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Schistosoma mansoni
cluster # 8592 cluster # 8592       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8592#0 length = 998 sequences # 7  

consensusID : consensus_8592#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 998
fasta sequence
                              [TGTCATTACACATTATATTTGTCTCGTAAACCGTTAATTTCTTCTTTGGGGGGGGGGAATCCACTAAAGGATAACTTTCTAATCCAATAATAATCAAGATTACATTTATGCCGTAAAAGCGCATTTTACTAACTCAACAAACTAATTGGTTGGCTGGTTTCTAACCTTGACTTTGATTAAAATTATATATATAATCTATCACTCTTACAGTTTCTTTCATTTTACTGACTTGTATCATTGATATCGACATACGCACATGTTACTACTACTACTACTACTACTACCCAGTTTTCACAGTAGTATTGGTTCCATTTTATGAATGAACAGTTAAATGTTGGTTTAAATAAGTACTCATTCACTATTATAATCATCATCATCATCATTACATGGTGATTGTTTCGTTAGAAAATTTCTTGTTGGTTGTTGACTTTTCTGTGTTCGTTTTCCCCATTTCATATGACCATATTTGTGAACTCATACTCATTCTTTACTGTCAAAAAGCATTTTGCTTATGTTTCAACATTCAATCATTCTTTGTTTATTAGTTAAACAACTGTTGATACATATATCAAGCTTATCTCTCGTGACTGTTGTCATTCTCTCATATTTGCACATCATATTCAACATGGTTCTAAAGATTTTCTCTGGTTAATTTCTTTCACCAATCTCCTCTTTCCCTTACTAATTCCATTCCTGGTTAAGGTTATTCAACGTATTACATGCATATAATAGCTACTTAATTAAATAGTAGTAGTAGTAGTATTCTAAACATTTGTTTGTATGTTAGTACATACTGTGATGATATTATTCATGCTTTGTGTTCTTTTTCTTATAATTTCTGTTGTTTTGAAGTTAGTCTTTTCTTTTTTAAAAGACATTGTATTCAGTAATTAGTATTAGTATAATAGTAGTATGTTTGGTGTTTCG-TTTTTTTTTTCGAAAAAAACATTATTCATTTTACTTTTTATTTTCTCAAGTGATAATTTTAATATAATTAA]

