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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8592#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 998 fasta sequence
[TGTCATTACACATTATATTTGTCTCGTAAACCGTTAATTTCTTCTTTGGGGGGGGGGAATCCACTAAAGGATAACTTTCTAATCCAATAATAATCAAGATTACATTTATGCCGTAAAAGCGCATTTTACTAACTCAACAAACTAATTGGTTGGCTGGTTTCTAACCTTGACTTTGATTAAAATTATATATATAATCTATCACTCTTACAGTTTCTTTCATTTTACTGACTTGTATCATTGATATCGACATACGCACATGTTACTACTACTACTACTACTACTACCCAGTTTTCACAGTAGTATTGGTTCCATTTTATGAATGAACAGTTAAATGTTGGTTTAAATAAGTACTCATTCACTATTATAATCATCATCATCATCATTACATGGTGATTGTTTCGTTAGAAAATTTCTTGTTGGTTGTTGACTTTTCTGTGTTCGTTTTCCCCATTTCATATGACCATATTTGTGAACTCATACTCATTCTTTACTGTCAAAAAGCATTTTGCTTATGTTTCAACATTCAATCATTCTTTGTTTATTAGTTAAACAACTGTTGATACATATATCAAGCTTATCTCTCGTGACTGTTGTCATTCTCTCATATTTGCACATCATATTCAACATGGTTCTAAAGATTTTCTCTGGTTAATTTCTTTCACCAATCTCCTCTTTCCCTTACTAATTCCATTCCTGGTTAAGGTTATTCAACGTATTACATGCATATAATAGCTACTTAATTAAATAGTAGTAGTAGTAGTATTCTAAACATTTGTTTGTATGTTAGTACATACTGTGATGATATTATTCATGCTTTGTGTTCTTTTTCTTATAATTTCTGTTGTTTTGAAGTTAGTCTTTTCTTTTTTAAAAGACATTGTATTCAGTAATTAGTATTAGTATAATAGTAGTATGTTTGGTGTTTCG-TTTTTTTTTTCGAAAAAAACATTATTCATTTTACTTTTTATTTTCTCAAGTGATAATTTTAATATAATTAA]
[+] EMBL CD079090 [TGTCATTACACATTATATTTGTCTCGTAAACCGTTAATTTCTTCTTTGGGGGGGGGGAATCCACTAAAGGATAACTTTCTAATCCAATAATAATCAAGATTACATTTATGCCGTAAAAGCGCATTTTACTAACTCAACAAACTAATTGGTTGGCTGGTTTCTAACCTTGACTTTGATTAAAATTATATATATAATCTATCACTCTTACAGTTTCTTTCATTTTACTGACTTGTATCATTGATATCGACATACGCACATGTTACTACTACTACTACTACTACTACCCAGTTTTCACAGTAGTATTGGTTCCATTTTATGAATGAACAGTTAAATGTTGGTTTAAATAAGTACTCATTCACTATTATAATCATCATCATCATCATTACATGGTGATTGTTTCGTTAGAAAATTTCTTGTTGGTTGTTGACTTTTCTGTGTTCGTTTTCCCCATTTCATATGACCATATTTGTGAACTCATACTCATTCTTTACTGTCAAAAAGCATTNTGCTTATGTTTCAACATTCAATCATTCTTTGTTTATTAGTTAAACAACTGTTGATACATATATCAAGCTTATCTCT ]
[-] EMBL CD196800 [ AAGGATAACTTTCTAATCCAATAATAATCAAGATTACATTTATGCCGTAAAAGCGCATTTTACTAACTCAACAAACTAATTGGTTGGCTGGTTTCTAACCTTGACTTTGATTAAAATTATATATATAATCTATCACTCTTACAGTTTCTTTCATTTTACTGACTTGTATCATTGATATCGACATACGCACATGT TACTACTACTACTACTACCCAGTTTTCACAGTAGTATTGGTTCCATTTTATGAATGAACAGTTAAATGTTGGTTTAAATAAGTACTCATTCACTATTATAATCATCATCATCATCATTACATGGTGATTGTTTCG ]
