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Schistosoma mansoni
cluster # 8587 cluster # 8587       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8587#0 length = 1089 sequences # 7  
consensusID : consensus_8587#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1089
fasta sequence 
                              [TTTTATTAACGAAAAAGGCTAAAGGAAAATAATTAGACTCAACTAAATAATATTTGGTTTCCGTGCTGTAATTTG-TTGTTTGTTTAAATGTG-TCTATATTGAATTCAGATTAAAAGTTGAAGACAGAAAAATAAAAATAGTATGTGTAGGGAGTTAGGG-TTTCAGAATATTTCTACTCTATTCGAACGAAAAATAGTGGATGATGAAGCAGTGCATCTGGAAAA-CCGAAAGAAAACATGAAATAAACATTCACAAAGAGTTTAATACAGTTGGTGCATGAGTAACTAATTCATACTAGTTGAAAGAAAGGCAGTGGTAGTAGTAGTAGTACCATTAAATTATGTGTATAGTTTGTG-TGTGTGTGATCAACGAAAATGCAAAATTAATTGATTAGAAGAAAAGAGCTGGAAAATCAACATAGCATATAACTCTATTCTAGTGATTTTCCTTATTTCTTGTCATTTTCTAATCTAGTCTCTTTTGTGTACTTGTTTGTTGTTTTACTGTTCAATTCTTTCTATTTCCACTAAAGCAGATAAGAAGGAACACAAGAAGAAACGGGATAAGTTACAAGATGGTAAGTTTAACTGATTCAAAAATTAAGCAATAAAGAAGGGTTGAGGAGGAAGAATAAAAAGATTGAGTGGATGAAAAGTAAAGCTATTGTATGATAGTATTATTTTGAGGATTTAGTTAATATGTAAGAATATCTTTTTAAAAGG-AAAAAAACGTGGTAAGGTACACAACTGCACATTATCATACATCAAAACATTAGATTTGTCAATTGAGCTAATATATTCAACAGATGTAAACTAAGTGAAGAGAATGAGTAGTAATGGTTGATTGTATTACTTAGTGATTCTAAAACAGTTTTCGTTTTGATAAAATCATATGAAATCTCTTTAGTATAAAAATGAGGATAAAATAACATTTTAATGATCATGAATTTCTTCAAGTGAATCATCCCCTTCAGTATCATGACCACTATCATCATCTTCAACTCCAAAGATGTTTTCGATTCGTTTTAATATAGATAAAACGATAGACCTCGTTTTCGTCATAGGTTTGCCATCGTTCTCTCCATCGTCG]

[+] EMBL AI740426             [TTTTATTAACGAAAAAGGCTAAAGGAAAATAATTAGACTCAACTAAATAATATTTGGTTTCCGTGCTGTAATTTGTTTGTTTGTTTAAATGTG TCTATATTGAATTCAGATTAAAAGTTGAAGACAGAAAAATAAAAATAGTATGTGTAGGGAGTTAGGGTTTTCAGAATATTTCTACTCTATTCGAACGAAAAATAGTGGATGATGAAGCAGTGCATCTGGAAAAGCCGAAAGAAAACATGAAATAAACATTCACAAAGAGTTTAATACAGTTGGTGCATGAGTAACTAATTCATACTAGTTGAAAGAAAGGCAGTGGTAGTAGTAGTAGTACCATTAAATTATGTGTAAAGTTTGGGATGTGTGTGATCAACGAAAATGCAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL BE431230             [                                                                      aaTTG TTGGTTGTTTAAAAGGGTTCTATAATGAATTCAGATTAAAAGGTGAAGACAGAAAAATAAAAATAGTATGTGTAGGGAGTGAGGG TTTCAGAATATTTCTACTCTATACGAACGAAAAATAGTGGATGATGAAGAAGTGAAACTGGAAAA CCGAAAGAAAACATGAAATAAACATTCACAAAGAGTTTAATACAGTTGGTGAATGAATAACTAATTCATACTAGTTGAAAGAAAGGCAGTGGTAGTAGTAGTAGTACCATTAAATTATGTGTATAGTTTGTG TGTGTGTGATCAACGAAAATGCAAAATTAATTGATTAGAAGAAAAGAGCTGGAAAATCAACATAGCATATAACTCAGTTCTAGTGATTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD136853             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGAAAGGCAGTG   GTAGTAGTAGTACCATTAAATTATGTGTATAGTTTGTG TGTGTGTGATCAACGAAAATGCAAAATTAATTGATTAGAAGAAAAGAGCTGGAAAATCAACATAGCATATAACTCTATTCTAGTGATTTTCCTTATTTCTTGTCATTTTCTAATCTAGTCTCTTTTGTGTACTTGTTTGTTGTTTTACTGTTCAATTCTTTCTATTTCCACTAAAGCAGATAAGAAGGAACACAAGAAGAAACGGGATAAGTTACAAGATGGTAAGTTTAACTGATTCAAAAATTAAGCAATAAAGAAGGGTTGAGGAGGAAGAATAAAAAGATTGAGTGGATGAAAAGTAAAGCTATTGTATGATAGTATTATTTTGAGGATTTAGTTAATATGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD134359             