[+] EMBL CD079090             [TGTCATTACACATTATATTTGTCTCGTAAACCGTTAATTTCTTCTTTGGGGGGGGGGAATCCACTAAAGGATAACTTTCTAATCCAATAATAATCAAGATTACATTTATGCCGTAAAAGCGCATTTTACTAACTCAACAAACTAATTGGTTGGCTGGTTTCTAACCTTGACTTTGATTAAAATTATATATATAATCTATCACTCTTACAGTTTCTTTCATTTTACTGACTTGTATCATTGATATCGACATACGCACATGTTACTACTACTACTACTACTACTACCCAGTTTTCACAGTAGTATTGGTTCCATTTTATGAATGAACAGTTAAATGTTGGTTTAAATAAGTACTCATTCACTATTATAATCATCATCATCATCATTACATGGTGATTGTTTCGTTAGAAAATTTCTTGTTGGTTGTTGACTTTTCTGTGTTCGTTTTCCCCATTTCATATGACCATATTTGTGAACTCATACTCATTCTTTACTGTCAAAAAGCATTNTGCTTATGTTTCAACATTCAATCATTCTTTGTTTATTAGTTAAACAACTGTTGATACATATATCAAGCTTATCTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD196800             [                                                                  AAGGATAACTTTCTAATCCAATAATAATCAAGATTACATTTATGCCGTAAAAGCGCATTTTACTAACTCAACAAACTAATTGGTTGGCTGGTTTCTAACCTTGACTTTGATTAAAATTATATATATAATCTATCACTCTTACAGTTTCTTTCATTTTACTGACTTGTATCATTGATATCGACATACGCACATGT      TACTACTACTACTACTACCCAGTTTTCACAGTAGTATTGGTTCCATTTTATGAATGAACAGTTAAATGTTGGTTTAAATAAGTACTCATTCACTATTATAATCATCATCATCATCATTACATGGTGATTGTTTCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD073544             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTGGTTGTTGACTTTTCTGTGTTCGTTTTCCCCATTTCATATGACCATATTTGTGAACTCATACTCATTCTTTACTGTCAAAAAGCATTTTGCTTATGTTTCAACATTCAATCATTCTTTGTTTATTAGTTAAACAACTGTTGATACATATATCAAGCTTATCTCTCGTGACTGTTGTCATTCTCTCATATTTGCACATCATATTCAACATGGTTCTAAAGATTTTCTCTGGTTAATTTCTTTCACCAATCTCCTCTTTCCCTTACTAATTCCATTCCTGGTTAAGGTTATTCAACGTATTACATGCATATAATAGCTACTTAATTAAATAGTAGTAGTAGTAGTATTCTAAACATTTGTTTGTATGTTAGTACATACTGTGATGATATTATTCATGCTTTGTGTTCTTTTTCTTATAATTTCTGTTGTTTTGAAGTTAGTCTTTTCTTTTTTAAAAGACATTGTATTCAGTAATTAGTATTAGTATAATGGTAGTATGT                                                                                   ]
[-] EMBL CD201554             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTGTGAACTCATACTCATTCTTTACTGTCAAAAAGCATTTTGCTTATGTTTCAACATTCAATCATTCTTTGTTTATTAGTTAAACAACTGTTGATACATATATCAAGCTTATCTCTCGTGACTGTTGTCATTCTCTCATATTTGCACATCATATTCAACATAGTTCTAAAGATTTTCTCTGGTTAATTTCTTTCACCAATCTCCTCTTTCCCCTACTAATTCCATTCCTGGTTAAGGTTATTCAACGTATTACATGCATATAATAGCTACTTAATTAAATAGTAGTAGTAGTAGTATTCTAAACATTTGTTTGTATGTTAGTACATACTGTGATGATATTATTCATGCTTTGTGTTCTTTTTCTTATAATTTCTGTTGTTTTGAAGTTAGTCTTTTCTTTTTTAAGAG                                                                                                                             ]
[-] EMBL AI975026             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATGTTTCAACATTCAATCATTCTTTGTTTATTAGTTAAACAACTGTTGATACATATATCAAGCTTATCTCTCGTGACTGTTGTCATTCTCTCATATTTGCACATCATATTCAACATAGTTCTAAAGATTTTCTCTGGTTAATTTCTTTCACCAATCTCCTCTTTCCCCTACTAATTCCATTCCTGGTTAAGGTTATTCAACGTATTACATGCATATAATAGCTACTTAATTAAATAGTAGTAGTAGTAGTATTCTAAACATTTGTTTGTATGTTAGTACATACTGTGATGATATTATTCATGCTTTGTGTTCTTTTTCTTAAAATTTCTGTTGTTTTGAAGTTAGTCTTTTCTTTTTTAAGAGACATTGTATTCAGTAATTAGTATTAGTATAATAGTAGTATGTTTGGTGTTTCG TTTTTTTTTTCGAAAAAAACATTATTCATTTTACTTTTTATTTTCTCAAGTGATAATTTTAATATAATTAA]
[-] EMBL CD140697             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TACATATATCAAGCTTATCTCTCGTGACTGTTGTCATTCTCTCATATTTGCACATCATATTCAACATGGTTCTAAAGATTTTCTCTGGTTAATTTCTTTCACCAATCTCCTCTTTCCCTTACTAATTCCATTCCTGGTTAAGGTTATTCAACGTATTACATGCATATAATAGCTACTTAATTAAATAGTAGTAGTAGTAGTATTCTAAACATTTGTTTGTATGTTAGTACATACTGTGATGATATTATTCATGCTTTGTGTTCTTTTTCTTATAATTTCTGTTGTTTTGAAGTTAGTCTTTTCTTTTTTAAAAGACATTGTATTCAGTAATTAGTATTAGTATAATAGTAGTATGTTTGGTGTTTCGTTTTTTTTTTTCGAAAAAAACATTATTCATTTTACT                                    ]
[-] EMBL CD140706             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTATCTCTCGTGACTGTTGTCATTCTCTCATATTCGCACATCATATTCAACATGGTTCTAAAGATTTTCTCTGGTTAATTTCTTTCACCAATCTCCTCTTTCCCTTACTAATTCCATTCCTGGTTAAGGTTATTCAACGTATTACATGCATATAATAGCTACTTAATTAAATAGTAGTAGTAGTAGTATTCTAAACATTTGTTTGTATGTTAGTACATACTGTGATGATATTATTCATGCTTTGTGTTCTTTTTCTTATAATTTCTGTTGTTTTGAAGTTAGTCTTTTCTTTTTTAAAAGACATTGTATTCAGTAATTAGTATTAGTATAATAGTAGTATGTTTGGTGTTTCGTTTTTTTTTTTCGAAAAAAACATTATTCATTTTACT                                    ]


>consensus_8592#0 TGTCATTACACATTATATTTGTCTCGTAAACCGTTAATTTCTTCTTTGGGGGGGGGGAAT CCACTAAAGGATAACTTTCTAATCCAATAATAATCAAGATTACATTTATGCCGTAAAAGC GCATTTTACTAACTCAACAAACTAATTGGTTGGCTGGTTTCTAACCTTGACTTTGATTAA AATTATATATATAATCTATCACTCTTACAGTTTCTTTCATTTTACTGACTTGTATCATTG ATATCGACATACGCACATGTTACTACTACTACTACTACTACTACCCAGTTTTCACAGTAG TATTGGTTCCATTTTATGAATGAACAGTTAAATGTTGGTTTAAATAAGTACTCATTCACT ATTATAATCATCATCATCATCATTACATGGTGATTGTTTCGTTAGAAAATTTCTTGTTGG TTGTTGACTTTTCTGTGTTCGTTTTCCCCATTTCATATGACCATATTTGTGAACTCATAC TCATTCTTTACTGTCAAAAAGCATTTTGCTTATGTTTCAACATTCAATCATTCTTTGTTT ATTAGTTAAACAACTGTTGATACATATATCAAGCTTATCTCTCGTGACTGTTGTCATTCT CTCATATTTGCACATCATATTCAACATGGTTCTAAAGATTTTCTCTGGTTAATTTCTTTC ACCAATCTCCTCTTTCCCTTACTAATTCCATTCCTGGTTAAGGTTATTCAACGTATTACA TGCATATAATAGCTACTTAATTAAATAGTAGTAGTAGTAGTATTCTAAACATTTGTTTGT ATGTTAGTACATACTGTGATGATATTATTCATGCTTTGTGTTCTTTTTCTTATAATTTCT GTTGTTTTGAAGTTAGTCTTTTCTTTTTTAAAAGACATTGTATTCAGTAATTAGTATTAG TATAATAGTAGTATGTTTGGTGTTTCGTTTTTTTTTTCGAAAAAAACATTATTCATTTTA CTTTTTATTTTCTCAAGTGATAATTTTAATATAATTAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)