[-] EMBL CD073544 [ TTGGTTGTTGACTTTTCTGTGTTCGTTTTCCCCATTTCATATGACCATATTTGTGAACTCATACTCATTCTTTACTGTCAAAAAGCATTTTGCTTATGTTTCAACATTCAATCATTCTTTGTTTATTAGTTAAACAACTGTTGATACATATATCAAGCTTATCTCTCGTGACTGTTGTCATTCTCTCATATTTGCACATCATATTCAACATGGTTCTAAAGATTTTCTCTGGTTAATTTCTTTCACCAATCTCCTCTTTCCCTTACTAATTCCATTCCTGGTTAAGGTTATTCAACGTATTACATGCATATAATAGCTACTTAATTAAATAGTAGTAGTAGTAGTATTCTAAACATTTGTTTGTATGTTAGTACATACTGTGATGATATTATTCATGCTTTGTGTTCTTTTTCTTATAATTTCTGTTGTTTTGAAGTTAGTCTTTTCTTTTTTAAAAGACATTGTATTCAGTAATTAGTATTAGTATAATGGTAGTATGT ]
[-] EMBL CD201554 [ TTTGTGAACTCATACTCATTCTTTACTGTCAAAAAGCATTTTGCTTATGTTTCAACATTCAATCATTCTTTGTTTATTAGTTAAACAACTGTTGATACATATATCAAGCTTATCTCTCGTGACTGTTGTCATTCTCTCATATTTGCACATCATATTCAACATAGTTCTAAAGATTTTCTCTGGTTAATTTCTTTCACCAATCTCCTCTTTCCCCTACTAATTCCATTCCTGGTTAAGGTTATTCAACGTATTACATGCATATAATAGCTACTTAATTAAATAGTAGTAGTAGTAGTATTCTAAACATTTGTTTGTATGTTAGTACATACTGTGATGATATTATTCATGCTTTGTGTTCTTTTTCTTATAATTTCTGTTGTTTTGAAGTTAGTCTTTTCTTTTTTAAGAG ]
[-] EMBL AI975026 [ TATGTTTCAACATTCAATCATTCTTTGTTTATTAGTTAAACAACTGTTGATACATATATCAAGCTTATCTCTCGTGACTGTTGTCATTCTCTCATATTTGCACATCATATTCAACATAGTTCTAAAGATTTTCTCTGGTTAATTTCTTTCACCAATCTCCTCTTTCCCCTACTAATTCCATTCCTGGTTAAGGTTATTCAACGTATTACATGCATATAATAGCTACTTAATTAAATAGTAGTAGTAGTAGTATTCTAAACATTTGTTTGTATGTTAGTACATACTGTGATGATATTATTCATGCTTTGTGTTCTTTTTCTTAAAATTTCTGTTGTTTTGAAGTTAGTCTTTTCTTTTTTAAGAGACATTGTATTCAGTAATTAGTATTAGTATAATAGTAGTATGTTTGGTGTTTCG TTTTTTTTTTCGAAAAAAACATTATTCATTTTACTTTTTATTTTCTCAAGTGATAATTTTAATATAATTAA]
[-] EMBL CD140697 [ TACATATATCAAGCTTATCTCTCGTGACTGTTGTCATTCTCTCATATTTGCACATCATATTCAACATGGTTCTAAAGATTTTCTCTGGTTAATTTCTTTCACCAATCTCCTCTTTCCCTTACTAATTCCATTCCTGGTTAAGGTTATTCAACGTATTACATGCATATAATAGCTACTTAATTAAATAGTAGTAGTAGTAGTATTCTAAACATTTGTTTGTATGTTAGTACATACTGTGATGATATTATTCATGCTTTGTGTTCTTTTTCTTATAATTTCTGTTGTTTTGAAGTTAGTCTTTTCTTTTTTAAAAGACATTGTATTCAGTAATTAGTATTAGTATAATAGTAGTATGTTTGGTGTTTCGTTTTTTTTTTTCGAAAAAAACATTATTCATTTTACT ]
[-] EMBL CD140706 [ TTATCTCTCGTGACTGTTGTCATTCTCTCATATTCGCACATCATATTCAACATGGTTCTAAAGATTTTCTCTGGTTAATTTCTTTCACCAATCTCCTCTTTCCCTTACTAATTCCATTCCTGGTTAAGGTTATTCAACGTATTACATGCATATAATAGCTACTTAATTAAATAGTAGTAGTAGTAGTATTCTAAACATTTGTTTGTATGTTAGTACATACTGTGATGATATTATTCATGCTTTGTGTTCTTTTTCTTATAATTTCTGTTGTTTTGAAGTTAGTCTTTTCTTTTTTAAAAGACATTGTATTCAGTAATTAGTATTAGTATAATAGTAGTATGTTTGGTGTTTCGTTTTTTTTTTTCGAAAAAAACATTATTCATTTTACT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||