These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8592#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 998 fasta sequence [TGTCATTACACATTATATTTGTCTCGTAAACCGTTAATTTCTTCTTTGGGGGGGGGGAATCCACTAAAGGATAACTTTCTAATCCAATAATAATCAAGATTACATTTATGCCGTAAAAGCGCATTTTACTAACTCAACAAACTAATTGGTTGGCTGGTTTCTAACCTTGACTTTGATTAAAATTATATATATAATCTATCACTCTTACAGTTTCTTTCATTTTACTGACTTGTATCATTGATATCGACATACGCACATGTTACTACTACTACTACTACTACTACCCAGTTTTCACAGTAGTATTGGTTCCATTTTATGAATGAACAGTTAAATGTTGGTTTAAATAAGTACTCATTCACTATTATAATCATCATCATCATCATTACATGGTGATTGTTTCGTTAGAAAATTTCTTGTTGGTTGTTGACTTTTCTGTGTTCGTTTTCCCCATTTCATATGACCATATTTGTGAACTCATACTCATTCTTTACTGTCAAAAAGCATTTTGCTTATGTTTCAACATTCAATCATTCTTTGTTTATTAGTTAAACAACTGTTGATACATATATCAAGCTTATCTCTCGTGACTGTTGTCATTCTCTCATATTTGCACATCATATTCAACATGGTTCTAAAGATTTTCTCTGGTTAATTTCTTTCACCAATCTCCTCTTTCCCTTACTAATTCCATTCCTGGTTAAGGTTATTCAACGTATTACATGCATATAATAGCTACTTAATTAAATAGTAGTAGTAGTAGTATTCTAAACATTTGTTTGTATGTTAGTACATACTGTGATGATATTATTCATGCTTTGTGTTCTTTTTCTTATAATTTCTGTTGTTTTGAAGTTAGTCTTTTCTTTTTTAAAAGACATTGTATTCAGTAATTAGTATTAGTATAATAGTAGTATGTTTGGTGTTTCG-TTTTTTTTTTCGAAAAAAACATTATTCATTTTACTTTTTATTTTCTCAAGTGATAATTTTAATATAATTAA] [+] EMBL CD079090 [TGTCATTACACATTATATTTGTCTCGTAAACCGTTAATTTCTTCTTTGGGGGGGGGGAATCCACTAAAGGATAACTTTCTAATCCAATAATAATCAAGATTACATTTATGCCGTAAAAGCGCATTTTACTAACTCAACAAACTAATTGGTTGGCTGGTTTCTAACCTTGACTTTGATTAAAATTATATATATAATCTATCACTCTTACAGTTTCTTTCATTTTACTGACTTGTATCATTGATATCGACATACGCACATGTTACTACTACTACTACTACTACTACCCAGTTTTCACAGTAGTATTGGTTCCATTTTATGAATGAACAGTTAAATGTTGGTTTAAATAAGTACTCATTCACTATTATAATCATCATCATCATCATTACATGGTGATTGTTTCGTTAGAAAATTTCTTGTTGGTTGTTGACTTTTCTGTGTTCGTTTTCCCCATTTCATATGACCATATTTGTGAACTCATACTCATTCTTTACTGTCAAAAAGCATTNTGCTTATGTTTCAACATTCAATCATTCTTTGTTTATTAGTTAAACAACTGTTGATACATATATCAAGCTTATCTCT ] [-] EMBL CD196800 [ AAGGATAACTTTCTAATCCAATAATAATCAAGATTACATTTATGCCGTAAAAGCGCATTTTACTAACTCAACAAACTAATTGGTTGGCTGGTTTCTAACCTTGACTTTGATTAAAATTATATATATAATCTATCACTCTTACAGTTTCTTTCATTTTACTGACTTGTATCATTGATATCGACATACGCACATGT TACTACTACTACTACTACCCAGTTTTCACAGTAGTATTGGTTCCATTTTATGAATGAACAGTTAAATGTTGGTTTAAATAAGTACTCATTCACTATTATAATCATCATCATCATCATTACATGGTGATTGTTTCG ] [-] EMBL CD073544 [ TTGGTTGTTGACTTTTCTGTGTTCGTTTTCCCCATTTCATATGACCATATTTGTGAACTCATACTCATTCTTTACTGTCAAAAAGCATTTTGCTTATGTTTCAACATTCAATCATTCTTTGTTTATTAGTTAAACAACTGTTGATACATATATCAAGCTTATCTCTCGTGACTGTTGTCATTCTCTCATATTTGCACATCATATTCAACATGGTTCTAAAGATTTTCTCTGGTTAATTTCTTTCACCAATCTCCTCTTTCCCTTACTAATTCCATTCCTGGTTAAGGTTATTCAACGTATTACATGCATATAATAGCTACTTAATTAAATAGTAGTAGTAGTAGTATTCTAAACATTTGTTTGTATGTTAGTACATACTGTGATGATATTATTCATGCTTTGTGTTCTTTTTCTTATAATTTCTGTTGTTTTGAAGTTAGTCTTTTCTTTTTTAAAAGACATTGTATTCAGTAATTAGTATTAGTATAATGGTAGTATGT ] [-] EMBL CD201554 [ TTTGTGAACTCATACTCATTCTTTACTGTCAAAAAGCATTTTGCTTATGTTTCAACATTCAATCATTCTTTGTTTATTAGTTAAACAACTGTTGATACATATATCAAGCTTATCTCTCGTGACTGTTGTCATTCTCTCATATTTGCACATCATATTCAACATAGTTCTAAAGATTTTCTCTGGTTAATTTCTTTCACCAATCTCCTCTTTCCCCTACTAATTCCATTCCTGGTTAAGGTTATTCAACGTATTACATGCATATAATAGCTACTTAATTAAATAGTAGTAGTAGTAGTATTCTAAACATTTGTTTGTATGTTAGTACATACTGTGATGATATTATTCATGCTTTGTGTTCTTTTTCTTATAATTTCTGTTGTTTTGAAGTTAGTCTTTTCTTTTTTAAGAG ] [-] EMBL AI975026 [ TATGTTTCAACATTCAATCATTCTTTGTTTATTAGTTAAACAACTGTTGATACATATATCAAGCTTATCTCTCGTGACTGTTGTCATTCTCTCATATTTGCACATCATATTCAACATAGTTCTAAAGATTTTCTCTGGTTAATTTCTTTCACCAATCTCCTCTTTCCCCTACTAATTCCATTCCTGGTTAAGGTTATTCAACGTATTACATGCATATAATAGCTACTTAATTAAATAGTAGTAGTAGTAGTATTCTAAACATTTGTTTGTATGTTAGTACATACTGTGATGATATTATTCATGCTTTGTGTTCTTTTTCTTAAAATTTCTGTTGTTTTGAAGTTAGTCTTTTCTTTTTTAAGAGACATTGTATTCAGTAATTAGTATTAGTATAATAGTAGTATGTTTGGTGTTTCG TTTTTTTTTTCGAAAAAAACATTATTCATTTTACTTTTTATTTTCTCAAGTGATAATTTTAATATAATTAA] [-] EMBL CD140697 [ TACATATATCAAGCTTATCTCTCGTGACTGTTGTCATTCTCTCATATTTGCACATCATATTCAACATGGTTCTAAAGATTTTCTCTGGTTAATTTCTTTCACCAATCTCCTCTTTCCCTTACTAATTCCATTCCTGGTTAAGGTTATTCAACGTATTACATGCATATAATAGCTACTTAATTAAATAGTAGTAGTAGTAGTATTCTAAACATTTGTTTGTATGTTAGTACATACTGTGATGATATTATTCATGCTTTGTGTTCTTTTTCTTATAATTTCTGTTGTTTTGAAGTTAGTCTTTTCTTTTTTAAAAGACATTGTATTCAGTAATTAGTATTAGTATAATAGTAGTATGTTTGGTGTTTCGTTTTTTTTTTTCGAAAAAAACATTATTCATTTTACT ] [-] EMBL CD140706 [ TTATCTCTCGTGACTGTTGTCATTCTCTCATATTCGCACATCATATTCAACATGGTTCTAAAGATTTTCTCTGGTTAATTTCTTTCACCAATCTCCTCTTTCCCTTACTAATTCCATTCCTGGTTAAGGTTATTCAACGTATTACATGCATATAATAGCTACTTAATTAAATAGTAGTAGTAGTAGTATTCTAAACATTTGTTTGTATGTTAGTACATACTGTGATGATATTATTCATGCTTTGTGTTCTTTTTCTTATAATTTCTGTTGTTTTGAAGTTAGTCTTTTCTTTTTTAAAAGACATTGTATTCAGTAATTAGTATTAGTATAATAGTAGTATGTTTGGTGTTTCGTTTTTTTTTTTCGAAAAAAACATTATTCATTTTACT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||