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GCAGTGGTAGTAGTAGTAGTACCATTAAATTATGTGTATAGTTTGTG TGTGTGTGATCAACGAAAATGCAAAATTAATTGATTAGAAGAAAAGAGCTGGAAAATCAACATAGCATATAACTCTATTCTAGTGATTTTCCTTATTTCTTGTCATTTTCTAATCTAGTCTCTTTTGTGTACTTGTTTGTTGTTTTACTGTTCAATTCTTTCTATTTCCACTAAAGCAGATAAGAAGGAACACAAGAAGAAACGGGATAAGTTACAAGATGGTAAGTTTAACTGATTCAAAAATTAAGCAATAAAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD139852             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAAGAAGGAACACAAGAAGAAACGGGATAAGTTACAAGATGGTAAGTTTAACTGATTCAAAAATTAAGCAATAAAGAAGGGTTGAGGAGGAAGAATAAAAAGATTGAGTGGATGAAAAGTAAAGCTATTGTATGATAGTATTATTTTGAGGATTTAGTTAATATGTAAGAATATCTTTTTAAAAGGAAAAAAAACGTGGTAAGGTACACAACTGCACATTATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD113185             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGATTGAGTGGATGAAAAGTAAAGCTATTGTATGATAGTATTATTTTGAGGATTTAGTTAATATGTAAGAATATCTTTTTAAAAGG AAAAAAACGAGGTAAGGTACACAACTGCACATTATCATACATCAAAACATTAGATTTGTCAATTGAGCTAATATATTCAACAGATGTAAACTAAGTGAAGAGAATGAGTAGTAATGGTTGATTGTATTACTTAGTGATTCTAAAACAGTTTTCGTTTTGATAAAATCATATGAAATCTCTTTAGTATAAAAATGAGGATAAAATAACATTTTAATGATCATGAATTTCTTCAAGTGAATCATCCCCTTCAGTATCATGACCACTATCATCATCTTCAACTCCAAAGATGTTTTCGATTCGTTTTAATATAGATAAAACGATAGACCTCGTTTTCGTCATAGGTTTG                     ]
[-] EMBL CD088490             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGTAAGAATATCTTTTTAAAAGG AAAAAAACGTGGTAAGGTACACAACTGCACATTATCATACATCAAAACATTAGATTTGTCAATTGAGCTAATATATTCAACAGATGTAAACTAAGTGAAGAGAATGAGTAGTAATGGTTGATTGTATTACTTAGTGATTCTAAAATAGTTTTCGTTTTGATAAAATCATATGAAATCTCTTTAGTATAAAAATGAGGATAAAATAACATTTTAATGATCATGAATTTCTTCAAGTGAATCATCCTCTTCAGTATCATGACCACTATCATCATCTTCAACTCCAAAGATGTTTTCGATTCGTTTTAATATAGATAAAACGATAGACCTCGTTTTCGTCATAGGTTTGCCATCGTTCTCTCCATCGTCG]




>consensus_8587#0
TTTTATTAACGAAAAAGGCTAAAGGAAAATAATTAGACTCAACTAAATAATATTTGGTTT
CCGTGCTGTAATTTGTTGTTTGTTTAAATGTGTCTATATTGAATTCAGATTAAAAGTTGA
AGACAGAAAAATAAAAATAGTATGTGTAGGGAGTTAGGGTTTCAGAATATTTCTACTCTA
TTCGAACGAAAAATAGTGGATGATGAAGCAGTGCATCTGGAAAACCGAAAGAAAACATGA
AATAAACATTCACAAAGAGTTTAATACAGTTGGTGCATGAGTAACTAATTCATACTAGTT
GAAAGAAAGGCAGTGGTAGTAGTAGTAGTACCATTAAATTATGTGTATAGTTTGTGTGTG
TGTGATCAACGAAAATGCAAAATTAATTGATTAGAAGAAAAGAGCTGGAAAATCAACATA
GCATATAACTCTATTCTAGTGATTTTCCTTATTTCTTGTCATTTTCTAATCTAGTCTCTT
TTGTGTACTTGTTTGTTGTTTTACTGTTCAATTCTTTCTATTTCCACTAAAGCAGATAAG
AAGGAACACAAGAAGAAACGGGATAAGTTACAAGATGGTAAGTTTAACTGATTCAAAAAT
TAAGCAATAAAGAAGGGTTGAGGAGGAAGAATAAAAAGATTGAGTGGATGAAAAGTAAAG
CTATTGTATGATAGTATTATTTTGAGGATTTAGTTAATATGTAAGAATATCTTTTTAAAA
GGAAAAAAACGTGGTAAGGTACACAACTGCACATTATCATACATCAAAACATTAGATTTG
TCAATTGAGCTAATATATTCAACAGATGTAAACTAAGTGAAGAGAATGAGTAGTAATGGT
TGATTGTATTACTTAGTGATTCTAAAACAGTTTTCGTTTTGATAAAATCATATGAAATCT
CTTTAGTATAAAAATGAGGATAAAATAACATTTTAATGATCATGAATTTCTTCAAGTGAA
TCATCCCCTTCAGTATCATGACCACTATCATCATCTTCAACTCCAAAGATGTTTTCGATT
CGTTTTAATATAGATAAAACGATAGACCTCGTTTTCGTCATAGGTTTGCCATCGTTCTCT
CCATCGTCG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)