATTCACAGTTCATCGTGGTGTCACTTAAGGATGGAATGTTCAACAATGCTAATGTACTACTCAAAAC AAATTTGTTGATGGTGTCTCAACCGTGTCACGGCATGTACCTCTACGAGTTCGCGACG ] [-] EMBL CD160066 [ AATATTTTTGGAACTCTATTACCAGGAAGTAAAGCACGTTTATCTCCCCCGGAAGGTATGAGTGTCCTTGATGGATTAGAAATTAAAGTTGCATTTGGTGATGTTTGGAAAGAATCACTTGGAGAACTAAGTGGTGGCCAAAGGTCATTAGCTGCCCTTTCGCTTATTCTGGCTTTATTACTCTTCAAACCAGCACCTTTGTATATAGTAGATGAAG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||